MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid2

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008342	AT	3	6	27	32	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008342	GC	3	6	355	360	0 %	0 %	50 %	50 %	114326612
3	NC_008342	GC	3	6	1316	1321	0 %	0 %	50 %	50 %	114326613
4	NC_008342	TA	3	6	1605	1610	50 %	50 %	0 %	0 %	114326613
5	NC_008342	AG	3	6	2811	2816	50 %	0 %	50 %	0 %	114326613
6	NC_008342	GC	3	6	5458	5463	0 %	0 %	50 %	50 %	114326616
7	NC_008342	GA	3	6	7385	7390	50 %	0 %	50 %	0 %	114326618
8	NC_008342	CG	3	6	7667	7672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008342	GC	3	6	7675	7680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008342	AC	3	6	8215	8220	50 %	0 %	0 %	50 %	114326619
11	NC_008342	CG	3	6	8540	8545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_008342	CA	3	6	9352	9357	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008342	AT	3	6	9444	9449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008342	AT	3	6	9690	9695	50 %	50 %	0 %	0 %	114326621
15	NC_008342	TG	3	6	10402	10407	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008342	AC	3	6	10841	10846	50 %	0 %	0 %	50 %	114326623
17	NC_008342	CG	3	6	11639	11644	0 %	0 %	50 %	50 %	114326624
18	NC_008342	CG	3	6	13340	13345	0 %	0 %	50 %	50 %	114326625
19	NC_008342	AT	3	6	14138	14143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008342	AC	3	6	14432	14437	50 %	0 %	0 %	50 %	114326626
21	NC_008342	GC	3	6	14809	14814	0 %	0 %	50 %	50 %	114326626
22	NC_008342	GC	4	8	15175	15182	0 %	0 %	50 %	50 %	114326626
23	NC_008342	CG	3	6	16049	16054	0 %	0 %	50 %	50 %	114326626
24	NC_008342	GC	3	6	16593	16598	0 %	0 %	50 %	50 %	114326626
25	NC_008342	GC	3	6	17630	17635	0 %	0 %	50 %	50 %	114326627
26	NC_008342	AG	3	6	18403	18408	50 %	0 %	50 %	0 %	114326627
27	NC_008342	GC	3	6	19138	19143	0 %	0 %	50 %	50 %	114326628
28	NC_008342	GC	3	6	19206	19211	0 %	0 %	50 %	50 %	114326628
29	NC_008342	GC	3	6	19227	19232	0 %	0 %	50 %	50 %	114326628
30	NC_008342	GC	3	6	20135	20140	0 %	0 %	50 %	50 %	114326628
31	NC_008342	GC	3	6	20412	20417	0 %	0 %	50 %	50 %	114326628
32	NC_008342	CG	3	6	20418	20423	0 %	0 %	50 %	50 %	114326628
33	NC_008342	GC	3	6	20711	20716	0 %	0 %	50 %	50 %	114326628
34	NC_008342	GC	3	6	20799	20804	0 %	0 %	50 %	50 %	114326628
35	NC_008342	CG	3	6	21026	21031	0 %	0 %	50 %	50 %	114326628
36	NC_008342	CG	4	8	21800	21807	0 %	0 %	50 %	50 %	114326628
37	NC_008342	TA	3	6	22499	22504	50 %	50 %	0 %	0 %	114326629
38	NC_008342	GT	3	6	22678	22683	0 %	50 %	50 %	0 %	114326629
39	NC_008342	GC	3	6	23613	23618	0 %	0 %	50 %	50 %	114326630
40	NC_008342	CG	3	6	24882	24887	0 %	0 %	50 %	50 %	114326631
41	NC_008342	GT	3	6	24993	24998	0 %	50 %	50 %	0 %	114326631
42	NC_008342	TA	3	6	25047	25052	50 %	50 %	0 %	0 %	114326631
43	NC_008342	GC	3	6	25078	25083	0 %	0 %	50 %	50 %	114326631
44	NC_008342	GC	3	6	26333	26338	0 %	0 %	50 %	50 %	114326633
45	NC_008342	AG	3	6	26544	26549	50 %	0 %	50 %	0 %	114326633
46	NC_008342	CT	3	6	27077	27082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008342	CG	3	6	27561	27566	0 %	0 %	50 %	50 %	114326634
48	NC_008342	GA	3	6	28803	28808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008342	AG	3	6	30096	30101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008342	GC	3	6	32659	32664	0 %	0 %	50 %	50 %	114326640
51	NC_008342	GA	3	6	34344	34349	50 %	0 %	50 %	0 %	114326642
52	NC_008342	AG	3	6	34648	34653	50 %	0 %	50 %	0 %	114326642
53	NC_008342	TA	3	6	35276	35281	50 %	50 %	0 %	0 %	114326642
54	NC_008342	AT	3	6	35441	35446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008342	TA	3	6	36214	36219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008342	CG	3	6	37435	37440	0 %	0 %	50 %	50 %	114326644
57	NC_008342	GC	3	6	37910	37915	0 %	0 %	50 %	50 %	114326644
58	NC_008342	AC	3	6	38223	38228	50 %	0 %	0 %	50 %	114326644
59	NC_008342	TG	3	6	38515	38520	0 %	50 %	50 %	0 %	114326645
60	NC_008342	AT	3	6	39242	39247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008342	AT	3	6	39263	39268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008342	AC	3	6	42740	42745	50 %	0 %	0 %	50 %	114326650
63	NC_008342	GT	3	6	43119	43124	0 %	50 %	50 %	0 %	114326650
64	NC_008342	TG	3	6	43804	43809	0 %	50 %	50 %	0 %	114326651
65	NC_008342	GT	3	6	44097	44102	0 %	50 %	50 %	0 %	114326651
66	NC_008342	TG	3	6	44156	44161	0 %	50 %	50 %	0 %	114326651
67	NC_008342	CG	3	6	45269	45274	0 %	0 %	50 %	50 %	114326652
68	NC_008342	AC	3	6	45320	45325	50 %	0 %	0 %	50 %	114326652
69	NC_008342	CG	3	6	45387	45392	0 %	0 %	50 %	50 %	114326652
70	NC_008342	GA	3	6	47504	47509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008342	GA	3	6	47558	47563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008342	AC	3	6	48738	48743	50 %	0 %	0 %	50 %	114326655
73	NC_008342	GC	3	6	49104	49109	0 %	0 %	50 %	50 %	114326656
74	NC_008342	CT	4	8	49123	49130	0 %	50 %	0 %	50 %	114326656
75	NC_008342	GC	3	6	49346	49351	0 %	0 %	50 %	50 %	114326657
76	NC_008342	GT	3	6	50348	50353	0 %	50 %	50 %	0 %	114326658
77	NC_008342	GA	3	6	50651	50656	50 %	0 %	50 %	0 %	114326658
78	NC_008342	CA	3	6	53458	53463	50 %	0 %	0 %	50 %	114326661
79	NC_008342	GC	3	6	54040	54045	0 %	0 %	50 %	50 %	114326662

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.