MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 2375

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_008340	CTTCCG	2	12	2757378	2757389	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2002	NC_008340	GCATCG	2	12	2757971	2757982	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321573
2003	NC_008340	CTACGA	2	12	2758056	2758067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114321573
2004	NC_008340	AATTGC	2	12	2758069	2758080	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114321573
2005	NC_008340	CCTCGC	2	12	2758919	2758930	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114321573
2006	NC_008340	GGTCCT	2	12	2763523	2763534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321577
2007	NC_008340	CAGGGT	2	12	2763740	2763751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114321577
2008	NC_008340	CCCCAG	2	12	2764196	2764207	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321577
2009	NC_008340	CGCCAG	2	12	2764835	2764846	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321577
2010	NC_008340	AGGTGA	2	12	2766631	2766642	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	114321581
2011	NC_008340	CCTCGG	2	12	2768547	2768558	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321583
2012	NC_008340	GGTTGT	2	12	2769057	2769068	0 %	50 %	50 %	0 %	114321583
2013	NC_008340	GCCAGG	2	12	2773983	2773994	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321587
2014	NC_008340	GTGGAA	2	12	2774207	2774218	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	114321587
2015	NC_008340	CAGGAC	2	12	2774810	2774821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321588
2016	NC_008340	GGCCGA	2	12	2775759	2775770	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321589
2017	NC_008340	CGGCGT	2	12	2777467	2777478	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321590
2018	NC_008340	GGCCTC	2	12	2777513	2777524	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321590
2019	NC_008340	CGGGCT	2	12	2777536	2777547	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321590
2020	NC_008340	CGGTCC	2	12	2778812	2778823	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321591
2021	NC_008340	CGTCCA	2	12	2779528	2779539	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321592
2022	NC_008340	CTCGCG	2	12	2779730	2779741	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321592
2023	NC_008340	GGTGGG	2	12	2780478	2780489	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_008340	CTGGAC	2	12	2781099	2781110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321593
2025	NC_008340	ACCTGC	2	12	2781996	2782007	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321595
2026	NC_008340	CTGGCG	2	12	2782550	2782561	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321595
2027	NC_008340	GGTGGA	2	12	2784739	2784750	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	114321598
2028	NC_008340	CCTGGA	2	12	2784919	2784930	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321598
2029	NC_008340	GAGACC	2	12	2785331	2785342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321598
2030	NC_008340	CCAGGG	2	12	2788420	2788431	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321600
2031	NC_008340	GCAGCG	2	12	2790584	2790595	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321602
2032	NC_008340	AGGCGC	2	12	2792115	2792126	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321604
2033	NC_008340	CCCCGG	2	12	2793068	2793079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321605
2034	NC_008340	CAGCTC	2	12	2793969	2793980	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321606
2035	NC_008340	GCATCC	2	12	2795438	2795449	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321607
2036	NC_008340	GACCTG	2	12	2795518	2795529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321607
2037	NC_008340	CGCCCG	2	12	2795936	2795947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321608
2038	NC_008340	CGGCGC	2	12	2797407	2797418	0 %	0 %	50 %	50 %	114321609
2039	NC_008340	CATGCC	2	12	2798977	2798988	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321611
2040	NC_008340	GTCCAC	2	12	2799232	2799243	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321611
2041	NC_008340	CACGCC	2	12	2805156	2805167	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321615
2042	NC_008340	CGACGG	2	12	2805404	2805415	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321615
2043	NC_008340	GGGCCA	2	12	2807986	2807997	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321618
2044	NC_008340	GGCGCA	2	12	2810190	2810201	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321619
2045	NC_008340	TGCTTC	2	12	2810976	2810987	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	114321620
2046	NC_008340	CATGGC	2	12	2813092	2813103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321621
2047	NC_008340	CAGCCG	2	12	2813419	2813430	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321621
2048	NC_008340	CCTCCA	2	12	2813985	2813996	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	114321621
2049	NC_008340	GGCCCC	2	12	2817976	2817987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321625
2050	NC_008340	CCGGCA	2	12	2820544	2820555	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321628
2051	NC_008340	GCACCA	2	12	2821784	2821795	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114321629
2052	NC_008340	GCCCGC	2	12	2823193	2823204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321630
2053	NC_008340	CCGCGC	2	12	2823315	2823326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321630
