MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Trichodesmium erythraeum IMS101 chromosome

Total Repeats: 3063

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008312	TGATT	2	10	611	620	20 %	60 %	20 %	0 %	113473943
2	NC_008312	ACCAC	2	10	1279	1288	40 %	0 %	0 %	60 %	113473943
3	NC_008312	TGAGA	2	10	11843	11852	40 %	20 %	40 %	0 %	113473947
4	NC_008312	TTTAT	2	10	13208	13217	20 %	80 %	0 %	0 %	113473948
5	NC_008312	TCTGT	2	10	17975	17984	0 %	60 %	20 %	20 %	113473949
6	NC_008312	CAATT	2	10	18583	18592	40 %	40 %	0 %	20 %	113473949
7	NC_008312	CAAAA	2	10	19472	19481	80 %	0 %	0 %	20 %	113473949
8	NC_008312	ATTTT	2	10	19810	19819	20 %	80 %	0 %	0 %	113473949
9	NC_008312	CTTAA	2	10	20837	20846	40 %	40 %	0 %	20 %	113473949
10	NC_008312	CAAGT	2	10	22893	22902	40 %	20 %	20 %	20 %	113473951
11	NC_008312	CAATC	2	10	27015	27024	40 %	20 %	0 %	40 %	113473954
12	NC_008312	ACCAA	2	10	29053	29062	60 %	0 %	0 %	40 %	113473955
13	NC_008312	TATGG	2	10	30382	30391	20 %	40 %	40 %	0 %	113473955
14	NC_008312	TTTCT	2	10	32027	32036	0 %	80 %	0 %	20 %	113473956
15	NC_008312	ATTTT	2	10	34057	34066	20 %	80 %	0 %	0 %	113473957
16	NC_008312	TTTCA	2	10	37039	37048	20 %	60 %	0 %	20 %	113473958
17	NC_008312	AAATT	2	10	37722	37731	60 %	40 %	0 %	0 %	113473958
18	NC_008312	TTAAA	2	10	41403	41412	60 %	40 %	0 %	0 %	113473960
19	NC_008312	AACTT	2	10	41515	41524	40 %	40 %	0 %	20 %	113473961
20	NC_008312	AAAAT	2	10	46395	46404	80 %	20 %	0 %	0 %	113473962
21	NC_008312	AAGGT	2	10	46410	46419	40 %	20 %	40 %	0 %	113473962
22	NC_008312	AATAA	2	10	47377	47386	80 %	20 %	0 %	0 %	113473962
23	NC_008312	TAAAC	2	10	56016	56025	60 %	20 %	0 %	20 %	113473965
24	NC_008312	TGTGA	2	10	56686	56695	20 %	40 %	40 %	0 %	113473966
25	NC_008312	TGAGA	2	10	59834	59843	40 %	20 %	40 %	0 %	113473969
26	NC_008312	CCCAA	2	10	69517	69526	40 %	0 %	0 %	60 %	113473973
27	NC_008312	TGAGA	2	10	75232	75241	40 %	20 %	40 %	0 %	113473979
28	NC_008312	ATTAG	2	10	77655	77664	40 %	40 %	20 %	0 %	113473981
29	NC_008312	ATTTT	2	10	77998	78007	20 %	80 %	0 %	0 %	113473981
30	NC_008312	ATGAT	2	10	79853	79862	40 %	40 %	20 %	0 %	113473982
31	NC_008312	CTTGG	2	10	85407	85416	0 %	40 %	40 %	20 %	113473985
32	NC_008312	ACTTT	2	10	85868	85877	20 %	60 %	0 %	20 %	113473985
33	NC_008312	AATTA	2	10	90616	90625	60 %	40 %	0 %	0 %	113473986
34	NC_008312	TTGTG	2	10	95822	95831	0 %	60 %	40 %	0 %	113473990
35	NC_008312	CCGGT	2	10	96079	96088	0 %	20 %	40 %	40 %	113473990
36	NC_008312	TATTC	2	10	99330	99339	20 %	60 %	0 %	20 %	113473992
37	NC_008312	AAAAC	2	10	100556	100565	80 %	0 %	0 %	20 %	113473993
38	NC_008312	TATTT	2	10	111522	111531	20 %	80 %	0 %	0 %	113474001
39	NC_008312	ATGCT	2	10	120361	120370	20 %	40 %	20 %	20 %	113474005
40	NC_008312	TGTTA	2	10	130588	130597	20 %	60 %	20 %	0 %	113474011
41	NC_008312	AAAGG	2	10	136153	136162	60 %	0 %	40 %	0 %	113474014
42	NC_008312	TCTTA	2	10	137141	137150	20 %	60 %	0 %	20 %	113474014
43	NC_008312	CAAAT	2	10	140167	140176	60 %	20 %	0 %	20 %	113474016
44	NC_008312	AAATA	2	10	155616	155625	80 %	20 %	0 %	0 %	113474024
45	NC_008312	ATAAA	2	10	156770	156779	80 %	20 %	0 %	0 %	113474024
46	NC_008312	GAATT	2	10	156947	156956	40 %	40 %	20 %	0 %	113474024
