MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia eutropha H16 chromosome 2

Total Repeats: 47184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008314	CCA	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116693961
2	NC_008314	CAT	2	6	1416	1421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116693961
3	NC_008314	AAC	2	6	1438	1443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116693961
4	NC_008314	CGA	2	6	1476	1481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693961
5	NC_008314	TGA	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116693961
6	NC_008314	GCA	2	6	1650	1655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693961
7	NC_008314	CCA	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116693961
8	NC_008314	GCC	2	6	1679	1684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693961
9	NC_008314	GAA	2	6	1776	1781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116693961
10	NC_008314	CGG	2	6	1881	1886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693961
11	NC_008314	CAG	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693961
12	NC_008314	CTG	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693961
13	NC_008314	TGG	2	6	2053	2058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116693961
14	NC_008314	GTG	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116693961
15	NC_008314	TTC	2	6	2119	2124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116693961
16	NC_008314	CTT	2	6	2226	2231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116693961
17	NC_008314	TGG	2	6	2348	2353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116693961
18	NC_008314	CAC	2	6	2773	2778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116693962
19	NC_008314	CGT	2	6	2779	2784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693962
20	NC_008314	ATC	2	6	3235	3240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116693963
21	NC_008314	GCG	2	6	3370	3375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693963
22	NC_008314	CGA	2	6	3384	3389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693963
23	NC_008314	GCG	2	6	3431	3436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693963
24	NC_008314	TCG	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693963
25	NC_008314	CGG	2	6	3500	3505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693963
26	NC_008314	ATT	2	6	3553	3558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116693963
27	NC_008314	GGT	2	6	3561	3566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116693963
28	NC_008314	CCG	2	6	3574	3579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693963
29	NC_008314	GCG	2	6	3589	3594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693963
30	NC_008314	GCA	2	6	3615	3620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693963
31	NC_008314	CGA	2	6	3717	3722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693963
32	NC_008314	GAT	2	6	3747	3752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116693963
33	NC_008314	AGG	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116693963
34	NC_008314	ATG	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116693963
35	NC_008314	CGA	2	6	3852	3857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693963
36	NC_008314	GGC	2	6	3932	3937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693964
37	NC_008314	TGC	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693964
38	NC_008314	GCC	2	6	4071	4076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693964
39	NC_008314	GTG	2	6	4158	4163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116693964
40	NC_008314	AGA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116693964
41	NC_008314	AGC	2	6	4372	4377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693964
42	NC_008314	GCT	2	6	4508	4513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693964
43	NC_008314	CGC	2	6	4571	4576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693964
44	NC_008314	GGC	2	6	4634	4639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693964
45	NC_008314	ATC	2	6	4644	4649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116693964
46	NC_008314	ACA	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116693964
47	NC_008314	GCT	2	6	4889	4894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693964
48	NC_008314	CAG	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693965
49	NC_008314	CAG	2	6	5028	5033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693965
50	NC_008314	GCC	2	6	5074	5079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693965
51	NC_008314	CGG	2	6	5103	5108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693965
52	NC_008314	TCT	2	6	5137	5142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116693965
53	NC_008314	TGC	2	6	5197	5202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693965
54	NC_008314	GCT	2	6	5273	5278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693965
55	NC_008314	CGC	2	6	5296	5301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693965
56	NC_008314	CAG	2	6	5346	5351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693965
57	NC_008314	TCG	3	9	5386	5394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693965
58	NC_008314	GCC	2	6	5479	5484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693965
59	NC_008314	GGC	2	6	5565	5570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693965
60	NC_008314	CGG	2	6	5710	5715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693965
61	NC_008314	TGC	2	6	5757	5762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693965
62	NC_008314	AGC	2	6	5767	5772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693965
63	NC_008314	CCT	2	6	5783	5788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116693965
64	NC_008314	TGC	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693965
65	NC_008314	CGG	2	6	5822	5827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693965
66	NC_008314	GAC	2	6	5847	5852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693965
67	NC_008314	CAG	2	6	5994	5999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693965
68	NC_008314	GCA	2	6	6025	6030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693965
69	NC_008314	CCA	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116693965
70	NC_008314	GCG	2	6	6218	6223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693965
71	NC_008314	CCG	2	6	6224	6229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693965
72	NC_008314	CAG	3	9	6303	6311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693965
73	NC_008314	TCG	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693965
74	NC_008314	TCG	2	6	6421	6426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693965
75	NC_008314	CAC	2	6	6441	6446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116693965
76	NC_008314	GCC	2	6	6451	6456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693965
77	NC_008314	CCG	2	6	6482	6487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693965
78	NC_008314	CAT	3	9	6513	6521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116693965
79	NC_008314	CCA	2	6	7037	7042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116693966
80	NC_008314	CCT	2	6	7065	7070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116693966
81	NC_008314	CTG	2	6	7090	7095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693966
82	NC_008314	CTG	2	6	7180	7185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693966
83	NC_008314	CGG	2	6	7212	7217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693966
