MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 10733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008322	ATGG	2	8	177	184	25 %	25 %	50 %	0 %	114045514
2	NC_008322	CCGT	2	8	320	327	0 %	25 %	25 %	50 %	114045514
3	NC_008322	TAAC	2	8	1309	1316	50 %	25 %	0 %	25 %	114045514
4	NC_008322	TCAC	2	8	1600	1607	25 %	25 %	0 %	50 %	114045515
5	NC_008322	TGAT	2	8	1896	1903	25 %	50 %	25 %	0 %	114045515
6	NC_008322	CGTT	2	8	1933	1940	0 %	50 %	25 %	25 %	114045515
7	NC_008322	AAGC	2	8	2273	2280	50 %	0 %	25 %	25 %	114045515
8	NC_008322	ATGT	2	8	2555	2562	25 %	50 %	25 %	0 %	114045515
9	NC_008322	GGAT	2	8	2671	2678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008322	CGTT	2	8	2894	2901	0 %	50 %	25 %	25 %	114045516
11	NC_008322	GTAG	2	8	3524	3531	25 %	25 %	50 %	0 %	114045516
12	NC_008322	GAAT	2	8	4481	4488	50 %	25 %	25 %	0 %	114045517
13	NC_008322	GCAA	2	8	5467	5474	50 %	0 %	25 %	25 %	114045517
14	NC_008322	GAAG	2	8	5987	5994	50 %	0 %	50 %	0 %	114045517
15	NC_008322	TTTG	2	8	6329	6336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008322	TATC	2	8	6346	6353	25 %	50 %	0 %	25 %	114045518
17	NC_008322	CTGG	2	8	6422	6429	0 %	25 %	50 %	25 %	114045518
18	NC_008322	GAGC	2	8	6718	6725	25 %	0 %	50 %	25 %	114045518
19	NC_008322	TATC	2	8	7079	7086	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_008322	ATAG	2	8	7097	7104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008322	CGTG	2	8	8659	8666	0 %	25 %	50 %	25 %	114045520
22	NC_008322	ATTT	2	8	8687	8694	25 %	75 %	0 %	0 %	114045520
23	NC_008322	TCAC	2	8	8912	8919	25 %	25 %	0 %	50 %	114045520
24	NC_008322	TTGG	2	8	9116	9123	0 %	50 %	50 %	0 %	114045520
25	NC_008322	GGTA	2	8	9512	9519	25 %	25 %	50 %	0 %	114045521
26	NC_008322	GGCG	2	8	10054	10061	0 %	0 %	75 %	25 %	114045521
27	NC_008322	ATGC	2	8	10064	10071	25 %	25 %	25 %	25 %	114045521
28	NC_008322	GCGG	2	8	10145	10152	0 %	0 %	75 %	25 %	114045521
29	NC_008322	GAAT	2	8	10831	10838	50 %	25 %	25 %	0 %	114045521
30	NC_008322	AAGA	2	8	11223	11230	75 %	0 %	25 %	0 %	114045521
31	NC_008322	AAGT	2	8	11775	11782	50 %	25 %	25 %	0 %	114045522
32	NC_008322	GCAG	2	8	12842	12849	25 %	0 %	50 %	25 %	114045523
33	NC_008322	GAGC	2	8	13421	13428	25 %	0 %	50 %	25 %	114045524
34	NC_008322	ACAT	2	8	13448	13455	50 %	25 %	0 %	25 %	114045524
35	NC_008322	GGTT	2	8	13742	13749	0 %	50 %	50 %	0 %	114045524
36	NC_008322	GAGT	2	8	13813	13820	25 %	25 %	50 %	0 %	114045524
37	NC_008322	GATT	2	8	15216	15223	25 %	50 %	25 %	0 %	114045524
38	NC_008322	CTGA	2	8	15568	15575	25 %	25 %	25 %	25 %	114045524
39	NC_008322	AGGC	2	8	15603	15610	25 %	0 %	50 %	25 %	114045524
40	NC_008322	CGAC	2	8	15728	15735	25 %	0 %	25 %	50 %	114045524
41	NC_008322	TGGC	2	8	16074	16081	0 %	25 %	50 %	25 %	114045524
42	NC_008322	ATTG	2	8	17656	17663	25 %	50 %	25 %	0 %	114045527
43	NC_008322	ATAA	2	8	17742	17749	75 %	25 %	0 %	0 %	114045527
44	NC_008322	AATC	2	8	18395	18402	50 %	25 %	0 %	25 %	114045527
45	NC_008322	CCAG	2	8	19623	19630	25 %	0 %	25 %	50 %	114045528
46	NC_008322	TCTT	2	8	20218	20225	0 %	75 %	0 %	25 %	114045529
47	NC_008322	TTGA	2	8	20725	20732	25 %	50 %	25 %	0 %	114045529
48	NC_008322	TCAC	2	8	20767	20774	25 %	25 %	0 %	50 %	114045529
