MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid1

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008341	GATG	2	8	1424	1431	25 %	25 %	50 %	0 %	114326556
2	NC_008341	CATC	2	8	2435	2442	25 %	25 %	0 %	50 %	114326556
3	NC_008341	GCTG	2	8	2774	2781	0 %	25 %	50 %	25 %	114326556
4	NC_008341	TGCC	2	8	3530	3537	0 %	25 %	25 %	50 %	114326557
5	NC_008341	AAAC	2	8	4023	4030	75 %	0 %	0 %	25 %	114326558
6	NC_008341	CCAT	2	8	4367	4374	25 %	25 %	0 %	50 %	114326558
7	NC_008341	TAAA	2	8	4472	4479	75 %	25 %	0 %	0 %	114326558
8	NC_008341	ATTT	2	8	4655	4662	25 %	75 %	0 %	0 %	114326558
9	NC_008341	TTCA	2	8	5125	5132	25 %	50 %	0 %	25 %	114326559
10	NC_008341	GGCG	2	8	6374	6381	0 %	0 %	75 %	25 %	114326560
11	NC_008341	GTGA	2	8	6449	6456	25 %	25 %	50 %	0 %	114326560
12	NC_008341	GCTG	2	8	7121	7128	0 %	25 %	50 %	25 %	114326561
13	NC_008341	ATCC	2	8	7301	7308	25 %	25 %	0 %	50 %	114326561
14	NC_008341	ATAA	2	8	7311	7318	75 %	25 %	0 %	0 %	114326561
15	NC_008341	CAAC	2	8	7327	7334	50 %	0 %	0 %	50 %	114326561
16	NC_008341	ATTA	2	8	7644	7651	50 %	50 %	0 %	0 %	114326561
17	NC_008341	TTAT	2	8	7768	7775	25 %	75 %	0 %	0 %	114326561
18	NC_008341	CGTA	2	8	7779	7786	25 %	25 %	25 %	25 %	114326561
19	NC_008341	GGAG	2	8	8059	8066	25 %	0 %	75 %	0 %	114326561
20	NC_008341	AATA	2	8	8184	8191	75 %	25 %	0 %	0 %	114326561
21	NC_008341	ATTC	2	8	8202	8209	25 %	50 %	0 %	25 %	114326561
22	NC_008341	AGCA	2	8	9581	9588	50 %	0 %	25 %	25 %	114326564
23	NC_008341	AGCG	2	8	9627	9634	25 %	0 %	50 %	25 %	114326564
24	NC_008341	GACC	2	8	9645	9652	25 %	0 %	25 %	50 %	114326564
25	NC_008341	AACC	2	8	9873	9880	50 %	0 %	0 %	50 %	114326564
26	NC_008341	GGGC	2	8	10370	10377	0 %	0 %	75 %	25 %	114326565
27	NC_008341	TCGA	2	8	10488	10495	25 %	25 %	25 %	25 %	114326565
28	NC_008341	CCGG	2	8	10883	10890	0 %	0 %	50 %	50 %	114326565
29	NC_008341	ATGT	2	8	11285	11292	25 %	50 %	25 %	0 %	114326565
30	NC_008341	ACCA	2	8	11499	11506	50 %	0 %	0 %	50 %	114326565
31	NC_008341	GTCG	2	8	11939	11946	0 %	25 %	50 %	25 %	114326566
32	NC_008341	CTGT	2	8	12183	12190	0 %	50 %	25 %	25 %	114326566
33	NC_008341	GCCG	2	8	12229	12236	0 %	0 %	50 %	50 %	114326566
34	NC_008341	CTGC	2	8	13099	13106	0 %	25 %	25 %	50 %	114326567
35	NC_008341	CACC	2	8	13498	13505	25 %	0 %	0 %	75 %	114326567
36	NC_008341	GGCG	2	8	13564	13571	0 %	0 %	75 %	25 %	114326567
37	NC_008341	CTTC	2	8	14515	14522	0 %	50 %	0 %	50 %	114326567
