MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ralstonia eutropha H16 chromosome 1

Total Repeats: 3800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008313	GGCCA	2	10	1058	1067	20 %	0 %	40 %	40 %	113866032
2	NC_008313	ACCAC	2	10	2349	2358	40 %	0 %	0 %	60 %	113866032
3	NC_008313	CGGGA	2	10	2629	2638	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4	NC_008313	CCCGC	2	10	2697	2706	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5	NC_008313	GACCA	2	10	3953	3962	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_008313	CCGGC	2	10	4126	4135	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_008313	AGCGC	2	10	4463	4472	20 %	0 %	40 %	40 %	113866034
8	NC_008313	ATTGG	2	10	6780	6789	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008313	GTTGG	2	10	10062	10071	0 %	40 %	60 %	0 %	113866036
10	NC_008313	CGGGT	2	10	11391	11400	0 %	20 %	60 %	20 %	113866037
11	NC_008313	TGAGG	2	10	15771	15780	20 %	20 %	60 %	0 %	113866039
12	NC_008313	GACAA	2	10	16147	16156	60 %	0 %	20 %	20 %	113866039
13	NC_008313	ATCAA	2	10	20585	20594	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_008313	GCCGG	2	10	25971	25980	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_008313	CTTCA	2	10	26380	26389	20 %	40 %	0 %	40 %	113866048
16	NC_008313	GCTTG	2	10	27377	27386	0 %	40 %	40 %	20 %	113866049
17	NC_008313	TGCCT	2	10	27687	27696	0 %	40 %	20 %	40 %	113866049
18	NC_008313	GCCAT	2	10	29403	29412	20 %	20 %	20 %	40 %	113866049
19	NC_008313	GCTTG	2	10	30083	30092	0 %	40 %	40 %	20 %	113866049
20	NC_008313	GCACG	2	10	30692	30701	20 %	0 %	40 %	40 %	113866049
21	NC_008313	TTTGC	2	10	31284	31293	0 %	60 %	20 %	20 %	113866049
22	NC_008313	GAGCG	2	10	34417	34426	20 %	0 %	60 %	20 %	113866052
23	NC_008313	CCTCC	2	10	35171	35180	0 %	20 %	0 %	80 %	113866053
24	NC_008313	GCGCC	2	10	38202	38211	0 %	0 %	40 %	60 %	113866056
25	NC_008313	GTCAT	2	10	38434	38443	20 %	40 %	20 %	20 %	113866056
26	NC_008313	GGGCG	2	10	39369	39378	0 %	0 %	80 %	20 %	113866056
27	NC_008313	CGCAG	2	10	39764	39773	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_008313	GCCGG	2	10	39859	39868	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008313	GCAGC	2	10	40538	40547	20 %	0 %	40 %	40 %	113866057
30	NC_008313	AAGCC	2	10	42358	42367	40 %	0 %	20 %	40 %	113866059
31	NC_008313	GCGCC	2	10	43792	43801	0 %	0 %	40 %	60 %	113866060
32	NC_008313	CTGGT	2	10	44491	44500	0 %	40 %	40 %	20 %	113866060
33	NC_008313	TTTTA	2	10	45280	45289	20 %	80 %	0 %	0 %	113866061
34	NC_008313	CGCAG	2	10	46283	46292	20 %	0 %	40 %	40 %	113866061
35	NC_008313	CAGGG	2	10	47001	47010	20 %	0 %	60 %	20 %	113866062
36	NC_008313	CCCGA	2	10	47627	47636	20 %	0 %	20 %	60 %	113866062
37	NC_008313	GCGGT	2	10	48294	48303	0 %	20 %	60 %	20 %	113866063
38	NC_008313	CTCCG	2	10	50450	50459	0 %	20 %	20 %	60 %	113866065
39	NC_008313	CGGCA	2	10	50953	50962	20 %	0 %	40 %	40 %	113866066
40	NC_008313	GTGGG	2	10	51338	51347	0 %	20 %	80 %	0 %	113866066
41	NC_008313	GCCGG	2	10	52436	52445	0 %	0 %	60 %	40 %	113866067
42	NC_008313	GCAGA	2	10	52843	52852	40 %	0 %	40 %	20 %	113866068
43	NC_008313	CCAGG	2	10	54197	54206	20 %	0 %	40 %	40 %	113866069
44	NC_008313	GCGCC	2	10	54438	54447	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_008313	CTGCT	2	10	54928	54937	0 %	40 %	20 %	40 %	113866070
46	NC_008313	TGGTC	2	10	55198	55207	0 %	40 %	40 %	20 %	113866070
