MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ralstonia eutropha H16 chromosome 2

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008314	TGAGTG	2	12	503	514	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008314	GTATCG	2	12	1138	1149	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_008314	ATGCAG	2	12	17011	17022	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_008314	ACCCGA	3	18	53275	53292	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5	NC_008314	GAACAG	2	12	76042	76053	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_008314	GGCGCG	2	12	78496	78507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008314	GGGCCG	2	12	94091	94102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_008314	CGGCAG	2	12	109098	109109	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008314	CGCACG	2	12	120207	120218	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_008314	GGAACG	2	12	150356	150367	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_008314	GACAAC	2	12	166934	166945	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_008314	ACCTCA	2	12	179920	179931	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008314	CCAGGC	2	12	200332	200343	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_008314	CCGGGC	2	12	236461	236472	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_008314	GCCGAC	2	12	246345	246356	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_008314	CGTCCT	2	12	354156	354167	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008314	GTCGGC	2	12	381349	381360	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008314	TGCGGT	2	12	409713	409724	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_008314	CTCCGG	2	12	425670	425681	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_008314	GGAGGG	2	12	463333	463344	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008314	TTGCGC	2	12	467273	467284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008314	CGGCGC	2	12	508154	508165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_008314	CCAGCG	2	12	509437	509448	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_008314	CGGTCG	2	12	569825	569836	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008314	GATGTC	2	12	580485	580496	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_008314	CCGGCG	2	12	589597	589608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_008314	GAGGGT	2	12	605114	605125	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008314	CTGGCC	2	12	625408	625419	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_008314	GGGAGA	2	12	640376	640387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008314	CCTGTT	2	12	647909	647920	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008314	TCATTA	2	12	678748	678759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_008314	CCGGCC	2	12	727907	727918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008314	GCCGGC	2	12	751842	751853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_008314	TGTGCC	2	12	751854	751865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_008314	GCCGCG	2	12	780589	780600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008314	TGCCGG	2	12	802788	802799	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_008314	AGTCCA	2	12	823975	823986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_008314	ACCTCA	2	12	872650	872661	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_008314	CATTTG	2	12	982404	982415	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_008314	CCAGTC	2	12	1008520	1008531	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008314	GAGCGC	2	12	1021477	1021488	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_008314	TGAAGG	2	12	1026179	1026190	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008314	AGCGGC	2	12	1038671	1038682	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_008314	CTTTGT	2	12	1042622	1042633	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_008314	CAGTTG	2	12	1067161	1067172	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_008314	GCCTGT	2	12	1067196	1067207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008314	GCTGCC	2	12	1081406	1081417	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008314	AAGCGT	2	12	1119766	1119777	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_008314	ATTCCG	2	12	1152523	1152534	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_008314	CGGATC	2	12	1158760	1158771	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_008314	TGCCTG	2	12	1201737	1201748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008314	GGCGCG	2	12	1204425	1204436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008314	TAGGTG	2	12	1210585	1210596	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008314	CGCGGG	2	12	1220467	1220478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008314	TGGCGC	2	12	1229275	1229286	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008314	TCGTTG	2	12	1279110	1279121	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_008314	AGGCTG	2	12	1291732	1291743	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_008314	TGCCAC	2	12	1304874	1304885	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008314	TGCGCC	2	12	1383368	1383379	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008314	GCACGC	2	12	1402923	1402934	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008314	CCCGGC	2	12	1471478	1471489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_008314	TCCGTT	2	12	1472150	1472161	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_008314	CGGAAA	2	12	1491618	1491629	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_008314	TGCCCG	2	12	1515987	1515998	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008314	CTTTCG	2	12	1529654	1529665	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_008314	ACCGAC	2	12	1533445	1533456	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008314	CTTGTC	2	12	1618118	1618129	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_008314	CCCTGC	2	12	1670213	1670224	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_008314	ATGTCG	2	12	1676960	1676971	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_008314	GGGAGA	2	12	1677287	1677298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008314	CCGGCA	2	12	1696315	1696326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
72	NC_008314	GTGCCG	2	12	1734958	1734969	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008314	CGCCGG	2	12	1767240	1767251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_008314	ACCGCC	2	12	1802363	1802374	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_008314	GCAAGA	2	12	1833596	1833607	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_008314	CCGAGT	2	12	1845738	1845749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_008314	CTTTGC	2	12	1845853	1845864	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008314	CCCCCG	2	12	1867940	1867951	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
79	NC_008314	ACAGGC	2	12	1871549	1871560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_008314	CGTGGT	2	12	1886870	1886881	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_008314	ATCATT	2	12	1919937	1919948	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_008314	GCTGGC	2	12	1962844	1962855	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008314	GCGCTG	2	12	1982541	1982552	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_008314	CATGCC	2	12	2033973	2033984	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008314	GCAAGC	2	12	2053694	2053705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_008314	ACGATT	2	12	2105096	2105107	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_008314	CCGGCC	2	12	2183158	2183169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_008314	CACGCG	2	12	2212072	2212083	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008314	CCGGGC	2	12	2248028	2248039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008314	CAGGAC	2	12	2297762	2297773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_008314	CTGTCA	2	12	2339324	2339335	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008314	GGACGT	2	12	2361192	2361203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_008314	CAATTG	2	12	2398458	2398469	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_008314	GAACCG	2	12	2409436	2409447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_008314	CGGCAT	2	12	2422479	2422490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_008314	TGTGCC	2	12	2428686	2428697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_008314	TTGGCC	2	12	2439100	2439111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008314	CCGACC	2	12	2466690	2466701	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008314	GGCGCC	2	12	2530903	2530914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008314	CTCAAG	2	12	2531985	2531996	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008314	GCACCG	2	12	2554625	2554636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008314	CCGGCC	2	12	2611403	2611414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_008314	TTGCCG	2	12	2612923	2612934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008314	GCCACG	2	12	2630037	2630048	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008314	CGCCTG	2	12	2648306	2648317	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008314	CGATGC	2	12	2668444	2668455	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008314	TCTCCC	2	12	2669702	2669713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_008314	GACGCG	2	12	2691215	2691226	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_008314	TGCCGC	2	12	2700967	2700978	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008314	TTTTTG	2	12	2701118	2701129	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008314	CAAGGC	2	12	2704953	2704964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_008314	GCCCGC	2	12	2748930	2748941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_008314	AGCACA	2	12	2796890	2796901	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_008314	TATCGT	2	12	2815789	2815800	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_008314	GGCGCC	2	12	2860644	2860655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008314	CCGGCC	2	12	2868781	2868792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_008314	CCGGGT	2	12	2873578	2873589	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_008314	GCTACC	2	12	2878755	2878766	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008314	TTTTGC	2	12	2903034	2903045	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_008314	CATGCC	2	12	2912358	2912369	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.