84	NC_008314	GGA	2	6	7230	7235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116693966
85	NC_008314	GGC	2	6	7284	7289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693966
86	NC_008314	CGG	2	6	7392	7397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693966
87	NC_008314	CCA	2	6	7428	7433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116693966
88	NC_008314	AGC	2	6	7477	7482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693966
89	NC_008314	CTG	2	6	7621	7626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693966
90	NC_008314	GCT	2	6	7659	7664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693966
91	NC_008314	CAA	2	6	7767	7772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116693966
92	NC_008314	CGC	2	6	8228	8233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693967
93	NC_008314	TGC	2	6	8426	8431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693967
94	NC_008314	GCT	2	6	8439	8444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693967
95	NC_008314	GCC	2	6	8494	8499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693967
96	NC_008314	CGG	2	6	8517	8522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693967
97	NC_008314	CCT	2	6	8573	8578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116693967
98	NC_008314	TCG	2	6	8735	8740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693968
99	NC_008314	TGC	2	6	8782	8787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693968
100	NC_008314	GCT	2	6	8859	8864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693968
101	NC_008314	GCC	3	9	8908	8916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693968
102	NC_008314	GCC	2	6	9006	9011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693968
103	NC_008314	CGG	2	6	9067	9072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693969
104	NC_008314	TCG	3	9	9108	9116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693969
105	NC_008314	CCG	2	6	9211	9216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693969
106	NC_008314	TCC	2	6	9302	9307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116693969
107	NC_008314	GCG	2	6	9641	9646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693970
108	NC_008314	GCT	2	6	9696	9701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693970
109	NC_008314	GCC	2	6	9717	9722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693970
110	NC_008314	TCG	2	6	9893	9898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693970
111	NC_008314	CAG	2	6	9912	9917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693970
112	NC_008314	GCC	2	6	9924	9929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693970
113	NC_008314	CTA	2	6	10014	10019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116693970
114	NC_008314	CGC	2	6	10059	10064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693970
115	NC_008314	CAT	2	6	10065	10070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116693970
116	NC_008314	CCG	2	6	10131	10136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693970
117	NC_008314	GCT	2	6	10164	10169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693970
118	NC_008314	TGC	2	6	10187	10192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693970
119	NC_008314	CAC	2	6	10297	10302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116693970
120	NC_008314	TGC	2	6	10316	10321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693970
121	NC_008314	GCT	2	6	10344	10349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693970
122	NC_008314	AGG	2	6	10385	10390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116693970
123	NC_008314	GGC	2	6	10401	10406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693970
124	NC_008314	TCA	2	6	10469	10474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116693970
125	NC_008314	GCA	2	6	11165	11170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693971
126	NC_008314	ACC	2	6	11247	11252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116693971
127	NC_008314	GGT	2	6	11255	11260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116693971
128	NC_008314	GCT	2	6	11264	11269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693971
129	NC_008314	GCT	2	6	11273	11278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693971
130	NC_008314	GGA	2	6	11279	11284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116693971
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252	NC_008314	TGG	2	6	19494	19499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116693976
253	NC_008314	CGA	2	6	19541	19546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693976
254	NC_008314	GCA	2	6	19591	19596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693976
255	NC_008314	ATG	2	6	19702	19707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116693976
256	NC_008314	TGG	2	6	19806	19811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116693977
257	NC_008314	TGC	2	6	19957	19962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693977
258	NC_008314	GCG	2	6	19965	19970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693977
259	NC_008314	GTG	2	6	20024	20029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116693977
260	NC_008314	CGT	2	6	20092	20097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693977
261	NC_008314	CAG	2	6	20105	20110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693977
262	NC_008314	CAG	2	6	20142	20147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	116693977
263	NC_008314	GGT	2	6	20179	20184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116693977
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265	NC_008314	GCG	2	6	20230	20235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693977
266	NC_008314	TCC	2	6	20328	20333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116693977
267	NC_008314	GTA	2	6	20360	20365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116693977
268	NC_008314	GGT	2	6	20408	20413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116693977
269	NC_008314	TAG	2	6	20460	20465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116693977
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273	NC_008314	CGG	2	6	21159	21164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693978
274	NC_008314	GCC	2	6	21182	21187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	116693978
275	NC_008314	GCG	2	6	21249	21254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693978
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277	NC_008314	TGG	2	6	21288	21293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116693978
278	NC_008314	GGC	2	6	21325	21330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693978
279	NC_008314	CCT	2	6	21462	21467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	116693978
280	NC_008314	TTC	2	6	21551	21556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116693978
281	NC_008314	CTT	2	6	21619	21624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116693978
282	NC_008314	TGC	2	6	21693	21698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116693978
283	NC_008314	CTT	2	6	21765	21770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116693978
284	NC_008314	TTC	2	6	21820	21825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116693978
285	NC_008314	GGA	2	6	21829	21834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116693978
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500	NC_008314	CGG	2	6	38448	38453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116693991

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