MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid2

Total Repeats: 547

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008342	AAT	2	6	340	345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114326612
2	NC_008342	AGA	2	6	463	468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326612
3	NC_008342	AAC	2	6	479	484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326612
4	NC_008342	CAA	2	6	559	564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326612
5	NC_008342	CGC	2	6	707	712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326613
6	NC_008342	GAT	2	6	783	788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326613
7	NC_008342	ACG	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326613
8	NC_008342	CAG	2	6	1543	1548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326613
9	NC_008342	GCA	2	6	1580	1585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326613
10	NC_008342	CAA	2	6	1686	1691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326613
11	NC_008342	GCA	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326613
12	NC_008342	TTG	2	6	1704	1709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114326613
13	NC_008342	TCA	2	6	1811	1816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326613
14	NC_008342	AGC	2	6	1863	1868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326613
15	NC_008342	CAG	2	6	1869	1874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326613
16	NC_008342	CGA	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326613
17	NC_008342	GAT	2	6	2160	2165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326613
18	NC_008342	AAG	2	6	2389	2394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326613
19	NC_008342	GAC	2	6	2428	2433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326613
20	NC_008342	GAA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326613
21	NC_008342	TAC	2	6	2541	2546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326613
22	NC_008342	CTT	2	6	2636	2641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114326613
23	NC_008342	GAA	2	6	2946	2951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326613
24	NC_008342	GCA	2	6	3080	3085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326613
25	NC_008342	CAT	2	6	3212	3217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326613
26	NC_008342	AGC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326613
27	NC_008342	AGC	2	6	3340	3345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326613
28	NC_008342	TTC	2	6	3765	3770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114326614
29	NC_008342	GCA	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326614
30	NC_008342	TAT	2	6	3983	3988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114326614
31	NC_008342	AAT	2	6	4040	4045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114326614
32	NC_008342	CAA	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326614
33	NC_008342	GAA	2	6	4619	4624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326615
34	NC_008342	ATT	2	6	4741	4746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114326615
35	NC_008342	GCA	2	6	4762	4767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326615
36	NC_008342	ATA	2	6	4922	4927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114326615
37	NC_008342	GCA	2	6	5121	5126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326615
38	NC_008342	CAA	2	6	5339	5344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326615
39	NC_008342	CGA	2	6	5381	5386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326616
40	NC_008342	CAG	2	6	5446	5451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326616
41	NC_008342	AGC	2	6	5472	5477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326616
42	NC_008342	TGG	2	6	5527	5532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114326616
43	NC_008342	AAC	2	6	5630	5635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326616
44	NC_008342	CGA	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326616
45	NC_008342	TCA	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326617
46	NC_008342	GGC	2	6	5968	5973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326617
47	NC_008342	GGC	2	6	6166	6171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326617
48	NC_008342	CCG	2	6	6293	6298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326617
49	NC_008342	AGC	2	6	6378	6383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326617
50	NC_008342	ATA	2	6	6428	6433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114326617
51	NC_008342	CGA	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326617
52	NC_008342	CGC	2	6	6563	6568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326617
53	NC_008342	CGC	2	6	6615	6620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326617
54	NC_008342	GAC	2	6	6673	6678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326617
55	NC_008342	GAA	2	6	6700	6705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326617
56	NC_008342	TGC	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326617
57	NC_008342	GAC	2	6	6790	6795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326617
58	NC_008342	GCC	2	6	6820	6825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326617
59	NC_008342	CAG	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326617
60	NC_008342	GAA	2	6	6885	6890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326617
61	NC_008342	TAT	2	6	6931	6936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114326618
62	NC_008342	TGG	2	6	7028	7033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114326618
63	NC_008342	CAT	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326618
64	NC_008342	AAG	2	6	7183	7188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326618
65	NC_008342	CAA	2	6	7246	7251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326618
66	NC_008342	CAA	2	6	7259	7264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326618
67	NC_008342	TTC	2	6	7364	7369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114326618
68	NC_008342	CAT	2	6	7485	7490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326618
69	NC_008342	GAA	2	6	7501	7506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326618
70	NC_008342	AGA	2	6	7546	7551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326618
71	NC_008342	CGG	3	9	8280	8288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326619
72	NC_008342	TCA	2	6	8342	8347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326619
73	NC_008342	AAG	2	6	8848	8853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326620
74	NC_008342	TGA	2	6	8916	8921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326620
75	NC_008342	TCA	2	6	9037	9042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326620
76	NC_008342	CAG	2	6	9104	9109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326620
77	NC_008342	TCG	2	6	9188	9193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326620
78	NC_008342	CGG	2	6	9243	9248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326620
79	NC_008342	CAA	2	6	9479	9484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326621
80	NC_008342	GCA	2	6	9512	9517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326621
