MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 7743

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008340	CTAC	2	8	623	630	25 %	25 %	0 %	50 %	114319167
2	NC_008340	CTAC	2	8	3121	3128	25 %	25 %	0 %	50 %	114319169
3	NC_008340	GGCG	2	8	3289	3296	0 %	0 %	75 %	25 %	114319169
4	NC_008340	CGCT	2	8	3474	3481	0 %	25 %	25 %	50 %	114319169
5	NC_008340	CCAT	2	8	4142	4149	25 %	25 %	0 %	50 %	114319170
6	NC_008340	TCCT	2	8	4537	4544	0 %	50 %	0 %	50 %	114319170
7	NC_008340	GAAG	2	8	4587	4594	50 %	0 %	50 %	0 %	114319170
8	NC_008340	GATG	2	8	6132	6139	25 %	25 %	50 %	0 %	114319170
9	NC_008340	GCCG	2	8	6664	6671	0 %	0 %	50 %	50 %	114319171
10	NC_008340	TGAG	2	8	6839	6846	25 %	25 %	50 %	0 %	114319171
11	NC_008340	CGGC	2	8	6851	6858	0 %	0 %	50 %	50 %	114319171
12	NC_008340	GGTG	2	8	7056	7063	0 %	25 %	75 %	0 %	114319171
13	NC_008340	CCGG	2	8	7537	7544	0 %	0 %	50 %	50 %	114319172
14	NC_008340	CCGG	2	8	8760	8767	0 %	0 %	50 %	50 %	114319172
15	NC_008340	CGGG	2	8	10460	10467	0 %	0 %	75 %	25 %	114319174
16	NC_008340	GCCC	2	8	10555	10562	0 %	0 %	25 %	75 %	114319174
17	NC_008340	GGCC	2	8	10584	10591	0 %	0 %	50 %	50 %	114319174
18	NC_008340	GGGC	2	8	10599	10606	0 %	0 %	75 %	25 %	114319174
19	NC_008340	GATC	2	8	10914	10921	25 %	25 %	25 %	25 %	114319174
20	NC_008340	GGAA	2	8	11361	11368	50 %	0 %	50 %	0 %	114319175
21	NC_008340	CGCT	2	8	11396	11403	0 %	25 %	25 %	50 %	114319175
22	NC_008340	CGGC	3	12	11630	11641	0 %	0 %	50 %	50 %	114319175
23	NC_008340	GCCC	2	8	11677	11684	0 %	0 %	25 %	75 %	114319175
24	NC_008340	GGCG	2	8	12545	12552	0 %	0 %	75 %	25 %	114319176
25	NC_008340	GGCG	2	8	12655	12662	0 %	0 %	75 %	25 %	114319176
26	NC_008340	GCGG	2	8	13431	13438	0 %	0 %	75 %	25 %	114319177
27	NC_008340	GCCA	2	8	13562	13569	25 %	0 %	25 %	50 %	114319177
28	NC_008340	CGAT	2	8	13706	13713	25 %	25 %	25 %	25 %	114319177
29	NC_008340	CCGG	2	8	14188	14195	0 %	0 %	50 %	50 %	114319177
30	NC_008340	CATC	2	8	14202	14209	25 %	25 %	0 %	50 %	114319177
31	NC_008340	GCCG	2	8	14481	14488	0 %	0 %	50 %	50 %	114319177
32	NC_008340	CCGC	2	8	14821	14828	0 %	0 %	25 %	75 %	114319178
33	NC_008340	AGGC	2	8	14935	14942	25 %	0 %	50 %	25 %	114319178
34	NC_008340	ATCC	2	8	17194	17201	25 %	25 %	0 %	50 %	114319179
35	NC_008340	GCGG	2	8	17677	17684	0 %	0 %	75 %	25 %	114319180
36	NC_008340	CCGG	2	8	18442	18449	0 %	0 %	50 %	50 %	114319181
37	NC_008340	CGGC	2	8	18874	18881	0 %	0 %	50 %	50 %	114319181
38	NC_008340	GCCG	2	8	19044	19051	0 %	0 %	50 %	50 %	114319181
39	NC_008340	GGTG	2	8	19486	19493	0 %	25 %	75 %	0 %	114319182
40	NC_008340	TACC	2	8	19583	19590	25 %	25 %	0 %	50 %	114319182
41	NC_008340	GCGA	2	8	20217	20224	25 %	0 %	50 %	25 %	114319182
42	NC_008340	AGAA	2	8	21020	21027	75 %	0 %	25 %	0 %	114319183
43	NC_008340	CGCC	2	8	21123	21130	0 %	0 %	25 %	75 %	114319183
44	NC_008340	CGGC	2	8	21159	21166	0 %	0 %	50 %	50 %	114319183
45	NC_008340	GCCG	2	8	21167	21174	0 %	0 %	50 %	50 %	114319183
46	NC_008340	CGGC	2	8	21280	21287	0 %	0 %	50 %	50 %	114319183
