MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 1920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008321	GGAT	2	8	2668	2675	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008321	TGAT	2	8	6291	6298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008321	TATC	2	8	7075	7082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008321	ATAG	2	8	7093	7100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008321	TCAC	2	8	28153	28160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008321	TTTA	2	8	28290	28297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008321	ACTG	2	8	34641	34648	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008321	CAAG	2	8	41577	41584	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008321	ACTG	2	8	42220	42227	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008321	AATG	2	8	42594	42601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008321	AAGT	2	8	42763	42770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008321	TGTT	2	8	44249	44256	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008321	TAAT	2	8	44362	44369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008321	GCGA	2	8	44787	44794	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008321	CTGA	2	8	44966	44973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008321	CGTC	2	8	45491	45498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008321	AAAG	2	8	45614	45621	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008321	GGTG	2	8	46009	46016	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008321	ATTG	2	8	46384	46391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008321	GACA	2	8	46883	46890	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_008321	GAAC	2	8	47203	47210	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008321	CTGT	2	8	50996	51003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008321	TGCT	2	8	51528	51535	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008321	GCTG	2	8	51739	51746	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_008321	TGGA	2	8	51948	51955	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008321	AATT	2	8	56294	56301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008321	CTTG	2	8	63869	63876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008321	TTAG	2	8	64863	64870	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008321	TAGA	2	8	64967	64974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008321	TCAT	2	8	67718	67725	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008321	CAAA	2	8	69099	69106	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008321	TTAT	2	8	75701	75708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008321	CAAA	2	8	75717	75724	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008321	ATAA	2	8	75831	75838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008321	TAGC	2	8	75860	75867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008321	AATT	2	8	77179	77186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008321	TGGG	2	8	77372	77379	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008321	GTGA	2	8	80864	80871	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008321	TTGC	2	8	80872	80879	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008321	CCGG	2	8	94757	94764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008321	AAAT	2	8	95340	95347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008321	TAGA	2	8	95381	95388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008321	GTGA	2	8	95486	95493	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008321	CCTC	2	8	96297	96304	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_008321	GCGA	2	8	96874	96881	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008321	TTAA	2	8	100179	100186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008321	CGAG	2	8	100386	100393	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008321	AGTG	2	8	104941	104948	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008321	TCAA	2	8	105022	105029	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_008321	TTTG	2	8	106389	106396	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008321	TAAT	2	8	106706	106713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008321	GATT	2	8	106752	106759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008321	AATT	2	8	106892	106899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008321	TACC	2	8	108364	108371	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008321	GAGT	2	8	109207	109214	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008321	TATC	2	8	112596	112603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008321	ATCC	2	8	112713	112720	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008321	TTTG	2	8	112871	112878	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008321	TAAA	2	8	112886	112893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008321	ACTC	2	8	113037	113044	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008321	CTTG	2	8	123083	123090	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008321	ATCA	2	8	126814	126821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008321	GGGA	2	8	131984	131991	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008321	ATAA	2	8	135920	135927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008321	ACAA	2	8	135951	135958	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008321	TGTT	3	12	136057	136068	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008321	AAAT	2	8	136077	136084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008321	ATTA	2	8	138977	138984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008321	AATT	2	8	139026	139033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008321	TCCT	2	8	139174	139181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008321	AAAC	2	8	139273	139280	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_008321	GGAA	2	8	139343	139350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008321	AGAT	2	8	142841	142848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008321	GCCC	2	8	143347	143354	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_008321	TAAA	2	8	147792	147799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008321	TTAT	2	8	151899	151906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008321	CAAA	2	8	151954	151961	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008321	TGTC	2	8	158457	158464	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008321	TTGG	2	8	160379	160386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008321	GAGT	2	8	164360	164367	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008321	TAAG	2	8	165736	165743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008321	AACA	2	8	167203	167210	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008321	TTTA	2	8	167254	167261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008321	GGCT	2	8	173332	173339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_008321	ATCG	2	8	175033	175040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008321	TTTA	2	8	175056	175063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008321	AAAT	2	8	189032	189039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008321	TAGT	2	8	189866	189873	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008321	TTCC	2	8	191855	191862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008321	AGAT	2	8	194489	194496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008321	CCGC	2	8	199979	199986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_008321	ATAA	2	8	201343	201350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008321	AAAG	2	8	201649	201656	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008321	AATG	2	8	201845	201852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008321	TACA	2	8	201871	