81	NC_008342	GGC	2	6	9569	9574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326621
82	NC_008342	ATA	2	6	9678	9683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114326621
83	NC_008342	AAC	2	6	9810	9815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326621
84	NC_008342	GCT	2	6	10120	10125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326622
85	NC_008342	AGC	2	6	10217	10222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326622
86	NC_008342	GGC	2	6	10318	10323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326622
87	NC_008342	CAG	2	6	10945	10950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326623
88	NC_008342	CAA	2	6	11531	11536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326624
89	NC_008342	GCT	2	6	11552	11557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326624
90	NC_008342	ACC	2	6	11567	11572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326624
91	NC_008342	ACT	2	6	11703	11708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326624
92	NC_008342	CAT	2	6	11749	11754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326624
93	NC_008342	GCT	2	6	11867	11872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326624
94	NC_008342	ATT	2	6	11993	11998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	114326624
95	NC_008342	AAG	2	6	12698	12703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326625
96	NC_008342	ACC	2	6	12868	12873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326625
97	NC_008342	GAT	2	6	12958	12963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326625
98	NC_008342	AAC	2	6	13180	13185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114326625
99	NC_008342	GCC	2	6	13232	13237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326625
100	NC_008342	AGG	2	6	13256	13261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114326625
101	NC_008342	CGA	2	6	13290	13295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326625
102	NC_008342	AAT	2	6	13408	13413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114326625
103	NC_008342	GAT	2	6	14461	14466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326626
104	NC_008342	CTG	2	6	14505	14510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326626
105	NC_008342	CTT	2	6	14520	14525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114326626
106	NC_008342	CAC	2	6	14532	14537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326626
107	NC_008342	CGA	2	6	14570	14575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326626
108	NC_008342	GTA	2	6	14628	14633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326626
109	NC_008342	GAA	2	6	14673	14678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114326626
110	NC_008342	GCT	2	6	14729	14734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326626
111	NC_008342	CGT	2	6	14834	14839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326626
112	NC_008342	CGC	2	6	14862	14867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114326626
113	NC_008342	GTA	2	6	14877	14882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326626
114	NC_008342	CTC	2	6	14919	14924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114326626
115	NC_008342	TGC	2	6	14929	14934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326626
116	NC_008342	TCG	2	6	14938	14943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326626
117	NC_008342	TGG	2	6	14956	14961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114326626
118	NC_008342	TCG	2	6	14980	14985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326626
119	NC_008342	CAG	2	6	14988	14993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326626
120	NC_008342	CCA	2	6	15017	15022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326626
121	NC_008342	CTT	2	6	15035	15040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114326626
122	NC_008342	TCG	2	6	15041	15046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326626
123	NC_008342	CAG	2	6	15051	15056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326626
124	NC_008342	CCA	2	6	15104	15109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326626
125	NC_008342	GCG	2	6	15138	15143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326626
126	NC_008342	TCG	2	6	15412	15417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326626
127	NC_008342	CTG	2	6	15435	15440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326626
128	NC_008342	TCG	2	6	15445	15450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326626
129	NC_008342	TGC	2	6	15512	15517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326626
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246	NC_008342	CCA	2	6	22645	22650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326629
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249	NC_008342	TGC	2	6	22914	22919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326629
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251	NC_008342	CAC	2	6	22957	22962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326629
252	NC_008342	ATG	2	6	23021	23026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326629
253	NC_008342	ACC	2	6	23042	23047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326629
254	NC_008342	TGC	2	6	23256	23261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326630
255	NC_008342	TCG	2	6	23530	23535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326630
256	NC_008342	CCA	2	6	23599	23604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326630
257	NC_008342	CGG	2	6	23700	23705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326630
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259	NC_008342	GCA	2	6	23771	23776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326630
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264	NC_008342	CCA	2	6	24152	24157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114326630
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369	NC_008342	GGC	2	6	36753	36758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114326643
370	NC_008342	AGC	2	6	36762	36767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326643
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372	NC_008342	GCT	2	6	37041	37046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326644
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374	NC_008342	GAG	2	6	37166	37171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114326644
375	NC_008342	CTG	2	6	37189	37194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326644
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377	NC_008342	TGT	2	6	37412	37417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114326644
378	NC_008342	TTC	2	6	37540	37545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114326644
379	NC_008342	GCT	2	6	37674	37679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114326644
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498	NC_008342	TGT	2	6	50737	50742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114326658
499	NC_008342	TCT	2	6	50788	50793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114326658
500	NC_008342	TAA	2	6	50834	50839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114326658

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