MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-7 chromosome

Total Repeats: 1937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008322	GGAT	2	8	2671	2678	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008322	TTTG	2	8	6329	6336	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008322	TATC	2	8	7079	7086	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008322	ATAG	2	8	7097	7104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008322	TTTA	2	8	26991	26998	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008322	ACTG	2	8	33342	33349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008322	ACTG	2	8	40931	40938	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008322	AATG	2	8	41305	41312	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008322	TGTT	2	8	42960	42967	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008322	TAAT	2	8	43073	43080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008322	GCGA	2	8	43493	43500	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008322	CTGA	2	8	43672	43679	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008322	CGTC	2	8	44197	44204	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008322	AAAG	2	8	44320	44327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008322	GGTG	2	8	44715	44722	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008322	ATTG	2	8	45090	45097	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008322	GACA	2	8	45589	45596	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008322	GAAC	2	8	45909	45916	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_008322	AGCC	2	8	53234	53241	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008322	AATT	2	8	55002	55009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008322	CCAT	2	8	59135	59142	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_008322	AATT	2	8	59178	59185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008322	AGTC	2	8	59379	59386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008322	CAAT	2	8	59411	59418	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008322	CAGG	2	8	63382	63389	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_008322	TTAG	2	8	64446	64453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008322	TAGA	2	8	64550	64557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008322	TCAT	2	8	67301	67308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_008322	CAAA	2	8	68682	68689	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008322	TTAT	2	8	75284	75291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008322	CAAA	2	8	75300	75307	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008322	ATAA	2	8	75414	75421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008322	TAGC	2	8	75443	75450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008322	AATT	2	8	76762	76769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008322	TGGG	2	8	76955	76962	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008322	GTGA	2	8	80447	80454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008322	TTGC	2	8	80455	80462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_008322	CCGG	2	8	94343	94350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008322	CCTC	2	8	95195	95202	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_008322	GCGA	2	8	95772	95779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008322	TTAA	2	8	98158	98165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008322	CGAG	2	8	98365	98372	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008322	AGTG	2	8	102920	102927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008322	AGCT	2	8	105623	105630	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_008322	TACC	2	8	105712	105719	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_008322	GAGT	2	8	106555	106562	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008322	ATCC	2	8	110063	110070	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008322	TGTT	2	8	110285	110292	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008322	ACTC	2	8	110387	110394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008322	CTTG	2	8	120433	120440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008322	TTTA	2	8	124156	124163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008322	TCAA	2	8	124164	124171	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008322	GGGA	2	8	130173	130180	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008322	TCCT	2	8	134186	134193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008322	AAAC	2	8	134285	134292	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008322	GGAA	2	8	134355	134362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008322	AGAT	2	8	137849	137856	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008322	GCCC	2	8	138355	138362	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_008322	TAAA	2	8	142801	142808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008322	TTAT	2	8	146909	146916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008322	CAAA	2	8	146964	146971	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008322	ACGG	2	8	151167	151174	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008322	GGCA	2	8	152978	152985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_008322	AGCC	2	8	153008	153015	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008322	TGTC	2	8	154010	154017	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008322	TTGG	2	8	155931	155938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008322	GAGT	2	8	159933	159940	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008322	TTTA	2	8	162827	162834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008322	GGCT	2	8	168893	168900	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008322	ATCG	2	8	170594	170601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_008322	TTTA	2	8	170617	170624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008322	AAAT	2	8	184592	184599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008322	TAGT	2	8	185426	185433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008322	GGTG	2	8	193535	193542	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008322	CCGC	2	8	195491	195498	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
