MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas eutropha C91 plasmid1

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008341	AT	3	6	4494	4499	50 %	50 %	0 %	0 %	114326558
2	NC_008341	CT	3	6	5353	5358	0 %	50 %	0 %	50 %	114326559
3	NC_008341	AC	3	6	6123	6128	50 %	0 %	0 %	50 %	114326560
4	NC_008341	AG	3	6	8065	8070	50 %	0 %	50 %	0 %	114326561
5	NC_008341	CG	3	6	8827	8832	0 %	0 %	50 %	50 %	114326563
6	NC_008341	CT	3	6	9118	9123	0 %	50 %	0 %	50 %	114326563
7	NC_008341	GC	3	6	9727	9732	0 %	0 %	50 %	50 %	114326564
8	NC_008341	TA	3	6	9758	9763	50 %	50 %	0 %	0 %	114326564
9	NC_008341	AC	3	6	9812	9817	50 %	0 %	0 %	50 %	114326564
10	NC_008341	GC	3	6	9922	9927	0 %	0 %	50 %	50 %	114326564
11	NC_008341	GC	3	6	11192	11197	0 %	0 %	50 %	50 %	114326565
12	NC_008341	AC	3	6	12127	12132	50 %	0 %	0 %	50 %	114326566
13	NC_008341	AT	3	6	12305	12310	50 %	50 %	0 %	0 %	114326566
14	NC_008341	CG	4	8	13003	13010	0 %	0 %	50 %	50 %	114326567
15	NC_008341	CG	3	6	13779	13784	0 %	0 %	50 %	50 %	114326567
16	NC_008341	GC	3	6	14006	14011	0 %	0 %	50 %	50 %	114326567
17	NC_008341	GC	3	6	14094	14099	0 %	0 %	50 %	50 %	114326567
18	NC_008341	GC	3	6	14386	14391	0 %	0 %	50 %	50 %	114326567
19	NC_008341	GC	3	6	14393	14398	0 %	0 %	50 %	50 %	114326567
20	NC_008341	GC	3	6	14670	14675	0 %	0 %	50 %	50 %	114326567
21	NC_008341	CG	3	6	15577	15582	0 %	0 %	50 %	50 %	114326567
22	NC_008341	GC	3	6	15599	15604	0 %	0 %	50 %	50 %	114326567
23	NC_008341	GC	3	6	15667	15672	0 %	0 %	50 %	50 %	114326567
24	NC_008341	TC	3	6	16401	16406	0 %	50 %	0 %	50 %	114326568
25	NC_008341	CG	3	6	17174	17179	0 %	0 %	50 %	50 %	114326568
26	NC_008341	CG	3	6	18211	18216	0 %	0 %	50 %	50 %	114326569
27	NC_008341	CG	3	6	18297	18302	0 %	0 %	50 %	50 %	114326569
28	NC_008341	CG	3	6	18756	18761	0 %	0 %	50 %	50 %	114326569
29	NC_008341	GC	4	8	19628	19635	0 %	0 %	50 %	50 %	114326569
30	NC_008341	GC	3	6	19996	20001	0 %	0 %	50 %	50 %	114326569
31	NC_008341	GT	3	6	20373	20378	0 %	50 %	50 %	0 %	114326569
32	NC_008341	AT	3	6	21669	21674	50 %	50 %	0 %	0 %	114326571
33	NC_008341	AG	3	6	22355	22360	50 %	0 %	50 %	0 %	114326572
34	NC_008341	CG	3	6	22743	22748	0 %	0 %	50 %	50 %	114326572
35	NC_008341	AT	3	6	22799	22804	50 %	50 %	0 %	0 %	114326572
36	NC_008341	TC	3	6	23109	23114	0 %	50 %	0 %	50 %	114326572
37	NC_008341	CA	3	6	26636	26641	50 %	0 %	0 %	50 %	114326574
38	NC_008341	TC	3	6	28444	28449	0 %	50 %	0 %	50 %	114326577
39	NC_008341	AT	3	6	28843	28848	50 %	50 %	0 %	0 %	114326578
40	NC_008341	GT	3	6	29705	29710	0 %	50 %	50 %	0 %	114326579
41	NC_008341	CG	3	6	29892	29897	0 %	0 %	50 %	50 %	114326579