47	NC_008340	CCGC	2	8	21593	21600	0 %	0 %	25 %	75 %	114319184
48	NC_008340	GCCG	2	8	22163	22170	0 %	0 %	50 %	50 %	114319184
49	NC_008340	CCAG	2	8	22256	22263	25 %	0 %	25 %	50 %	114319184
50	NC_008340	GAGG	2	8	23194	23201	25 %	0 %	75 %	0 %	114319185
51	NC_008340	CAGC	2	8	23352	23359	25 %	0 %	25 %	50 %	114319185
52	NC_008340	CGGC	2	8	23459	23466	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
53	NC_008340	CCTT	2	8	23954	23961	0 %	50 %	0 %	50 %	114319185
54	NC_008340	CTGG	2	8	24235	24242	0 %	25 %	50 %	25 %	114319185
55	NC_008340	GGCG	2	8	24435	24442	0 %	0 %	75 %	25 %	114319185
56	NC_008340	GCGG	2	8	24636	24643	0 %	0 %	75 %	25 %	114319186
57	NC_008340	GACT	2	8	25139	25146	25 %	25 %	25 %	25 %	114319187
58	NC_008340	CGGG	2	8	25340	25347	0 %	0 %	75 %	25 %	114319187
59	NC_008340	CGGC	2	8	25943	25950	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
60	NC_008340	CAGC	2	8	26097	26104	25 %	0 %	25 %	50 %	114319188
61	NC_008340	GCGG	2	8	26111	26118	0 %	0 %	75 %	25 %	114319188
62	NC_008340	CCGG	2	8	26195	26202	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
63	NC_008340	GGGC	2	8	26352	26359	0 %	0 %	75 %	25 %	114319188
64	NC_008340	GGTC	2	8	26466	26473	0 %	25 %	50 %	25 %	114319188
65	NC_008340	TGGA	2	8	26572	26579	25 %	25 %	50 %	0 %	114319188
66	NC_008340	CGGA	2	8	26860	26867	25 %	0 %	50 %	25 %	114319188
67	NC_008340	GCCG	2	8	26936	26943	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
68	NC_008340	GCCC	2	8	27442	27449	0 %	0 %	25 %	75 %	114319189
69	NC_008340	CCGG	2	8	27533	27540	0 %	0 %	50 %	50 %	114319189
70	NC_008340	GGCC	2	8	28068	28075	0 %	0 %	50 %	50 %	114319190
71	NC_008340	TGCC	2	8	28878	28885	0 %	25 %	25 %	50 %	114319192
72	NC_008340	CGGC	2	8	29303	29310	0 %	0 %	50 %	50 %	114319192
73	NC_008340	TGCC	2	8	29607	29614	0 %	25 %	25 %	50 %	114319192
74	NC_008340	CGGG	2	8	29900	29907	0 %	0 %	75 %	25 %	114319192
75	NC_008340	GCCG	2	8	30326	30333	0 %	0 %	50 %	50 %	114319193
76	NC_008340	GCCA	2	8	30348	30355	25 %	0 %	25 %	50 %	114319193
77	NC_008340	CGCC	2	8	32506	32513	0 %	0 %	25 %	75 %	114319195
78	NC_008340	GATC	2	8	33031	33038	25 %	25 %	25 %	25 %	114319196
79	NC_008340	CCAT	2	8	34021	34028	25 %	25 %	0 %	50 %	114319197
80	NC_008340	GGGT	2	8	34248	34255	0 %	25 %	75 %	0 %	114319197
81	NC_008340	CAGC	2	8	36334	36341	25 %	0 %	25 %	50 %	114319198
82	NC_008340	CCGC	2	8	36819	36826	0 %	0 %	25 %	75 %	114319199
83	NC_008340	GGGT	2	8	37055	37062	0 %	25 %	75 %	0 %	114319199
84	NC_008340	GCCG	2	8	37125	37132	0 %	0 %	50 %	50 %	114319199
85	NC_008340	CGGC	2	8	38052	38059	0 %	0 %	50 %	50 %	114319200
86	NC_008340	GCCG	2	8	38257	38264	0 %	0 %	50 %	50 %	114319201
87	NC_008340	ATCG	2	8	40082	40089	25 %	25 %	25 %	25 %	114319202
88	NC_008340	GCGG	2	8	40455	40462	0 %	0 %	75 %	25 %	114319203
89	NC_008340	GGGC	2	8	40505	40512	0 %	0 %	75 %	25 %	114319203
90	NC_008340	GCCA	2	8	42131	42138	25 %	0 %	25 %	50 %	114319205
91	NC_008340	CCAT	2	8	42693	42700	25 %	25 %	0 %	50 %	114319205
92	NC_008340	GTTG	2	8	42772	42779	0 %	50 %	50 %	0 %	114319205
