MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid1

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008341	CCG	2	6	24	29	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_008341	ATT	2	6	92	97	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008341	GGC	2	6	110	115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008341	GCA	2	6	125	130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008341	GGC	2	6	3217	3222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008341	ATT	2	6	3751	3756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008341	TAA	2	6	5560	5565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008341	TAG	2	6	5566	5571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008341	TAC	2	6	5578	5583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008341	TAT	3	9	5584	5592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008341	AGA	2	6	5609	5614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008341	ATT	2	6	5820	5825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008341	TAA	2	6	5830	5835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008341	TAA	2	6	6621	6626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008341	ATT	2	6	6728	6733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008341	ACG	2	6	6833	6838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008341	AAG	2	6	6873	6878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008341	GCT	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008341	ATT	2	6	8295	8300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008341	TGA	2	6	9427	9432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008341	GTT	2	6	9456	9461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008341	AAT	2	6	20407	20412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008341	ATC	2	6	21819	21824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008341	CTG	2	6	23403	23408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008341	AGT	2	6	23477	23482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008341	GCT	2	6	23499	23504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008341	TCG	2	6	23557	23562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008341	ATA	2	6	23564	23569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008341	GCA	2	6	23589	23594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008341	AAT	2	6	28632	28637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008341	TAT	2	6	28682	28687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008341	TAC	2	6	29022	29027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_008341	GCA	2	6	30463	30468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008341	TTA	2	6	30587	30592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008341	TTA	2	6	31421	31426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008341	TTA	2	6	31431	31436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008341	ACA	2	6	32088	32093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008341	TGA	2	6	36711	36716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008341	GGA	2	6	36825	36830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008341	GTC	2	6	36838	36843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_008341	CTC	2	6	40750	40755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_008341	CCT	2	6	41413	41418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_008341	TTA	2	6	45202	45207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008341	GCT	2	6	45349	45354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_008341	AAG	2	6	47885	47890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008341	GTC	2	6	49171	49176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008341	GCG	2	6	49187	49192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008341	GTT	3	9	49244	49252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008341	CCT	2	6	49501	49506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_008341	ATT	2	6	49557	49562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008341	ATA	2	6	49637	49642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008341	ATA	2	6	49647	49652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008341	GAG	2	6	49786	49791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008341	ATG	2	6	58921	58926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008341	ATA	2	6	58929	58934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008341	GTT	2	6	59912	59917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008341	CTT	2	6	59931	59936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008341	CAA	2	6	60244	60249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008341	GCC	2	6	60353	60358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_008341	CCG	2	6	60535	60540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_008341	TTG	2	6	60714	60719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008341	GAG	2	6	60751	60756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008341	ATA	2	6	62377	62382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008341	GAA	2	6	62407	62412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008341	TGC	2	6	62439	62444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008341	GAC	2	6	62739	62744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008341	TCA	2	6	62883	62888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008341	ATG	2	6	62903	62908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008341	AAG	2	6	62910	62915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008341	GTT	2	6	63052	63057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008341	GGA	2	6	64383	64388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008341	CAT	2	6	64452	64457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008341	CAG	2	6	64506	64511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008341	GCC	2	6	64605	64610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_008341	CTG	2	6	64990	64995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008341	ACC	2	6	65059	65064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.