MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 2269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008321	CCAAA	2	10	378	387	60 %	0 %	0 %	40 %	113968347
2	NC_008321	GCTGA	2	10	11063	11072	20 %	20 %	40 %	20 %	113968354
3	NC_008321	TGGCG	2	10	11424	11433	0 %	20 %	60 %	20 %	113968355
4	NC_008321	AGATT	2	10	12993	13002	40 %	40 %	20 %	0 %	113968357
5	NC_008321	AGAGT	2	10	13983	13992	40 %	20 %	40 %	0 %	113968357
6	NC_008321	AGCTC	2	10	19406	19415	20 %	20 %	20 %	40 %	113968361
7	NC_008321	ACCAT	2	10	19582	19591	40 %	20 %	0 %	40 %	113968362
8	NC_008321	CGGCG	2	10	24470	24479	0 %	0 %	60 %	40 %	113968365
9	NC_008321	CGAAA	2	10	25048	25057	60 %	0 %	20 %	20 %	113968365
10	NC_008321	TGTGA	2	10	33992	34001	20 %	40 %	40 %	0 %	113968374
11	NC_008321	ATTTA	2	10	34935	34944	40 %	60 %	0 %	0 %	113968376
12	NC_008321	CGAAA	2	10	36476	36485	60 %	0 %	20 %	20 %	113968377
13	NC_008321	GGTTG	2	10	36895	36904	0 %	40 %	60 %	0 %	113968377
14	NC_008321	GCGCA	2	10	41133	41142	20 %	0 %	40 %	40 %	113968383
15	NC_008321	TGGCG	2	10	41198	41207	0 %	20 %	60 %	20 %	113968383
16	NC_008321	AAGAT	2	10	41285	41294	60 %	20 %	20 %	0 %	113968384
17	NC_008321	ATTTG	2	10	48580	48589	20 %	60 %	20 %	0 %	113968387
18	NC_008321	TTGAT	2	10	50422	50431	20 %	60 %	20 %	0 %	113968389
19	NC_008321	GCCTT	2	10	52981	52990	0 %	40 %	20 %	40 %	113968390
20	NC_008321	TGCAC	2	10	53275	53284	20 %	20 %	20 %	40 %	113968390
21	NC_008321	AAGTT	2	10	54700	54709	40 %	40 %	20 %	0 %	113968392
22	NC_008321	AGAAA	2	10	56052	56061	80 %	0 %	20 %	0 %	113968393
23	NC_008321	ATTGA	2	10	58047	58056	40 %	40 %	20 %	0 %	113968395
24	NC_008321	TGGCA	2	10	58540	58549	20 %	20 %	40 %	20 %	113968395
25	NC_008321	TGTTT	2	10	59483	59492	0 %	80 %	20 %	0 %	113968395
26	NC_008321	AGTTA	2	10	59970	59979	40 %	40 %	20 %	0 %	113968396
27	NC_008321	GTGCT	2	10	61379	61388	0 %	40 %	40 %	20 %	113968397
28	NC_008321	TATGG	2	10	61579	61588	20 %	40 %	40 %	0 %	113968397
29	NC_008321	GAGCA	2	10	63591	63600	40 %	0 %	40 %	20 %	113968399
30	NC_008321	ACCTT	2	10	65961	65970	20 %	40 %	0 %	40 %	113968401
31	NC_008321	CACTG	2	10	66401	66410	20 %	20 %	20 %	40 %	113968401
32	NC_008321	CATTT	2	10	69228	69237	20 %	60 %	0 %	20 %	113968404
33	NC_008321	AAGAT	2	10	70851	70860	60 %	20 %	20 %	0 %	113968405
34	NC_008321	TCGTG	2	10	73938	73947	0 %	40 %	40 %	20 %	113968408
35	NC_008321	TTGAT	2	10	74619	74628	20 %	60 %	20 %	0 %	113968409
36	NC_008321	TTAGC	2	10	76771	76780	20 %	40 %	20 %	20 %	113968410
37	NC_008321	TTGAA	2	10	77126	77135	40 %	40 %	20 %	0 %	113968410
38	NC_008321	AGCAA	2	10	81046	81055	60 %	0 %	20 %	20 %	113968413
39	NC_008321	TGCGC	2	10	87580	87589	0 %	20 %	40 %	40 %	113968421
