MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Synechococcus sp. CC9311

Total Repeats: 31211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008319	GCT	2	6	351	356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953564
2	NC_008319	GTG	2	6	370	375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953564
3	NC_008319	CTG	2	6	517	522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953564
4	NC_008319	CTG	2	6	585	590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953564
5	NC_008319	GTG	2	6	622	627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953564
6	NC_008319	CTC	2	6	642	647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953564
7	NC_008319	TGA	2	6	773	778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953564
8	NC_008319	AGG	2	6	842	847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953564
9	NC_008319	ACG	2	6	1251	1256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953564
10	NC_008319	ATG	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953564
11	NC_008319	CAC	2	6	1387	1392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953136
12	NC_008319	GTC	2	6	1481	1486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953136
13	NC_008319	CGA	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953136
14	NC_008319	CAG	2	6	1549	1554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953136
15	NC_008319	CTG	2	6	1615	1620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953136
16	NC_008319	TCT	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953136
17	NC_008319	CAT	2	6	1659	1664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953136
18	NC_008319	TTG	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953136
19	NC_008319	GAT	2	6	1822	1827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953136
20	NC_008319	TTC	2	6	1862	1867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953136
21	NC_008319	GCA	2	6	1896	1901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953136
22	NC_008319	CAG	2	6	2003	2008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953136
23	NC_008319	GAT	2	6	2038	2043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953136
24	NC_008319	TCC	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955261
25	NC_008319	GGC	2	6	2226	2231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955261
26	NC_008319	GTG	2	6	2431	2436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955261
27	NC_008319	ACC	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955261
28	NC_008319	TGC	2	6	2514	2519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955261
29	NC_008319	TGG	2	6	2529	2534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955261
30	NC_008319	TGG	2	6	2630	2635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955261
31	NC_008319	CGT	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955261
32	NC_008319	GGT	2	6	2811	2816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955261
33	NC_008319	CAC	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955261
34	NC_008319	GAT	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955261
35	NC_008319	CTG	2	6	2906	2911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955261
36	NC_008319	TGT	2	6	2982	2987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955261
37	NC_008319	CGC	2	6	2988	2993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955261
38	NC_008319	TGC	2	6	3006	3011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955261
39	NC_008319	GTT	2	6	3026	3031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955261
40	NC_008319	GCT	2	6	3040	3045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955261
41	NC_008319	TGT	2	6	3146	3151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955261
42	NC_008319	GAG	2	6	3172	3177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955261
43	NC_008319	GGT	2	6	3246	3251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955261
44	NC_008319	TGC	2	6	3257	3262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955261
45	NC_008319	GGC	2	6	3276	3281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955261
46	NC_008319	AGA	2	6	3306	3311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113955261
47	NC_008319	CAA	2	6	3321	3326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113955261
48	NC_008319	GCT	2	6	3333	3338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955261
49	NC_008319	CTG	2	6	3430	3435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955261
50	NC_008319	TGA	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955261
51	NC_008319	GGT	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955261
52	NC_008319	TGC	2	6	3537	3542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955261
53	NC_008319	TGT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955261
54	NC_008319	GAT	2	6	3871	3876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113955261
55	NC_008319	TGT	2	6	3906	3911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955261
56	NC_008319	TGG	2	6	3917	3922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955261
57	NC_008319	TGG	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955261
58	NC_008319	GAG	2	6	4009	4014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113955261
59	NC_008319	CAG	2	6	4173	4178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955261
60	NC_008319	TGG	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955261
61	NC_008319	GGT	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955261
62	NC_008319	AGC	2	6	4325	4330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955261
63	NC_008319	TGG	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955261
64	NC_008319	GTT	2	6	4412	4417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955261
65	NC_008319	GGC	2	6	4549	4554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954725
66	NC_008319	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954725
67	NC_008319	GCA	2	6	4673	4678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954725
68	NC_008319	GGT	2	6	4794	4799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954725
69	NC_008319	CCA	2	6	4825	4830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954725
70	NC_008319	TGA	2	6	4870	4875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954725
71	NC_008319	GCA	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954725