49	NC_008322	TTGC	2	8	22025	22032	0 %	50 %	25 %	25 %	114045529
50	NC_008322	ATTA	2	8	22604	22611	50 %	50 %	0 %	0 %	114045530
51	NC_008322	CCAT	2	8	23551	23558	25 %	25 %	0 %	50 %	114045530
52	NC_008322	TACT	2	8	23919	23926	25 %	50 %	0 %	25 %	114045531
53	NC_008322	GCCA	2	8	23951	23958	25 %	0 %	25 %	50 %	114045531
54	NC_008322	GTGC	2	8	24146	24153	0 %	25 %	50 %	25 %	114045531
55	NC_008322	TGAA	2	8	24360	24367	50 %	25 %	25 %	0 %	114045531
56	NC_008322	TTAT	2	8	24634	24641	25 %	75 %	0 %	0 %	114045532
57	NC_008322	ATCT	2	8	25057	25064	25 %	50 %	0 %	25 %	114045532
58	NC_008322	GCGG	2	8	25552	25559	0 %	0 %	75 %	25 %	114045532
59	NC_008322	GATT	2	8	26329	26336	25 %	50 %	25 %	0 %	114045533
60	NC_008322	GACC	2	8	26397	26404	25 %	0 %	25 %	50 %	114045533
61	NC_008322	TTTA	2	8	26991	26998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008322	AATA	2	8	27361	27368	75 %	25 %	0 %	0 %	114045535
63	NC_008322	TGAT	2	8	27521	27528	25 %	50 %	25 %	0 %	114045535
64	NC_008322	AAAG	2	8	27723	27730	75 %	0 %	25 %	0 %	114045536
65	NC_008322	ATAA	2	8	30176	30183	75 %	25 %	0 %	0 %	114045537
66	NC_008322	GGCA	2	8	30264	30271	25 %	0 %	50 %	25 %	114045537
67	NC_008322	CACC	2	8	30450	30457	25 %	0 %	0 %	75 %	114045537
68	NC_008322	TTAA	2	8	31379	31386	50 %	50 %	0 %	0 %	114045538
69	NC_008322	GACA	2	8	33019	33026	50 %	0 %	25 %	25 %	114045540
70	NC_008322	ACTG	2	8	33342	33349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008322	GTAT	2	8	33948	33955	25 %	50 %	25 %	0 %	114045541
72	NC_008322	AATT	2	8	34506	34513	50 %	50 %	0 %	0 %	114045541
73	NC_008322	GTTT	2	8	34777	34784	0 %	75 %	25 %	0 %	114045542
74	NC_008322	TTAT	2	8	34840	34847	25 %	75 %	0 %	0 %	114045542
75	NC_008322	TCTT	2	8	35202	35209	0 %	75 %	0 %	25 %	114045542
76	NC_008322	ACTC	2	8	35735	35742	25 %	25 %	0 %	50 %	114045543
77	NC_008322	TTGG	2	8	35783	35790	0 %	50 %	50 %	0 %	114045543
78	NC_008322	CATT	2	8	35847	35854	25 %	50 %	0 %	25 %	114045543
79	NC_008322	GCCT	2	8	35990	35997	0 %	25 %	25 %	50 %	114045543
80	NC_008322	GCAC	2	8	36286	36293	25 %	0 %	25 %	50 %	114045544
81	NC_008322	GCGA	2	8	37121	37128	25 %	0 %	50 %	25 %	114045545
82	NC_008322	CGTG	2	8	37282	37289	0 %	25 %	50 %	25 %	114045545
83	NC_008322	GCAA	2	8	37632	37639	50 %	0 %	25 %	25 %	114045546
84	NC_008322	TGAT	2	8	39856	39863	25 %	50 %	25 %	0 %	114045548
85	NC_008322	TACA	2	8	40822	40829	50 %	25 %	0 %	25 %	114045550
86	NC_008322	GGAT	2	8	40847	40854	25 %	25 %	50 %	0 %	114045550
87	NC_008322	ACTG	2	8	40931	40938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_008322	AATG	2	8	41305	41312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008322	TGTT	2	8	42960	42967	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008322	TAAT	2	8	43073	43080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008322	GCGA	2	8	43493	43500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008322	CTGA	2	8	43672	43679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008322	CGTC	2	8	44197	44204	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_008322	AAAG	2	8	44320	44327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008322	GGTG	2	8	44715	44722	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008322	ATTG	2	8	45090	45097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008322	GACA	2	8	45589	45596	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008322	GAAC	2	8	45909	45916	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008322	GATT	2	8	47451	47458	25 %	50 %	25 %	0 %	114045552