2054	NC_008340	GCGTCC	2	12	2826852	2826863	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321633
2055	NC_008340	GGTCCG	2	12	2828321	2828332	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321635
2056	NC_008340	GCCACC	2	12	2831140	2831151	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321637
2057	NC_008340	CCCGGA	2	12	2833466	2833477	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321639
2058	NC_008340	CAACCG	2	12	2833658	2833669	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114321639
2059	NC_008340	CTGGCC	2	12	2834833	2834844	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321641
2060	NC_008340	CCCTCC	2	12	2837257	2837268	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	114321643
2061	NC_008340	CGACAC	2	12	2839042	2839053	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114321645
2062	NC_008340	CCACGT	2	12	2841550	2841561	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321648
2063	NC_008340	CCAGCG	2	12	2846078	2846089	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321652
2064	NC_008340	ACCCGG	2	12	2846544	2846555	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321653
2065	NC_008340	GCAGGC	2	12	2846686	2846697	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321653
2066	NC_008340	GTAGCG	2	12	2846853	2846864	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114321654
2067	NC_008340	CCGCGC	2	12	2848431	2848442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321656
2068	NC_008340	CGCTGG	2	12	2848792	2848803	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321656
2069	NC_008340	CCAGCG	2	12	2849599	2849610	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321657
2070	NC_008340	TCGGTG	2	12	2850797	2850808	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114321658
2071	NC_008340	CGGTGG	2	12	2851902	2851913	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321659
2072	NC_008340	CGGGGC	2	12	2852428	2852439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321659
2073	NC_008340	GTCAGG	2	12	2853260	2853271	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114321660
2074	NC_008340	GCCCGG	2	12	2853424	2853435	0 %	0 %	50 %	50 %	114321660
2075	NC_008340	CCCGCT	2	12	2854706	2854717	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114321660
2076	NC_008340	CCGACC	2	12	2855069	2855080	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321660
2077	NC_008340	CCGCCT	2	12	2855177	2855188	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114321660
2078	NC_008340	CCACGG	2	12	2855942	2855953	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2079	NC_008340	CACCGG	2	12	2856679	2856690	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321661
2080	NC_008340	TCCGCC	2	12	2860373	2860384	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114321663
2081	NC_008340	CGTCCT	2	12	2860449	2860460	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114321663
2082	NC_008340	CCTCGT	2	12	2860779	2860790	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114321663
2083	NC_008340	TTGCGC	2	12	2863570	2863581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321666
2084	NC_008340	TCATGA	2	12	2865469	2865480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	114321668
2085	NC_008340	GACCTG	2	12	2865954	2865965	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321669
2086	NC_008340	CTGGAC	2	12	2866487	2866498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321670
2087	NC_008340	GCCCGA	2	12	2866734	2866745	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321671
2088	NC_008340	GCGCCC	2	12	2866751	2866762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321671
2089	NC_008340	ATGGAC	2	12	2868401	2868412	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114321672
2090	NC_008340	CGCCAT	2	12	2869636	2869647	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321675
2091	NC_008340	GCTCCG	2	12	2871736	2871747	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321676
2092	NC_008340	GGCTCG	2	12	2871759	2871770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321676
2093	NC_008340	GCGCCA	2	12	2881870	2881881	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321685
2094	NC_008340	GGATCT	2	12	2882924	2882935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114321686
2095	NC_008340	CGCCAG	2	12	2886251	2886262	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321690
2096	NC_008340	CCTGGC	2	12	2886522	2886533	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321691
2097	NC_008340	AGCAAC	2	12	2888451	2888462	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	114321692
2098	NC_008340	CATCCC	2	12	2889788	2889799	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	114321694
2099	NC_008340	TGGCCA	2	12	2890549	2890560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321694
2100	NC_008340	GCATCG	2	12	2891469	2891480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321695
2101	NC_008340	CCCGCA	2	12	2891863	2891874	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2102	NC_008340	ATCCGC	2	12	2893976	2893987	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321697
2103	NC_008340	GCGGCT	2	12	2895674	2895685	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321699
2104	NC_008340	CGGTGC	2	12	2895861	2895872	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2105	NC_008340	CTGGCC	2	12	2896422	2896433	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321700
2106	NC_008340	ACCGCT	2	12	2896801	2896812	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321700