47	NC_008313	CCGCC	2	10	55486	55495	0 %	0 %	20 %	80 %	113866071
48	NC_008313	GCCGC	2	10	58261	58270	0 %	0 %	40 %	60 %	113866074
49	NC_008313	CAGCC	2	10	58475	58484	20 %	0 %	20 %	60 %	113866074
50	NC_008313	CTCGC	2	10	59092	59101	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_008313	TGGCC	2	10	61176	61185	0 %	20 %	40 %	40 %	113866077
52	NC_008313	CGCGC	2	10	61243	61252	0 %	0 %	40 %	60 %	113866077
53	NC_008313	GGACC	2	10	68108	68117	20 %	0 %	40 %	40 %	113866086
54	NC_008313	CGGCG	2	10	68630	68639	0 %	0 %	60 %	40 %	113866087
55	NC_008313	GCGCT	2	10	68713	68722	0 %	20 %	40 %	40 %	113866087
56	NC_008313	TCCTT	2	10	70726	70735	0 %	60 %	0 %	40 %	113866088
57	NC_008313	GGGCA	2	10	70818	70827	20 %	0 %	60 %	20 %	113866088
58	NC_008313	GTGAA	2	10	71317	71326	40 %	20 %	40 %	0 %	113866088
59	NC_008313	GAGCA	2	10	71436	71445	40 %	0 %	40 %	20 %	113866088
60	NC_008313	GGTGC	2	10	71853	71862	0 %	20 %	60 %	20 %	113866088
61	NC_008313	CTGGA	2	10	72936	72945	20 %	20 %	40 %	20 %	113866089
62	NC_008313	TGCGG	2	10	76012	76021	0 %	20 %	60 %	20 %	113866092
63	NC_008313	GCATT	2	10	76446	76455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_008313	TCGTG	2	10	78008	78017	0 %	40 %	40 %	20 %	113866094
65	NC_008313	GCGCC	2	10	79070	79079	0 %	0 %	40 %	60 %	113866095
66	NC_008313	CGCGG	2	10	79209	79218	0 %	0 %	60 %	40 %	113866095
67	NC_008313	GGGCG	2	10	79550	79559	0 %	0 %	80 %	20 %	113866095
68	NC_008313	TGCGC	2	10	79637	79646	0 %	20 %	40 %	40 %	113866095
69	NC_008313	GCAAA	2	10	80383	80392	60 %	0 %	20 %	20 %	113866096
70	NC_008313	GCCGC	2	10	80607	80616	0 %	0 %	40 %	60 %	113866097
71	NC_008313	CCCTG	2	10	82772	82781	0 %	20 %	20 %	60 %	113866099
72	NC_008313	GCGCG	2	10	83700	83709	0 %	0 %	60 %	40 %	113866100
73	NC_008313	GCTCG	2	10	86957	86966	0 %	20 %	40 %	40 %	113866103
74	NC_008313	AGGGC	2	10	87464	87473	20 %	0 %	60 %	20 %	113866103
75	NC_008313	CGCAC	2	10	88067	88076	20 %	0 %	20 %	60 %	113866104
76	NC_008313	TGCGA	2	10	88283	88292	20 %	20 %	40 %	20 %	113866104
77	NC_008313	GCCCG	2	10	91473	91482	0 %	0 %	40 %	60 %	113866107
78	NC_008313	TGGCT	2	10	92549	92558	0 %	40 %	40 %	20 %	113866108
79	NC_008313	GGCCA	2	10	93714	93723	20 %	0 %	40 %	40 %	113866110
80	NC_008313	GGCGC	2	10	94583	94592	0 %	0 %	60 %	40 %	113866111
81	NC_008313	GGGTC	2	10	94909	94918	0 %	20 %	60 %	20 %	113866111
82	NC_008313	CGCGG	2	10	96377	96386	0 %	0 %	60 %	40 %	113866113
83	NC_008313	CTGCG	2	10	96391	96400	0 %	20 %	40 %	40 %	113866113
84	NC_008313	AAGGA	2	10	98377	98386	60 %	0 %	40 %	0 %	113866115
85	NC_008313	CGCAG	2	10	100016	100025	20 %	0 %	40 %	40 %	113866117
86	NC_008313	CTGAA	2	10	101212	101221	40 %	20 %	20 %	20 %	113866118
87	NC_008313	CCGCA	2	10	101549	101558	20 %	0 %	20 %	60 %	113866119
88	NC_008313	GACCG	2	10	102258	102267	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_008313	CTGCT	2	10	103652	103661	0 %	40 %	20 %	40 %	113866121
90	NC_008313	GCCTG	2	10	103959	103968	0 %	20 %	40 %	40 %	113866121
91	NC_008313	GCCGG	2	10	104203	104212	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_008313	CACCG	2	10	105370	105379	20 %	0 %	20 %	60 %	113866123
93	NC_008313	GCCCG	2	10	105478	105487	0 %	0 %	40 %	60 %	113866123
94	NC_008313	GCCGC	2	10	107428	107437	0 %	0 %	40 %	60 %	113866126
95	NC_008313	GCCGC	2	10	113341	113350	0 %	0 %	40 %	60 %	113866131
