MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 1151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008319	ATCA	2	8	10449	10456	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008319	AAAT	2	8	34311	34318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008319	AGGG	2	8	35436	35443	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008319	GGTC	2	8	43315	43322	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008319	AGCG	2	8	43344	43351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008319	GAAT	2	8	43552	43559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008319	TCAT	2	8	45220	45227	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_008319	CGTG	2	8	50068	50075	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008319	CCTT	2	8	50647	50654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008319	ATAA	2	8	51220	51227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008319	TGGC	2	8	51476	51483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008319	TTGA	2	8	51839	51846	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008319	CTTG	2	8	51861	51868	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008319	TTAA	2	8	69451	69458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008319	AGTG	2	8	69541	69548	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008319	CCTT	2	8	76921	76928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008319	TGTT	2	8	88272	88279	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008319	GTTG	2	8	110219	110226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008319	CAGC	2	8	110243	110250	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008319	TGAT	2	8	113778	113785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008319	GCTT	2	8	117667	117674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008319	GAAG	2	8	144380	144387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008319	AATA	2	8	146542	146549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008319	ATAA	2	8	147414	147421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008319	ATAA	2	8	150271	150278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008319	TATT	2	8	150314	150321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008319	AGAC	2	8	150335	150342	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008319	GATG	2	8	150387	150394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008319	CAAG	2	8	154663	154670	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_008319	AGGC	2	8	171825	171832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_008319	GGCT	2	8	173099	173106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_008319	CACT	2	8	173112	173119	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008319	TCGA	2	8	174663	174670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008319	CATG	2	8	176142	176149	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008319	AGGC	2	8	177918	177925	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_008319	AGGA	2	8	178065	178072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008319	TACC	2	8	178182	178189	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_008319	ACCT	2	8	199343	199350	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008319	CTTT	2	8	199911	199918	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_008319	AAGG	2	8	207996	208003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008319	GTTG	2	8	224833	224840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008319	TTGC	2	8	232540	232547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_008319	ATGG	2	8	232549	232556	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008319	AATT	2	8	235518	235525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008319	CAGG	2	8	254513	254520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_008319	AGTC	2	8	266578	266585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008319	ATGC	2	8	268963	268970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008319	TTAA	2	8	275372	275379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008319	TCCT	2	8	275461	275468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008319	TGCT	2	8	275507	275514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008319	TTTG	2	8	275734	275741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008319	TGTC	2	8	275840	275847	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008319	TGGT	2	8	276743	276750	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008319	CCAT	2	8	288517	288524	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_008319	CGAC	2	8	298137	298144	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008319	CGAT	2	8	298306	298313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008319	GCTC	2	8	306081	306088	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_008319	GTTG	2	8	308621	308628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008319	GAAG	2	8	314828	314835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008319	ACCG	2	8	318765	318772	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008319	CCCA	2	8	325801	325808	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_008319	ATGG	2	8	326633	326640	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008319	AATT	2	8	327990	327997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008319	CCTG	2	8	337921	337928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008319	TCAA	2	8	340078	340085	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_008319	TCAT	2	8	340492	340499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008319	CGGC	2	8	351329	351336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008319	GAAA	2	8	352024	352031	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008319	CTAA	2	8	352435	352442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008319	AATT	2	8	354794	354801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008319	CCAT	2	8	363602	363609	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008319	ATTC	2	8	368239	368246	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_008319	AGGT	2	8	368288	368295	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008319	CCAT	2	8	371751	371758	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_008319	TGGT	2	8	371845	371852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008319	ATTC	2	8	380038	380045	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008319	GGCT	2	8	380065	380072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008319	ATCG	2	8	383304	383311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_008319	TTCG	2	8	398774	398781	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008319	CTGA	2	8	402214	402221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_008319	ATTA	2	8	402224	402231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008319	GAAA	2	8	402234	402241	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008319	CGGG	2	8	407167	407174	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008319	TGGA	2	8	407184	407191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008319	TTCT	2	8	416700	416707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008319	TGAT	2	8	416792	416799	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008319	ATCC	2	8	416823	416830	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008319	TTGC	2	8	416941	416948	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008319	GAGG	2	8	417319	417326	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008319	AAAG	2	8	420676	420683	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008319	AATG	2	8	424450	424457	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008319	GAAG	2	8	426993	427000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008319	GTGA	2	8	433314	433321	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008319	AGCG	2	8	435924	435931	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008319	GCTG	2	8	435937	435944	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008319	CAAA	2	8	436096	436103	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008319	GCCG	2	8	437731	437738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_008319	TATG	2	8	439449	439456	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008319	CTCC	2	8	440448	440455	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_008319	TTGG	2	8	442081	442088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008319	AGGC	2	8	442335	442342	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008319	AGGG	2	8	442364	442371	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008319	GATC	3	12	443872	443883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_008319	ATCA	2	8	451467	451474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008319	GTTG	2	8	451598	451605	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008319	GGTT	2	8	454629	454636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008319	CGAT	2	8	468267	468274	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_008319	GCCT	2	8	471171	471178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008319	CCAG	2	8	474514	474521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008319	AATT	2	8	481119	481126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008319	AATC	2	8	484216	484223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008319	CATT	2	8	485672	485679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_008319	CTCA	2	8	486651	486658	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008319	TATT	2	8	490694	490701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008319	TTTA	2	8	494326	494333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008319	TGAT	2	8	494461	494468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008319	AGCT	2	8	495182	495189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008319	ATGG	2	8	495336	495343	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008319	TTGT	2	8	495393	495400	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008319	CGAT	2	8	495484	495491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008319	TAGT	2	8	496848	496855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008319	TGCT	2	8	496865	496872	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_008319	CTAG	2	8	497079	497086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008319	CTTT	2	8	499501	499508	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_008319	GTTG	2	8	499564	499571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008319	TCAA	2	8	500589	500596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_008319	CTTT	2	8	502187	502194	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008319	TGAC	2	8	503238	503245	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008319	CTTT	2	8	503948	503955	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_008319	TTTC	2	8	504840	504847	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_008319	TACT	2	8	504935	504942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008319	CTTC	2	8	507163	507170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008319	GGTC	2	8	507901	507908	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_008319	TGCT	2	8	507917	507924	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008319	ATGG	3	12	514170	514181	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008319	AATC	2	8	514755	514762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008319	CAGA	2	8	516598	516605	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008319	ATGG	2	8	517461	517468	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008319	TTGG	2	8	521577	521584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008319	CGTT	2	8	527244	527251	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008319	CGAA	2	8	530017	530024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008319	ACGC	2	8	530789	530796	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_008319	ACAA	2	8	531447	531454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_008319	ACTG	2	8	531779	531786	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_008319	TTCA	2	8	532042	532049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008319	AGCT	2	8	533019	533026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_008319	AATG	2	8	533345	533352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008319	TACA	2	8	534207	534214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008319	GAAG	2	8	534500	534507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_008319	ATTG	2	8	541985	541992	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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