47	NC_008312	CCAAA	2	10	157277	157286	60 %	0 %	0 %	40 %	113474024
48	NC_008312	AATTC	2	10	160900	160909	40 %	40 %	0 %	20 %	113474026
49	NC_008312	AATTA	2	10	166024	166033	60 %	40 %	0 %	0 %	113474029
50	NC_008312	TGTTA	2	10	168377	168386	20 %	60 %	20 %	0 %	113474031
51	NC_008312	TTCTC	2	10	169191	169200	0 %	60 %	0 %	40 %	113474031
52	NC_008312	CCCAA	2	10	171084	171093	40 %	0 %	0 %	60 %	113474031
53	NC_008312	CTAAC	2	10	171418	171427	40 %	20 %	0 %	40 %	113474031
54	NC_008312	CTAAC	2	10	171520	171529	40 %	20 %	0 %	40 %	113474031
55	NC_008312	ATTCA	2	10	171572	171581	40 %	40 %	0 %	20 %	113474031
56	NC_008312	ATTTT	2	10	175623	175632	20 %	80 %	0 %	0 %	113474031
57	NC_008312	AAACT	2	10	180456	180465	60 %	20 %	0 %	20 %	113474033
58	NC_008312	TGCAT	2	10	180535	180544	20 %	40 %	20 %	20 %	113474033
59	NC_008312	TAATT	2	10	180981	180990	40 %	60 %	0 %	0 %	113474033
60	NC_008312	CAAAT	2	10	182971	182980	60 %	20 %	0 %	20 %	113474035
61	NC_008312	ATGCG	2	10	192500	192509	20 %	20 %	40 %	20 %	113474039
62	NC_008312	AAGAT	2	10	197325	197334	60 %	20 %	20 %	0 %	113474041
63	NC_008312	ACTTT	2	10	197451	197460	20 %	60 %	0 %	20 %	113474042
64	NC_008312	ATAAA	2	10	200570	200579	80 %	20 %	0 %	0 %	113474045
65	NC_008312	TAGCA	2	10	200763	200772	40 %	20 %	20 %	20 %	113474045
66	NC_008312	TGATA	2	10	205904	205913	40 %	40 %	20 %	0 %	113474047
67	NC_008312	GTACA	2	10	208593	208602	40 %	20 %	20 %	20 %	113474049
68	NC_008312	GAAGT	2	10	209813	209822	40 %	20 %	40 %	0 %	113474050
69	NC_008312	AAATG	2	10	209991	210000	60 %	20 %	20 %	0 %	113474050
70	NC_008312	AAAGT	2	10	211417	211426	60 %	20 %	20 %	0 %	113474051
71	NC_008312	AATCA	2	10	213334	213343	60 %	20 %	0 %	20 %	113474052
72	NC_008312	AACTG	2	10	215307	215316	40 %	20 %	20 %	20 %	113474053
73	NC_008312	TTTTA	2	10	215907	215916	20 %	80 %	0 %	0 %	113474054
74	NC_008312	TTGGA	2	10	216128	216137	20 %	40 %	40 %	0 %	113474054
75	NC_008312	TTTTC	2	10	216854	216863	0 %	80 %	0 %	20 %	113474054
76	NC_008312	ATCAA	2	10	220482	220491	60 %	20 %	0 %	20 %	113474057
77	NC_008312	AAAAC	2	10	223616	223625	80 %	0 %	0 %	20 %	113474059
78	NC_008312	TACAA	2	10	223680	223689	60 %	20 %	0 %	20 %	113474059
79	NC_008312	AAAAT	2	10	224194	224203	80 %	20 %	0 %	0 %	113474059
80	NC_008312	AAAGG	2	10	225417	225426	60 %	0 %	40 %	0 %	113474060
81	NC_008312	TTAAT	2	10	230297	230306	40 %	60 %	0 %	0 %	113474062
82	NC_008312	ACCTA	2	10	232130	232139	40 %	20 %	0 %	40 %	113474062
83	NC_008312	ACAAG	2	10	232155	232164	60 %	0 %	20 %	20 %	113474062
84	NC_008312	AATAG	2	10	232587	232596	60 %	20 %	20 %	0 %	113474062
85	NC_008312	AACGA	2	10	241227	241236	60 %	0 %	20 %	20 %	113474065
86	NC_008312	GATAC	2	10	241546	241555	40 %	20 %	20 %	20 %	113474066
87	NC_008312	ATATT	2	10	242003	242012	40 %	60 %	0 %	0 %	113474066
88	NC_008312	ATCTA	2	10	244326	244335	40 %	40 %	0 %	20 %	113474068
89	NC_008312	AAATT	2	10	246930	246939	60 %	40 %	0 %	0 %	113474069
90	NC_008312	TAATT	2	10	247036	247045	40 %	60 %	0 %	0 %	113474069
91	NC_008312	GGAAG	2	10	248986	248995	40 %	0 %	60 %	0 %	113474071
92	NC_008312	ACCAA	2	10	252239	252248	60 %	0 %	0 %	40 %	113474074
93	NC_008312	AAAGG	2	10	260894	260903	60 %	0 %	40 %	0 %	113474078
