MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 8675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008340	CACC	2	8	29	36	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_008340	CTAC	2	8	623	630	25 %	25 %	0 %	50 %	114319167
3	NC_008340	CCGC	2	8	1514	1521	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_008340	ATTG	2	8	1551	1558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008340	CTAC	2	8	3121	3128	25 %	25 %	0 %	50 %	114319169
6	NC_008340	GGCG	2	8	3289	3296	0 %	0 %	75 %	25 %	114319169
7	NC_008340	CGCT	2	8	3474	3481	0 %	25 %	25 %	50 %	114319169
8	NC_008340	CCAT	2	8	4142	4149	25 %	25 %	0 %	50 %	114319170
9	NC_008340	TCCT	2	8	4537	4544	0 %	50 %	0 %	50 %	114319170
10	NC_008340	GAAG	2	8	4587	4594	50 %	0 %	50 %	0 %	114319170
11	NC_008340	GATG	2	8	6132	6139	25 %	25 %	50 %	0 %	114319170
12	NC_008340	TCCG	2	8	6370	6377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008340	GCCG	2	8	6664	6671	0 %	0 %	50 %	50 %	114319171
14	NC_008340	TGAG	2	8	6839	6846	25 %	25 %	50 %	0 %	114319171
15	NC_008340	CGGC	2	8	6851	6858	0 %	0 %	50 %	50 %	114319171
16	NC_008340	GGTG	2	8	7056	7063	0 %	25 %	75 %	0 %	114319171
17	NC_008340	CCGG	2	8	7537	7544	0 %	0 %	50 %	50 %	114319172
18	NC_008340	CCGG	2	8	8760	8767	0 %	0 %	50 %	50 %	114319172
19	NC_008340	GATG	2	8	8953	8960	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008340	CGGG	2	8	10460	10467	0 %	0 %	75 %	25 %	114319174
21	NC_008340	GCCC	2	8	10555	10562	0 %	0 %	25 %	75 %	114319174
22	NC_008340	GGCC	2	8	10584	10591	0 %	0 %	50 %	50 %	114319174
23	NC_008340	GGGC	2	8	10599	10606	0 %	0 %	75 %	25 %	114319174
24	NC_008340	GATC	2	8	10914	10921	25 %	25 %	25 %	25 %	114319174
25	NC_008340	GGAA	2	8	11361	11368	50 %	0 %	50 %	0 %	114319175
26	NC_008340	CGCT	2	8	11396	11403	0 %	25 %	25 %	50 %	114319175
27	NC_008340	CGGC	3	12	11630	11641	0 %	0 %	50 %	50 %	114319175
28	NC_008340	GCCC	2	8	11677	11684	0 %	0 %	25 %	75 %	114319175
29	NC_008340	GGCG	2	8	12545	12552	0 %	0 %	75 %	25 %	114319176
30	NC_008340	GGCG	2	8	12655	12662	0 %	0 %	75 %	25 %	114319176
31	NC_008340	GCGG	2	8	13431	13438	0 %	0 %	75 %	25 %	114319177
32	NC_008340	GCCA	2	8	13562	13569	25 %	0 %	25 %	50 %	114319177
33	NC_008340	CGAT	2	8	13706	13713	25 %	25 %	25 %	25 %	114319177
34	NC_008340	CCGG	2	8	14188	14195	0 %	0 %	50 %	50 %	114319177
35	NC_008340	CATC	2	8	14202	14209	25 %	25 %	0 %	50 %	114319177
36	NC_008340	GCCG	2	8	14481	14488	0 %	0 %	50 %	50 %	114319177
37	NC_008340	CCGC	2	8	14821	14828	0 %	0 %	25 %	75 %	114319178
38	NC_008340	AGGC	2	8	14935	14942	25 %	0 %	50 %	25 %	114319178
39	NC_008340	GGCC	2	8	15819	15826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008340	ATCC	2	8	17194	17201	25 %	25 %	0 %	50 %	114319179
41	NC_008340	GCGG	2	8	17677	17684	0 %	0 %	75 %	25 %	114319180
42	NC_008340	CTGC	2	8	18132	18139	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_008340	CTGC	2	8	18193	18200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_008340	CCGG	2	8	18442	18449	0 %	0 %	50 %	50 %	114319181
45	NC_008340	CGGC	2	8	18874	18881	0 %	0 %	50 %	50 %	114319181
46	NC_008340	GCCG	2	8	19044	19051	0 %	0 %	50 %	50 %	114319181
47	NC_008340	GGTG	2	8	19486	19493	0 %	25 %	75 %	0 %	114319182