42	NC_008341	AT	3	6	31094	31099	50 %	50 %	0 %	0 %	114326580
43	NC_008341	CT	3	6	32018	32023	0 %	50 %	0 %	50 %	114326582
44	NC_008341	AC	3	6	32370	32375	50 %	0 %	0 %	50 %	114326583
45	NC_008341	TC	3	6	32514	32519	0 %	50 %	0 %	50 %	114326583
46	NC_008341	TG	3	6	32627	32632	0 %	50 %	50 %	0 %	114326583
47	NC_008341	TA	3	6	33397	33402	50 %	50 %	0 %	0 %	114326583
48	NC_008341	AT	3	6	34221	34226	50 %	50 %	0 %	0 %	114326583
49	NC_008341	GC	3	6	35050	35055	0 %	0 %	50 %	50 %	114326583
50	NC_008341	GA	3	6	35535	35540	50 %	0 %	50 %	0 %	114326583
51	NC_008341	GA	3	6	36614	36619	50 %	0 %	50 %	0 %	114326583
52	NC_008341	GC	3	6	37180	37185	0 %	0 %	50 %	50 %	114326584
53	NC_008341	GT	3	6	38047	38052	0 %	50 %	50 %	0 %	114326584
54	NC_008341	GC	4	8	38560	38567	0 %	0 %	50 %	50 %	114326584
55	NC_008341	GC	3	6	39347	39352	0 %	0 %	50 %	50 %	114326584
56	NC_008341	GC	3	6	40042	40047	0 %	0 %	50 %	50 %	114326585
57	NC_008341	GC	3	6	40978	40983	0 %	0 %	50 %	50 %	114326587
58	NC_008341	GT	3	6	41660	41665	0 %	50 %	50 %	0 %	114326589
59	NC_008341	TG	3	6	41918	41923	0 %	50 %	50 %	0 %	114326589
60	NC_008341	GT	3	6	42118	42123	0 %	50 %	50 %	0 %	114326589
61	NC_008341	CG	3	6	42554	42559	0 %	0 %	50 %	50 %	114326589
62	NC_008341	GC	3	6	43513	43518	0 %	0 %	50 %	50 %	114326590
63	NC_008341	GC	3	6	44191	44196	0 %	0 %	50 %	50 %	114326592
64	NC_008341	TC	3	6	45638	45643	0 %	50 %	0 %	50 %	114326595
65	NC_008341	TC	3	6	45927	45932	0 %	50 %	0 %	50 %	114326595
66	NC_008341	TG	3	6	46417	46422	0 %	50 %	50 %	0 %	114326596
67	NC_008341	AC	3	6	46918	46923	50 %	0 %	0 %	50 %	114326597
68	NC_008341	AT	3	6	50233	50238	50 %	50 %	0 %	0 %	114326601
69	NC_008341	AG	4	8	51443	51450	50 %	0 %	50 %	0 %	114326601
70	NC_008341	GC	3	6	51673	51678	0 %	0 %	50 %	50 %	114326601
71	NC_008341	GC	4	8	52242	52249	0 %	0 %	50 %	50 %	114326602
72	NC_008341	GA	3	6	52793	52798	50 %	0 %	50 %	0 %	114326602
73	NC_008341	AG	3	6	53242	53247	50 %	0 %	50 %	0 %	114326602
74	NC_008341	CG	3	6	53295	53300	0 %	0 %	50 %	50 %	114326602
75	NC_008341	CA	3	6	53555	53560	50 %	0 %	0 %	50 %	114326602
76	NC_008341	GC	3	6	54821	54826	0 %	0 %	50 %	50 %	114326604
77	NC_008341	AG	3	6	55824	55829	50 %	0 %	50 %	0 %	114326605
78	NC_008341	GC	3	6	56252	56257	0 %	0 %	50 %	50 %	114326605
79	NC_008341	GC	3	6	56630	56635	0 %	0 %	50 %	50 %	114326605
80	NC_008341	AC	3	6	58999	59004	50 %	0 %	0 %	50 %	114326606
81	NC_008341	GA	3	6	59028	59033	50 %	0 %	50 %	0 %	114326606
82	NC_008341	CG	3	6	59090	59095	0 %	0 %	50 %	50 %	114326606
83	NC_008341	CG	4	8	59708	59715	0 %	0 %	50 %	50 %	114326607

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.