MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 7419

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008319	CGCT	2	8	389	396	0 %	25 %	25 %	50 %	113953564
2	NC_008319	TCGA	2	8	988	995	25 %	25 %	25 %	25 %	113953564
3	NC_008319	AGCC	2	8	1072	1079	25 %	0 %	25 %	50 %	113953564
4	NC_008319	GGTT	2	8	1084	1091	0 %	50 %	50 %	0 %	113953564
5	NC_008319	ACCT	2	8	1296	1303	25 %	25 %	0 %	50 %	113953564
6	NC_008319	AGCG	2	8	1686	1693	25 %	0 %	50 %	25 %	113953136
7	NC_008319	GCCT	2	8	1733	1740	0 %	25 %	25 %	50 %	113953136
8	NC_008319	CCAT	2	8	1808	1815	25 %	25 %	0 %	50 %	113953136
9	NC_008319	GGTT	2	8	1933	1940	0 %	50 %	50 %	0 %	113953136
10	NC_008319	TGGC	2	8	2645	2652	0 %	25 %	50 %	25 %	113955261
11	NC_008319	GTGG	2	8	2689	2696	0 %	25 %	75 %	0 %	113955261
12	NC_008319	TTGA	2	8	2944	2951	25 %	50 %	25 %	0 %	113955261
13	NC_008319	GTGC	2	8	3157	3164	0 %	25 %	50 %	25 %	113955261
14	NC_008319	ATCG	2	8	3406	3413	25 %	25 %	25 %	25 %	113955261
15	NC_008319	TTTG	2	8	4278	4285	0 %	75 %	25 %	0 %	113955261
16	NC_008319	CGTT	2	8	5230	5237	0 %	50 %	25 %	25 %	113954725
17	NC_008319	TCGC	2	8	5350	5357	0 %	25 %	25 %	50 %	113954725
18	NC_008319	TGAT	2	8	5650	5657	25 %	50 %	25 %	0 %	113954725
19	NC_008319	TCGT	2	8	5665	5672	0 %	50 %	25 %	25 %	113954725
20	NC_008319	AAGG	2	8	5874	5881	50 %	0 %	50 %	0 %	113954725
21	NC_008319	GCTT	2	8	5925	5932	0 %	50 %	25 %	25 %	113954725
22	NC_008319	GATT	2	8	6051	6058	25 %	50 %	25 %	0 %	113953878
23	NC_008319	TAGG	2	8	6923	6930	25 %	25 %	50 %	0 %	113953878
24	NC_008319	TTCC	2	8	7128	7135	0 %	50 %	0 %	50 %	113953878
25	NC_008319	TGGT	2	8	7375	7382	0 %	50 %	50 %	0 %	113953878
26	NC_008319	AGTC	2	8	7520	7527	25 %	25 %	25 %	25 %	113953878
27	NC_008319	CGAT	2	8	8459	8466	25 %	25 %	25 %	25 %	113953878
28	NC_008319	GAGC	2	8	8723	8730	25 %	0 %	50 %	25 %	113953244
29	NC_008319	GCTT	2	8	8941	8948	0 %	50 %	25 %	25 %	113953244
30	NC_008319	GTTG	2	8	9102	9109	0 %	50 %	50 %	0 %	113953244
31	NC_008319	GCGG	2	8	9240	9247	0 %	0 %	75 %	25 %	113953244
32	NC_008319	CATG	2	8	9845	9852	25 %	25 %	25 %	25 %	113952821
33	NC_008319	AGCG	2	8	10135	10142	25 %	0 %	50 %	25 %	113952821
34	NC_008319	GCAA	2	8	10197	10204	50 %	0 %	25 %	25 %	113952821
35	NC_008319	TCCT	2	8	10367	10374	0 %	50 %	0 %	50 %	113952821
36	NC_008319	ATCA	2	8	10449	10456	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008319	TCAA	2	8	10637	10644	50 %	25 %	0 %	25 %	113953255
38	NC_008319	GTTG	2	8	10727	10734	0 %	50 %	50 %	0 %	113953255
39	NC_008319	CTCA	2	8	10915	10922	25 %	25 %	0 %	50 %	113953255
40	NC_008319	GTCC	2	8	11673	11680	0 %	25 %	25 %	50 %	113954152
41	NC_008319	ATCG	2	8	12416	12423	25 %	25 %	25 %	25 %	113954607
42	NC_008319	TGAT	2	8	12444	12451	25 %	50 %	25 %	0 %	113954607
43	NC_008319	GAAC	2	8	13517	13524	50 %	0 %	25 %	25 %	113955324
44	NC_008319	TGGT	2	8	13654	13661	0 %	50 %	50 %	0 %	113955324
45	NC_008319	AATC	3	12	14370	14381	50 %	25 %	0 %	25 %	113953373
46	NC_008319	CACG	2	8	14621	14628	25 %	0 %	25 %	50 %	113953373
47	NC_008319	CTTG	2	8	14821	14828	0 %	50 %	25 %	25 %	113953373
48	NC_008319	GCCG	2	8	15023	15030	0 %	0 %	50 %	50 %	113953373