96	NC_008313	CGGTG	2	10	113393	113402	0 %	20 %	60 %	20 %	113866131
97	NC_008313	CGCGC	2	10	113808	113817	0 %	0 %	40 %	60 %	113866132
98	NC_008313	CCACG	2	10	115437	115446	20 %	0 %	20 %	60 %	113866132
99	NC_008313	CCGGC	2	10	116163	116172	0 %	0 %	40 %	60 %	113866133
100	NC_008313	CGGCG	2	10	117475	117484	0 %	0 %	60 %	40 %	113866134
101	NC_008313	GCGCC	2	10	119581	119590	0 %	0 %	40 %	60 %	113866136
102	NC_008313	GCTGC	2	10	119745	119754	0 %	20 %	40 %	40 %	113866136
103	NC_008313	GGCCG	2	10	120490	120499	0 %	0 %	60 %	40 %	113866138
104	NC_008313	GCCCG	2	10	120955	120964	0 %	0 %	40 %	60 %	113866138
105	NC_008313	CCAGC	2	10	123129	123138	20 %	0 %	20 %	60 %	113866140
106	NC_008313	CAGCG	2	10	123181	123190	20 %	0 %	40 %	40 %	113866140
107	NC_008313	CGGCG	2	10	123203	123212	0 %	0 %	60 %	40 %	113866140
108	NC_008313	CGCGG	2	10	123925	123934	0 %	0 %	60 %	40 %	113866141
109	NC_008313	GCACG	2	10	124423	124432	20 %	0 %	40 %	40 %	113866142
110	NC_008313	GCGCG	2	10	124902	124911	0 %	0 %	60 %	40 %	113866142
111	NC_008313	CCGGG	2	10	125870	125879	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_008313	CGGCG	2	10	125951	125960	0 %	0 %	60 %	40 %	113866143
113	NC_008313	CCCGG	2	10	126627	126636	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
114	NC_008313	GGCCG	2	10	126709	126718	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_008313	CGTGC	2	10	127116	127125	0 %	20 %	40 %	40 %	113866144
116	NC_008313	GCGCC	2	10	127143	127152	0 %	0 %	40 %	60 %	113866144
117	NC_008313	TCGGC	2	10	127442	127451	0 %	20 %	40 %	40 %	113866144
118	NC_008313	GGGCC	2	10	127894	127903	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_008313	GCCGG	2	10	131989	131998	0 %	0 %	60 %	40 %	113866148
120	NC_008313	TGCAG	2	10	133374	133383	20 %	20 %	40 %	20 %	113866149
121	NC_008313	GCCGC	2	10	135734	135743	0 %	0 %	40 %	60 %	113866151
122	NC_008313	CCATG	2	10	135834	135843	20 %	20 %	20 %	40 %	113866151
123	NC_008313	CTGGT	2	10	136515	136524	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_008313	GAAGC	2	10	137347	137356	40 %	0 %	40 %	20 %	113866153
125	NC_008313	GACCC	2	10	137486	137495	20 %	0 %	20 %	60 %	113866154
126	NC_008313	GGCGC	2	10	139984	139993	0 %	0 %	60 %	40 %	113866156
127	NC_008313	AGCGC	2	10	139998	140007	20 %	0 %	40 %	40 %	113866156
128	NC_008313	GCTGG	2	10	142465	142474	0 %	20 %	60 %	20 %	113866159
129	NC_008313	CGGCG	2	10	143065	143074	0 %	0 %	60 %	40 %	113866160
130	NC_008313	CGGCC	2	10	143248	143257	0 %	0 %	40 %	60 %	113866160
131	NC_008313	CCAGC	2	10	143470	143479	20 %	0 %	20 %	60 %	113866160
132	NC_008313	CATGC	2	10	144999	145008	20 %	20 %	20 %	40 %	113866162
133	NC_008313	GGCCA	2	10	145693	145702	20 %	0 %	40 %	40 %	113866163
134	NC_008313	TCGAC	2	10	146298	146307	20 %	20 %	20 %	40 %	113866163
135	NC_008313	CGGGT	2	10	147094	147103	0 %	20 %	60 %	20 %	113866164
136	NC_008313	GGCGC	2	10	147340	147349	0 %	0 %	60 %	40 %	113866164
137	NC_008313	CCCGC	2	10	148520	148529	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
138	NC_008313	GCCGG	2	10	149758	149767	0 %	0 %	60 %	40 %	113866167
139	NC_008313	CGGGC	2	10	150237	150246	0 %	0 %	60 %	40 %	113866167
140	NC_008313	GCCGT	2	10	150301	150310	0 %	20 %	40 %	40 %	113866167
141	NC_008313	GCGCC	2	10	150722	150731	0 %	0 %	40 %	60 %	113866168
142	NC_008313	CGGGA	2	10	152122	152131	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
