MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 4507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008340	CA	3	6	1595	1600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008340	CA	3	6	2070	2075	50 %	0 %	0 %	50 %	114319168
3	NC_008340	GC	3	6	2146	2151	0 %	0 %	50 %	50 %	114319168
4	NC_008340	TG	3	6	3238	3243	0 %	50 %	50 %	0 %	114319169
5	NC_008340	CG	3	6	3597	3602	0 %	0 %	50 %	50 %	114319169
6	NC_008340	AG	3	6	3937	3942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008340	GC	3	6	5704	5709	0 %	0 %	50 %	50 %	114319170
8	NC_008340	CT	3	6	6001	6006	0 %	50 %	0 %	50 %	114319170
9	NC_008340	GC	3	6	7078	7083	0 %	0 %	50 %	50 %	114319171
10	NC_008340	GC	3	6	8503	8508	0 %	0 %	50 %	50 %	114319172
11	NC_008340	GC	3	6	9644	9649	0 %	0 %	50 %	50 %	114319173
12	NC_008340	GT	3	6	10155	10160	0 %	50 %	50 %	0 %	114319173
13	NC_008340	CG	3	6	10188	10193	0 %	0 %	50 %	50 %	114319173
14	NC_008340	GC	3	6	11046	11051	0 %	0 %	50 %	50 %	114319174
15	NC_008340	GC	3	6	11307	11312	0 %	0 %	50 %	50 %	114319174
16	NC_008340	TG	3	6	11556	11561	0 %	50 %	50 %	0 %	114319175
17	NC_008340	CG	3	6	12252	12257	0 %	0 %	50 %	50 %	114319176
18	NC_008340	CG	3	6	13291	13296	0 %	0 %	50 %	50 %	114319177
19	NC_008340	GC	3	6	13367	13372	0 %	0 %	50 %	50 %	114319177
20	NC_008340	CG	3	6	14362	14367	0 %	0 %	50 %	50 %	114319177
21	NC_008340	GC	3	6	15519	15524	0 %	0 %	50 %	50 %	114319178
22	NC_008340	GC	3	6	16406	16411	0 %	0 %	50 %	50 %	114319179
23	NC_008340	GC	3	6	16611	16616	0 %	0 %	50 %	50 %	114319179
24	NC_008340	GC	3	6	17095	17100	0 %	0 %	50 %	50 %	114319179
25	NC_008340	GC	3	6	18147	18152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008340	GC	3	6	20076	20081	0 %	0 %	50 %	50 %	114319182
27	NC_008340	GC	3	6	20785	20790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008340	CG	3	6	20896	20901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008340	CG	3	6	21891	21896	0 %	0 %	50 %	50 %	114319184
30	NC_008340	TG	3	6	22157	22162	0 %	50 %	50 %	0 %	114319184
31	NC_008340	CG	3	6	22249	22254	0 %	0 %	50 %	50 %	114319184
32	NC_008340	TC	3	6	22511	22516	0 %	50 %	0 %	50 %	114319184
33	NC_008340	GC	3	6	23207	23212	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
34	NC_008340	GC	3	6	24261	24266	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
35	NC_008340	CG	3	6	24372	24377	0 %	0 %	50 %	50 %	114319185
36	NC_008340	TG	3	6	24475	24480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008340	CT	3	6	24486	24491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008340	GA	3	6	24856	24861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008340	GC	3	6	25091	25096	0 %	0 %	50 %	50 %	114319187
40	NC_008340	GC	4	8	25510	25517	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
41	NC_008340	CT	3	6	26128	26133	0 %	50 %	0 %	50 %	114319188
42	NC_008340	GC	4	8	27084	27091	0 %	0 %	50 %	50 %	114319188
43	NC_008340	CG	3	6	27253	27258	0 %	0 %	50 %	50 %	114319189
44	NC_008340	TC	3	6	29073	29078	0 %	50 %	0 %	50 %	114319192
45	NC_008340	CG	3	6	30018	30023	0 %	0 %	50 %	50 %	114319192
46	NC_008340	GC	3	6	30883	30888	0 %	0 %	50 %	50 %	114319194