94	NC_008312	CTTCT	2	10	261379	261388	0 %	60 %	0 %	40 %	113474078
95	NC_008312	TTGTG	2	10	262805	262814	0 %	60 %	40 %	0 %	113474080
96	NC_008312	AAGCT	2	10	264073	264082	40 %	20 %	20 %	20 %	113474081
97	NC_008312	CTGTA	2	10	264454	264463	20 %	40 %	20 %	20 %	113474082
98	NC_008312	GGCGA	2	10	265010	265019	20 %	0 %	60 %	20 %	113474082
99	NC_008312	TGCCG	2	10	265668	265677	0 %	20 %	40 %	40 %	113474082
100	NC_008312	TGAAA	2	10	269354	269363	60 %	20 %	20 %	0 %	113474084
101	NC_008312	CTATC	2	10	270290	270299	20 %	40 %	0 %	40 %	113474085
102	NC_008312	CTATC	2	10	271807	271816	20 %	40 %	0 %	40 %	113474086
103	NC_008312	ACCAA	2	10	273367	273376	60 %	0 %	0 %	40 %	113474087
104	NC_008312	CTAAA	2	10	275714	275723	60 %	20 %	0 %	20 %	113474088
105	NC_008312	ACCTG	2	10	276325	276334	20 %	20 %	20 %	40 %	113474088
106	NC_008312	ATTAA	2	10	278182	278191	60 %	40 %	0 %	0 %	113474089
107	NC_008312	GGAAG	2	10	281903	281912	40 %	0 %	60 %	0 %	113474091
108	NC_008312	TTGGA	2	10	282349	282358	20 %	40 %	40 %	0 %	113474091
109	NC_008312	ATTCT	2	10	282617	282626	20 %	60 %	0 %	20 %	113474091
110	NC_008312	TGCAA	2	10	282753	282762	40 %	20 %	20 %	20 %	113474091
111	NC_008312	TAAAT	2	10	286775	286784	60 %	40 %	0 %	0 %	113474093
112	NC_008312	TTTGG	2	10	289187	289196	0 %	60 %	40 %	0 %	113474094
113	NC_008312	GAGGT	2	10	290897	290906	20 %	20 %	60 %	0 %	113474095
114	NC_008312	AAACC	2	10	292878	292887	60 %	0 %	0 %	40 %	113474096
115	NC_008312	TGAAA	2	10	295509	295518	60 %	20 %	20 %	0 %	113474098
116	NC_008312	TCTTT	2	10	297158	297167	0 %	80 %	0 %	20 %	113474099
117	NC_008312	ATATT	2	10	298533	298542	40 %	60 %	0 %	0 %	113474100
118	NC_008312	ATCAG	2	10	298795	298804	40 %	20 %	20 %	20 %	113474100
119	NC_008312	AAAAG	2	10	302762	302771	80 %	0 %	20 %	0 %	113474101
120	NC_008312	AATTA	2	10	305123	305132	60 %	40 %	0 %	0 %	113474102
121	NC_008312	AAAAG	2	10	309633	309642	80 %	0 %	20 %	0 %	113474105
122	NC_008312	ATCCC	2	10	313199	313208	20 %	20 %	0 %	60 %	113474108
123	NC_008312	TTACA	2	10	316416	316425	40 %	40 %	0 %	20 %	113474110
124	NC_008312	ACTTA	2	10	317121	317130	40 %	40 %	0 %	20 %	113474110
125	NC_008312	ACTCA	2	10	318366	318375	40 %	20 %	0 %	40 %	113474111
126	NC_008312	GAATG	2	10	324930	324939	40 %	20 %	40 %	0 %	113474114
127	NC_008312	AGCAA	2	10	325055	325064	60 %	0 %	20 %	20 %	113474114
128	NC_008312	CTTGA	2	10	327404	327413	20 %	40 %	20 %	20 %	113474116
129	NC_008312	ATGGG	2	10	327463	327472	20 %	20 %	60 %	0 %	113474116
130	NC_008312	TTAAG	2	10	331629	331638	40 %	40 %	20 %	0 %	113474118
131	NC_008312	CTGGT	2	10	337598	337607	0 %	40 %	40 %	20 %	113474120
132	NC_008312	TTCTA	2	10	339852	339861	20 %	60 %	0 %	20 %	113474121
133	NC_008312	AATAC	2	10	345482	345491	60 %	20 %	0 %	20 %	113474124
134	NC_008312	AAGTT	2	10	347206	347215	40 %	40 %	20 %	0 %	113474124
135	NC_008312	CTGGT	2	10	349516	349525	0 %	40 %	40 %	20 %	113474125
136	NC_008312	AGGTC	2	10	350460	350469	20 %	20 %	40 %	20 %	113474126
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151	NC_008312	CATAT	2	10	385696	385705	40 %	40 %	0 %	20 %	113474145
152	NC_008312	TTATT	2	10	386373	386382	20 %	80 %	0 %	0 %	113474145
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