143	NC_008313	GAAAA	2	10	152309	152318	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008313	GCCCA	2	10	154320	154329	20 %	0 %	20 %	60 %	113866171
145	NC_008313	TGCCG	2	10	154540	154549	0 %	20 %	40 %	40 %	113866171
146	NC_008313	GCTGC	2	10	154735	154744	0 %	20 %	40 %	40 %	113866172
147	NC_008313	GCGCC	2	10	158020	158029	0 %	0 %	40 %	60 %	113866175
148	NC_008313	GGCGA	2	10	158112	158121	20 %	0 %	60 %	20 %	113866175
149	NC_008313	GGGCG	2	10	158581	158590	0 %	0 %	80 %	20 %	113866175
150	NC_008313	GGCGC	2	10	159388	159397	0 %	0 %	60 %	40 %	113866176
151	NC_008313	GCCCG	2	10	159632	159641	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
152	NC_008313	GCCAC	2	10	160736	160745	20 %	0 %	20 %	60 %	113866178
153	NC_008313	CATGG	2	10	161174	161183	20 %	20 %	40 %	20 %	113866178
154	NC_008313	GCCGC	2	10	162770	162779	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
155	NC_008313	AGGCC	2	10	164301	164310	20 %	0 %	40 %	40 %	113866182
156	NC_008313	CCTGG	2	10	164781	164790	0 %	20 %	40 %	40 %	113866182
157	NC_008313	CTGAC	2	10	168197	168206	20 %	20 %	20 %	40 %	113866184
158	NC_008313	CAGGC	2	10	168993	169002	20 %	0 %	40 %	40 %	113866186
159	NC_008313	CGCGG	3	15	171730	171744	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
160	NC_008313	ACCAC	2	10	172826	172835	40 %	0 %	0 %	60 %	113866190
161	NC_008313	GCGCC	2	10	183842	183851	0 %	0 %	40 %	60 %	113866201
162	NC_008313	CTGGA	2	10	184197	184206	20 %	20 %	40 %	20 %	113866201
163	NC_008313	AGCAC	2	10	185027	185036	40 %	0 %	20 %	40 %	113866202
164	NC_008313	GGACT	2	10	185491	185500	20 %	20 %	40 %	20 %	113866203
165	NC_008313	CATCC	2	10	186637	186646	20 %	20 %	0 %	60 %	113866204
166	NC_008313	CGATT	2	10	187212	187221	20 %	40 %	20 %	20 %	113866205
167	NC_008313	GCGCG	2	10	187388	187397	0 %	0 %	60 %	40 %	113866205
168	NC_008313	GTGCC	2	10	187907	187916	0 %	20 %	40 %	40 %	113866206
169	NC_008313	GCAGA	2	10	189423	189432	40 %	0 %	40 %	20 %	113866208
170	NC_008313	CCTGC	2	10	189437	189446	0 %	20 %	20 %	60 %	113866208
171	NC_008313	GCTGT	2	10	190112	190121	0 %	40 %	40 %	20 %	113866208
172	NC_008313	CAGCC	2	10	190706	190715	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
173	NC_008313	CTTGC	2	10	190728	190737	0 %	40 %	20 %	40 %	113866209
174	NC_008313	GCCGG	2	10	190928	190937	0 %	0 %	60 %	40 %	113866209
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176	NC_008313	GCCGC	2	10	195052	195061	0 %	0 %	40 %	60 %	113866212
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178	NC_008313	ACCGC	2	10	195541	195550	20 %	0 %	20 %	60 %	113866213
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186	NC_008313	CGGTC	2	10	207085	207094	0 %	20 %	40 %	40 %	113866224
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190	NC_008313	GCCGG	2	10	211742	211751	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
191	NC_008313	TCGGC	2	10	212285	212294	0 %	20 %	40 %	40 %	113866229
192	NC_008313	GCGCC	2	10	212363	212372	0 %	0 %	40 %	60 %	113866229
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195	NC_008313	CCGAC	2	10	212636	212645	20 %	0 %	20 %	60 %	113866229
196	NC_008313	GGTCA	2	10	213075	213084	20 %	20 %	40 %	20 %	113866230
197	NC_008313	ACTCA	2	10	215155	215164	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
198	NC_008313	CCGTG	2	10	215595	215604	0 %	20 %	40 %	40 %	113866233
