MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid2

Total Repeats: 98

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008342	TAA	2	6	61	66	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008342	ATA	2	6	102	107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008342	GGC	2	6	153	158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008342	ATG	2	6	176	181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008342	ACT	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008342	TGT	2	6	4302	4307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008342	ATT	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008342	TTC	2	6	4366	4371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008342	CGC	2	6	4392	4397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_008342	ACA	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008342	CTA	2	6	7623	7628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008342	CAG	2	6	7751	7756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008342	GCT	2	6	7803	7808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_008342	ACA	2	6	8082	8087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008342	AAC	2	6	8470	8475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008342	ATA	2	6	8490	8495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008342	TAA	2	6	9368	9373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008342	GAA	2	6	9956	9961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008342	CTG	2	6	9992	9997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008342	GGT	2	6	10431	10436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008342	TGG	2	6	10481	10486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008342	AGC	2	6	11198	11203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008342	AGC	2	6	11209	11214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008342	AAG	2	6	11302	11307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008342	CGT	2	6	11391	11396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008342	CTG	2	6	12104	12109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008342	GCC	2	6	12204	12209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_008342	GGC	2	6	12357	12362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008342	AAG	2	6	12366	12371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008342	AGG	2	6	12390	12395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008342	AAG	2	6	12453	12458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008342	AAC	2	6	12488	12493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008342	AGA	2	6	12553	12558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008342	TAT	2	6	13586	13591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008342	ATG	2	6	13793	13798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008342	GTA	2	6	14067	14072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008342	ATT	2	6	14398	14403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008342	AAC	2	6	25349	25354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008342	TCA	2	6	25378	25383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008342	AGT	2	6	25988	25993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008342	TTG	2	6	26051	26056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008342	AGT	2	6	26064	26069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008342	AGA	2	6	26757	26762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008342	TGA	2	6	26776	26781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008342	TGT	2	6	26793	26798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008342	ATA	2	6	26818	26823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008342	GAC	2	6	27009	27014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008342	CAC	2	6	27137	27142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008342	AAG	2	6	27990	27995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008342	TAA	2	6	28704	28709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008342	TCA	2	6	29916	29921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008342	TCG	2	6	29926	29931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008342	GGC	2	6	29993	29998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008342	ATA	2	6	30890	30895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008342	TAA	2	6	30921	30926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008342	GCC	2	6	31399	31404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_008342	ACG	2	6	31414	31419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008342	CTT	2	6	31452	31457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008342	GGC	2	6	33408	33413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008342	GGC	2	6	33523	33528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_008342	GGT	2	6	33565	33570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008342	AGA	2	6	33600	33605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008342	GCC	2	6	33613	33618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_008342	TAA	2	6	33638	33643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008342	AAT	2	6	33705	33710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008342	ATT	2	6	33752	33757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008342	TAA	2	6	33758	33763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008342	TAT	2	6	33774	33779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008342	ATC	2	6	33788	33793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008342	CAA	2	6	35604	35609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008342	GTC	2	6	35638	35643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008342	CAC	2	6	35696	35701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_008342	TTG	2	6	35753	35758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008342	GTT	2	6	35840	35845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008342	ATC	2	6	35932	35937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008342	TAA	2	6	35989	35994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008342	TCC	2	6	35995	36000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_008342	ATA	2	6	36291	36296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008342	ATT	2	6	39183	39188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008342	GCC	2	6	39396	39401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_008342	GGC	2	6	39549	39554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_008342	AAG	2	6	39558	39563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008342	AGG	2	6	39582	39587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008342	AAG	2	6	39645	39650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008342	GAA	2	6	40053	40058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008342	ATA	2	6	40161	40166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008342	TTA	2	6	41394	41399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008342	CGC	2	6	41436	41441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_008342	AAT	2	6	47467	47472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008342	GAG	2	6	47533	47538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008342	CAG	2	6	47705	47710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008342	TAC	2	6	47787	47792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008342	GGC	2	6	53919	53924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_008342	GCC	2	6	53930	53935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_008342	TAG	2	6	55224	55229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008342	CGA	2	6	55401	55406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008342	GTT	2	6	55559	55564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008342	TGG	2	6	55566	55571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.