MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 10568

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008321	ATGG	2	8	175	182	25 %	25 %	50 %	0 %	113968347
2	NC_008321	CCGT	2	8	318	325	0 %	25 %	25 %	50 %	113968347
3	NC_008321	GATT	2	8	1122	1129	25 %	50 %	25 %	0 %	113968347
4	NC_008321	TAAC	2	8	1307	1314	50 %	25 %	0 %	25 %	113968347
5	NC_008321	TCAC	2	8	1598	1605	25 %	25 %	0 %	50 %	113968348
6	NC_008321	TCAT	2	8	1654	1661	25 %	50 %	0 %	25 %	113968348
7	NC_008321	TGAT	2	8	1894	1901	25 %	50 %	25 %	0 %	113968348
8	NC_008321	CGTT	2	8	1931	1938	0 %	50 %	25 %	25 %	113968348
9	NC_008321	CAAG	2	8	2270	2277	50 %	0 %	25 %	25 %	113968348
10	NC_008321	ATGT	2	8	2553	2560	25 %	50 %	25 %	0 %	113968348
11	NC_008321	GGAT	2	8	2668	2675	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008321	TTAT	2	8	2823	2830	25 %	75 %	0 %	0 %	113968349
13	NC_008321	CGTT	2	8	2891	2898	0 %	50 %	25 %	25 %	113968349
14	NC_008321	GTAG	2	8	3521	3528	25 %	25 %	50 %	0 %	113968349
15	NC_008321	GAAT	2	8	4478	4485	50 %	25 %	25 %	0 %	113968350
16	NC_008321	GAAG	2	8	5984	5991	50 %	0 %	50 %	0 %	113968350
17	NC_008321	TGAT	2	8	6291	6298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008321	CTAT	2	8	6341	6348	25 %	50 %	0 %	25 %	113968351
19	NC_008321	CTGG	2	8	6418	6425	0 %	25 %	50 %	25 %	113968351
20	NC_008321	GAGC	2	8	6714	6721	25 %	0 %	50 %	25 %	113968351
21	NC_008321	TATC	2	8	7075	7082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008321	ATAG	2	8	7093	7100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008321	ATTT	2	8	8683	8690	25 %	75 %	0 %	0 %	113968353
24	NC_008321	TCAC	2	8	8908	8915	25 %	25 %	0 %	50 %	113968353
25	NC_008321	TTGG	2	8	9112	9119	0 %	50 %	50 %	0 %	113968353
26	NC_008321	AATT	2	8	9498	9505	50 %	50 %	0 %	0 %	113968354
27	NC_008321	ATGC	2	8	10060	10067	25 %	25 %	25 %	25 %	113968354
28	NC_008321	GAAT	2	8	10827	10834	50 %	25 %	25 %	0 %	113968354
29	NC_008321	TGTC	2	8	10968	10975	0 %	50 %	25 %	25 %	113968354
30	NC_008321	AAGA	2	8	11219	11226	75 %	0 %	25 %	0 %	113968354
31	NC_008321	AAGT	2	8	11771	11778	50 %	25 %	25 %	0 %	113968355
32	NC_008321	GCAG	2	8	12838	12845	25 %	0 %	50 %	25 %	113968356
33	NC_008321	GAGC	2	8	13417	13424	25 %	0 %	50 %	25 %	113968357
34	NC_008321	CATA	2	8	13445	13452	50 %	25 %	0 %	25 %	113968357
35	NC_008321	GGTT	2	8	13738	13745	0 %	50 %	50 %	0 %	113968357
36	NC_008321	GAGT	2	8	13809	13816	25 %	25 %	50 %	0 %	113968357
37	NC_008321	GATT	2	8	15212	15219	25 %	50 %	25 %	0 %	113968357
38	NC_008321	CTGA	2	8	15564	15571	25 %	25 %	25 %	25 %	113968357
39	NC_008321	GGCT	2	8	15600	15607	0 %	25 %	50 %	25 %	113968357
40	NC_008321	CGAC	2	8	15724	15731	25 %	0 %	25 %	50 %	113968357
41	NC_008321	TGGC	2	8	16070	16077	0 %	25 %	50 %	25 %	113968357
42	NC_008321	ATTG	2	8	17652	17659	25 %	50 %	25 %	0 %	113968360
43	NC_008321	ATAA	2	8	17738	17745	75 %	25 %	0 %	0 %	113968360
44	NC_008321	AATC	2	8	18391	18398	50 %	25 %	0 %	25 %	113968360
45	NC_008321	TCCT	2	8	19165	19172	0 %	50 %	0 %	50 %	113968361
46	NC_008321	TTGC	2	8	19512	19519	0 %	50 %	25 %	25 %	113968362
47	NC_008321	GATG	2	8	20853	20860	25 %	25 %	50 %	0 %	113968363
48	NC_008321	TCTT	2	8	21516	21523	0 %	75 %	0 %	25 %	113968364
49	NC_008321	TTGA	2	8	22023	22030	25 %	50 %	25 %	0 %	113968364
