MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008340	GGCC	2	8	1708431	1708438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_008340	GCCG	2	8	1733687	1733694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
503	NC_008340	CCTC	2	8	1733698	1733705	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
504	NC_008340	CGGC	2	8	1734995	1735002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_008340	CCTA	2	8	1735020	1735027	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_008340	GGCC	2	8	1738911	1738918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
507	NC_008340	TGAG	2	8	1738996	1739003	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_008340	CAGC	2	8	1739184	1739191	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
509	NC_008340	TTCG	2	8	1742220	1742227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_008340	TGCA	2	8	1742290	1742297	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
511	NC_008340	ACGA	2	8	1742404	1742411	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
512	NC_008340	ACCC	2	8	1744082	1744089	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
513	NC_008340	TGAT	2	8	1749022	1749029	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_008340	GTTG	2	8	1749662	1749669	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_008340	CCGG	2	8	1749804	1749811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_008340	TCCC	2	8	1751921	1751928	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
517	NC_008340	ATTT	2	8	1766347	1766354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_008340	ATCT	2	8	1766444	1766451	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_008340	TTCC	2	8	1766801	1766808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_008340	AAAG	2	8	1767503	1767510	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_008340	AGAA	2	8	1767525	1767532	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008340	GGGC	2	8	1778936	1778943	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
523	NC_008340	CCGG	2	8	1779327	1779334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_008340	CAGG	2	8	1779506	1779513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
525	NC_008340	GACC	2	8	1780080	1780087	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
526	NC_008340	GGCC	2	8	1781273	1781280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_008340	CCGG	2	8	1781283	1781290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_008340	CAGG	2	8	1785709	1785716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
529	NC_008340	TTGA	2	8	1785819	1785826	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008340	AACG	2	8	1788235	1788242	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
531	NC_008340	GCCG	2	8	1808860	1808867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_008340	ATGG	2	8	1813256	1813263	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_008340	GTTG	2	8	1814908	1814915	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008340	TCAG	2	8	1816200	1816207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
535	NC_008340	CGCC	2	8	1816263	1816270	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
536	NC_008340	GGCA	2	8	1816812	1816819	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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538	NC_008340	GCCC	2	8	1826380	1826387	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
539	NC_008340	TCCC	2	8	1826481	1826488	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
540	NC_008340	GCCA	2	8	1833448	1833455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
541	NC_008340	CAGG	2	8	1834369	1834376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
542	NC_008340	GCCG	2	8	1838741	1838748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_008340	TGCC	2	8	1839702	1839709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
544	NC_008340	TCCG	2	8	1844030	1844037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
545	NC_008340	GCCC	2	8	1845355	1845362	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
546	NC_008340	GGCA	2	8	1851798	1851805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
547	NC_008340	GCCG	2	8	1851814	1851821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
548	NC_008340	CCGG	2	8	1851826	1851833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
549	NC_008340	AGCG	2	8	1864790	1864797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
550	NC_008340	CTGC	2	8	1877251	1877258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
551	NC_008340	AGGC	2	8	1877345	1877352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
552	NC_008340	TGGC	2	8	1886934	1886941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
553	NC_008340	CCGG	2	8	1887132	1887139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
554	NC_008340	CATC	2	8	1893860	1893867	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_008340	ATCA	2	8	1897477	1897484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
556	NC_008340	GCGG	2	8	1910400	1910407	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
557	NC_008340	GATC	2	8	1912741	1912748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
558	NC_008340	GGCC	2	8	1915424	1915431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_008340	TCGA	2	8	1920143	1920150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
560	NC_008340	CCAT	2	8	1931134	1931141	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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562	NC_008340	TATC	2	8	1943170	1943177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
563	NC_008340	TGCC	2	8	1949164	1949171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
564	NC_008340	TCGT	2	8	1955517	1955524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
565	NC_008340	TCAG	2	8	1955569	1955576	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_008340	CCCG	2	8	1958574	1958581	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
567	NC_008340	TCAG	2	8	1961025	1961032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
568	NC_008340	GCCA	2	8	1965450	1965457	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
569	NC_008340	CGGG	2	8	1965507	1965514	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
570	NC_008340	CCGG	2	8	1967289	1967296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_008340	CGGC	2	8	1968635	1968642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
572	NC_008340	CCGG	2	8	1972688	1972695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
573	NC_008340	CGGG	2	8	1975044	1975051	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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575	NC_008340	GCCG	2	8	1979681	1979688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
576	NC_008340	CGGC	2	8	1979700	1979707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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581	NC_008340	CCGG	2	8	1990079	1990086	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
582	NC_008340	CGCC	2	8	1990600	1990607	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
583	NC_008340	CCGC	2	8	2014413	2014420	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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601	NC_008340	GCGG	2	8	2071637	2071644	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
602	NC_008340	AACA	2	8	2071645	2071652	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
603	NC_008340	ATCT	2	8	2075770	2075777	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
604	NC_008340	ATTA	2	8	2075846	2075853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_008340	GCCC	2	8	2084165	2084172	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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611	NC_008340	CGAC	2	8	2113096	2113103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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613	NC_008340	CCGC	2	8	2120394	2120401	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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615	NC_008340	GCGG	2	8	2123599	2123606	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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623	NC_008340	TTTG	2	8	2145646	2145653	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008340	CTTT	2	8	2154869	2154876	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_008340	GGTC	2	8	2158326	2158333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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627	NC_008340	GGAC	2	8	2158724	2158731	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
628	NC_008340	GGCT	2	8	2158959	2158966	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
629	NC_008340	GGAC	2	8	2160805	2160812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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631	NC_008340	CCGG	2	8	2163133	2163140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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633	NC_008340	CCGG	2	8	2170416	2170423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_008340	GGCC	2	8	2175956	2175963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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637	NC_008340	CCGG	2	8	2178909	2178916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
638	NC_008340	CACC	2	8	2181379	2181386	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
639	NC_008340	CTGC	2	8	2183340	2183347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
640	NC_008340	GCAG	2	8	2183482	2183489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
641	NC_008340	GGCG	2	8	2185937	2185944	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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928	NC_008340	CCGC	2	8	3247021	3247028	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
929	NC_008340	GCGG	2	8	3247892	3247899	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
930	NC_008340	CGGC	2	8	3247952	3247959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
931	NC_008340	GGGT	2	8	3251345	3251352	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
932	NC_008340	ACCC	2	8	3251400	3251407	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

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