48	NC_008340	TACC	2	8	19583	19590	25 %	25 %	0 %	50 %	114319182
49	NC_008340	GCGA	2	8	20217	20224	25 %	0 %	50 %	25 %	114319182
50	NC_008340	AGAA	2	8	21020	21027	75 %	0 %	25 %	0 %	114319183
51	NC_008340	CGCC	2	8	21123	21130	0 %	0 %	25 %	75 %	114319183
52	NC_008340	CGGC	2	8	21159	21166	0 %	0 %	50 %	50 %	114319183
53	NC_008340	GCCG	2	8	21167	21174	0 %	0 %	50 %	50 %	114319183
54	NC_008340	CGGC	2	8	21280	21287	0 %	0 %	50 %	50 %	114319183
55	NC_008340	CCGC	2	8	21593	21600	0 %	0 %	25 %	75 %	114319184
56	NC_008340	GCCG	2	8	22163	22170	0 %	0 %	50 %	50 %	114319184
57	NC_008340	CCAG	2	8	22256	22263	25 %	0 %	25 %	50 %	114319184
58	NC_008340	CGGG	2	8	22724	22731	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008340	GAGG	2	8	23194	23201	25 %	0 %	75 %	0 %	114319185
60	NC_008340	CAGC	2	8	23352	23359	25 %	0 %	25 %	50 %	114319185
61	NC_008340	CGGC	2	8	23459	23466	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
62	NC_008340	CCTT	2	8	23954	23961	0 %	50 %	0 %	50 %	114319185
63	NC_008340	CTGG	2	8	24235	24242	0 %	25 %	50 %	25 %	114319185
64	NC_008340	GGCG	2	8	24435	24442	0 %	0 %	75 %	25 %	114319185
65	NC_008340	GCGG	2	8	24636	24643	0 %	0 %	75 %	25 %	114319186
66	NC_008340	TCGT	2	8	24834	24841	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008340	GACT	2	8	25139	25146	25 %	25 %	25 %	25 %	114319187
68	NC_008340	CGGG	2	8	25340	25347	0 %	0 %	75 %	25 %	114319187
69	NC_008340	CGGC	2	8	25943	25950	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
70	NC_008340	CAGC	2	8	26097	26104	25 %	0 %	25 %	50 %	114319188
71	NC_008340	GCGG	2	8	26111	26118	0 %	0 %	75 %	25 %	114319188
72	NC_008340	CCGG	2	8	26195	26202	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
73	NC_008340	GGGC	2	8	26352	26359	0 %	0 %	75 %	25 %	114319188
74	NC_008340	GGTC	2	8	26466	26473	0 %	25 %	50 %	25 %	114319188
75	NC_008340	TGGA	2	8	26572	26579	25 %	25 %	50 %	0 %	114319188
76	NC_008340	CGGA	2	8	26860	26867	25 %	0 %	50 %	25 %	114319188
77	NC_008340	GCCG	2	8	26936	26943	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
78	NC_008340	GCCC	2	8	27442	27449	0 %	0 %	25 %	75 %	114319189
79	NC_008340	CCGG	2	8	27533	27540	0 %	0 %	50 %	50 %	114319189
80	NC_008340	GGCC	2	8	28068	28075	0 %	0 %	50 %	50 %	114319190
81	NC_008340	TGCC	2	8	28878	28885	0 %	25 %	25 %	50 %	114319192
82	NC_008340	CGGC	2	8	29303	29310	0 %	0 %	50 %	50 %	114319192
83	NC_008340	TGCC	2	8	29607	29614	0 %	25 %	25 %	50 %	114319192
84	NC_008340	CGGG	2	8	29900	29907	0 %	0 %	75 %	25 %	114319192
85	NC_008340	GCCG	2	8	30326	30333	0 %	0 %	50 %	50 %	114319193
86	NC_008340	GCCA	2	8	30348	30355	25 %	0 %	25 %	50 %	114319193
87	NC_008340	CGCC	2	8	32506	32513	0 %	0 %	25 %	75 %	114319195
88	NC_008340	GATC	2	8	33031	33038	25 %	25 %	25 %	25 %	114319196
89	NC_008340	CCAT	2	8	34021	34028	25 %	25 %	0 %	50 %	114319197
90	NC_008340	GGGT	2	8	34248	34255	0 %	25 %	75 %	0 %	114319197
91	NC_008340	CAGC	2	8	36334	36341	25 %	0 %	25 %	50 %	114319198
92	NC_008340	CCGC	2	8	36819	36826	0 %	0 %	25 %	75 %	114319199
93	NC_008340	GGGT	2	8	37055	37062	0 %	25 %	75 %	0 %	114319199
94	NC_008340	GCCG	2	8	37125	37132	0 %	0 %	50 %	50 %	114319199
95	NC_008340	CGGC	2	8	38052	38059	0 %	0 %	50 %	50 %	114319200
