MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid1

Total Repeats: 176

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008341	GGCG	2	8	50	57	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008341	GATG	2	8	1424	1431	25 %	25 %	50 %	0 %	114326556
3	NC_008341	CATC	2	8	2435	2442	25 %	25 %	0 %	50 %	114326556
4	NC_008341	GCTG	2	8	2774	2781	0 %	25 %	50 %	25 %	114326556
5	NC_008341	TGCC	2	8	3530	3537	0 %	25 %	25 %	50 %	114326557
6	NC_008341	AAAC	2	8	4023	4030	75 %	0 %	0 %	25 %	114326558
7	NC_008341	CCAT	2	8	4367	4374	25 %	25 %	0 %	50 %	114326558
8	NC_008341	TAAA	2	8	4472	4479	75 %	25 %	0 %	0 %	114326558
9	NC_008341	ATTT	2	8	4655	4662	25 %	75 %	0 %	0 %	114326558
10	NC_008341	TTCA	2	8	5125	5132	25 %	50 %	0 %	25 %	114326559
11	NC_008341	TGTT	2	8	5630	5637	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008341	GGAT	2	8	5742	5749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008341	GGCG	2	8	6374	6381	0 %	0 %	75 %	25 %	114326560
14	NC_008341	GTGA	2	8	6449	6456	25 %	25 %	50 %	0 %	114326560
15	NC_008341	AAAG	2	8	6579	6586	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008341	AAAG	2	8	6588	6595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008341	TATT	2	8	6648	6655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008341	TCTA	2	8	6795	6802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008341	GCTG	2	8	7121	7128	0 %	25 %	50 %	25 %	114326561
20	NC_008341	ATCC	2	8	7301	7308	25 %	25 %	0 %	50 %	114326561
21	NC_008341	ATAA	2	8	7311	7318	75 %	25 %	0 %	0 %	114326561
22	NC_008341	CAAC	2	8	7327	7334	50 %	0 %	0 %	50 %	114326561
23	NC_008341	ATTA	2	8	7644	7651	50 %	50 %	0 %	0 %	114326561
24	NC_008341	TTAT	2	8	7768	7775	25 %	75 %	0 %	0 %	114326561
25	NC_008341	CGTA	2	8	7779	7786	25 %	25 %	25 %	25 %	114326561
26	NC_008341	GGAG	2	8	8059	8066	25 %	0 %	75 %	0 %	114326561
27	NC_008341	AATA	2	8	8184	8191	75 %	25 %	0 %	0 %	114326561
28	NC_008341	ATTC	2	8	8202	8209	25 %	50 %	0 %	25 %	114326561
29	NC_008341	AGCA	2	8	9581	9588	50 %	0 %	25 %	25 %	114326564
30	NC_008341	AGCG	2	8	9627	9634	25 %	0 %	50 %	25 %	114326564
31	NC_008341	GACC	2	8	9645	9652	25 %	0 %	25 %	50 %	114326564
32	NC_008341	AACC	2	8	9873	9880	50 %	0 %	0 %	50 %	114326564
33	NC_008341	GGGC	2	8	10370	10377	0 %	0 %	75 %	25 %	114326565
34	NC_008341	TCGA	2	8	10488	10495	25 %	25 %	25 %	25 %	114326565
35	NC_008341	CCGG	2	8	10883	10890	0 %	0 %	50 %	50 %	114326565
36	NC_008341	ATGT	2	8	11285	11292	25 %	50 %	25 %	0 %	114326565
37	NC_008341	ACCA	2	8	11499	11506	50 %	0 %	0 %	50 %	114326565
38	NC_008341	GTCG	2	8	11939	11946	0 %	25 %	50 %	25 %	114326566
39	NC_008341	CTGT	2	8	12183	12190	0 %	50 %	25 %	25 %	114326566
40	NC_008341	GCCG	2	8	12229	12236	0 %	0 %	50 %	50 %	114326566
41	NC_008341	CTGC	2	8	13099	13106	0 %	25 %	25 %	50 %	114326567
42	NC_008341	CACC	2	8	13498	13505	25 %	0 %	0 %	75 %	114326567
43	NC_008341	GGCG	2	8	13564	13571	0 %	0 %	75 %	25 %	114326567
44	NC_008341	CTTC	2	8	14515	14522	0 %	50 %	0 %	50 %	114326567
45	NC_008341	GAAG	2	8	15879	15886	50 %	0 %	50 %	0 %	114326568
46	NC_008341	TGGC	2	8	15906	15913	0 %	25 %	50 %	25 %	114326568
47	NC_008341	GGCA	2	8	16382	16389	25 %	0 %	50 %	25 %	114326568