199	NC_008313	ATCGA	2	10	215743	215752	40 %	20 %	20 %	20 %	113866233
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201	NC_008313	CGCGT	2	10	216026	216035	0 %	20 %	40 %	40 %	113866233
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206	NC_008313	GCATC	2	10	219372	219381	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
207	NC_008313	CGGCG	2	10	219472	219481	0 %	0 %	60 %	40 %	113866237
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210	NC_008313	GGCGC	2	10	223145	223154	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
211	NC_008313	GCGCC	2	10	223214	223223	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
212	NC_008313	CGGGG	2	10	225580	225589	0 %	0 %	80 %	20 %	113866244
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217	NC_008313	CGGCA	2	10	230664	230673	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
218	NC_008313	GGATT	2	10	232833	232842	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
219	NC_008313	GGGAA	2	10	232902	232911	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
220	NC_008313	GACGT	2	10	234734	234743	20 %	20 %	40 %	20 %	113866255
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234	NC_008313	CGCTG	2	10	251421	251430	0 %	20 %	40 %	40 %	113866267
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240	NC_008313	CGCGT	2	10	260690	260699	0 %	20 %	40 %	40 %	113866280
241	NC_008313	CAGCG	2	10	261617	261626	20 %	0 %	40 %	40 %	113866281
242	NC_008313	CTGGA	2	10	263571	263580	20 %	20 %	40 %	20 %	113866282
243	NC_008313	CTCGA	2	10	263937	263946	20 %	20 %	20 %	40 %	113866282
244	NC_008313	GCGCC	2	10	264229	264238	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
245	NC_008313	GAAGC	2	10	265602	265611	40 %	0 %	40 %	20 %	113866284
246	NC_008313	TGCGC	2	10	266024	266033	0 %	20 %	40 %	40 %	113866284
247	NC_008313	TCGAG	2	10	266098	266107	20 %	20 %	40 %	20 %	113866284
248	NC_008313	AGCGC	2	10	266267	266276	20 %	0 %	40 %	40 %	113866284
249	NC_008313	GCCGC	2	10	267912	267921	0 %	0 %	40 %	60 %	113866288
250	NC_008313	GCATC	2	10	268150	268159	20 %	20 %	20 %	40 %	113866288
251	NC_008313	GCGCC	2	10	269312	269321	0 %	0 %	40 %	60 %	113866289
252	NC_008313	CGCGC	2	10	270104	270113	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
253	NC_008313	ACCGC	2	10	270531	270540	20 %	0 %	20 %	60 %	113866291
254	NC_008313	CCCGA	2	10	272666	272675	20 %	0 %	20 %	60 %	113866293
255	NC_008313	GCACC	2	10	273445	273454	20 %	0 %	20 %	60 %	113866293
256	NC_008313	AGCGC	2	10	276473	276482	20 %	0 %	40 %	40 %	113866296
257	NC_008313	CGCAG	2	10	277985	277994	20 %	0 %	40 %	40 %	113866297
258	NC_008313	GTCAT	2	10	279905	279914	20 %	40 %	20 %	20 %	113866299
259	NC_008313	GCCCA	2	10	280356	280365	20 %	0 %	20 %	60 %	113866300
260	NC_008313	AGGGC	2	10	282708	282717	20 %	0 %	60 %	20 %	113866301
261	NC_008313	GCCGC	2	10	284196	284205	0 %	0 %	40 %	60 %	113866302
262	NC_008313	CGCAT	2	10	284500	284509	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
263	NC_008313	GCGCC	2	10	284656	284665	0 %	0 %	40 %	60 %	113866303
264	NC_008313	CACAA	2	10	287516	287525	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
265	NC_008313	GGCGC	2	10	287905	287914	0 %	0 %	60 %	40 %	113866306
266	NC_008313	CGGTG	2	10	288153	288162	0 %	20 %	60 %	20 %	113866306
267	NC_008313	GCGCT	2	10	288457	288466	0 %	20 %	40 %	40 %	113866306
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