40	NC_008321	GCAGC	2	10	88223	88232	20 %	0 %	40 %	40 %	113968421
41	NC_008321	TGGCT	2	10	88408	88417	0 %	40 %	40 %	20 %	113968422
42	NC_008321	TGGCA	2	10	88503	88512	20 %	20 %	40 %	20 %	113968422
43	NC_008321	TGACC	2	10	88639	88648	20 %	20 %	20 %	40 %	113968422
44	NC_008321	TGTGC	2	10	90432	90441	0 %	40 %	40 %	20 %	113968423
45	NC_008321	TCGAT	2	10	93488	93497	20 %	40 %	20 %	20 %	113968424
46	NC_008321	GTGTG	2	10	94331	94340	0 %	40 %	60 %	0 %	113968425
47	NC_008321	AAGCA	2	10	98014	98023	60 %	0 %	20 %	20 %	113968432
48	NC_008321	TGGAT	2	10	98517	98526	20 %	40 %	40 %	0 %	113968433
49	NC_008321	GAAAG	2	10	101235	101244	60 %	0 %	40 %	0 %	113968437
50	NC_008321	CCCGC	2	10	105545	105554	0 %	0 %	20 %	80 %	113968441
51	NC_008321	CCGTT	2	10	110315	110324	0 %	40 %	20 %	40 %	113968444
52	NC_008321	AAAAC	2	10	112151	112160	80 %	0 %	0 %	20 %	113968445
53	NC_008321	AAGCA	2	10	112341	112350	60 %	0 %	20 %	20 %	113968445
54	NC_008321	GCTGG	2	10	114329	114338	0 %	20 %	60 %	20 %	113968447
55	NC_008321	CTGAA	2	10	115237	115246	40 %	20 %	20 %	20 %	113968447
56	NC_008321	TGTGA	2	10	115416	115425	20 %	40 %	40 %	0 %	113968447
57	NC_008321	TGCCA	2	10	115808	115817	20 %	20 %	20 %	40 %	113968447
58	NC_008321	GAATG	2	10	116273	116282	40 %	20 %	40 %	0 %	113968448
59	NC_008321	TTGCG	2	10	119634	119643	0 %	40 %	40 %	20 %	113968451
60	NC_008321	TGTGG	2	10	122536	122545	0 %	40 %	60 %	0 %	113968453
61	NC_008321	ATGAC	2	10	123148	123157	40 %	20 %	20 %	20 %	113968454
62	NC_008321	TGAGC	2	10	128548	128557	20 %	20 %	40 %	20 %	113968460
63	NC_008321	CGGTG	2	10	130057	130066	0 %	20 %	60 %	20 %	113968462
64	NC_008321	ATTCT	2	10	137484	137493	20 %	60 %	0 %	20 %	113968469
65	NC_008321	AAGAG	2	10	138557	138566	60 %	0 %	40 %	0 %	113968469
66	NC_008321	CTTAC	2	10	138862	138871	20 %	40 %	0 %	40 %	113968469
67	NC_008321	AGCTG	2	10	141062	141071	20 %	20 %	40 %	20 %	113968470
68	NC_008321	GGCGA	2	10	142374	142383	20 %	0 %	60 %	20 %	113968471
69	NC_008321	GCTTG	2	10	146799	146808	0 %	40 %	40 %	20 %	113968477
70	NC_008321	CTCTT	2	10	148512	148521	0 %	60 %	0 %	40 %	113968479
71	NC_008321	CACGG	2	10	149282	149291	20 %	0 %	40 %	40 %	113968479
72	NC_008321	CATGG	2	10	149672	149681	20 %	20 %	40 %	20 %	113968479
73	NC_008321	GCTAT	2	10	153465	153474	20 %	40 %	20 %	20 %	113968481
74	NC_008321	CTCCA	2	10	153485	153494	20 %	20 %	0 %	60 %	113968481
75	NC_008321	TTGCT	2	10	163921	163930	0 %	60 %	20 %	20 %	113968490
76	NC_008321	GGTTG	2	10	167918	167927	0 %	40 %	60 %	0 %	113968494
77	NC_008321	GGGCA	2	10	169243	169252	20 %	0 %	60 %	20 %	113968494
78	NC_008321	TGACC	2	10	169509	169518	20 %	20 %	20 %	40 %	113968494