38	NC_008341	GAAG	2	8	15879	15886	50 %	0 %	50 %	0 %	114326568
39	NC_008341	TGGC	2	8	15906	15913	0 %	25 %	50 %	25 %	114326568
40	NC_008341	GGCA	2	8	16382	16389	25 %	0 %	50 %	25 %	114326568
41	NC_008341	CAAT	2	8	16714	16721	50 %	25 %	0 %	25 %	114326568
42	NC_008341	GCGG	2	8	16816	16823	0 %	0 %	75 %	25 %	114326568
43	NC_008341	TCGG	2	8	16880	16887	0 %	25 %	50 %	25 %	114326568
44	NC_008341	ACCG	2	8	17249	17256	25 %	0 %	25 %	50 %	114326568
45	NC_008341	GCGG	2	8	17301	17308	0 %	0 %	75 %	25 %	114326568
46	NC_008341	AGGC	2	8	18363	18370	25 %	0 %	50 %	25 %	114326569
47	NC_008341	TCGC	2	8	18391	18398	0 %	25 %	25 %	50 %	114326569
48	NC_008341	ACCA	2	8	18578	18585	50 %	0 %	0 %	50 %	114326569
49	NC_008341	GAAG	2	8	18841	18848	50 %	0 %	50 %	0 %	114326569
50	NC_008341	GGAA	2	8	18967	18974	50 %	0 %	50 %	0 %	114326569
51	NC_008341	GATG	2	8	20209	20216	25 %	25 %	50 %	0 %	114326569
52	NC_008341	GTTT	2	8	20886	20893	0 %	75 %	25 %	0 %	114326570
53	NC_008341	CGCT	2	8	21316	21323	0 %	25 %	25 %	50 %	114326571
54	NC_008341	ATCA	2	8	21403	21410	50 %	25 %	0 %	25 %	114326571
55	NC_008341	TGTC	2	8	21485	21492	0 %	50 %	25 %	25 %	114326571
56	NC_008341	GTGC	2	8	21515	21522	0 %	25 %	50 %	25 %	114326571
57	NC_008341	CTGA	2	8	21906	21913	25 %	25 %	25 %	25 %	114326572
58	NC_008341	GTTG	2	8	22438	22445	0 %	50 %	50 %	0 %	114326572
59	NC_008341	AATC	2	8	22663	22670	50 %	25 %	0 %	25 %	114326572
60	NC_008341	ATAA	2	8	22772	22779	75 %	25 %	0 %	0 %	114326572
61	NC_008341	AAAC	2	8	23082	23089	75 %	0 %	0 %	25 %	114326572
62	NC_008341	CAAC	2	8	23328	23335	50 %	0 %	0 %	50 %	114326572
63	NC_008341	CCCA	2	8	23979	23986	25 %	0 %	0 %	75 %	114326573
64	NC_008341	ACCA	2	8	24105	24112	50 %	0 %	0 %	50 %	114326573
65	NC_008341	TATT	2	8	24200	24207	25 %	75 %	0 %	0 %	114326573
66	NC_008341	CATG	2	8	24882	24889	25 %	25 %	25 %	25 %	114326574
67	NC_008341	ATCC	2	8	25389	25396	25 %	25 %	0 %	50 %	114326574
68	NC_008341	CCGG	2	8	25568	25575	0 %	0 %	50 %	50 %	114326574
69	NC_008341	GTAT	2	8	25649	25656	25 %	50 %	25 %	0 %	114326574
70	NC_008341	CATG	2	8	25809	25816	25 %	25 %	25 %	25 %	114326574
71	NC_008341	TCTG	2	8	25883	25890	0 %	50 %	25 %	25 %	114326574
72	NC_008341	ATCC	2	8	26064	26071	25 %	25 %	0 %	50 %	114326574
73	NC_008341	GTAC	2	8	26284	26291	25 %	25 %	25 %	25 %	114326574
74	NC_008341	TTCC	2	8	26292	26299	0 %	50 %	0 %	50 %	114326574