50	NC_008321	TCAC	2	8	22065	22072	25 %	25 %	0 %	50 %	113968364
51	NC_008321	TTGC	2	8	23323	23330	0 %	50 %	25 %	25 %	113968364
52	NC_008321	ATTA	2	8	23902	23909	50 %	50 %	0 %	0 %	113968365
53	NC_008321	TACT	2	8	25217	25224	25 %	50 %	0 %	25 %	113968366
54	NC_008321	GCCA	2	8	25249	25256	25 %	0 %	25 %	50 %	113968366
55	NC_008321	GTGC	2	8	25444	25451	0 %	25 %	50 %	25 %	113968366
56	NC_008321	TGAA	2	8	25658	25665	50 %	25 %	25 %	0 %	113968366
57	NC_008321	TTAT	2	8	25932	25939	25 %	75 %	0 %	0 %	113968367
58	NC_008321	ATCT	2	8	26355	26362	25 %	50 %	0 %	25 %	113968367
59	NC_008321	TGGC	2	8	26394	26401	0 %	25 %	50 %	25 %	113968367
60	NC_008321	GCGG	2	8	26850	26857	0 %	0 %	75 %	25 %	113968367
61	NC_008321	GATT	2	8	27627	27634	25 %	50 %	25 %	0 %	113968368
62	NC_008321	GACC	2	8	27695	27702	25 %	0 %	25 %	50 %	113968368
63	NC_008321	TCAC	2	8	28153	28160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_008321	TTTA	2	8	28290	28297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008321	AAAG	2	8	29022	29029	75 %	0 %	25 %	0 %	113968371
66	NC_008321	ATAA	2	8	31475	31482	75 %	25 %	0 %	0 %	113968372
67	NC_008321	GGCA	2	8	31563	31570	25 %	0 %	50 %	25 %	113968372
68	NC_008321	CACC	2	8	31749	31756	25 %	0 %	0 %	75 %	113968372
69	NC_008321	CTCA	2	8	32548	32555	25 %	25 %	0 %	50 %	113968373
70	NC_008321	TTAA	2	8	32678	32685	50 %	50 %	0 %	0 %	113968373
71	NC_008321	ACAA	2	8	34319	34326	75 %	0 %	0 %	25 %	113968375
72	NC_008321	ACTG	2	8	34641	34648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008321	GTAT	2	8	35247	35254	25 %	50 %	25 %	0 %	113968376
74	NC_008321	AATT	2	8	35805	35812	50 %	50 %	0 %	0 %	113968376
75	NC_008321	GTTT	2	8	36076	36083	0 %	75 %	25 %	0 %	113968377
76	NC_008321	TTAT	2	8	36139	36146	25 %	75 %	0 %	0 %	113968377
77	NC_008321	TCTT	2	8	36501	36508	0 %	75 %	0 %	25 %	113968377
78	NC_008321	ACTC	2	8	37034	37041	25 %	25 %	0 %	50 %	113968378
79	NC_008321	TTGG	2	8	37082	37089	0 %	50 %	50 %	0 %	113968378
80	NC_008321	AGGA	2	8	37108	37115	50 %	0 %	50 %	0 %	113968378
81	NC_008321	CATT	2	8	37146	37153	25 %	50 %	0 %	25 %	113968378
82	NC_008321	GCCT	2	8	37289	37296	0 %	25 %	25 %	50 %	113968378
83	NC_008321	GCAC	2	8	37585	37592	25 %	0 %	25 %	50 %	113968379
84	NC_008321	GCGA	2	8	38420	38427	25 %	0 %	50 %	25 %	113968380
85	NC_008321	GCAA	2	8	38931	38938	50 %	0 %	25 %	25 %	113968381
86	NC_008321	ATAG	2	8	39827	39834	50 %	25 %	25 %	0 %	113968382
87	NC_008321	AGCC	2	8	39990	39997	25 %	0 %	25 %	50 %	113968382
88	NC_008321	TGAT	2	8	41145	41152	25 %	50 %	25 %	0 %	113968383
89	NC_008321	CAAG	2	8	41577	41584	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_008321	TACA	2	8	42111	42118	50 %	25 %	0 %	25 %	113968385
91	NC_008321	GGAT	2	8	42136	42143	25 %	25 %	50 %	0 %	113968385
92	NC_008321	ACTG	2	8	42220	42227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_008321	AATG	2	8	42594	42601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008321	AAGT	2	8	42763	42770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008321	TGTT	2	8	44249	44256	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008321	TAAT	2	8	44362	44369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008321	GCGA	2	8	44787	44794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008321	