47	NC_008340	TC	3	6	31633	31638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008340	CG	3	6	32443	32448	0 %	0 %	50 %	50 %	114319195
49	NC_008340	GC	3	6	32894	32899	0 %	0 %	50 %	50 %	114319196
50	NC_008340	AC	3	6	33276	33281	50 %	0 %	0 %	50 %	114319196
51	NC_008340	GC	3	6	33655	33660	0 %	0 %	50 %	50 %	114319196
52	NC_008340	CG	3	6	34345	34350	0 %	0 %	50 %	50 %	114319197
53	NC_008340	TC	3	6	34778	34783	0 %	50 %	0 %	50 %	114319197
54	NC_008340	GC	3	6	35056	35061	0 %	0 %	50 %	50 %	114319197
55	NC_008340	AG	3	6	35321	35326	50 %	0 %	50 %	0 %	114319197
56	NC_008340	CG	3	6	35952	35957	0 %	0 %	50 %	50 %	114319198
57	NC_008340	GA	3	6	38786	38791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008340	GC	3	6	39000	39005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008340	CG	3	6	39037	39042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008340	GC	3	6	39734	39739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008340	CA	3	6	39905	39910	50 %	0 %	0 %	50 %	114319202
62	NC_008340	GC	3	6	40074	40079	0 %	0 %	50 %	50 %	114319202
63	NC_008340	CT	4	8	41057	41064	0 %	50 %	0 %	50 %	114319203
64	NC_008340	CG	3	6	41220	41225	0 %	0 %	50 %	50 %	114319203
65	NC_008340	GA	3	6	41275	41280	50 %	0 %	50 %	0 %	114319203
66	NC_008340	CG	3	6	42081	42086	0 %	0 %	50 %	50 %	114319205
67	NC_008340	GC	3	6	42390	42395	0 %	0 %	50 %	50 %	114319205
68	NC_008340	AG	3	6	42621	42626	50 %	0 %	50 %	0 %	114319205
69	NC_008340	GC	3	6	43214	43219	0 %	0 %	50 %	50 %	114319205
70	NC_008340	GC	3	6	43964	43969	0 %	0 %	50 %	50 %	114319206
71	NC_008340	CG	3	6	45950	45955	0 %	0 %	50 %	50 %	114319206
72	NC_008340	CG	3	6	46053	46058	0 %	0 %	50 %	50 %	114319206
73	NC_008340	CG	3	6	46484	46489	0 %	0 %	50 %	50 %	114319206
74	NC_008340	GC	3	6	46746	46751	0 %	0 %	50 %	50 %	114319207
75	NC_008340	GC	3	6	47023	47028	0 %	0 %	50 %	50 %	114319207
76	NC_008340	GC	3	6	47443	47448	0 %	0 %	50 %	50 %	114319207
77	NC_008340	AG	3	6	49106	49111	50 %	0 %	50 %	0 %	114319209
78	NC_008340	CG	3	6	50489	50494	0 %	0 %	50 %	50 %	114319210
79	NC_008340	CG	3	6	50751	50756	0 %	0 %	50 %	50 %	114319210
80	NC_008340	GC	3	6	50963	50968	0 %	0 %	50 %	50 %	114319210
81	NC_008340	CG	3	6	51863	51868	0 %	0 %	50 %	50 %	114319212
82	NC_008340	GC	3	6	52087	52092	0 %	0 %	50 %	50 %	114319212
83	NC_008340	GC	3	6	52654	52659	0 %	0 %	50 %	50 %	114319212
84	NC_008340	TC	3	6	52956	52961	0 %	50 %	0 %	50 %	114319212
85	NC_008340	CG	3	6	53011	53016	0 %	0 %	50 %	50 %	114319212
86	NC_008340	GC	3	6	53037	53042	0 %	0 %	50 %	50 %	114319212
87	NC_008340	GC	3	6	53200	53205	0 %	0 %	50 %	50 %	114319212
88	NC_008340	GC	3	6	53721	53726	0 %	0 %	50 %	50 %	114319213
89	NC_008340	TC	3	6	54197	54202	0 %	50 %	0 %	50 %	114319213
90	NC_008340	CG	3	6	54203	54208	0 %	0 %	50 %	50 %	114319213
91	NC_008340	GC	3	6	54813	54818	0 %	0 %	50 %	50 %	114319214
92	NC_008340	CG	3	6	54987	54992	0 %	0 %	50 %	50 %	114319214
93	NC_008340	GC	3	6	55440	55445	0 %	0 %	50 %	50 %	114319215
94	NC_008340	CG	3	6	55516	55521	0 %	0 %	50 %	50 %	114319215
95	NC_008340	CT	3	6	56511	56516	0 %	50 %	0 %	50 %	114319216
96	NC_008340	GC	3	6	56635	56640	0 %	0 %	50 %	50 %	114319216
