MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Shewanella sp. MR-7 plasmid1

Total Repeats: 91

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008320	GCG	2	6	144	149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008320	CGT	2	6	196	201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008320	CTC	2	6	315	320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_008320	GGC	2	6	449	454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008320	GCG	2	6	486	491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008320	CTC	2	6	697	702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_008320	GGT	2	6	739	744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008320	GGT	2	6	772	777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008320	GGT	2	6	805	810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008320	TGG	2	6	876	881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008320	CAC	2	6	899	904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008320	TCT	2	6	944	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951723
13	NC_008320	TTA	2	6	1155	1160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113951723
14	NC_008320	GAA	2	6	1173	1178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951723
15	NC_008320	CCT	2	6	1294	1299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113951723
16	NC_008320	CTA	2	6	1356	1361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951723
17	NC_008320	GCC	2	6	1686	1691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951724
18	NC_008320	GGC	2	6	1723	1728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113951724
19	NC_008320	CTG	2	6	1750	1755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951724
20	NC_008320	AAC	2	6	1822	1827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951724
21	NC_008320	ACA	2	6	1863	1868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951724
22	NC_008320	CTT	2	6	1870	1875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951724
23	NC_008320	TAC	2	6	1888	1893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951724
24	NC_008320	TAA	2	6	1894	1899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113951724
25	NC_008320	GAA	2	6	1949	1954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951724
26	NC_008320	AGA	2	6	2018	2023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951724
27	NC_008320	AAG	2	6	2041	2046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113951724
28	NC_008320	TAT	2	6	2147	2152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113951725
29	NC_008320	ATC	2	6	2163	2168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951725
30	NC_008320	CAA	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951725
31	NC_008320	TAG	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113951725
32	NC_008320	ACT	2	6	2238	2243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951725
33	NC_008320	TTG	2	6	2353	2358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113951725
34	NC_008320	TGT	2	6	2528	2533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113951725
35	NC_008320	TCT	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951726
36	NC_008320	TTC	2	6	2695	2700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951726
37	NC_008320	AAC	2	6	2828	2833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951726
38	NC_008320	TAT	2	6	2850	2855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113951726
39	NC_008320	ACT	2	6	2890	2895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008320	AAG	2	6	3035	3040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008320	AAT	2	6	3045	3050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008320	CTT	2	6	3051	3056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008320	TCC	2	6	3058	3063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_008320	ATT	2	6	3091	3096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008320	CGC	2	6	3153	3158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_008320	CAC	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_008320	ACG	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008320	CTC	2	6	3408	3413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_008320	TCA	2	6	3539	3544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008320	TAG	2	6	3619	3624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008320	CAC	2	6	3641	3646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_008320	TAC	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008320	TGT	2	6	3677	3682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008320	ATT	2	6	3720	3725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008320	ACA	2	6	4061	4066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008320	ATC	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951728
57	NC_008320	CAA	2	6	4131	4136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951728
58	NC_008320	CAT	2	6	4145	4150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951728
59	NC_008320	CTT	2	6	4218	4223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951728
60	NC_008320	GAT	2	6	4265	4270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113951728
61	NC_008320	CTT	2	6	4356	4361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951728
62	NC_008320	GGT	2	6	4432	4437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008320	AAT	2	6	4449	4454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008320	TTA	2	6	4488	4493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008320	AAT	2	6	4495	4500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008320	TGC	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008320	GCA	2	6	4614	4619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008320	ATA	2	6	4622	4627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008320	CAT	2	6	4755	4760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_008320	AGA	2	6	4816	4821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008320	CAT	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008320	TTC	2	6	4918	4923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008320	GTG	2	6	4978	4983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113951729
74	NC_008320	TGC	2	6	4993	4998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951729
75	NC_008320	ACT	2	6	5137	5142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113951729
76	NC_008320	GCC	2	6	5184	5189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951729
77	NC_008320	CAA	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008320	GGT	2	6	5281	5286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008320	ATC	2	6	5321	5326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008320	TTC	2	6	5502	5507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951730
81	NC_008320	CCA	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113951730
82	NC_008320	GCT	2	6	5618	5623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951730
83	NC_008320	GCT	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951730
84	NC_008320	GTT	2	6	5774	5779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113951730
85	NC_008320	CGC	2	6	5843	5848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951730
86	NC_008320	CGC	2	6	5887	5892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113951730
87	NC_008320	TGC	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113951730
88	NC_008320	CTT	2	6	6119	6124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951730
89	NC_008320	CAA	2	6	6138	6143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113951730
90	NC_008320	CTT	2	6	6183	6188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113951730
91	NC_008320	AGA	2	6	6398	6403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.