CTGA	2	8	44966	44973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008321	CGTC	2	8	45491	45498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008321	AAAG	2	8	45614	45621	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008321	GGTG	2	8	46009	46016	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008321	ATTG	2	8	46384	46391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008321	GACA	2	8	46883	46890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008321	GAAC	2	8	47203	47210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008321	AGCG	2	8	48688	48695	25 %	0 %	50 %	25 %	113968387
106	NC_008321	GATT	2	8	48745	48752	25 %	50 %	25 %	0 %	113968387
107	NC_008321	GTTT	2	8	49014	49021	0 %	75 %	25 %	0 %	113968388
108	NC_008321	CTGT	2	8	50996	51003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_008321	TGCT	2	8	51528	51535	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008321	GCTG	2	8	51739	51746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_008321	TGGA	2	8	51948	51955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008321	CCAC	2	8	52306	52313	25 %	0 %	0 %	75 %	113968390
113	NC_008321	TCAG	2	8	52726	52733	25 %	25 %	25 %	25 %	113968390
114	NC_008321	TGGG	2	8	53932	53939	0 %	25 %	75 %	0 %	113968391
115	NC_008321	TTTG	2	8	53940	53947	0 %	75 %	25 %	0 %	113968391
116	NC_008321	GGCA	2	8	54275	54282	25 %	0 %	50 %	25 %	113968391
117	NC_008321	TTTC	2	8	54646	54653	0 %	75 %	0 %	25 %	113968392
118	NC_008321	CTGA	2	8	54849	54856	25 %	25 %	25 %	25 %	113968392
119	NC_008321	CTCA	2	8	54868	54875	25 %	25 %	0 %	50 %	113968392
120	NC_008321	GTAG	2	8	54924	54931	25 %	25 %	50 %	0 %	113968392
121	NC_008321	CGCT	2	8	55190	55197	0 %	25 %	25 %	50 %	113968393
122	NC_008321	AATT	2	8	56294	56301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008321	AGGC	2	8	56733	56740	25 %	0 %	50 %	25 %	113968394
124	NC_008321	AATC	2	8	57085	57092	50 %	25 %	0 %	25 %	113968394
125	NC_008321	AATG	2	8	57301	57308	50 %	25 %	25 %	0 %	113968394
126	NC_008321	GATG	2	8	57424	57431	25 %	25 %	50 %	0 %	113968394
127	NC_008321	GGTT	2	8	57437	57444	0 %	50 %	50 %	0 %	113968394
128	NC_008321	TTGT	2	8	58323	58330	0 %	75 %	25 %	0 %	113968395
129	NC_008321	TATG	2	8	58497	58504	25 %	50 %	25 %	0 %	113968395
130	NC_008321	AATG	2	8	58620	58627	50 %	25 %	25 %	0 %	113968395
131	NC_008321	GGAA	2	8	59270	59277	50 %	0 %	50 %	0 %	113968395
132	NC_008321	GAGC	2	8	59366	59373	25 %	0 %	50 %	25 %	113968395
133	NC_008321	ATAA	2	8	59623	59630	75 %	25 %	0 %	0 %	113968395
134	NC_008321	GCCA	2	8	60082	60089	25 %	0 %	25 %	50 %	113968396
135	NC_008321	AATA	2	8	60567	60574	75 %	25 %	0 %	0 %	113968396
136	NC_008321	AAGC	2	8	61071	61078	50 %	0 %	25 %	25 %	113968396
137	NC_008321	GGGC	2	8	61947	61954	0 %	0 %	75 %	25 %	113968398
138	NC_008321	TGGG	2	8	62130	62137	0 %	25 %	75 %	0 %	113968398
139	NC_008321	CAGC	2	8	62196	62203	25 %	0 %	25 %	50 %	113968398
140	NC_008321	TCAA	2	8	62953	62960	50 %	25 %	0 %	25 %	113968399
141	NC_008321	ATCA	2	8	63573	63580	50 %	25 %	0 %	25 %	113968399
142	NC_008321	TGCG	2	8	63634	63641	0 %	25 %	50 %	25 %	113968399
143	NC_008321	CTTG	2	8	63869	63876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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