2107	NC_008340	CCGGGA	2	12	2898165	2898176	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321701
2108	NC_008340	CGGCGC	2	12	2901285	2901296	0 %	0 %	50 %	50 %	114321705
2109	NC_008340	GGCGGT	2	12	2905320	2905331	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321711
2110	NC_008340	TGTCCA	2	12	2906945	2906956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114321712
2111	NC_008340	GAGGCG	2	12	2909330	2909341	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	114321715
2112	NC_008340	TAGCCG	2	12	2909627	2909638	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321715
2113	NC_008340	CATGCG	2	12	2910223	2910234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321715
2114	NC_008340	CCAAGC	2	12	2912080	2912091	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114321717
2115	NC_008340	ACCGTC	2	12	2912411	2912422	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321718
2116	NC_008340	CCGGTG	2	12	2915106	2915117	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321721
2117	NC_008340	TGCTGG	2	12	2915581	2915592	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114321722
2118	NC_008340	CCTGAA	2	12	2917841	2917852	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114321723
2119	NC_008340	CGGGTC	2	12	2918154	2918165	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321723
2120	NC_008340	CCGAGG	2	12	2918742	2918753	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321725
2121	NC_008340	GCCACC	2	12	2919122	2919133	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321725
2122	NC_008340	GGGCCT	2	12	2921690	2921701	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321727
2123	NC_008340	ACCGAG	2	12	2921977	2921988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321727
2124	NC_008340	GGCACA	2	12	2922406	2922417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2125	NC_008340	GGGCGA	2	12	2922586	2922597	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	114321728
2126	NC_008340	GCCGTC	2	12	2922925	2922936	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321728
2127	NC_008340	AGCGAA	2	12	2923462	2923473	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2128	NC_008340	CCAGGG	2	12	2923868	2923879	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321729
2129	NC_008340	CCGCGC	2	12	2924534	2924545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321729
2130	NC_008340	GCGCGA	2	12	2926214	2926225	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321731
2131	NC_008340	CACCCT	2	12	2927570	2927581	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	114321731
2132	NC_008340	CTGGAG	2	12	2928333	2928344	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114321731
2133	NC_008340	TGGCCA	2	12	2931736	2931747	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321735
2134	NC_008340	AGATGA	2	12	2932072	2932083	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	114321735
2135	NC_008340	CCTGCC	2	12	2938850	2938861	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2136	NC_008340	TCCGGC	4	24	2940003	2940026	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321742
2137	NC_008340	TCGGGC	2	12	2940027	2940038	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321742
2138	NC_008340	TCCGGC	6	36	2940039	2940074	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321742
2139	NC_008340	GGGATC	2	12	2940521	2940532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114321743
2140	NC_008340	TGGGCG	2	12	2941856	2941867	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321743
2141	NC_008340	GCCAGC	2	12	2942033	2942044	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321743
2142	NC_008340	GGGCCA	2	12	2942596	2942607	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321744
2143	NC_008340	CGCGGG	2	12	2944613	2944624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321745
2144	NC_008340	ACCCCC	2	12	2944999	2945010	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	114321745
2145	NC_008340	AGGCCC	2	12	2946241	2946252	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321747
2146	NC_008340	GGTGGG	2	12	2948141	2948152	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
2147	NC_008340	TGCTGG	2	12	2949432	2949443	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114321749
2148	NC_008340	GCCTCC	2	12	2949790	2949801	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114321750
2149	NC_008340	CATGGC	2	12	2953171	2953182	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321751
2150	NC_008340	CAGGGC	2	12	2955584	2955595	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321753
2151	NC_008340	GGCACG	2	12	2956535	2956546	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321754
2152	NC_008340	TGGTGA	2	12	2958009	2958020	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	114321755
2153	NC_008340	ATCGGT	2	12	2961414	2961425	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114321756
2154	NC_008340	CACCGG	2	12	2964727	2964738	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321761
2155	NC_008340	GTCCAG	2	12	2967264	2967275	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321764
2156	NC_008340	GATCAC	2	12	2973546	2973557	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114321771
2157	NC_008340	TCAGCA	2	12	2973599	2973610	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114321771
2158	NC_008340	CCTGGC	2	12	2977095	2977106	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321774
2159	NC_008340	CGGGCC	2	12	2977361	2977372	0 %	0 %	50 %	50 %	114321774
2160	NC_008340	GGGCCG	2	12	2977681	2977692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321774