72	NC_008319	CAG	2	6	5007	5012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954725
73	NC_008319	TAG	2	6	5192	5197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954725
74	NC_008319	CAT	2	6	5216	5221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113954725
75	NC_008319	GTG	2	6	5262	5267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954725
76	NC_008319	CAC	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954725
77	NC_008319	ACC	2	6	5676	5681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954725
78	NC_008319	CAC	2	6	5746	5751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954725
79	NC_008319	GCT	2	6	5808	5813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954725
80	NC_008319	GAG	2	6	5835	5840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113954725
81	NC_008319	TGG	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954725
82	NC_008319	GGC	2	6	6005	6010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954725
83	NC_008319	GTC	2	6	6101	6106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953878
84	NC_008319	GAC	2	6	6110	6115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953878
85	NC_008319	GCT	2	6	6157	6162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953878
86	NC_008319	TGG	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953878
87	NC_008319	TGA	2	6	6446	6451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953878
88	NC_008319	GCT	2	6	6484	6489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953878
89	NC_008319	CTT	2	6	6503	6508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953878
90	NC_008319	GGC	2	6	6525	6530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953878
91	NC_008319	TCC	2	6	6628	6633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953878
92	NC_008319	ACC	2	6	6658	6663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953878
93	NC_008319	TTG	2	6	6708	6713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953878
94	NC_008319	GGC	2	6	6781	6786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953878
95	NC_008319	AGC	2	6	6862	6867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953878
96	NC_008319	GGC	2	6	6978	6983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953878
97	NC_008319	GGT	2	6	6998	7003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953878
98	NC_008319	CAC	2	6	7004	7009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953878
99	NC_008319	AAG	2	6	7104	7109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953878
100	NC_008319	TTG	2	6	7302	7307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953878
101	NC_008319	GGT	2	6	7323	7328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953878
102	NC_008319	CCA	2	6	7337	7342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953878
103	NC_008319	TGA	2	6	7388	7393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113953878
104	NC_008319	GGA	2	6	7424	7429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113953878
105	NC_008319	CCA	2	6	7463	7468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953878
106	NC_008319	CAG	2	6	7473	7478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953878
107	NC_008319	CGG	2	6	7552	7557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953878
108	NC_008319	CCA	3	9	7562	7570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953878
109	NC_008319	TCA	2	6	7594	7599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953878
110	NC_008319	CCA	2	6	7615	7620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953878
111	NC_008319	CGT	2	6	7628	7633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953878
112	NC_008319	CCG	2	6	7710	7715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953878
113	NC_008319	TGC	2	6	7772	7777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953878
114	NC_008319	CGC	2	6	7805	7810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953878
115	NC_008319	AAG	2	6	7815	7820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953878
116	NC_008319	CCA	2	6	7916	7921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113953878
117	NC_008319	TGG	2	6	7949	7954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953878
118	NC_008319	AGC	2	6	7976	7981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953878
119	NC_008319	GAA	2	6	8012	8017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113953878
120	NC_008319	GGC	2	6	8136	8141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953878
121	NC_008319	TGG	2	6	8142	8147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953878
122	NC_008319	GGT	2	6	8258	8263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953878
123	NC_008319	CTC	2	6	8475	8480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113953878
124	NC_008319	TTG	2	6	8620	8625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953244
125	NC_008319	GTT	2	6	8666	8671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953244
126	NC_008319	CGC	2	6	8769	8774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113953244
127	NC_008319	CGA	2	6	8830	8835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953244
128	NC_008319	CTT	2	6	8840	8845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953244
129	NC_008319	TTG	2	6	8950	8955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953244
130	NC_008319	CGT	2	6	9044	9049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953244
131	NC_008319	CGT	2	6	9146	9151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953244
132	NC_008319	GTT	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113953244
133	NC_008319	GCT	2	6	9232	9237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953244
134	NC_008319	CTT	2	6	9248	9253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113953244
135	NC_008319	TCA	2	6	9392	9397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113953244
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137	NC_008319	GCT	2	6	9751	9756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952821
138	NC_008319	TCG	2	6	9791	9796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113952821
139	NC_008319	CTA	2	6	9892	9897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113952821
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143	NC_008319	GTA	2	6	10178	10183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113952821