96	NC_008340	GCCG	2	8	38257	38264	0 %	0 %	50 %	50 %	114319201
97	NC_008340	TGGC	2	8	38976	38983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008340	CCCT	2	8	39181	39188	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_008340	CCAG	2	8	39267	39274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008340	GTCG	2	8	39587	39594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008340	GCCG	2	8	39683	39690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008340	ATCG	2	8	40082	40089	25 %	25 %	25 %	25 %	114319202
103	NC_008340	GCGG	2	8	40455	40462	0 %	0 %	75 %	25 %	114319203
104	NC_008340	GGGC	2	8	40505	40512	0 %	0 %	75 %	25 %	114319203
105	NC_008340	GCCA	2	8	42131	42138	25 %	0 %	25 %	50 %	114319205
106	NC_008340	CCAT	2	8	42693	42700	25 %	25 %	0 %	50 %	114319205
107	NC_008340	GTTG	2	8	42772	42779	0 %	50 %	50 %	0 %	114319205
108	NC_008340	CAAC	2	8	42948	42955	50 %	0 %	0 %	50 %	114319205
109	NC_008340	TGCC	2	8	43658	43665	0 %	25 %	25 %	50 %	114319206
110	NC_008340	GGCG	2	8	44249	44256	0 %	0 %	75 %	25 %	114319206
111	NC_008340	CTGG	2	8	44739	44746	0 %	25 %	50 %	25 %	114319206
112	NC_008340	TGCT	2	8	44856	44863	0 %	50 %	25 %	25 %	114319206
113	NC_008340	GCGA	2	8	45658	45665	25 %	0 %	50 %	25 %	114319206
114	NC_008340	CAGG	2	8	45837	45844	25 %	0 %	50 %	25 %	114319206
115	NC_008340	CAGG	2	8	45894	45901	25 %	0 %	50 %	25 %	114319206
116	NC_008340	TCGG	2	8	46033	46040	0 %	25 %	50 %	25 %	114319206
117	NC_008340	AGCC	2	8	46342	46349	25 %	0 %	25 %	50 %	114319206
118	NC_008340	GCTG	2	8	46920	46927	0 %	25 %	50 %	25 %	114319207
119	NC_008340	GCAG	2	8	47077	47084	25 %	0 %	50 %	25 %	114319207
120	NC_008340	ACAA	2	8	47142	47149	75 %	0 %	0 %	25 %	114319207
121	NC_008340	CAGC	2	8	47150	47157	25 %	0 %	25 %	50 %	114319207
122	NC_008340	AGCC	2	8	47202	47209	25 %	0 %	25 %	50 %	114319207
123	NC_008340	CCGG	2	8	48178	48185	0 %	0 %	50 %	50 %	114319208
124	NC_008340	GGGC	2	8	48457	48464	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008340	TGCG	2	8	49024	49031	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008340	GCAG	2	8	49491	49498	25 %	0 %	50 %	25 %	114319209
127	NC_008340	ACCG	2	8	50616	50623	25 %	0 %	25 %	50 %	114319210
128	NC_008340	TCCA	2	8	50973	50980	25 %	25 %	0 %	50 %	114319210
129	NC_008340	GTCG	2	8	51078	51085	0 %	25 %	50 %	25 %	114319210
130	NC_008340	GCCG	2	8	51425	51432	0 %	0 %	50 %	50 %	114319211
131	NC_008340	CTTC	2	8	51588	51595	0 %	50 %	0 %	50 %	114319212
132	NC_008340	AGCC	2	8	51883	51890	25 %	0 %	25 %	50 %	114319212
133	NC_008340	GCCG	2	8	52041	52048	0 %	0 %	50 %	50 %	114319212
134	NC_008340	GGGC	2	8	53169	53176	0 %	0 %	75 %	25 %	114319212
135	NC_008340	GCGG	2	8	53780	53787	0 %	0 %	75 %	25 %	114319213
136	NC_008340	GGTG	2	8	53926	53933	0 %	25 %	75 %	0 %	114319213
137	NC_008340	TGCC	2	8	54439	54446	0 %	25 %	25 %	50 %	114319214
138	NC_008340	GCGG	2	8	54735	54742	0 %	0 %	75 %	25 %	114319214
139	NC_008340	CCAC	2	8	54788	54795	25 %	0 %	0 %	75 %	114319214
140	NC_008340	GCCG	2	8	54876	54883	0 %	0 %	50 %	50 %	114319214
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142	NC_008340	GCCT	2	8	55077	55084	0 %	25 %	25 %	50 %	114319215
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