100	NC_008322	GTTT	2	8	47720	47727	0 %	75 %	25 %	0 %	114045553
101	NC_008322	CTGT	2	8	49702	49709	0 %	50 %	25 %	25 %	114045555
102	NC_008322	TGCT	2	8	50235	50242	0 %	50 %	25 %	25 %	114045555
103	NC_008322	GCTG	2	8	50446	50453	0 %	25 %	50 %	25 %	114045555
104	NC_008322	TGGA	2	8	50655	50662	25 %	25 %	50 %	0 %	114045555
105	NC_008322	TGGG	2	8	52639	52646	0 %	25 %	75 %	0 %	114045557
106	NC_008322	TTTG	2	8	52647	52654	0 %	75 %	25 %	0 %	114045557
107	NC_008322	GGCA	2	8	52982	52989	25 %	0 %	50 %	25 %	114045557
108	NC_008322	AGCC	2	8	53234	53241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008322	TTTC	2	8	53354	53361	0 %	75 %	0 %	25 %	114045558
110	NC_008322	TGAG	2	8	53558	53565	25 %	25 %	50 %	0 %	114045558
111	NC_008322	CTCA	2	8	53576	53583	25 %	25 %	0 %	50 %	114045558
112	NC_008322	GTAG	2	8	53632	53639	25 %	25 %	50 %	0 %	114045558
113	NC_008322	GGGC	2	8	53805	53812	0 %	0 %	75 %	25 %	114045559
114	NC_008322	CGCT	2	8	53898	53905	0 %	25 %	25 %	50 %	114045559
115	NC_008322	CCTG	2	8	53929	53936	0 %	25 %	25 %	50 %	114045559
116	NC_008322	AATT	2	8	55002	55009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008322	AGGC	2	8	55441	55448	25 %	0 %	50 %	25 %	114045560
118	NC_008322	AATG	2	8	56009	56016	50 %	25 %	25 %	0 %	114045560
119	NC_008322	GATG	2	8	56132	56139	25 %	25 %	50 %	0 %	114045560
120	NC_008322	GGTT	2	8	56145	56152	0 %	50 %	50 %	0 %	114045560
121	NC_008322	GGCT	2	8	56798	56805	0 %	25 %	50 %	25 %	114045561
122	NC_008322	GGCT	2	8	56921	56928	0 %	25 %	50 %	25 %	114045561
123	NC_008322	GGCT	2	8	57167	57174	0 %	25 %	50 %	25 %	114045561
124	NC_008322	AGGC	2	8	57289	57296	25 %	0 %	50 %	25 %	114045561
125	NC_008322	GGCT	2	8	57413	57420	0 %	25 %	50 %	25 %	114045561
126	NC_008322	GGCT	2	8	57536	57543	0 %	25 %	50 %	25 %	114045561
127	NC_008322	GGCT	2	8	57905	57912	0 %	25 %	50 %	25 %	114045561
128	NC_008322	TTCA	2	8	58994	59001	25 %	50 %	0 %	25 %	114045561
129	NC_008322	CCAT	2	8	59135	59142	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008322	AATT	2	8	59178	59185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008322	AGTC	2	8	59379	59386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008322	CAAT	2	8	59411	59418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008322	GCCA	2	8	59665	59672	25 %	0 %	25 %	50 %	114045562
134	NC_008322	AATA	2	8	60150	60157	75 %	25 %	0 %	0 %	114045562
135	NC_008322	AAGC	2	8	60654	60661	50 %	0 %	25 %	25 %	114045562
136	NC_008322	GGGC	2	8	61530	61537	0 %	0 %	75 %	25 %	114045564
137	NC_008322	AGTG	2	8	61755	61762	25 %	25 %	50 %	0 %	114045564
138	NC_008322	CAGC	2	8	61779	61786	25 %	0 %	25 %	50 %	114045564
139	NC_008322	AATC	2	8	63155	63162	50 %	25 %	0 %	25 %	114045565
140	NC_008322	TGCG	2	8	63217	63224	0 %	25 %	50 %	25 %	114045565
141	NC_008322	CAGG	2	8	63382	63389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008322	CAAT	2	8	63907	63914	50 %	25 %	0 %	25 %	114045566
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