75	NC_008341	ATCA	2	8	26551	26558	50 %	25 %	0 %	25 %	114326574
76	NC_008341	AGCA	2	8	26854	26861	50 %	0 %	25 %	25 %	114326574
77	NC_008341	AACC	2	8	27572	27579	50 %	0 %	0 %	50 %	114326576
78	NC_008341	TTAA	2	8	27672	27679	50 %	50 %	0 %	0 %	114326577
79	NC_008341	CCAC	2	8	28480	28487	25 %	0 %	0 %	75 %	114326577
80	NC_008341	TCAT	2	8	30608	30615	25 %	50 %	0 %	25 %	114326580
81	NC_008341	TGTT	2	8	30965	30972	0 %	75 %	25 %	0 %	114326580
82	NC_008341	AGCA	2	8	30990	30997	50 %	0 %	25 %	25 %	114326580
83	NC_008341	GCTG	2	8	31136	31143	0 %	25 %	50 %	25 %	114326580
84	NC_008341	CCAT	2	8	31726	31733	25 %	25 %	0 %	50 %	114326582
85	NC_008341	CTGA	2	8	32684	32691	25 %	25 %	25 %	25 %	114326583
86	NC_008341	TTGG	2	8	33078	33085	0 %	50 %	50 %	0 %	114326583
87	NC_008341	CTTT	2	8	35692	35699	0 %	75 %	0 %	25 %	114326583
88	NC_008341	TGTT	2	8	35766	35773	0 %	75 %	25 %	0 %	114326583
89	NC_008341	CTTG	2	8	35860	35867	0 %	50 %	25 %	25 %	114326583
90	NC_008341	AGGC	2	8	36268	36275	25 %	0 %	50 %	25 %	114326583
91	NC_008341	TTTG	2	8	36376	36383	0 %	75 %	25 %	0 %	114326583
92	NC_008341	CTTG	2	8	37359	37366	0 %	50 %	25 %	25 %	114326584
93	NC_008341	GTCC	2	8	37718	37725	0 %	25 %	25 %	50 %	114326584
94	NC_008341	TCAA	2	8	38825	38832	50 %	25 %	0 %	25 %	114326584
95	NC_008341	GCCA	2	8	39215	39222	25 %	0 %	25 %	50 %	114326584
96	NC_008341	TTTC	2	8	39969	39976	0 %	75 %	0 %	25 %	114326585
97	NC_008341	ACAA	2	8	40854	40861	75 %	0 %	0 %	25 %	114326587
98	NC_008341	GCCG	2	8	40910	40917	0 %	0 %	50 %	50 %	114326587
99	NC_008341	CGGC	2	8	41792	41799	0 %	0 %	50 %	50 %	114326589
100	NC_008341	GCCG	2	8	41856	41863	0 %	0 %	50 %	50 %	114326589
101	NC_008341	CTGG	2	8	42105	42112	0 %	25 %	50 %	25 %	114326589
102	NC_008341	ACGG	2	8	42444	42451	25 %	0 %	50 %	25 %	114326589
103	NC_008341	GTCC	2	8	42815	42822	0 %	25 %	25 %	50 %	114326589
104	NC_008341	GGCC	2	8	42932	42939	0 %	0 %	50 %	50 %	114326589
105	NC_008341	CAGC	2	8	43343	43350	25 %	0 %	25 %	50 %	114326590
106	NC_008341	AATT	2	8	44298	44305	50 %	50 %	0 %	0 %	114326593
107	NC_008341	CTTG	2	8	45008	45015	0 %	50 %	25 %	25 %	114326594
108	NC_008341	TGTT	2	8	45774	45781	0 %	75 %	25 %	0 %	114326595
109	NC_008341	GGAT	2	8	45948	45955	25 %	25 %	50 %	0 %	114326595
110	NC_008341	TGGA	2	8	46457	46464	25 %	25 %	50 %	0 %	114326596
111	NC_008341	GATG	2	8	46678	46685	25 %	25 %	50 %	0 %	114326597