48	NC_008341	CAAT	2	8	16714	16721	50 %	25 %	0 %	25 %	114326568
49	NC_008341	GCGG	2	8	16816	16823	0 %	0 %	75 %	25 %	114326568
50	NC_008341	TCGG	2	8	16880	16887	0 %	25 %	50 %	25 %	114326568
51	NC_008341	ACCG	2	8	17249	17256	25 %	0 %	25 %	50 %	114326568
52	NC_008341	GCGG	2	8	17301	17308	0 %	0 %	75 %	25 %	114326568
53	NC_008341	AGGC	2	8	18363	18370	25 %	0 %	50 %	25 %	114326569
54	NC_008341	TCGC	2	8	18391	18398	0 %	25 %	25 %	50 %	114326569
55	NC_008341	ACCA	2	8	18578	18585	50 %	0 %	0 %	50 %	114326569
56	NC_008341	GAAG	2	8	18841	18848	50 %	0 %	50 %	0 %	114326569
57	NC_008341	GGAA	2	8	18967	18974	50 %	0 %	50 %	0 %	114326569
58	NC_008341	GATG	2	8	20209	20216	25 %	25 %	50 %	0 %	114326569
59	NC_008341	GTTT	2	8	20886	20893	0 %	75 %	25 %	0 %	114326570
60	NC_008341	CGCT	2	8	21316	21323	0 %	25 %	25 %	50 %	114326571
61	NC_008341	ATCA	2	8	21403	21410	50 %	25 %	0 %	25 %	114326571
62	NC_008341	TGTC	2	8	21485	21492	0 %	50 %	25 %	25 %	114326571
63	NC_008341	GTGC	2	8	21515	21522	0 %	25 %	50 %	25 %	114326571
64	NC_008341	CTGA	2	8	21906	21913	25 %	25 %	25 %	25 %	114326572
65	NC_008341	GTTG	2	8	22438	22445	0 %	50 %	50 %	0 %	114326572
66	NC_008341	AATC	2	8	22663	22670	50 %	25 %	0 %	25 %	114326572
67	NC_008341	ATAA	2	8	22772	22779	75 %	25 %	0 %	0 %	114326572
68	NC_008341	AAAC	2	8	23082	23089	75 %	0 %	0 %	25 %	114326572
69	NC_008341	CAAC	2	8	23328	23335	50 %	0 %	0 %	50 %	114326572
70	NC_008341	CCCA	2	8	23979	23986	25 %	0 %	0 %	75 %	114326573
71	NC_008341	ACCA	2	8	24105	24112	50 %	0 %	0 %	50 %	114326573
72	NC_008341	TATT	2	8	24200	24207	25 %	75 %	0 %	0 %	114326573
73	NC_008341	CATG	2	8	24882	24889	25 %	25 %	25 %	25 %	114326574
74	NC_008341	ATCC	2	8	25389	25396	25 %	25 %	0 %	50 %	114326574
75	NC_008341	CCGG	2	8	25568	25575	0 %	0 %	50 %	50 %	114326574
76	NC_008341	GTAT	2	8	25649	25656	25 %	50 %	25 %	0 %	114326574
77	NC_008341	CATG	2	8	25809	25816	25 %	25 %	25 %	25 %	114326574
78	NC_008341	TCTG	2	8	25883	25890	0 %	50 %	25 %	25 %	114326574
79	NC_008341	ATCC	2	8	26064	26071	25 %	25 %	0 %	50 %	114326574
80	NC_008341	GTAC	2	8	26284	26291	25 %	25 %	25 %	25 %	114326574
81	NC_008341	TTCC	2	8	26292	26299	0 %	50 %	0 %	50 %	114326574
82	NC_008341	ATCA	2	8	26551	26558	50 %	25 %	0 %	25 %	114326574
83	NC_008341	AGCA	2	8	26854	26861	50 %	0 %	25 %	25 %	114326574
84	NC_008341	AACC	2	8	27572	27579	50 %	0 %	0 %	50 %	114326576
85	NC_008341	TTAA	2	8	27672	27679	50 %	50 %	0 %	0 %	114326577
86	NC_008341	CCAC	2	8	28480	28487	25 %	0 %	0 %	75 %	114326577
87	NC_008341	AAAT	2	8	30028	30035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008341	TCAT	2	8	30608	30615	25 %	50 %	0 %	25 %	114326580
89	NC_008341	TGTT	2	8	30965	30972	0 %	75 %	25 %	0 %	114326580
90	NC_008341	AGCA	2	8	30990	30997	50 %	0 %	25 %	25 %	114326580
91	NC_008341	GCTG	2	8	31136	31143	0 %	25 %	50 %	25 %	114326580
92	NC_008341	AATT	2	8	31409	31416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008341	CCAT	2	8	31726	31733	25 %	25 %	0 %	50 %	114326582
94	NC_008341	CTGA	2	8	32684	32691	25 %	25 %	25 %	25 %	114326583
95	NC_008341	TTGG	2	8	33078	33085	0 %	50 %	50 %	0 %	114326583
96	NC_008341	CTTT	2	8	35692	35699	0 %	75 %	0 %	25 %	114326583
97	NC_008341	TGTT	2	8	35766	35773	0 %	75 %	25 %	0 %	114326583