2161	NC_008340	GCCAAG	2	12	2981276	2981287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321779
2162	NC_008340	GCCCGG	2	12	2985963	2985974	0 %	0 %	50 %	50 %	114321782
2163	NC_008340	AGCACC	2	12	2986828	2986839	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114321783
2164	NC_008340	GACGTT	2	12	2987163	2987174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114321783
2165	NC_008340	GCCAGG	2	12	2989778	2989789	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321785
2166	NC_008340	CGCAGG	2	12	2990971	2990982	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321786
2167	NC_008340	GGCAGC	2	12	2991842	2991853	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321787
2168	NC_008340	GCCAGG	2	12	2993207	2993218	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321790
2169	NC_008340	CGGCCA	2	12	2993767	2993778	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321791
2170	NC_008340	GCCCCG	2	12	2994261	2994272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321791
2171	NC_008340	GGGAGC	2	12	2997543	2997554	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	114321794
2172	NC_008340	GCCTGG	2	12	2998221	2998232	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321794
2173	NC_008340	TTCGGC	2	12	2998334	2998345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321794
2174	NC_008340	GCGGCA	2	12	3001754	3001765	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321798
2175	NC_008340	GCTGGC	2	12	3002295	3002306	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321798
2176	NC_008340	AGGCGC	2	12	3004205	3004216	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321799
2177	NC_008340	TGGACC	2	12	3005288	3005299	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321800
2178	NC_008340	CACCGG	2	12	3006277	3006288	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321801
2179	NC_008340	GCCACC	2	12	3007126	3007137	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321801
2180	NC_008340	GCCATC	2	12	3007356	3007367	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321802
2181	NC_008340	CGCCAG	2	12	3007698	3007709	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321802
2182	NC_008340	CTCCAG	2	12	3008771	3008782	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321804
2183	NC_008340	GGCGCT	2	12	3009454	3009465	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321804
2184	NC_008340	TCGGCG	2	12	3012566	3012577	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321806
2185	NC_008340	GACCTG	2	12	3013248	3013259	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321807
2186	NC_008340	GCCCTG	2	12	3013478	3013489	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321808
2187	NC_008340	GCCCCA	2	12	3016164	3016175	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321811
2188	NC_008340	CTGGTC	2	12	3018779	3018790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114321813
2189	NC_008340	CGCGGG	2	12	3018927	3018938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321813
2190	NC_008340	CGGCGA	2	12	3019318	3019329	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321813
2191	NC_008340	TCCAGC	2	12	3019886	3019897	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321814
2192	NC_008340	TCCAGC	2	12	3024676	3024687	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321819
2193	NC_008340	GCCACC	2	12	3026791	3026802	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321820
2194	NC_008340	GCACCG	2	12	3027492	3027503	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321821
2195	NC_008340	ACGCCC	2	12	3028895	3028906	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321822
2196	NC_008340	CCACCG	2	12	3029295	3029306	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321822
2197	NC_008340	CTGTTC	2	12	3032878	3032889	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	114321825
2198	NC_008340	GGTGGG	2	12	3033449	3033460	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
2199	NC_008340	GGTGGG	2	12	3033478	3033489	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
2200	NC_008340	CTTCCG	2	12	3033548	3033559	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2201	NC_008340	ACCTGG	2	12	3034576	3034587	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321826
2202	NC_008340	TGCCCA	2	12	3035833	3035844	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321827
2203	NC_008340	CTACCT	2	12	3038052	3038063	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	114321829
2204	NC_008340	AGGCCA	2	12	3038246	3038257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321829
2205	NC_008340	CGGTGG	2	12	3041836	3041847	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321830
2206	NC_008340	GTGCAG	2	12	3042235	3042246	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114321830
2207	NC_008340	CTGCGC	2	12	3043412	3043423	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321831
2208	NC_008340	CATAGG	2	12	3043736	3043747	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114321832
2209	NC_008340	TGCGCC	2	12	3045340	3045351	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321833
2210	NC_008340	CAGCGA	2	12	3046366	3046377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
2211	NC_008340	CTGGGG	2	12	3047188	3047199	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321834
2212	NC_008340	AGCGAC	2	12	3047417	3047428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321834
2213	NC_008340	ACCGAC	2	12	3049126	3049137	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	114321835
2214	NC_008340	ACTGGG	2	12	3050124	3050135	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114321835
