MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid2

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008342	CTGG	2	8	270	277	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008342	GGCG	2	8	800	807	0 %	0 %	75 %	25 %	114326613
3	NC_008342	CCTA	2	8	1138	1145	25 %	25 %	0 %	50 %	114326613
4	NC_008342	AGAC	2	8	1660	1667	50 %	0 %	25 %	25 %	114326613
5	NC_008342	CACG	2	8	1920	1927	25 %	0 %	25 %	50 %	114326613
6	NC_008342	CCGA	2	8	2038	2045	25 %	0 %	25 %	50 %	114326613
7	NC_008342	CCAG	2	8	2726	2733	25 %	0 %	25 %	50 %	114326613
8	NC_008342	GCTG	2	8	2834	2841	0 %	25 %	50 %	25 %	114326613
9	NC_008342	ATTT	2	8	3566	3573	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008342	ATCA	2	8	3641	3648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008342	CGAA	2	8	3721	3728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008342	GAGT	2	8	3927	3934	25 %	25 %	50 %	0 %	114326614
13	NC_008342	GGGC	2	8	4570	4577	0 %	0 %	75 %	25 %	114326615
14	NC_008342	ATAC	2	8	4831	4838	50 %	25 %	0 %	25 %	114326615
15	NC_008342	CCGC	2	8	4934	4941	0 %	0 %	25 %	75 %	114326615
16	NC_008342	CCAA	2	8	5103	5110	50 %	0 %	0 %	50 %	114326615
17	NC_008342	CAAC	2	8	5432	5439	50 %	0 %	0 %	50 %	114326616
18	NC_008342	CAGT	2	8	5809	5816	25 %	25 %	25 %	25 %	114326617
19	NC_008342	AAGA	2	8	6526	6533	75 %	0 %	25 %	0 %	114326617
20	NC_008342	GCTT	2	8	6975	6982	0 %	50 %	25 %	25 %	114326618
21	NC_008342	TCAC	2	8	7038	7045	25 %	25 %	0 %	50 %	114326618
22	NC_008342	ATCC	2	8	7392	7399	25 %	25 %	0 %	50 %	114326618
23	NC_008342	TACA	2	8	7476	7483	50 %	25 %	0 %	25 %	114326618
24	NC_008342	CTTC	2	8	7595	7602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008342	AGGC	2	8	7795	7802	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008342	GTGA	2	8	8576	8583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008342	TAAA	2	8	9329	9336	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008342	AGAA	2	8	9531	9538	75 %	0 %	25 %	0 %	114326621
29	NC_008342	ACCG	2	8	9938	9945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008342	TTTA	2	8	10647	10654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008342	CCCG	2	8	11496	11503	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_008342	GAAA	2	8	11651	11658	75 %	0 %	25 %	0 %	114326624
33	NC_008342	GAGG	2	8	11833	11840	25 %	0 %	75 %	0 %	114326624
34	NC_008342	TTGA	2	8	11966	11973	25 %	50 %	25 %	0 %	114326624
35	NC_008342	CCAG	2	8	12293	12300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008342	TAAC	2	8	12646	12653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008342	CGCA	2	8	13048	13055	25 %	0 %	25 %	50 %	114326625
38	NC_008342	CGCT	2	8	13428	13435	0 %	25 %	25 %	50 %	114326625
39	NC_008342	TAAC	2	8	13471	13478	50 %	25 %	0 %	25 %	114326625
40	NC_008342	TACA	2	8	13604	13611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008342	ATGT	2	8	13968	13975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008342	CAGC	2	8	14187	14194	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008342	CCAT	2	8	14593	14600	25 %	25 %	0 %	50 %	114326626
44	NC_008342	TTCC	2	8	15836	15843	0 %	50 %	0 %	50 %	114326626
45	NC_008342	CTTC	2	8	15962	15969	0 %	50 %	0 %	50 %	114326626
46	NC_008342	TGGT	2	8	16225	16232	0 %	50 %	50 %	0 %	114326626
47	NC_008342	GCGA	2	8	16412	16419	25 %	0 %	50 %	25 %	114326626
48	NC_008342	TGCC	2	8	16439	16446	0 %	25 %	25 %	50 %	114326626
49	NC_008342	CCGC	2	8	17502	17509	0 %	0 %	25 %	75 %	114326627
50	NC_008342	CGGT	2	8	17554	17561	0 %	25 %	50 %	25 %	114326627
51	NC_008342	CCGA	2	8	17923	17930	25 %	0 %	25 %	50 %	114326627
52	NC_008342	GATT	2	8	18088	18095	25 %	50 %	25 %	0 %	114326627