49	NC_008319	ACCC	2	8	15639	15646	25 %	0 %	0 %	75 %	113953373
50	NC_008319	CGGA	2	8	16102	16109	25 %	0 %	50 %	25 %	113954024
51	NC_008319	CTTG	2	8	16201	16208	0 %	50 %	25 %	25 %	113954024
52	NC_008319	GGCA	2	8	16387	16394	25 %	0 %	50 %	25 %	113954024
53	NC_008319	TTTG	2	8	17050	17057	0 %	75 %	25 %	0 %	113954024
54	NC_008319	CCCT	2	8	17400	17407	0 %	25 %	0 %	75 %	113955034
55	NC_008319	GTGG	2	8	18148	18155	0 %	25 %	75 %	0 %	113955552
56	NC_008319	TTTG	2	8	18316	18323	0 %	75 %	25 %	0 %	113955552
57	NC_008319	TTTG	2	8	18763	18770	0 %	75 %	25 %	0 %	113955552
58	NC_008319	ACCT	2	8	19193	19200	25 %	25 %	0 %	50 %	113954714
59	NC_008319	CGAC	2	8	19394	19401	25 %	0 %	25 %	50 %	113954714
60	NC_008319	TGCT	2	8	19607	19614	0 %	50 %	25 %	25 %	113953859
61	NC_008319	TCAG	2	8	19675	19682	25 %	25 %	25 %	25 %	113953859
62	NC_008319	TGCG	2	8	19685	19692	0 %	25 %	50 %	25 %	113953859
63	NC_008319	ACGC	2	8	20300	20307	25 %	0 %	25 %	50 %	113953859
64	NC_008319	TGAA	2	8	22804	22811	50 %	25 %	25 %	0 %	113955252
65	NC_008319	TGAA	2	8	23227	23234	50 %	25 %	25 %	0 %	113955252
66	NC_008319	TGAA	2	8	23650	23657	50 %	25 %	25 %	0 %	113955252
67	NC_008319	AGAT	2	8	23864	23871	50 %	25 %	25 %	0 %	113955252
68	NC_008319	GGTA	2	8	24249	24256	25 %	25 %	50 %	0 %	113955237
69	NC_008319	GTGA	2	8	24591	24598	25 %	25 %	50 %	0 %	113955237
70	NC_008319	GCCT	2	8	25019	25026	0 %	25 %	25 %	50 %	113955237
71	NC_008319	GCTT	2	8	25354	25361	0 %	50 %	25 %	25 %	113955237
72	NC_008319	ATCA	2	8	25593	25600	50 %	25 %	0 %	25 %	113954482
73	NC_008319	TGGC	2	8	25703	25710	0 %	25 %	50 %	25 %	113954482
74	NC_008319	CACC	2	8	25973	25980	25 %	0 %	0 %	75 %	113954482
75	NC_008319	CCAA	2	8	26632	26639	50 %	0 %	0 %	50 %	113954125
76	NC_008319	TTCA	2	8	26876	26883	25 %	50 %	0 %	25 %	113954125
77	NC_008319	TTGA	2	8	27565	27572	25 %	50 %	25 %	0 %	113954125
78	NC_008319	GCAA	2	8	27586	27593	50 %	0 %	25 %	25 %	113954125
79	NC_008319	TTAA	2	8	27864	27871	50 %	50 %	0 %	0 %	113954125
80	NC_008319	GATT	2	8	29591	29598	25 %	50 %	25 %	0 %	113955228
81	NC_008319	TGGA	2	8	30091	30098	25 %	25 %	50 %	0 %	113955228
82	NC_008319	CCAA	2	8	30408	30415	50 %	0 %	0 %	50 %	113954491
83	NC_008319	GATC	2	8	32305	32312	25 %	25 %	25 %	25 %	113955022
84	NC_008319	CCCA	2	8	32378	32385	25 %	0 %	0 %	75 %	113955022
85	NC_008319	GCAA	2	8	32527	32534	50 %	0 %	25 %	25 %	113955022
86	NC_008319	TTCC	2	8	32796	32803	0 %	50 %	0 %	50 %	113954195
87	NC_008319	GATC	2	8	32937	32944	25 %	25 %	25 %	25 %	113954195
88	NC_008319	GAGC	2	8	32954	32961	25 %	0 %	50 %	25 %	113954195
89	NC_008319	TGAT	2	8	33539	33546	25 %	50 %	25 %	0 %	113954195
90	NC_008319	AAAT	2	8	34311	34318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008319	GGAA	2	8	34641	34648	50 %	0 %	50 %	0 %	113953745
92	NC_008319	ACGA	2	8	35252	35259	50 %	0 %	25 %	25 %	113953745
93	NC_008319	CTTG	2	8	35318	35325	0 %	50 %	25 %	25 %	113953745
94	NC_008319	CAGC	2	8	35347	35354	25 %	0 %	25 %	50 %	113953745
95	NC_008319	AGGG	2	8	35436	35443	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008319	TCCT	2	8	35520	35527	0 %	50 %	0 %	50 %	113952878