2215	NC_008340	TGGAGG	2	12	3051161	3051172	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	114321836
2216	NC_008340	ACTGGC	2	12	3053069	3053080	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321838
2217	NC_008340	CCGGCG	2	12	3054746	3054757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2218	NC_008340	CAACGG	2	12	3056492	3056503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321841
2219	NC_008340	GCCCGC	2	12	3057281	3057292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321842
2220	NC_008340	CACACC	2	12	3059158	3059169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321844
2221	NC_008340	TGGGCA	2	12	3059858	3059869	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114321845
2222	NC_008340	TGCGCC	2	12	3060053	3060064	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321845
2223	NC_008340	GACCTG	2	12	3061486	3061497	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321845
2224	NC_008340	GGCCAA	2	12	3062791	3062802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321846
2225	NC_008340	CGCCAC	2	12	3064602	3064613	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321848
2226	NC_008340	GGCCAG	2	12	3064728	3064739	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321848
2227	NC_008340	ATGCCG	2	12	3064831	3064842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321848
2228	NC_008340	CAGGCC	2	12	3065064	3065075	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321848
2229	NC_008340	GCGTCG	2	12	3068072	3068083	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321849
2230	NC_008340	CAGCCG	2	12	3069437	3069448	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321850
2231	NC_008340	GATCCT	2	12	3072565	3072576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114321853
2232	NC_008340	CCATGT	2	12	3072733	3072744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114321853
2233	NC_008340	CATCCT	2	12	3073504	3073515	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	114321854
2234	NC_008340	CGGCCA	2	12	3074592	3074603	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321856
2235	NC_008340	GACAGC	2	12	3082406	3082417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321865
2236	NC_008340	ATCACC	2	12	3082831	3082842	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
2237	NC_008340	CGGTCA	2	12	3084017	3084028	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321866
2238	NC_008340	GGCCAC	2	12	3084366	3084377	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321866
2239	NC_008340	TTACCG	2	12	3086459	3086470	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114321868
2240	NC_008340	TCGGCC	2	12	3086700	3086711	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2241	NC_008340	CTGCGC	2	12	3087425	3087436	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321870
2242	NC_008340	CATGCC	2	12	3088523	3088534	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321870
2243	NC_008340	GGCGTG	2	12	3090414	3090425	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321871
2244	NC_008340	CAGGTT	2	12	3091289	3091300	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114321872
2245	NC_008340	CAAAGC	2	12	3091804	3091815	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	114321872
2246	NC_008340	CCTCGA	2	12	3092350	3092361	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321872
2247	NC_008340	CCCACA	2	12	3092719	3092730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2248	NC_008340	CGAGGC	2	12	3094269	3094280	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321873
2249	NC_008340	CCTACA	2	12	3096774	3096785	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	114321875
2250	NC_008340	ACGCCC	2	12	3098438	3098449	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321876
2251	NC_008340	GGAGAT	2	12	3098901	3098912	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	114321876
2252	NC_008340	TGGCCC	2	12	3100102	3100113	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321878
2253	NC_008340	CGCCGG	2	12	3102258	3102269	0 %	0 %	50 %	50 %	114321880
2254	NC_008340	ACCGGC	2	12	3104966	3104977	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321883
2255	NC_008340	CGCCAG	2	12	3108356	3108367	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321886
2256	NC_008340	CGCATG	2	12	3111494	3111505	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321890
2257	NC_008340	CCCGGC	2	12	3111978	3111989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321890
2258	NC_008340	AGGGCC	2	12	3112121	3112132	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321890
2259	NC_008340	GATCTG	2	12	3113526	3113537	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114321891
2260	NC_008340	TGGCCA	2	12	3114065	3114076	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321891
2261	NC_008340	GCCTGG	2	12	3115420	3115431	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321892
2262	NC_008340	TCCGGC	2	12	3118007	3118018	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321895
2263	NC_008340	GGCGCT	2	12	3118579	3118590	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321895
2264	NC_008340	CATCGA	2	12	3119959	3119970	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114321895
2265	NC_008340	CCTCCA	2	12	3124093	3124104	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	114321899
2266	NC_008340	AGCTGG	2	12	3124402	3124413	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114321899
2267	NC_008340	TGGCCA	2	12	3125395	3125406	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321900