79	NC_008321	GCCGA	2	10	171965	171974	20 %	0 %	40 %	40 %	113968496
80	NC_008321	TGGTT	2	10	176812	176821	0 %	60 %	40 %	0 %	113968500
81	NC_008321	GCCGC	2	10	178205	178214	0 %	0 %	40 %	60 %	113968501
82	NC_008321	TGAGC	2	10	183561	183570	20 %	20 %	40 %	20 %	113968505
83	NC_008321	GATGC	2	10	186086	186095	20 %	20 %	40 %	20 %	113968509
84	NC_008321	TTGTC	2	10	186573	186582	0 %	60 %	20 %	20 %	113968509
85	NC_008321	AATCA	2	10	192266	192275	60 %	20 %	0 %	20 %	113968517
86	NC_008321	GCCTT	2	10	193148	193157	0 %	40 %	20 %	40 %	113968518
87	NC_008321	TTCGT	2	10	194039	194048	0 %	60 %	20 %	20 %	113968518
88	NC_008321	TAACT	2	10	194479	194488	40 %	40 %	0 %	20 %	113968518
89	NC_008321	GGTTT	2	10	194734	194743	0 %	60 %	40 %	0 %	113968519
90	NC_008321	GTTTT	2	10	196236	196245	0 %	80 %	20 %	0 %	113968520
91	NC_008321	CATCG	2	10	199058	199067	20 %	20 %	20 %	40 %	113968523
92	NC_008321	GTCAG	2	10	209041	209050	20 %	20 %	40 %	20 %	113968527
93	NC_008321	GCATG	2	10	213036	213045	20 %	20 %	40 %	20 %	113968532
94	NC_008321	ATTAA	2	10	213486	213495	60 %	40 %	0 %	0 %	113968532
95	NC_008321	TGGTC	2	10	217584	217593	0 %	40 %	40 %	20 %	113968537
96	NC_008321	AGCAA	2	10	220333	220342	60 %	0 %	20 %	20 %	113968538
97	NC_008321	CTGAT	2	10	220384	220393	20 %	40 %	20 %	20 %	113968538
98	NC_008321	TCTGT	2	10	220469	220478	0 %	60 %	20 %	20 %	113968538
99	NC_008321	TCGTA	2	10	222005	222014	20 %	40 %	20 %	20 %	113968538
100	NC_008321	GTTCT	2	10	225793	225802	0 %	60 %	20 %	20 %	113968541
101	NC_008321	TGGCG	2	10	230623	230632	0 %	20 %	60 %	20 %	113968545
102	NC_008321	AAGCC	2	10	236270	236279	40 %	0 %	20 %	40 %	113968558
103	NC_008321	GTTGA	2	10	237642	237651	20 %	40 %	40 %	0 %	113968561
104	NC_008321	TCGCG	2	10	238317	238326	0 %	20 %	40 %	40 %	113968563
105	NC_008321	ATGGC	2	10	240575	240584	20 %	20 %	40 %	20 %	113968567
106	NC_008321	TGCGG	2	10	246534	246543	0 %	20 %	60 %	20 %	113968576
107	NC_008321	CCTTG	2	10	247748	247757	0 %	40 %	20 %	40 %	113968578
108	NC_008321	TTTGA	2	10	248652	248661	20 %	60 %	20 %	0 %	113968578
109	NC_008321	CAACA	2	10	248898	248907	60 %	0 %	0 %	40 %	113968578
110	NC_008321	CTGTT	2	10	250426	250435	0 %	60 %	20 %	20 %	113968579
111	NC_008321	CCATA	2	10	251675	251684	40 %	20 %	0 %	40 %	113968580
112	NC_008321	GCCGC	2	10	260752	260761	0 %	0 %	40 %	60 %	113968585
113	NC_008321	TTGCA	2	10	265383	265392	20 %	40 %	20 %	20 %	113968592
114	NC_008321	CTTTG	2	10	266733	266742	0 %	60 %	20 %	20 %	113968594
115	NC_008321	ATCGA	2	10	268838	268847	40 %	20 %	20 %	20 %	113968595
116	NC_008321	AGATC	2	10	272067	272076	40 %	20 %	20 %	20 %	113968597
117	NC_008321	CCATT	2	10	274262	274271	20 %	40 %	0 %	40 %	113968600