201878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008321	GCCT	2	8	203788	203795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008321	TAAT	2	8	203933	203940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008321	GCGA	2	8	204357	204364	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008321	CTGA	2	8	204536	204543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008321	CGTC	2	8	205061	205068	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008321	AAAG	2	8	205184	205191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008321	GGTG	2	8	205579	205586	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008321	ATTG	2	8	205954	205961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008321	GACA	2	8	206453	206460	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008321	GAAC	2	8	206773	206780	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_008321	CTGC	2	8	207094	207101	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008321	GTAA	2	8	207116	207123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008321	TTGT	2	8	210457	210464	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008321	TTAG	2	8	210805	210812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008321	TATG	2	8	211048	211055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008321	GCTG	2	8	215522	215529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008321	TAAG	2	8	225086	225093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008321	GTTT	2	8	234387	234394	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008321	AACA	2	8	241569	241576	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008321	GGAA	2	8	246995	247002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008321	GGAT	2	8	247678	247685	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008321	AAGC	2	8	253066	253073	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008321	AATG	2	8	253319	253326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008321	TACA	2	8	253345	253352	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008321	TGTT	2	8	255013	255020	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008321	TAAT	2	8	255126	255133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008321	GCGA	2	8	255550	255557	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008321	CTGA	2	8	255729	255736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008321	CGTC	2	8	256254	256261	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_008321	AAAG	2	8	256377	256384	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008321	GGTG	2	8	256772	256779	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008321	ATTG	2	8	257147	257154	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008321	GACA	2	8	257646	257653	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008321	GAAC	2	8	257966	257973	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008321	AAAT	2	8	258757	258764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008321	AGGA	2	8	263972	263979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008321	ATGA	2	8	265506	265513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008321	AAAG	2	8	266305	266312	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008321	TGAC	2	8	267989	267996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008321	GGAA	2	8	268159	268166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008321	CATA	2	8	274502	274509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008321	TTTA	2	8	274515	274522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008321	ATCA	2	8	280644	280651	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008321	AGTT	2	8	280680	280687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008321	TTAA	2	8	281208	281215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008321	GCCT	2	8	282190	282197	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_008321	AGAC	2	8	282537	282544	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008321	TAAG	2	8	283290	283297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008321	TTTA	2	8	286614	286621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008321	TGGG	2	8	286635	286642	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008321	GCAA	2	8	292886	292893	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008321	CTTC	2	8	294590	294597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_008321	GTTT	2	8	294628	294635	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008321	TAAT	2	8	294716	294723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008321	CCTA	2	8	294855	294862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_008321	AGTC	2	8	297276	297283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008321	TTCC	2	8	299925	299932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_008321	TAAA	2	8	307639	307646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_008321	GAAG	2	8	307758	307765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_008321	GTTT	2	8	309163	309170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
156	NC_008321	TAAA	2	8	313402	313409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008321	TCGT	2	8	317988	317995	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_008321	ATGA	2	8	318065	318072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008321	ATTT	2	8	318525	318532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_008321	TAAA	2	8	318550	318557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008321	AAAT	2	8	318576	318583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_008321	TTGA	2	8	325092	325099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_008321	TAAA	2	8	336331	336338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_008321	AAGC	2	8	341928	341935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
171	NC_008321	GGCG	2	8	347918	347925	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
172	NC_008321	TAAT	2	8	348622	348629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_008321	ATTT	2	8	375731	375738	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_008321	ATTA	2	8	449355	449362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_008321	ATTC	2	8	469074	469081	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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261	NC_008321	GCTT	2	8	608005	608012	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
262	NC_008321	AATG	2	8	612057	612064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
263	NC_008321	TCAT	2	8	612179	612186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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292	NC_008321	TAGC	2	8	705151	705158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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295	NC_008321	TTTG	2	8	715353	715360	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
296	NC_008321	TATT	2	8	717732	717739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_008321	TTGA	2	8	725291	725298	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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483	NC_008321	TTAA	2	8	1145290	1145297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_008321	GGAT	2	8	1150258	1150265	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_008321	GAAA	2	8	1154628	1154635	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
487	NC_008321	TCAG	2	8	1161225	1161232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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492	NC_008321	ACTC	2	8	1174422	1174429	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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498	NC_008321	AATG	2	8	1192435	1192442	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_008321	TGTT	2	8	1203620	1203627	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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