53	NC_008342	CTGC	2	8	18420	18427	0 %	25 %	25 %	50 %	114326627
54	NC_008342	CAAG	2	8	18573	18580	50 %	0 %	25 %	25 %	114326627
55	NC_008342	GCCA	2	8	18897	18904	25 %	0 %	25 %	50 %	114326627
56	NC_008342	CTTC	2	8	18924	18931	0 %	50 %	0 %	50 %	114326627
57	NC_008342	GAAG	2	8	20288	20295	50 %	0 %	50 %	0 %	114326628
58	NC_008342	CGCC	2	8	21239	21246	0 %	0 %	25 %	75 %	114326628
59	NC_008342	GGTG	2	8	21305	21312	0 %	25 %	75 %	0 %	114326628
60	NC_008342	GCAG	2	8	21704	21711	25 %	0 %	50 %	25 %	114326628
61	NC_008342	CGGC	2	8	22574	22581	0 %	0 %	50 %	50 %	114326629
62	NC_008342	CGAC	2	8	22864	22871	25 %	0 %	25 %	50 %	114326629
63	NC_008342	TGGT	2	8	23304	23311	0 %	50 %	50 %	0 %	114326630
64	NC_008342	ACAT	2	8	23518	23525	50 %	25 %	0 %	25 %	114326630
65	NC_008342	CGTG	2	8	23901	23908	0 %	25 %	50 %	25 %	114326630
66	NC_008342	GCCG	2	8	23919	23926	0 %	0 %	50 %	50 %	114326630
67	NC_008342	AGAT	2	8	24007	24014	50 %	25 %	25 %	0 %	114326630
68	NC_008342	TCGA	2	8	24315	24322	25 %	25 %	25 %	25 %	114326630
69	NC_008342	CGCC	2	8	24432	24439	0 %	0 %	25 %	75 %	114326630
70	NC_008342	CTTG	2	8	24458	24465	0 %	50 %	25 %	25 %	114326630
71	NC_008342	GGTT	2	8	24930	24937	0 %	50 %	50 %	0 %	114326631
72	NC_008342	CGCT	2	8	25176	25183	0 %	25 %	25 %	50 %	114326631
73	NC_008342	CAGC	2	8	25205	25212	25 %	0 %	25 %	50 %	114326631
74	NC_008342	TGCT	2	8	25222	25229	0 %	50 %	25 %	25 %	114326631
75	NC_008342	CCAA	2	8	26198	26205	50 %	0 %	0 %	50 %	114326633
76	NC_008342	TGCA	2	8	26252	26259	25 %	25 %	25 %	25 %	114326633
77	NC_008342	TAAT	2	8	26412	26419	50 %	50 %	0 %	0 %	114326633
78	NC_008342	ACCT	2	8	26506	26513	25 %	25 %	0 %	50 %	114326633
79	NC_008342	GTAA	2	8	26514	26521	50 %	25 %	25 %	0 %	114326633
80	NC_008342	AAGG	2	8	27150	27157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008342	GGAA	2	8	27727	27734	50 %	0 %	50 %	0 %	114326634
82	NC_008342	CCGT	2	8	27741	27748	0 %	25 %	25 %	50 %	114326634
83	NC_008342	AATC	2	8	28022	28029	50 %	25 %	0 %	25 %	114326635
84	NC_008342	TCAA	2	8	28646	28653	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008342	CTGC	2	8	28971	28978	0 %	25 %	25 %	50 %	114326636
86	NC_008342	TTCT	2	8	29437	29444	0 %	75 %	0 %	25 %	114326636
87	NC_008342	GATT	2	8	29632	29639	25 %	50 %	25 %	0 %	114326636
88	NC_008342	GAAA	2	8	29848	29855	75 %	0 %	25 %	0 %	114326636
89	NC_008342	TAAT	2	8	30026	30033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008342	GCGT	2	8	30515	30522	0 %	25 %	50 %	25 %	114326638
91	NC_008342	GGCT	2	8	31242	31249	0 %	25 %	50 %	25 %	114326639
92	NC_008342	CAGG	2	8	31570	31577	25 %	0 %	50 %	25 %	114326640
93	NC_008342	GGCG	2	8	32505	32512	0 %	0 %	75 %	25 %	114326640
94	NC_008342	GTCC	2	8	32865	32872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008342	CTTG	2	8	32970	32977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008342	TCCC	2	8	33036	33043	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_008342	TTTA	2	8	33794	33801	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008342	GATT	2	8	33952	33959	25 %	50 %	25 %	0 %	114326642
99	NC_008342	CACC	2	8	34018	34025	25 %	0 %	0 %	75 %	114326642
100	NC_008342	CAAG	2	8	34617	34624	50 %	0 %	25 %	25 %	114326642
101	NC_008342	GCAT	2	8	35037	35044	25 %	25 %	25 %	25 %	114326642
102	NC_008342	AGCA	2	8	35119	35126	50 %	0 %	25 %	25 %	114326642
103	NC_008342	TCCA	2	8	35946	35953	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008342	TTTA	2	8	36261	36268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008342	GCGG	2	8	36384	36391	0 %	0 %	75 %	25 %	114326643