97	NC_008340	CT	3	6	57511	57516	0 %	50 %	0 %	50 %	114319217
98	NC_008340	GC	3	6	57790	57795	0 %	0 %	50 %	50 %	114319218
99	NC_008340	GC	3	6	57857	57862	0 %	0 %	50 %	50 %	114319218
100	NC_008340	GC	3	6	58043	58048	0 %	0 %	50 %	50 %	114319218
101	NC_008340	CG	3	6	58141	58146	0 %	0 %	50 %	50 %	114319218
102	NC_008340	CG	3	6	58416	58421	0 %	0 %	50 %	50 %	114319218
103	NC_008340	CG	3	6	58485	58490	0 %	0 %	50 %	50 %	114319218
104	NC_008340	AG	3	6	58944	58949	50 %	0 %	50 %	0 %	114319218
105	NC_008340	AC	3	6	58986	58991	50 %	0 %	0 %	50 %	114319218
106	NC_008340	GC	4	8	60602	60609	0 %	0 %	50 %	50 %	114319220
107	NC_008340	GC	3	6	61522	61527	0 %	0 %	50 %	50 %	114319221
108	NC_008340	CG	3	6	63411	63416	0 %	0 %	50 %	50 %	114319221
109	NC_008340	GC	3	6	67887	67892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008340	GC	3	6	68037	68042	0 %	0 %	50 %	50 %	114319226
111	NC_008340	GC	3	6	68101	68106	0 %	0 %	50 %	50 %	114319226
112	NC_008340	GC	3	6	68188	68193	0 %	0 %	50 %	50 %	114319226
113	NC_008340	CT	3	6	68678	68683	0 %	50 %	0 %	50 %	114319227
114	NC_008340	TC	3	6	69265	69270	0 %	50 %	0 %	50 %	114319227
115	NC_008340	CG	3	6	69271	69276	0 %	0 %	50 %	50 %	114319227
116	NC_008340	GC	3	6	69394	69399	0 %	0 %	50 %	50 %	114319227
117	NC_008340	GC	3	6	69503	69508	0 %	0 %	50 %	50 %	114319227
118	NC_008340	GC	3	6	69926	69931	0 %	0 %	50 %	50 %	114319228
119	NC_008340	CG	3	6	71376	71381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008340	CT	3	6	71408	71413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_008340	GC	3	6	72518	72523	0 %	0 %	50 %	50 %	114319231
122	NC_008340	GC	3	6	72776	72781	0 %	0 %	50 %	50 %	114319231
123	NC_008340	CG	3	6	73431	73436	0 %	0 %	50 %	50 %	114319232
124	NC_008340	GC	3	6	76670	76675	0 %	0 %	50 %	50 %	114319235
125	NC_008340	GC	3	6	77935	77940	0 %	0 %	50 %	50 %	114319236
126	NC_008340	CG	3	6	78627	78632	0 %	0 %	50 %	50 %	114319236
127	NC_008340	GC	3	6	78855	78860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_008340	CG	3	6	79269	79274	0 %	0 %	50 %	50 %	114319237
129	NC_008340	CG	4	8	79630	79637	0 %	0 %	50 %	50 %	114319237
130	NC_008340	GC	3	6	79949	79954	0 %	0 %	50 %	50 %	114319238
131	NC_008340	CG	3	6	80612	80617	0 %	0 %	50 %	50 %	114319238
132	NC_008340	GC	3	6	80680	80685	0 %	0 %	50 %	50 %	114319238
133	NC_008340	CA	3	6	81047	81052	50 %	0 %	0 %	50 %	114319238
134	NC_008340	CG	3	6	81467	81472	0 %	0 %	50 %	50 %	114319238
135	NC_008340	GC	3	6	81829	81834	0 %	0 %	50 %	50 %	114319238
136	NC_008340	CG	3	6	84876	84881	0 %	0 %	50 %	50 %	114319242
137	NC_008340	GT	3	6	85034	85039	0 %	50 %	50 %	0 %	114319242
138	NC_008340	GC	3	6	85638	85643	0 %	0 %	50 %	50 %	114319242
139	NC_008340	GC	3	6	85766	85771	0 %	0 %	50 %	50 %	114319242
140	NC_008340	GC	3	6	86637	86642	0 %	0 %	50 %	50 %	114319242
141	NC_008340	CG	3	6	86766	86771	0 %	0 %	50 %	50 %	114319242
142	NC_008340	AC	3	6	88112	88117	50 %	0 %	0 %	50 %	114319243
143	NC_008340	GC	3	6	88703	88708	0 %	0 %	50 %	50 %	114319243
144	NC_008340	GA	3	6	89399	89404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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