MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008322	TGAAGG	2	12	44447	44458	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008322	TAACAC	2	12	64829	64840	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008322	TTTTGT	2	12	73732	73743	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008322	CGATAA	2	12	75469	75480	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_008322	GATCTC	2	12	110311	110322	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008322	GCTTGT	2	12	126897	126908	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_008322	TGAAGG	2	12	200866	200877	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008322	CTGCTC	2	12	239024	239035	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_008322	TGAAGG	2	12	252112	252123	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008322	CTGATA	2	12	294859	294870	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008322	GTTTAG	2	12	385253	385264	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008322	TGAAGG	2	12	444760	444771	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008322	TGAAGG	2	12	451159	451170	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008322	CAAAGT	4	24	488888	488911	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_008322	GACAAA	2	12	495551	495562	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_008322	AGATAT	2	12	561773	561784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008322	GCTGAT	2	12	574201	574212	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008322	CTGATG	2	12	597934	597945	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008322	ATTTAG	2	12	623473	623484	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008322	TTGATT	2	12	631231	631242	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008322	TTTATT	2	12	636210	636221	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008322	TTAAAT	2	12	651787	651798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008322	ATGTTT	2	12	657401	657412	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008322	AGAAAG	2	12	721251	721262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008322	TTTTTA	2	12	784690	784701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008322	ACTAAC	2	12	829030	829041	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008322	CTGCTA	2	12	855153	855164	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008322	CAAAGG	2	12	876894	876905	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_008322	ATAAAA	2	12	895881	895892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008322	TGTGGC	2	12	916854	916865	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_008322	TTGAGT	2	12	922163	922174	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008322	ATAAAA	2	12	923739	923750	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008322	TCCATA	2	12	945398	945409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_008322	ATGGCA	2	12	982511	982522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_008322	AATGCT	2	12	1039248	1039259	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_008322	TAAACC	2	12	1039475	1039486	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008322	TTTCAT	2	12	1077454	1077465	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_008322	TAATGA	2	12	1097843	1097854	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008322	ATCTTC	2	12	1151944	1151955	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008322	GACTTT	2	12	1152871	1152882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_008322	GATTTT	2	12	1152883	1152894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008322	GCTCTT	2	12	1211853	1211864	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008322	TGTAAT	2	12	1273598	1273609	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008322	TAGTAT	2	12	1273657	1273668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008322	AAAACA	2	12	1284451	1284462	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008322	TTCTTG	2	12	1313781	1313792	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_008322	TGAAAT	2	12	1314018	1314029	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008322	GGCACT	2	12	1355314	1355325	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_008322	ATTGGT	2	12	1386891	1386902	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008322	TAGTAA	2	12	1409437	1409448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008322	TTACGT	2	12	1413645	1413656	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_008322	TAACAA	2	12	1420554	1420565	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_008322	TGCTTA	2	12	1465917	1465928	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_008322	ATCATT	2	12	1479407	1479418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_008322	CTAAAG	2	12	1492480	1492491	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_008322	TATGGC	2	12	1510621	1510632	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008322	GCTAAA	9	54	1526464	1526517	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008322	TAAATC	2	12	1536596	1536607	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_008322	AGCGCT	2	12	1577637	1577648	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_008322	GAATGT	2	12	1595476	1595487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008322	ACGTTA	2	12	1639058	1639069	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_008322	AAAACA	2	12	1722247	1722258	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_008322	TTTTAG	2	12	1746129	1746140	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008322	TGCCCA	2	12	1754427	1754438	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008322	ATTGAT	2	12	1754829	1754840	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008322	TTTGAG	2	12	1810375	1810386	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008322	GGAACT	2	12	1822843	1822854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_008322	TGAAGG	2	12	1865730	1865741	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008322	TATTTA	2	12	1871194	1871205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008322	GACAGC	2	12	1929071	1929082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008322	ATTGCA	2	12	1937379	1937390	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_008322	ACGTAA	2	12	1975378	1975389	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_008322	ACTTCC	2	12	2028994	2029005	