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147	NC_008319	GGT	2	6	10526	10531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113953255
148	NC_008319	TGC	2	6	10550	10555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953255
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153	NC_008319	GCT	2	6	10969	10974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113953255
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155	NC_008319	CAG	2	6	11011	11016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113953255
156	NC_008319	GGC	2	6	11121	11126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113953255
157	NC_008319	GTT	2	6	11272	11277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113954152
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159	NC_008319	TCG	2	6	11478	11483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954152
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161	NC_008319	CTT	2	6	11564	11569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954152
162	NC_008319	CTT	2	6	11705	11710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954152
163	NC_008319	TGA	2	6	11845	11850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113954152
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241	NC_008319	GGC	2	6	16152	16157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954024
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247	NC_008319	GCA	2	6	16614	16619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954024
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249	NC_008319	ACA	2	6	16737	16742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113954024
250	NC_008319	TGG	2	6	16779	16784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954024
251	NC_008319	CCA	2	6	16785	16790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113954024
252	NC_008319	TGC	2	6	16821	16826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954024
253	NC_008319	GGC	2	6	16861	16866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113954024
254	NC_008319	TGC	2	6	16870	16875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954024
255	NC_008319	TGG	2	6	16950	16955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954024
256	NC_008319	CGT	2	6	16960	16965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113954024
257	NC_008319	AAG	2	6	16980	16985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113954024
258	NC_008319	CTT	2	6	16991	16996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113954024
259	NC_008319	GCA	2	6	17020	17025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113954024
260	NC_008319	TGG	2	6	17079	17084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113954024
261	NC_008319	TCG	2	6	17319	17324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955034
262	NC_008319	CAT	2	6	17356	17361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113955034
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267	NC_008319	TCG	2	6	17560	17565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955034
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270	NC_008319	CGG	2	6	17584	17589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955034
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272	NC_008319	TGG	2	6	17602	17607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955034
273	NC_008319	CGG	2	6	17620	17625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955034
274	NC_008319	TGG	2	6	17626	17631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955034
275	NC_008319	CGG	2	6	17644	17649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955034
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277	NC_008319	CGG	2	6	17668	17673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955034
278	NC_008319	TGG	2	6	17674	17679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955034
279	NC_008319	CGG	2	6	17692	17697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955034
280	NC_008319	TGG	2	6	17698	17703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955034
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282	NC_008319	GGC	2	6	17768	17773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955034
283	NC_008319	ACG	2	6	17781	17786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955034
284	NC_008319	CGC	2	6	17801	17806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113955034
285	NC_008319	GTG	2	6	17808	17813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955034
286	NC_008319	CGA	2	6	17818	17823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955034
287	NC_008319	GCT	2	6	17901	17906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955552
288	NC_008319	TTG	2	6	17958	17963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113955552
289	NC_008319	GGC	2	6	18010	18015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113955552
290	NC_008319	GTC	2	6	18028	18033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955552
291	NC_008319	CTC	2	6	18034	18039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955552
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293	NC_008319	CCA	2	6	18231	18236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955552
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303	NC_008319	CAG	2	6	18755	18760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113955552
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364	NC_008319	CTC	2	6	22693	22698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955252
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372	NC_008319	GTC	2	6	23099	23104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955252
373	NC_008319	CCA	2	6	23136	23141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955252
374	NC_008319	GCT	2	6	23210	23215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113955252
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376	NC_008319	CAC	2	6	23353	23358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113955252
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499	NC_008319	GTG	2	6	32697	32702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113955022
500	NC_008319	CCT	2	6	32719	32724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113955022

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