76	NC_008322	ATAA	2	8	196855	196862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008322	AAAG	2	8	197161	197168	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008322	AATG	2	8	197357	197364	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008322	TACA	2	8	197383	197390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008322	TGTT	2	8	199051	199058	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008322	TCCT	2	8	199181	199188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_008322	GCCT	2	8	199342	199349	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_008322	TAAT	2	8	199487	199494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008322	GCGA	2	8	199912	199919	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008322	CTGA	2	8	200091	200098	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008322	CGTC	2	8	200616	200623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_008322	AAAG	2	8	200739	200746	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008322	GGTG	2	8	201134	201141	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008322	ATTG	2	8	201509	201516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008322	GACA	2	8	202008	202015	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008322	GAAC	2	8	202328	202335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_008322	TTGT	2	8	206102	206109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008322	TTAG	2	8	206450	206457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008322	TATG	2	8	206693	206700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008322	GCTG	2	8	211167	211174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008322	TAAG	2	8	220731	220738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008322	GTTT	2	8	230032	230039	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008322	AACA	2	8	237214	237221	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008322	GTTT	2	8	238740	238747	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008322	GCTC	2	8	239490	239497	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008322	TAGG	2	8	239512	239519	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008322	GGAA	2	8	242640	242647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008322	GGAT	2	8	243323	243330	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008322	AAGC	2	8	248711	248718	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008322	AATG	2	8	248965	248972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008322	TGTT	2	8	250620	250627	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008322	TAAT	2	8	250733	250740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008322	GCGA	2	8	251158	251165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008322	CTGA	2	8	251337	251344	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008322	CGTC	2	8	251862	251869	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008322	AAAG	2	8	251985	251992	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008322	GGTG	2	8	252380	252387	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008322	ATTG	2	8	252755	252762	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008322	GACA	2	8	253254	253261	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008322	GAAC	2	8	253574	253581	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008322	TCAT	2	8	254225	254232	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008322	TTAC	2	8	254357	254364	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008322	AGTC	2	8	255701	255708	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008322	TCTG	2	8	272789	272796	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008322	GTTG	2	8	280200	280207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008322	GCGA	2	8	286919	286926	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008322	ATGA	2	8	286939	286946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008322	GCAA	2	8	287045	287052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008322	GTAT	2	8	294459	294466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008322	TGAG	2	8	294614	294621	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008322	ATTG	2	8	294665	294672	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008322	TAAA	2	8	294683	294690	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008322	TGAG	2	8	297938	297945	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008322	GGGT	2	8	298042	298049	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008322	CTGG	2	8	300276	300283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008322	AAAT	2	8	301747	301754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008322	TTTG	2	8	302386	302393	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008322	TTAA	2	8	307625	307632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008322	ATAG	2	8	309952	309959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008322	TGAT	2	8	310260	310267	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008322	TTTG	2	8	310508	310515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008322	GCGA	2	8	319304	319311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008322	TTTA	2	8	320471	320478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008322	TTCG	2	8	320785	320792	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008322	TGAT	2	8	332436	332443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008322	TTTA	2	8	333439	333446	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008322	TCGC	2	8	335741	335748	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008322	ATTT	2	8	335832	335839	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008322	TGAA	2	8	353258	353265	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008322	AAGG	2	8	365716	365723	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008322	GGTA	2	8	371762	371769	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008322	AAAG	2	8	375489	375496	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008322	GCTA	2	8	377242	377249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008322	TAAA	2	8	378159	378166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008322	AGAT	2	8	384052	384059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008322	AGAT	2	8	384159	384166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008322	AGAT	2	8	384246	384253	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008322	TCCA	2	8	385024	385031	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_008322	AGCG	2	8	385611	385618	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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162	NC_008322	GATA	2	8	408362	408369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_008322	TATT	2	8	413346	413353	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_008322	CTTT	2	8	1193691	1193698	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
482	NC_008322	TGCT	2	8	1193733	1193740	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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494	NC_008322	CACT	2	8	1206295	1206302	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
495	NC_008322	TAAG	2	8	1207597	1207604	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
496	NC_008322	TGAT	2	8	1207723	1207730	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
497	NC_008322	GAAC	2	8	1211930	1211937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
498	NC_008322	GGAT	2	8	1212621	1212628	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
499	NC_008322	GAAA	2	8	1216990	1216997	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_008322	TATT	2	8	1227841	1227848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

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