MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008341	GCCGAC	2	12	504	515	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114326556
2	NC_008341	CGCGGC	2	12	1044	1055	0 %	0 %	50 %	50 %	114326556
3	NC_008341	TTGTGT	2	12	4783	4794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114326559
4	NC_008341	GGGATC	2	12	15405	15416	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114326567
5	NC_008341	GATCAA	2	12	19456	19467	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	114326569
6	NC_008341	ATCTTC	2	12	22018	22029	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	114326572
7	NC_008341	CATTGT	2	12	22617	22628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	114326572
8	NC_008341	TATTTC	2	12	24586	24597	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	114326574
9	NC_008341	TCAATC	2	12	26867	26878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114326575
10	NC_008341	ATTTTT	2	12	27193	27204	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	114326575
11	NC_008341	TAACGA	2	12	29673	29684	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	114326579
12	NC_008341	CTTGCC	2	12	35175	35186	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114326583
13	NC_008341	CACCGT	2	12	41166	41177	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114326588
14	NC_008341	CAAGGT	2	12	41697	41708	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114326589
15	NC_008341	GCGAGG	2	12	43824	43835	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	114326591
16	NC_008341	GACCAG	2	12	43910	43921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114326592
17	NC_008341	GATTCG	2	12	45933	45944	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114326595
18	NC_008341	TAATGG	2	12	48320	48331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114326598
19	NC_008341	AACGCA	2	12	51324	51335	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	114326601
20	NC_008341	GCACCG	4	24	56890	56913	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114326605

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.