MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 3996

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008319	CTA	2	6	28	33	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008319	GAG	2	6	138	143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008319	ACG	2	6	1340	1345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008319	TCG	2	6	2149	2154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008319	ATC	2	6	8528	8533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_008319	CTG	2	6	11142	11147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008319	CTG	2	6	14306	14311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008319	TCT	2	6	17238	17243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008319	TTG	2	6	17257	17262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008319	TGC	2	6	17867	17872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_008319	TCC	2	6	18878	18883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_008319	TGC	2	6	18885	18890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_008319	GAT	2	6	20727	20732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008319	TTG	2	6	24178	24183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008319	CAT	2	6	24203	24208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_008319	TAC	2	6	29232	29237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_008319	AGG	2	6	34298	34303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008319	CCT	2	6	34341	34346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_008319	GAT	2	6	39740	39745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008319	TGT	2	6	40760	40765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008319	TTC	2	6	40772	40777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008319	GAT	2	6	41530	41535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008319	TCA	2	6	41628	41633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_008319	GAG	2	6	41829	41834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008319	ACC	2	6	43242	43247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_008319	CGA	2	6	43387	43392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_008319	ATC	2	6	43539	43544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008319	TTA	2	6	44661	44666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008319	TGA	2	6	45598	45603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008319	GTG	2	6	49726	49731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008319	TGT	2	6	49929	49934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008319	GTA	2	6	50919	50924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008319	TAT	2	6	51091	51096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008319	TTA	2	6	51233	51238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008319	TTA	2	6	51403	51408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008319	TTG	2	6	51512	51517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008319	TGT	2	6	51518	51523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008319	TTG	2	6	51560	51565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008319	CTG	2	6	51598	51603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008319	TGG	2	6	51889	51894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008319	CTG	2	6	57137	57142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008319	CTA	2	6	57172	57177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_008319	GTT	2	6	57394	57399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008319	TGT	2	6	57439	57444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008319	ACC	2	6	59884	59889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_008319	TCA	2	6	67260	67265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008319	CGG	3	9	68027	68035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_008319	GGA	2	6	68039	68044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008319	CGG	2	6	69422	69427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008319	GGT	2	6	69485	69490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008319	GCG	2	6	69513	69518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008319	TTC	2	6	71581	71586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008319	CAG	2	6	74318	74323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_008319	GCG	2	6	74379	74384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008319	AAC	2	6	75437	75442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008319	ATG	2	6	75494	75499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008319	ACG	2	6	76308	76313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008319	CAG	2	6	80823	80828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_008319	AGG	2	6	82806	82811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008319	TGA	2	6	82823	82828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008319	ATC	2	6	82863	82868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_008319	CGC	2	6	82889	82894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_008319	CTG	2	6	82904	82909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008319	CAG	2	6	86255	86260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_008319	CAC	2	6	86279	86284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_008319	TGC	2	6	87127	87132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_008319	GTG	2	6	87288	87293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008319	GTT	2	6	88200	88205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008319	CCA	2	6	88755	88760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008319	GAT	2	6	88804	88809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008319	CGT	2	6	90029	90034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008319	TGC	2	6	93709	93714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008319	TCA	2	6	93737	93742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008319	GCT	2	6	96301	96306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_008319	CAG	2	6	96323	96328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008319	GAA	2	6	97273	97278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008319	GGT	2	6	97344	97349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008319	ACG	2	6	97379	97384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_008319	CGA	2	6	100987	100992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008319	TGC	2	6	108950	108955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_008319	TGG	2	6	108957	108962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008319	TGA	2	6	111368	111373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008319	AGA	2	6	112306	112311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008319	TCC	2	6	115944	115949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_008319	AGC	2	6	117426	117431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008319	TTG	2	6	117460	117465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008319	CTG	2	6	117524	117529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008319	GCA	2	6	117566	117571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008319	TGA	2	6	117585	117590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008319	GAG	2	6	117689	117694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008319	ATG	2	6	117719	117724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008319	ATA	2	6	117828	117833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008319	TTG	2	6	117848	117853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008319	GAT	2	6	118588	118593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008319	ATG	2	6	118999	119004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008319	GCT	2	6	119021	119026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008319	GTT	2	6	122836	122841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008319	CGC	2	6	123662	123667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008319	CTT	2	6	123690	123695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008319	GCT	2	6	127161	127166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008319	GTT	2	6	127191	127196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008319	GCT	2	6	135274	135279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008319	ATC	2	6	136715	136720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008319	GTG	2	6	136776	136781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008319	CCT	2	6	136802	136807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_008319	AGG	2	6	138882	138887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008319	CCT	2	6	140468	140473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008319	AAC	2	6	140480	140485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008319	TGC	2	6	142753	142758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008319	TCA	2	6	143582	143587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_008319	GGC	2	6	143618	143623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008319	TCC	2	6	143669	143674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008319	CAC	2	6	143716	143721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_008319	CCA	2	6	144407	144412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_008319	CAT	2	6	144477	144482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_008319	TAC	2	6	144565	144570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008319	AGA	2	6	144581	144586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008319	AAT	2	6	145415	145420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008319	ATA	2	6	145428	145433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008319	GCA	2	6	145435	145440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008319	TCA	2	6	145478	145483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008319	ATC	2	6	145485	145490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_008319	TAA	2	6	145524	145529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008319	AAG	2	6	147525	147530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008319	TTA	2	6	150217	150222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008319	AAT	2	6	150240	150245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008319	ATG	2	6	150345	150350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008319	AGA	2	6	154538	154543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008319	ACG	2	6	154582	154587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008319	CCA	2	6	154694	154699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_008319	AGC	2	6	155787	155792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008319	ATT	2	6	156109	156114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008319	CGA	2	6	162745	162750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_008319	CTC	2	6	163824	163829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_008319	AGT	3	9	163912	163920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008319	ACA	2	6	163925	163930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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