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008322	ACGTCA	2	12	2089786	2089797	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008322	GCTAAT	2	12	2090868	2090879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008322	ACTTAA	2	12	2117038	2117049	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_008322	AAATAC	2	12	2117234	2117245	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_008322	TTTTGC	2	12	2117473	2117484	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_008322	TAAATT	2	12	2156449	2156460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008322	GGCTTA	2	12	2161910	2161921	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008322	AGTTAA	2	12	2189452	2189463	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008322	CAGATG	2	12	2190663	2190674	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_008322	CGCAGT	2	12	2237083	2237094	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008322	TGTGTC	2	12	2239674	2239685	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_008322	CAATTT	2	12	2248344	2248355	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_008322	ATATTG	2	12	2249461	2249472	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008322	TTAAAA	2	12	2249550	2249561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008322	TGCAGC	2	12	2264683	2264694	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008322	GTTAAA	2	12	2278205	2278216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008322	GATAGA	2	12	2294101	2294112	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008322	CTTTTA	2	12	2323303	2323314	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_008322	GCATTT	2	12	2326076	2326087	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008322	CTTTTT	2	12	2336708	2336719	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_008322	CAAAAA	2	12	2365508	2365519	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_008322	CTAAGA	2	12	2380648	2380659	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_008322	CGATCG	2	12	2431982	2431993	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008322	TGTTTT	2	12	2597270	2597281	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008322	AACAAT	2	12	2630601	2630612	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_008322	GACAGC	2	12	2634079	2634090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008322	TTAAAT	2	12	2685632	2685643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008322	TAAAAA	2	12	2736965	2736976	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008322	CGCGAG	2	12	2771519	2771530	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008322	GCAGTG	2	12	2817624	2817635	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_008322	CACACT	2	12	2822683	2822694	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008322	AGAAAA	2	12	2828961	2828972	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008322	CTTTAC	2	12	2834376	2834387	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008322	GATGCT	2	12	2861977	2861988	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_008322	AAAAAT	2	12	2910108	2910119	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008322	GCCAGC	2	12	2913796	2913807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008322	AAAACA	2	12	2920600	2920611	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_008322	GTCCCA	2	12	2928427	2928438	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008322	CTCAAT	2	12	2944893	2944904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008322	CTTAAC	2	12	2965002	2965013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008322	CAGCTT	2	12	3039159	3039170	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_008322	AAAAAT	2	12	3039308	3039319	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008322	CTGCAA	2	12	3044663	3044674	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008322	TAGAAA	2	12	3047217	3047228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008322	GACTTT	2	12	3065097	3065108	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_008322	CCCTTA	2	12	3073162	3073173	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008322	CTTTTA	2	12	3094941	3094952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_008322	TCACAA	2	12	3112748	3112759	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008322	GCATGG	2	12	3117452	3117463	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_008322	GGCTTT	2	12	3138015	3138026	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_008322	GTCTTG	2	12	3150347	3150358	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_008322	CTTTAT	2	12	3164915	3164926	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_008322	GGCAGG	2	12	3268299	3268310	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_008322	TTTGAA	2	12	3280383	3280394	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008322	TATTGA	2	12	3282402	3282413	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008322	CAAAAA	2	12	3285831	3285842	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_008322	TAAACC	2	12	3305304	3305315	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008322	CAATTT	2	12	3318213	3318224	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_008322	GATCTC	2	12	3323290	3323301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_008322	CAATAA	2	12	3347080	3347091	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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138	NC_008322	AATATT	2	12	3409333	3409344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008322	TGTTAT	2	12	3442910	3442921	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008322	CGCCCT	2	12	3450462	3450473	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_008322	AACTTA	2	12	3465409	3465420	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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143	NC_008322	GTTAAC	2	12	3494795	3494806	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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146	NC_008322	TCACCT	2	12	3559615	3559626	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_008322	GAAAAA	2	12	3576589	3576600	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008322	TATTTT	2	12	3576606	3576617	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_008322	TTTTTA	2	12	3706166	3706177	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008322	TAAGCG	2	12	3709217	3709228	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.