93	NC_008340	CAAC	2	8	42948	42955	50 %	0 %	0 %	50 %	114319205
94	NC_008340	TGCC	2	8	43658	43665	0 %	25 %	25 %	50 %	114319206
95	NC_008340	GGCG	2	8	44249	44256	0 %	0 %	75 %	25 %	114319206
96	NC_008340	CTGG	2	8	44739	44746	0 %	25 %	50 %	25 %	114319206
97	NC_008340	TGCT	2	8	44856	44863	0 %	50 %	25 %	25 %	114319206
98	NC_008340	GCGA	2	8	45658	45665	25 %	0 %	50 %	25 %	114319206
99	NC_008340	CAGG	2	8	45837	45844	25 %	0 %	50 %	25 %	114319206
100	NC_008340	CAGG	2	8	45894	45901	25 %	0 %	50 %	25 %	114319206
101	NC_008340	TCGG	2	8	46033	46040	0 %	25 %	50 %	25 %	114319206
102	NC_008340	AGCC	2	8	46342	46349	25 %	0 %	25 %	50 %	114319206
103	NC_008340	GCTG	2	8	46920	46927	0 %	25 %	50 %	25 %	114319207
104	NC_008340	GCAG	2	8	47077	47084	25 %	0 %	50 %	25 %	114319207
105	NC_008340	ACAA	2	8	47142	47149	75 %	0 %	0 %	25 %	114319207
106	NC_008340	CAGC	2	8	47150	47157	25 %	0 %	25 %	50 %	114319207
107	NC_008340	AGCC	2	8	47202	47209	25 %	0 %	25 %	50 %	114319207
108	NC_008340	CCGG	2	8	48178	48185	0 %	0 %	50 %	50 %	114319208
109	NC_008340	GCAG	2	8	49491	49498	25 %	0 %	50 %	25 %	114319209
110	NC_008340	ACCG	2	8	50616	50623	25 %	0 %	25 %	50 %	114319210
111	NC_008340	TCCA	2	8	50973	50980	25 %	25 %	0 %	50 %	114319210
112	NC_008340	GTCG	2	8	51078	51085	0 %	25 %	50 %	25 %	114319210
113	NC_008340	GCCG	2	8	51425	51432	0 %	0 %	50 %	50 %	114319211
114	NC_008340	CTTC	2	8	51588	51595	0 %	50 %	0 %	50 %	114319212
115	NC_008340	AGCC	2	8	51883	51890	25 %	0 %	25 %	50 %	114319212
116	NC_008340	GCCG	2	8	52041	52048	0 %	0 %	50 %	50 %	114319212
117	NC_008340	GGGC	2	8	53169	53176	0 %	0 %	75 %	25 %	114319212
118	NC_008340	GCGG	2	8	53780	53787	0 %	0 %	75 %	25 %	114319213
119	NC_008340	GGTG	2	8	53926	53933	0 %	25 %	75 %	0 %	114319213
120	NC_008340	TGCC	2	8	54439	54446	0 %	25 %	25 %	50 %	114319214
121	NC_008340	GCGG	2	8	54735	54742	0 %	0 %	75 %	25 %	114319214
122	NC_008340	CCAC	2	8	54788	54795	25 %	0 %	0 %	75 %	114319214
123	NC_008340	GCCG	2	8	54876	54883	0 %	0 %	50 %	50 %	114319214
124	NC_008340	GGTC	2	8	55051	55058	0 %	25 %	50 %	25 %	114319215
125	NC_008340	GCCT	2	8	55077	55084	0 %	25 %	25 %	50 %	114319215
126	NC_008340	TGCC	2	8	56077	56084	0 %	25 %	25 %	50 %	114319216
127	NC_008340	CGAC	2	8	57462	57469	25 %	0 %	25 %	50 %	114319217
128	NC_008340	CGCC	2	8	57569	57576	0 %	0 %	25 %	75 %	114319217
129	NC_008340	GTCC	2	8	57624	57631	0 %	25 %	25 %	50 %	114319217
130	NC_008340	TTGC	2	8	57870	57877	0 %	50 %	25 %	25 %	114319218
131	NC_008340	GGCC	2	8	58082	58089	0 %	0 %	50 %	50 %	114319218
132	NC_008340	GCTG	2	8	58147	58154	0 %	25 %	50 %	25 %	114319218
133	NC_008340	GGTC	2	8	58169	58176	0 %	25 %	50 %	25 %	114319218
134	NC_008340	ATTG	2	8	58367	58374	25 %	50 %	25 %	0 %	114319218
135	NC_008340	GTGG	2	8	58723	58730	0 %	25 %	75 %	0 %	114319218
136	NC_008340	CCAC	2	8	58786	58793	25 %	0 %	0 %	75 %	114319218
137	NC_008340	CCGG	2	8	59064	59071	0 %	0 %	50 %	50 %	114319218
138	NC_008340	TGCC	2	8	59656	59663	0 %	25 %	25 %	50 %	114319219
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