MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid1

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008341	GCCAA	2	10	277	286	40 %	0 %	20 %	40 %	114326556
2	NC_008341	ATTCA	2	10	778	787	40 %	40 %	0 %	20 %	114326556
3	NC_008341	CCGGC	2	10	1294	1303	0 %	0 %	40 %	60 %	114326556
4	NC_008341	AATGG	2	10	2878	2887	40 %	20 %	40 %	0 %	114326556
5	NC_008341	TCAGT	2	10	4301	4310	20 %	40 %	20 %	20 %	114326558
6	NC_008341	GCTTT	2	10	4313	4322	0 %	60 %	20 %	20 %	114326558
7	NC_008341	AAGCA	2	10	4768	4777	60 %	0 %	20 %	20 %	114326559
8	NC_008341	GCCTG	2	10	7020	7029	0 %	20 %	40 %	40 %	114326561
9	NC_008341	ATTCC	2	10	8409	8418	20 %	40 %	0 %	40 %	114326562
10	NC_008341	CGCGC	2	10	10241	10250	0 %	0 %	40 %	60 %	114326565
11	NC_008341	CGTGC	2	10	13807	13816	0 %	20 %	40 %	40 %	114326567
12	NC_008341	ACACG	2	10	15349	15358	40 %	0 %	20 %	40 %	114326567
13	NC_008341	GCAGT	2	10	16918	16927	20 %	20 %	40 %	20 %	114326568
14	NC_008341	ATCGC	2	10	17162	17171	20 %	20 %	20 %	40 %	114326568
15	NC_008341	CTGTT	2	10	26519	26528	0 %	60 %	20 %	20 %	114326574
16	NC_008341	AAAGA	2	10	27548	27557	80 %	0 %	20 %	0 %	114326576
17	NC_008341	CTTTG	2	10	28207	28216	0 %	60 %	20 %	20 %	114326577
18	NC_008341	ATTGA	2	10	31465	31474	40 %	40 %	20 %	0 %	114326581
19	NC_008341	GCCGT	2	10	37007	37016	0 %	20 %	40 %	40 %	114326584
20	NC_008341	GCGAA	2	10	37520	37529	40 %	0 %	40 %	20 %	114326584
21	NC_008341	AGCGC	2	10	38430	38439	20 %	0 %	40 %	40 %	114326584
22	NC_008341	CGGTT	2	10	41068	41077	0 %	40 %	40 %	20 %	114326588
23	NC_008341	TGGCG	2	10	42533	42542	0 %	20 %	60 %	20 %	114326589
24	NC_008341	CTACC	2	10	47055	47064	20 %	20 %	0 %	60 %	114326597
25	NC_008341	TTCAC	2	10	47404	47413	20 %	40 %	0 %	40 %	114326597
26	NC_008341	TCTCT	2	10	54206	54215	0 %	60 %	0 %	40 %	114326603
27	NC_008341	TTGAT	2	10	54803	54812	20 %	60 %	20 %	0 %	114326604
28	NC_008341	GGCAC	2	10	55611	55620	20 %	0 %	40 %	40 %	114326605
29	NC_008341	TCGGA	2	10	56221	56230	20 %	20 %	40 %	20 %	114326605
30	NC_008341	GCAGG	2	10	56456	56465	20 %	0 %	60 %	20 %	114326605
31	NC_008341	ACGCC	2	10	56938	56947	20 %	0 %	20 %	60 %	114326605
32	NC_008341	TGAAG	2	10	57029	57038	40 %	20 %	40 %	0 %	114326605
33	NC_008341	AAAGC	2	10	57111	57120	60 %	0 %	20 %	20 %	114326605
34	NC_008341	AAGCG	2	10	57695	57704	40 %	0 %	40 %	20 %	114326605
35	NC_008341	CCATG	2	10	60167	60176	20 %	20 %	20 %	40 %	114326608

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.