118	NC_008321	TGGTT	2	10	274826	274835	0 %	60 %	40 %	0 %	113968601
119	NC_008321	GTTGG	2	10	277195	277204	0 %	40 %	60 %	0 %	113968603
120	NC_008321	GCGCC	2	10	277318	277327	0 %	0 %	40 %	60 %	113968603
121	NC_008321	TGGGG	2	10	278306	278315	0 %	20 %	80 %	0 %	113968604
122	NC_008321	CATGT	2	10	278763	278772	20 %	40 %	20 %	20 %	113968605
123	NC_008321	AGCTT	2	10	279376	279385	20 %	40 %	20 %	20 %	113968605
124	NC_008321	ATGGC	2	10	279461	279470	20 %	20 %	40 %	20 %	113968605
125	NC_008321	GTTCA	2	10	279597	279606	20 %	40 %	20 %	20 %	113968605
126	NC_008321	GGCGA	2	10	283636	283645	20 %	0 %	60 %	20 %	113968608
127	NC_008321	TTGTC	2	10	287271	287280	0 %	60 %	20 %	20 %	113968611
128	NC_008321	CGCTA	2	10	287405	287414	20 %	20 %	20 %	40 %	113968611
129	NC_008321	GCTGG	2	10	293103	293112	0 %	20 %	60 %	20 %	113968616
130	NC_008321	GACCT	2	10	296945	296954	20 %	20 %	20 %	40 %	113968620
131	NC_008321	TTGCC	2	10	297957	297966	0 %	40 %	20 %	40 %	113968621
132	NC_008321	AATTG	2	10	298521	298530	40 %	40 %	20 %	0 %	113968622
133	NC_008321	GTGCT	2	10	298564	298573	0 %	40 %	40 %	20 %	113968622
134	NC_008321	GAGCT	2	10	302592	302601	20 %	20 %	40 %	20 %	113968626
135	NC_008321	CGAAT	2	10	302648	302657	40 %	20 %	20 %	20 %	113968626
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138	NC_008321	TGGCG	2	10	310541	310550	0 %	20 %	60 %	20 %	113968635
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140	NC_008321	AACTC	2	10	313639	313648	40 %	20 %	0 %	40 %	113968638
141	NC_008321	TAAGG	2	10	314749	314758	40 %	20 %	40 %	0 %	113968638
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151	NC_008321	GCGGT	2	10	326895	326904	0 %	20 %	60 %	20 %	113968648
152	NC_008321	ATGGC	2	10	336631	336640	20 %	20 %	40 %	20 %	113968655
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157	NC_008321	ATTGG	2	10	344569	344578	20 %	40 %	40 %	0 %	113968661
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165	NC_008321	TCGGC	2	10	359392	359401	0 %	20 %	40 %	40 %	113968681
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173	NC_008321	CAAAG	2	10	375517	375526	60 %	0 %	20 %	20 %	113968697
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177	NC_008321	CCAAT	2	10	380856	380865	40 %	20 %	0 %	40 %	113968700
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248	NC_008321	GCTAG	2	10	473007	473016	20 %	20 %	40 %	20 %	113968769
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258	NC_008321	ATCCA	2	10	487804	487813	40 %	20 %	0 %	40 %	113968776
259	NC_008321	CGGTG	2	10	490751	490760	0 %	20 %	60 %	20 %	113968777
260	NC_008321	AGCTC	2	10	492046	492055	20 %	20 %	20 %	40 %	113968778
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