MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Shewanella sp. MR-4 chromosome

Total Repeats: 50995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008321	CAA	2	6	97	102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968347
2	NC_008321	CAG	2	6	136	141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968347
3	NC_008321	ATG	2	6	284	289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968347
4	NC_008321	TAC	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968347
5	NC_008321	ATC	2	6	437	442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968347
6	NC_008321	GCA	2	6	443	448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968347
7	NC_008321	TCG	2	6	479	484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968347
8	NC_008321	GGT	2	6	541	546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968347
9	NC_008321	TTA	2	6	598	603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968347
10	NC_008321	CAT	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968347
11	NC_008321	AAT	2	6	631	636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968347
12	NC_008321	GGT	2	6	648	653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968347
13	NC_008321	GAA	2	6	715	720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968347
14	NC_008321	TAC	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968347
15	NC_008321	CGA	2	6	759	764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968347
16	NC_008321	GAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968347
17	NC_008321	ATC	2	6	839	844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968347
18	NC_008321	ATC	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968347
19	NC_008321	GCC	2	6	942	947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968347
20	NC_008321	CGA	2	6	1011	1016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968347
21	NC_008321	CTT	2	6	1023	1028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968347
22	NC_008321	GCC	2	6	1109	1114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968347
23	NC_008321	ACA	2	6	1187	1192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968347
24	NC_008321	TAC	2	6	1213	1218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968347
25	NC_008321	TGT	2	6	1238	1243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968347
26	NC_008321	CGT	2	6	1249	1254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968347
27	NC_008321	TGG	2	6	1344	1349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968347
28	NC_008321	CAC	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968347
29	NC_008321	AGA	2	6	1422	1427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968347
30	NC_008321	TCT	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968347
31	NC_008321	GAA	2	6	1671	1676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968348
32	NC_008321	TAC	2	6	1682	1687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968348
33	NC_008321	AAG	2	6	1698	1703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968348
34	NC_008321	CAA	2	6	1755	1760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968348
35	NC_008321	GTT	2	6	1772	1777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968348
36	NC_008321	GAA	2	6	1821	1826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968348
37	NC_008321	TGC	2	6	1978	1983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968348
38	NC_008321	TTG	2	6	2097	2102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968348
39	NC_008321	GAT	2	6	2109	2114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968348
40	NC_008321	ACC	2	6	2157	2162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968348
41	NC_008321	CAC	2	6	2165	2170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968348
42	NC_008321	GAA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968348
43	NC_008321	GAA	2	6	2388	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968348
44	NC_008321	ATC	2	6	2394	2399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968348
45	NC_008321	ACA	2	6	2410	2415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968348
46	NC_008321	AAC	2	6	2466	2471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968348
47	NC_008321	GAT	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968348
48	NC_008321	ACC	2	6	2533	2538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968348
49	NC_008321	GAA	2	6	2541	2546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968348
50	NC_008321	ATT	2	6	3568	3573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968349
51	NC_008321	ACA	2	6	3613	3618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968349
52	NC_008321	GAT	2	6	3647	3652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968349
53	NC_008321	AGC	2	6	3696	3701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968349
54	NC_008321	GCA	2	6	3746	3751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968349
55	NC_008321	ATA	2	6	3838	3843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968350
56	NC_008321	TTC	2	6	3863	3868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968350
57	NC_008321	CGA	2	6	3935	3940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968350
58	NC_008321	CAT	2	6	3954	3959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968350
59	NC_008321	AGT	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968350
60	NC_008321	CGA	2	6	4061	4066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968350
61	NC_008321	GAA	2	6	4098	4103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968350
62	NC_008321	GCC	2	6	4113	4118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968350
63	NC_008321	CGA	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968350
64	NC_008321	GGT	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968350
65	NC_008321	CGC	2	6	4248	4253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968350
66	NC_008321	GAA	2	6	4362	4367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968350
67	NC_008321	CGA	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968350
68	NC_008321	TAA	2	6	4535	4540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968350
69	NC_008321	CAA	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968350
70	NC_008321	TGG	2	6	4676	4681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968350
71	NC_008321	CAA	2	6	4724	4729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968350
72	NC_008321	CTG	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968350
73	NC_008321	TCG	2	6	4957	4962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968350
74	NC_008321	GCG	2	6	4995	5000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968350
75	NC_008321	CGT	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968350
76	NC_008321	GGT	2	6	5046	5051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968350
77	NC_008321	CTG	2	6	5125	5130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968350