106	NC_008342	GGGC	2	8	36908	36915	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008342	TTTG	2	8	37153	37160	0 %	75 %	25 %	0 %	114326644
108	NC_008342	GTAT	2	8	37376	37383	25 %	50 %	25 %	0 %	114326644
109	NC_008342	TTTC	2	8	37518	37525	0 %	75 %	0 %	25 %	114326644
110	NC_008342	CCTA	2	8	37690	37697	25 %	25 %	0 %	50 %	114326644
111	NC_008342	AATC	2	8	38071	38078	50 %	25 %	0 %	25 %	114326644
112	NC_008342	TGCT	2	8	38386	38393	0 %	50 %	25 %	25 %	114326645
113	NC_008342	CCAT	2	8	38821	38828	25 %	25 %	0 %	50 %	114326646
114	NC_008342	CATA	2	8	39278	39285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008342	TTCA	2	8	39286	39293	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008342	CCAG	2	8	39485	39492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_008342	TTAA	2	8	39727	39734	50 %	50 %	0 %	0 %	114326647
118	NC_008342	GCGG	2	8	40738	40745	0 %	0 %	75 %	25 %	114326648
119	NC_008342	CAGC	2	8	40983	40990	25 %	0 %	25 %	50 %	114326648
120	NC_008342	CATC	2	8	42518	42525	25 %	25 %	0 %	50 %	114326650
121	NC_008342	AAGC	2	8	42528	42535	50 %	0 %	25 %	25 %	114326650
122	NC_008342	AACC	2	8	43644	43651	50 %	0 %	0 %	50 %	114326650
123	NC_008342	TCTG	2	8	44041	44048	0 %	50 %	25 %	25 %	114326651
124	NC_008342	TGAT	2	8	44615	44622	25 %	50 %	25 %	0 %	114326651
125	NC_008342	CCCG	2	8	45010	45017	0 %	0 %	25 %	75 %	114326652
126	NC_008342	CCGT	2	8	45176	45183	0 %	25 %	25 %	50 %	114326652
127	NC_008342	TGAT	2	8	45763	45770	25 %	50 %	25 %	0 %	114326652
128	NC_008342	TTAG	2	8	46135	46142	25 %	50 %	25 %	0 %	114326653
129	NC_008342	TGCT	2	8	46429	46436	0 %	50 %	25 %	25 %	114326653
130	NC_008342	ACGA	2	8	46605	46612	50 %	0 %	25 %	25 %	114326653
131	NC_008342	TGTT	2	8	47549	47556	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008342	ATTT	2	8	47797	47804	25 %	75 %	0 %	0 %	114326655
133	NC_008342	CCGC	2	8	48139	48146	0 %	0 %	25 %	75 %	114326655
134	NC_008342	GATT	2	8	48610	48617	25 %	50 %	25 %	0 %	114326655
135	NC_008342	GTTC	2	8	49431	49438	0 %	50 %	25 %	25 %	114326657
136	NC_008342	AGCG	2	8	49644	49651	25 %	0 %	50 %	25 %	114326657
137	NC_008342	TTGC	2	8	49694	49701	0 %	50 %	25 %	25 %	114326657
138	NC_008342	AGAA	2	8	50112	50119	75 %	0 %	25 %	0 %	114326658
139	NC_008342	AATG	2	8	50298	50305	50 %	25 %	25 %	0 %	114326658
140	NC_008342	TGTT	2	8	50310	50317	0 %	75 %	25 %	0 %	114326658
141	NC_008342	GACA	2	8	50442	50449	50 %	0 %	25 %	25 %	114326658
142	NC_008342	CGAC	2	8	50756	50763	25 %	0 %	25 %	50 %	114326658
143	NC_008342	AATC	2	8	51467	51474	50 %	25 %	0 %	25 %	114326658
144	NC_008342	ACGA	2	8	52634	52641	50 %	0 %	25 %	25 %	114326659
145	NC_008342	GTTA	2	8	53190	53197	25 %	50 %	25 %	0 %	114326661
146	NC_008342	GTTT	2	8	53310	53317	0 %	75 %	25 %	0 %	114326661
147	NC_008342	GCCT	2	8	53469	53476	0 %	25 %	25 %	50 %	114326661
148	NC_008342	TTTA	2	8	53514	53521	25 %	75 %	0 %	0 %	114326661
149	NC_008342	TTGG	2	8	53600	53607	0 %	50 %	50 %	0 %	114326661
150	NC_008342	ATCA	2	8	53721	53728	50 %	25 %	0 %	25 %	114326661
151	NC_008342	ACAA	2	8	53943	53950	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008342	ATGG	2	8	54179	54186	25 %	25 %	50 %	0 %	114326662
153	NC_008342	TCAT	2	8	54381	54388	25 %	50 %	0 %	25 %	114326662
154	NC_008342	TGCG	2	8	54524	54531	0 %	25 %	50 %	25 %	114326663
155	NC_008342	AGTA	2	8	54576	54583	50 %	25 %	25 %	0 %	114326663
156	NC_008342	GGAA	2	8	54651	54658	50 %	0 %	50 %	0 %	114326663
157	NC_008342	TTGC	2	8	54771	54778	0 %	50 %	25 %	25 %	114326663
158	NC_008342	CAGC	2	8	55423	55430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
159	NC_008342	CCCG	2	8	55546	55553	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.