2268	NC_008340	CCAGGT	2	12	3127242	3127253	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321901
2269	NC_008340	CGGTGG	2	12	3128596	3128607	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321902
2270	NC_008340	CGAACG	2	12	3129115	3129126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114321903
2271	NC_008340	TGCCCG	2	12	3137402	3137413	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321910
2272	NC_008340	TCAAGG	2	12	3139618	3139629	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114321910
2273	NC_008340	TGGCCA	2	12	3139744	3139755	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321910
2274	NC_008340	CGAGGA	2	12	3139796	3139807	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	114321910
2275	NC_008340	GCTTTG	2	12	3140383	3140394	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	114321910
2276	NC_008340	ACCTGG	2	12	3140980	3140991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321910
2277	NC_008340	CCCACC	2	12	3143099	3143110	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
2278	NC_008340	CGGCCT	2	12	3144262	3144273	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321912
2279	NC_008340	TCCGCC	2	12	3145624	3145635	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114321915
2280	NC_008340	GCAGGC	2	12	3146057	3146068	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321915
2281	NC_008340	CGTCCA	2	12	3146457	3146468	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321916
2282	NC_008340	CTGGGC	2	12	3146734	3146745	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321916
2283	NC_008340	GGTAAC	2	12	3150503	3150514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114321920
2284	NC_008340	TCGGCC	2	12	3150580	3150591	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321920
2285	NC_008340	TCCCTG	2	12	3156638	3156649	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114321926
2286	NC_008340	CGACCC	2	12	3159343	3159354	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321926
2287	NC_008340	GCCTGG	2	12	3160896	3160907	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321926
2288	NC_008340	TGGCGG	2	12	3162091	3162102	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321927
2289	NC_008340	TGGCCC	2	12	3162699	3162710	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114321928
2290	NC_008340	GGCCGG	2	12	3163120	3163131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114321928
2291	NC_008340	CCGTGG	2	12	3164121	3164132	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321930
2292	NC_008340	CCCGGC	2	12	3164645	3164656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321930
2293	NC_008340	CCGGCG	2	12	3165599	3165610	0 %	0 %	50 %	50 %	114321931
2294	NC_008340	CGAACA	2	12	3166593	3166604	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	114321931
2295	NC_008340	GAGCAG	2	12	3166837	3166848	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	114321931
2296	NC_008340	AAGAGA	2	12	3169980	3169991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114321933
2297	NC_008340	GAAGGC	2	12	3170403	3170414	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	114321934
2298	NC_008340	TGGCGG	2	12	3172223	3172234	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321936
2299	NC_008340	GCGCCC	2	12	3175801	3175812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321939
2300	NC_008340	CTGGGC	2	12	3176519	3176530	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321940
2301	NC_008340	CCACAC	2	12	3177470	3177481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114321941
2302	NC_008340	GCACGG	2	12	3177914	3177925	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321941
2303	NC_008340	CCCCCA	2	12	3179082	3179093	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	114321943
2304	NC_008340	GGTCGG	2	12	3181917	3181928	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321946
2305	NC_008340	TCTTCC	2	12	3186506	3186517	0 %	50 %	0 %	50 %	114321950
2306	NC_008340	CAGCGC	2	12	3187738	3187749	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321950
2307	NC_008340	ATCGCC	2	12	3187750	3187761	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321950
2308	NC_008340	TCGGAA	2	12	3187822	3187833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114321950
2309	NC_008340	CTCCCC	2	12	3188412	3188423	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	114321951
2310	NC_008340	GGGCAG	2	12	3192678	3192689	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	114321955
2311	NC_008340	CTGCTC	2	12	3194343	3194354	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114321957
2312	NC_008340	CGCCGG	2	12	3194504	3194515	0 %	0 %	50 %	50 %	114321957
2313	NC_008340	CCCGCG	2	12	3194531	3194542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321957
2314	NC_008340	CGGTGG	2	12	3195515	3195526	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321958
2315	NC_008340	CGATGC	2	12	3198045	3198056	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321960
2316	NC_008340	GCCCCG	2	12	3198125	3198136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114321960
2317	NC_008340	CTTGCC	2	12	3199236	3199247	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114321961
2318	NC_008340	CTCCAG	2	12	3199787	3199798	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114321962
2319	NC_008340	CGCGGC	2	12	3202035	3202046	0 %	0 %	50 %	50 %	114321963
2320	NC_008340	CACCGC	2	12	3202146	3202157	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321963
2321	NC_008340	GGCCAG	2	12	3202467	3202478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321963