78	NC_008321	TCT	2	6	5232	5237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968350
79	NC_008321	CGA	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968350
80	NC_008321	CAT	4	12	5321	5332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968350
81	NC_008321	CTT	3	9	5381	5389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968350
82	NC_008321	GCC	2	6	5438	5443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968350
83	NC_008321	GAA	2	6	5456	5461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968350
84	NC_008321	AGC	2	6	5492	5497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968350
85	NC_008321	TTG	2	6	5623	5628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968350
86	NC_008321	ATC	2	6	5677	5682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968350
87	NC_008321	CAA	2	6	5690	5695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968350
88	NC_008321	TGG	2	6	5755	5760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968350
89	NC_008321	TTC	2	6	5886	5891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968350
90	NC_008321	GCG	2	6	5928	5933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968350
91	NC_008321	GGT	2	6	5955	5960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968350
92	NC_008321	CGC	2	6	6123	6128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968350
93	NC_008321	TGC	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968350
94	NC_008321	TGA	2	6	6146	6151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968350
95	NC_008321	TCG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968351
96	NC_008321	GAA	2	6	6482	6487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968351
97	NC_008321	CAT	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968351
98	NC_008321	GTG	2	6	6555	6560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968351
99	NC_008321	AGT	2	6	6967	6972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968351
100	NC_008321	ATG	2	6	7121	7126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968352
101	NC_008321	GTT	2	6	7450	7455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968352
102	NC_008321	GCG	2	6	7544	7549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968352
103	NC_008321	TTA	2	6	7586	7591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968352
104	NC_008321	GCG	2	6	7694	7699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968352
105	NC_008321	TGA	2	6	7710	7715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968352
106	NC_008321	GTT	2	6	7735	7740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968352
107	NC_008321	AGC	2	6	7748	7753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968352
108	NC_008321	TGC	2	6	7756	7761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968352
109	NC_008321	ATT	2	6	7838	7843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968352
110	NC_008321	TAA	2	6	8145	8150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113968353
111	NC_008321	TGG	2	6	8337	8342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113968353
112	NC_008321	TTG	2	6	8494	8499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968353
113	NC_008321	GCA	2	6	8595	8600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968353
114	NC_008321	CGC	2	6	8632	8637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968353
115	NC_008321	GAA	2	6	8758	8763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968353
116	NC_008321	ATG	2	6	8798	8803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968353
117	NC_008321	AGC	2	6	8864	8869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968353
118	NC_008321	TGA	2	6	8894	8899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968353
119	NC_008321	TTG	2	6	8926	8931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968353
120	NC_008321	ATC	2	6	9040	9045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113968353
121	NC_008321	TGC	2	6	9059	9064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968353
122	NC_008321	TTA	2	6	9103	9108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968353
123	NC_008321	CAG	2	6	9160	9165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968353
124	NC_008321	TTA	2	6	9284	9289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113968354
125	NC_008321	GTT	2	6	9304	9309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968354
126	NC_008321	GAA	2	6	9349	9354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968354
127	NC_008321	CAG	2	6	9382	9387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968354
128	NC_008321	CGC	2	6	9559	9564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113968354
129	NC_008321	GCG	2	6	9854	9859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968354
130	NC_008321	GCT	2	6	9965	9970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113968354
131	NC_008321	GGC	2	6	10144	10149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968354
132	NC_008321	GGC	2	6	10186	10191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968354
133	NC_008321	GTT	3	9	10233	10241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113968354
134	NC_008321	GAA	3	9	10303	10311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113968354
135	NC_008321	CTT	2	6	10554	10559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968354
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138	NC_008321	CGG	2	6	10581	10586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968354
139	NC_008321	CCA	2	6	10589	10594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968354
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147	NC_008321	TTC	2	6	11260	11265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968354
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155	NC_008321	GCG	2	6	12022	12027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113968355
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162	NC_008321	ACA	2	6	12496	12501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113968356
163	NC_008321	CGA	2	6	12553	12558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968356
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244	NC_008321	ATG	2	6	20931	20936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968363
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248	NC_008321	ACC	2	6	21239	21244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968364
249	NC_008321	ACC	2	6	21314	21319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113968364
250	NC_008321	CTT	2	6	21388	21393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113968364
251	NC_008321	GAT	2	6	21440	21445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113968364
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253	NC_008321	CAG	2	6	21488	21493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113968364
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