112	NC_008341	CAGA	2	8	47036	47043	50 %	0 %	25 %	25 %	114326597
113	NC_008341	TCAG	2	8	47168	47175	25 %	25 %	25 %	25 %	114326597
114	NC_008341	AAAG	2	8	47325	47332	75 %	0 %	25 %	0 %	114326597
115	NC_008341	GCCA	2	8	47357	47364	25 %	0 %	25 %	50 %	114326597
116	NC_008341	GCAA	2	8	47432	47439	50 %	0 %	25 %	25 %	114326597
117	NC_008341	TATT	2	8	47465	47472	25 %	75 %	0 %	0 %	114326597
118	NC_008341	ATCA	2	8	47511	47518	50 %	25 %	0 %	25 %	114326597
119	NC_008341	ATCA	2	8	48405	48412	50 %	25 %	0 %	25 %	114326598
120	NC_008341	TTTC	2	8	48943	48950	0 %	75 %	0 %	25 %	114326599
121	NC_008341	CCTG	2	8	50388	50395	0 %	25 %	25 %	50 %	114326601
122	NC_008341	CATC	2	8	50477	50484	25 %	25 %	0 %	50 %	114326601
123	NC_008341	GCTA	2	8	50800	50807	25 %	25 %	25 %	25 %	114326601
124	NC_008341	CAGT	2	8	50959	50966	25 %	25 %	25 %	25 %	114326601
125	NC_008341	TGAC	2	8	50994	51001	25 %	25 %	25 %	25 %	114326601
126	NC_008341	GTAT	2	8	51052	51059	25 %	50 %	25 %	0 %	114326601
127	NC_008341	AGAA	3	12	51140	51151	75 %	0 %	25 %	0 %	114326601
128	NC_008341	AGAA	2	8	51299	51306	75 %	0 %	25 %	0 %	114326601
129	NC_008341	AGCA	2	8	52135	52142	50 %	0 %	25 %	25 %	114326601
130	NC_008341	CAGG	2	8	52174	52181	25 %	0 %	50 %	25 %	114326601
131	NC_008341	ACTG	2	8	53022	53029	25 %	25 %	25 %	25 %	114326602
132	NC_008341	GTTT	2	8	53189	53196	0 %	75 %	25 %	0 %	114326602
133	NC_008341	AAAG	2	8	54129	54136	75 %	0 %	25 %	0 %	114326602
134	NC_008341	GGTT	2	8	54272	54279	0 %	50 %	50 %	0 %	114326603
135	NC_008341	ATCA	2	8	54347	54354	50 %	25 %	0 %	25 %	114326603
136	NC_008341	CTTA	2	8	54416	54423	25 %	50 %	0 %	25 %	114326603
137	NC_008341	AGCA	2	8	54706	54713	50 %	0 %	25 %	25 %	114326603
138	NC_008341	AGCA	2	8	55136	55143	50 %	0 %	25 %	25 %	114326604
139	NC_008341	AATG	2	8	55317	55324	50 %	25 %	25 %	0 %	114326604
140	NC_008341	TGGC	2	8	55707	55714	0 %	25 %	50 %	25 %	114326605
141	NC_008341	ACAG	2	8	56091	56098	50 %	0 %	25 %	25 %	114326605
142	NC_008341	CCGG	2	8	56990	56997	0 %	0 %	50 %	50 %	114326605
143	NC_008341	GCGA	2	8	57041	57048	25 %	0 %	50 %	25 %	114326605
144	NC_008341	GCCG	2	8	57329	57336	0 %	0 %	50 %	50 %	114326605
145	NC_008341	ATGG	2	8	57471	57478	25 %	25 %	50 %	0 %	114326605
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153	NC_008341	CGTC	2	8	64064	64071	0 %	25 %	25 %	50 %	114326610

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.