2322	NC_008340	GAGGCC	2	12	3205641	3205652	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321967
2323	NC_008340	ATCCAG	2	12	3212808	3212819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114321975
2324	NC_008340	GCCGAG	2	12	3212893	3212904	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321975
2325	NC_008340	CGGCAT	2	12	3213059	3213070	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321975
2326	NC_008340	GCCACG	2	12	3214715	3214726	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321977
2327	NC_008340	CTGGCG	2	12	3215495	3215506	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321978
2328	NC_008340	ACTGGC	2	12	3216190	3216201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321979
2329	NC_008340	GCTGGT	2	12	3216223	3216234	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114321979
2330	NC_008340	CATCTC	2	12	3218769	3218780	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	114321982
2331	NC_008340	GCCACG	2	12	3219136	3219147	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321982
2332	NC_008340	ACCGCA	2	12	3219543	3219554	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2333	NC_008340	ACCGAT	2	12	3221581	3221592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	114321985
2334	NC_008340	CCCCGA	2	12	3222633	3222644	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
2335	NC_008340	CGGGTG	2	12	3225636	3225647	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114321987
2336	NC_008340	GACCGG	2	12	3227074	3227085	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114321988
2337	NC_008340	GCTGGC	2	12	3227283	3227294	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321988
2338	NC_008340	CGGCAC	2	12	3228830	3228841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321988
2339	NC_008340	TGCCCC	2	12	3230262	3230273	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114321990
2340	NC_008340	GCGATC	2	12	3232387	3232398	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114321991
2341	NC_008340	GCCCGG	2	12	3235806	3235817	0 %	0 %	50 %	50 %	114321994
2342	NC_008340	TCGCCC	2	12	3235900	3235911	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114321994
2343	NC_008340	CTCCGC	2	12	3236565	3236576	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114321995
2344	NC_008340	CACCGC	2	12	3237707	3237718	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321995
2345	NC_008340	CCACCG	2	12	3238849	3238860	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321997
2346	NC_008340	CCGGGT	2	12	3238907	3238918	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114321997
2347	NC_008340	GCCGGC	2	12	3240092	3240103	0 %	0 %	50 %	50 %	114321998
2348	NC_008340	CGACCC	2	12	3241593	3241604	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114321999
2349	NC_008340	GCGCCA	2	12	3242262	3242273	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114321999
2350	NC_008340	CAGCTG	2	12	3243201	3243212	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114322000
2351	NC_008340	CGCTAT	2	12	3244806	3244817	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	114322002
2352	NC_008340	CGCGGC	2	12	3244904	3244915	0 %	0 %	50 %	50 %	114322002
2353	NC_008340	CGGCTA	2	12	3246631	3246642	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114322004
2354	NC_008340	CTGGGC	2	12	3246980	3246991	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114322004
2355	NC_008340	CGGTCG	2	12	3250140	3250151	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114322007
2356	NC_008340	GGTCCA	2	12	3250534	3250545	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	114322007
2357	NC_008340	CTGGGC	2	12	3252405	3252416	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114322009
2358	NC_008340	CGCCCT	2	12	3252419	3252430	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114322009
2359	NC_008340	CGACGG	2	12	3252638	3252649	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114322009
2360	NC_008340	GCCCCT	2	12	3252827	3252838	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114322010
2361	NC_008340	TCGGCT	2	12	3254902	3254913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114322010
2362	NC_008340	CTTGAG	2	12	3256510	3256521	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	114322012
2363	NC_008340	CCGATC	3	18	3257417	3257434	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114322012
2364	NC_008340	CCCGCT	2	12	3257835	3257846	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114322012
2365	NC_008340	TTGGCC	2	12	3258635	3258646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114322013
2366	NC_008340	CGGGCC	2	12	3260631	3260642	0 %	0 %	50 %	50 %	114322015
2367	NC_008340	CGGGCC	2	12	3261117	3261128	0 %	0 %	50 %	50 %	114322016
2368	NC_008340	GGGCCA	2	12	3263626	3263637	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	114322018
2369	NC_008340	GGCGCC	2	12	3266117	3266128	0 %	0 %	50 %	50 %	114322021
2370	NC_008340	GCCCTT	2	12	3266608	3266619	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	114322022
2371	NC_008340	GCCGCG	2	12	3267722	3267733	0 %	0 %	50 %	50 %	114322024
2372	NC_008340	GCCACG	2	12	3268167	3268178	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	114322024
2373	NC_008340	GATCGA	2	12	3269241	3269252	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	114322025
2374	NC_008340	CCTCGC	2	12	3274780	3274791	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	114322029
2375	NC_008340	CGGTGG	2	12	3274927	3274938	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114322029

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.