97	NC_008319	CAGA	2	8	36222	36229	50 %	0 %	25 %	25 %	113952878
98	NC_008319	ATCG	2	8	38085	38092	25 %	25 %	25 %	25 %	113955533
99	NC_008319	GGAG	2	8	38228	38235	25 %	0 %	75 %	0 %	113953615
100	NC_008319	ACCT	2	8	38263	38270	25 %	25 %	0 %	50 %	113953615
101	NC_008319	GCTG	2	8	38546	38553	0 %	25 %	50 %	25 %	113953615
102	NC_008319	CAGA	2	8	39049	39056	50 %	0 %	25 %	25 %	113952791
103	NC_008319	CAGC	2	8	39343	39350	25 %	0 %	25 %	50 %	113952791
104	NC_008319	TTCA	2	8	40359	40366	25 %	50 %	0 %	25 %	113953487
105	NC_008319	CCCA	2	8	40414	40421	25 %	0 %	0 %	75 %	113953487
106	NC_008319	TGGT	2	8	41073	41080	0 %	50 %	50 %	0 %	113955234
107	NC_008319	TCGA	2	8	41299	41306	25 %	25 %	25 %	25 %	113955234
108	NC_008319	AATA	2	8	41324	41331	75 %	25 %	0 %	0 %	113955234
109	NC_008319	GTTG	2	8	41842	41849	0 %	50 %	50 %	0 %	113952800
110	NC_008319	TTGC	2	8	42039	42046	0 %	50 %	25 %	25 %	113952800
111	NC_008319	TGCA	2	8	42241	42248	25 %	25 %	25 %	25 %	113952800
112	NC_008319	CGGC	2	8	42332	42339	0 %	0 %	50 %	50 %	113952800
113	NC_008319	GCTG	2	8	42359	42366	0 %	25 %	50 %	25 %	113952800
114	NC_008319	AGCC	2	8	42470	42477	25 %	0 %	25 %	50 %	113952800
115	NC_008319	CCTC	2	8	42545	42552	0 %	25 %	0 %	75 %	113952800
116	NC_008319	GATC	2	8	42575	42582	25 %	25 %	25 %	25 %	113952800
117	NC_008319	GGTC	2	8	43315	43322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008319	AGCG	2	8	43344	43351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_008319	GAAT	2	8	43552	43559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008319	CGAG	2	8	44356	44363	25 %	0 %	50 %	25 %	113954460
121	NC_008319	GCAA	2	8	44526	44533	50 %	0 %	25 %	25 %	113954460
122	NC_008319	TTCC	2	8	44686	44693	0 %	50 %	0 %	50 %	113955144
123	NC_008319	CACC	2	8	45011	45018	25 %	0 %	0 %	75 %	113953178
124	NC_008319	TCAT	2	8	45220	45227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008319	CCGC	2	8	45788	45795	0 %	0 %	25 %	75 %	113953744
126	NC_008319	GCTC	2	8	46136	46143	0 %	25 %	25 %	50 %	113953744
127	NC_008319	CAGC	2	8	46621	46628	25 %	0 %	25 %	50 %	113953744
128	NC_008319	GGGT	2	8	46728	46735	0 %	25 %	75 %	0 %	113953744
129	NC_008319	TGCT	2	8	46807	46814	0 %	50 %	25 %	25 %	113952935
130	NC_008319	GGTT	2	8	47110	47117	0 %	50 %	50 %	0 %	113952935
131	NC_008319	CGCC	2	8	47184	47191	0 %	0 %	25 %	75 %	113952935
132	NC_008319	TGGC	2	8	47606	47613	0 %	25 %	50 %	25 %	113952935
133	NC_008319	CATT	2	8	47949	47956	25 %	50 %	0 %	25 %	113952935
134	NC_008319	AGGC	2	8	47969	47976	25 %	0 %	50 %	25 %	113952935
135	NC_008319	CCAT	2	8	49254	49261	25 %	25 %	0 %	50 %	113954939
136	NC_008319	CGTG	2	8	50068	50075	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008319	GGGA	2	8	50426	50433	25 %	0 %	75 %	0 %	113954102
138	NC_008319	CCTT	2	8	50647	50654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008319	ATAA	2	8	51220	51227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008319	TGGC	2	8	51476	51483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008319	TTGA	2	8	51839	51846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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