98	NC_008341	CTTG	2	8	35860	35867	0 %	50 %	25 %	25 %	114326583
99	NC_008341	AGGC	2	8	36268	36275	25 %	0 %	50 %	25 %	114326583
100	NC_008341	TTTG	2	8	36376	36383	0 %	75 %	25 %	0 %	114326583
101	NC_008341	ATTA	2	8	36809	36816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008341	CTTG	2	8	37359	37366	0 %	50 %	25 %	25 %	114326584
103	NC_008341	GTCC	2	8	37718	37725	0 %	25 %	25 %	50 %	114326584
104	NC_008341	TCAA	2	8	38825	38832	50 %	25 %	0 %	25 %	114326584
105	NC_008341	GCCA	2	8	39215	39222	25 %	0 %	25 %	50 %	114326584
106	NC_008341	TTTC	2	8	39969	39976	0 %	75 %	0 %	25 %	114326585
107	NC_008341	TCAA	2	8	40457	40464	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008341	GGCT	2	8	40791	40798	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008341	ACAA	2	8	40854	40861	75 %	0 %	0 %	25 %	114326587
110	NC_008341	GCCG	2	8	40910	40917	0 %	0 %	50 %	50 %	114326587
111	NC_008341	CGGC	2	8	41792	41799	0 %	0 %	50 %	50 %	114326589
112	NC_008341	GCCG	2	8	41856	41863	0 %	0 %	50 %	50 %	114326589
113	NC_008341	CTGG	2	8	42105	42112	0 %	25 %	50 %	25 %	114326589
114	NC_008341	ACGG	2	8	42444	42451	25 %	0 %	50 %	25 %	114326589
115	NC_008341	GTCC	2	8	42815	42822	0 %	25 %	25 %	50 %	114326589
116	NC_008341	GGCC	2	8	42932	42939	0 %	0 %	50 %	50 %	114326589
117	NC_008341	CAGC	2	8	43343	43350	25 %	0 %	25 %	50 %	114326590
118	NC_008341	AATT	2	8	44298	44305	50 %	50 %	0 %	0 %	114326593
119	NC_008341	CTTG	2	8	45008	45015	0 %	50 %	25 %	25 %	114326594
120	NC_008341	AAAT	2	8	45283	45290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008341	AGTA	2	8	45376	45383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008341	TGTT	2	8	45774	45781	0 %	75 %	25 %	0 %	114326595
123	NC_008341	GGAT	2	8	45948	45955	25 %	25 %	50 %	0 %	114326595
124	NC_008341	TGGA	2	8	46457	46464	25 %	25 %	50 %	0 %	114326596
125	NC_008341	GATG	2	8	46678	46685	25 %	25 %	50 %	0 %	114326597
126	NC_008341	CAGA	2	8	47036	47043	50 %	0 %	25 %	25 %	114326597
127	NC_008341	TCAG	2	8	47168	47175	25 %	25 %	25 %	25 %	114326597
128	NC_008341	AAAG	2	8	47325	47332	75 %	0 %	25 %	0 %	114326597
129	NC_008341	GCCA	2	8	47357	47364	25 %	0 %	25 %	50 %	114326597
130	NC_008341	GCAA	2	8	47432	47439	50 %	0 %	25 %	25 %	114326597
131	NC_008341	TATT	2	8	47465	47472	25 %	75 %	0 %	0 %	114326597
132	NC_008341	ATCA	2	8	47511	47518	50 %	25 %	0 %	25 %	114326597
133	NC_008341	TTGT	2	8	47894	47901	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008341	ATCA	2	8	48405	48412	50 %	25 %	0 %	25 %	114326598
135	NC_008341	TTTC	2	8	48943	48950	0 %	75 %	0 %	25 %	114326599
136	NC_008341	ATTT	2	8	49398	49405	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008341	CCTG	2	8	50388	50395	0 %	25 %	25 %	50 %	114326601
138	NC_008341	CATC	2	8	50477	50484	25 %	25 %	0 %	50 %	114326601
139	NC_008341	GCTA	2	8	50800	50807	25 %	25 %	25 %	25 %	114326601
140	NC_008341	CAGT	2	8	50959	50966	25 %	25 %	25 %	25 %	114326601
141	NC_008341	TGAC	2	8	50994	51001	25 %	25 %	25 %	25 %	114326601
142	NC_008341	GTAT	2	8	51052	51059	25 %	50 %	25 %	0 %	114326601
143	NC_008341	AGAA	3	12	51140	51151	75 %	0 %	25 %	0 %	114326601
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.