MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 5567

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008309	ATTT	2	8	556	563	25 %	75 %	0 %	0 %	113460150
2	NC_008309	GTTA	2	8	686	693	25 %	50 %	25 %	0 %	113460150
3	NC_008309	AGAT	2	8	830	837	50 %	25 %	25 %	0 %	113460150
4	NC_008309	GTTA	2	8	1480	1487	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008309	ATTA	2	8	1897	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008309	ACAG	2	8	2533	2540	50 %	0 %	25 %	25 %	113460151
7	NC_008309	AAAT	2	8	2651	2658	75 %	25 %	0 %	0 %	113460151
8	NC_008309	GATT	2	8	2798	2805	25 %	50 %	25 %	0 %	113460151
9	NC_008309	AAAT	2	8	2865	2872	75 %	25 %	0 %	0 %	113460151
10	NC_008309	TACT	2	8	3395	3402	25 %	50 %	0 %	25 %	113460152
11	NC_008309	CTAG	2	8	3408	3415	25 %	25 %	25 %	25 %	113460152
12	NC_008309	TTAA	2	8	4482	4489	50 %	50 %	0 %	0 %	113460153
13	NC_008309	AACC	2	8	4707	4714	50 %	0 %	0 %	50 %	113460153
14	NC_008309	CGAT	2	8	5320	5327	25 %	25 %	25 %	25 %	113460153
15	NC_008309	TATC	2	8	5332	5339	25 %	50 %	0 %	25 %	113460153
16	NC_008309	AGCA	2	8	5503	5510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_008309	TGCT	2	8	5637	5644	0 %	50 %	25 %	25 %	113460154
18	NC_008309	CAAG	2	8	6052	6059	50 %	0 %	25 %	25 %	113460154
19	NC_008309	TAAG	2	8	6923	6930	50 %	25 %	25 %	0 %	113460154
20	NC_008309	CGCT	2	8	6948	6955	0 %	25 %	25 %	50 %	113460154
21	NC_008309	GCCA	2	8	7968	7975	25 %	0 %	25 %	50 %	113460154
22	NC_008309	TTAG	2	8	8008	8015	25 %	50 %	25 %	0 %	113460154
23	NC_008309	TAAA	2	8	8333	8340	75 %	25 %	0 %	0 %	113460155
24	NC_008309	ATAA	2	8	8369	8376	75 %	25 %	0 %	0 %	113460155
25	NC_008309	CTTT	2	8	8470	8477	0 %	75 %	0 %	25 %	113460155
26	NC_008309	GCTC	2	8	8923	8930	0 %	25 %	25 %	50 %	113460155
27	NC_008309	CTAA	2	8	9139	9146	50 %	25 %	0 %	25 %	113460156
28	NC_008309	TAAA	2	8	9155	9162	75 %	25 %	0 %	0 %	113460156
29	NC_008309	TGTT	2	8	9309	9316	0 %	75 %	25 %	0 %	113460156
30	NC_008309	ACAA	2	8	9908	9915	75 %	0 %	0 %	25 %	113460157
31	NC_008309	TAAT	2	8	10684	10691	50 %	50 %	0 %	0 %	113460158
32	NC_008309	ATGG	2	8	11114	11121	25 %	25 %	50 %	0 %	113460159
33	NC_008309	AAAG	2	8	11269	11276	75 %	0 %	25 %	0 %	113460159
34	NC_008309	AAAT	2	8	11593	11600	75 %	25 %	0 %	0 %	113460160
35	NC_008309	AATT	2	8	11690	11697	50 %	50 %	0 %	0 %	113460160
36	NC_008309	AATA	2	8	11915	11922	75 %	25 %	0 %	0 %	113460160
37	NC_008309	TAGC	2	8	13064	13071	25 %	25 %	25 %	25 %	113460161
38	NC_008309	TTTG	2	8	13564	13571	0 %	75 %	25 %	0 %	113460162
39	NC_008309	TGAA	2	8	13587	13594	50 %	25 %	25 %	0 %	113460162
40	NC_008309	GAAA	2	8	14131	14138	75 %	0 %	25 %	0 %	113460162
41	NC_008309	AAGC	2	8	14163	14170	50 %	0 %	25 %	25 %	113460162
42	NC_008309	TAAC	2	8	14226	14233	50 %	25 %	0 %	25 %	113460162
43	NC_008309	GCTT	2	8	14278	14285	0 %	50 %	25 %	25 %	113460162
44	NC_008309	GCAA	2	8	14304	14311	50 %	0 %	25 %	25 %	113460162
45	NC_008309	AAAT	2	8	15712	15719	75 %	25 %	0 %	0 %	113460164
46	NC_008309	ATCA	2	8	16040	16047	50 %	25 %	0 %	25 %	113460165
47	NC_008309	TTGA	2	8	16059	16066	25 %	50 %	25 %	0 %	113460165
48	NC_008309	ACCA	2	8	16472	16479	50 %	0 %	0 %	50 %	113460165
49	NC_008309	TAAT	2	8	16618	16625	50 %	50 %	0 %	0 %	113460165
50	NC_008309	ATTG	2	8	16958	16965	25 %	50 %	25 %	0 %	113460166
51	NC_008309	AATA	2	8	18390	18397	75 %	25 %	0 %	0 %	113460166
52	NC_008309	ACAA	2	8	19094	19101	75 %	0 %	0 %	25 %	113460167
53	NC_008309	GATA	2	8	19265	19272	50 %	25 %	25 %	0 %	113460167
54	NC_008309	TATT	2	8	19391	19398	25 %	75 %	0 %	0 %	113460167
55	NC_008309	ACAG	2	8	19464	19471	50 %	0 %	25 %	25 %	113460167
56	NC_008309	TAAA	2	8	19578	19585	75 %	25 %	0 %	0 %	113460167
57	NC_008309	TGCG	2	8	19915	19922	0 %	25 %	50 %	25 %	113460167
58	NC_008309	TTAA	2	8	20157	20164	50 %	50 %	0 %	0 %	113460168
59	NC_008309	ACAA	2	8	20674	20681	75 %	0 %	0 %	25 %	113460168
60	NC_008309	TATG	2	8	21710	21717	25 %	50 %	25 %	0 %	113460169
61	NC_008309	TACT	2	8	22130	22137	25 %	50 %	0 %	25 %	113460169
62	NC_008309	GGTA	2	8	22164	22171	25 %	25 %	50 %	0 %	113460169
63	NC_008309	AAAT	2	8	22285	22292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008309	CTGT	2	8	22354	22361	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_008309	CAAG	2	8	23283	23290	50 %	0 %	25 %	25 %	113460170
66	NC_008309	TAAC	2	8	23451	23458	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008309	TATT	2	8	23793	23800	25 %	75 %	0 %	0 %	113460171
68	NC_008309	TTGT	2	8	23991	23998	0 %	75 %	25 %	0 %	113460171
69	NC_008309	TGAT	2	8	24076	24083	25 %	50 %	25 %	0 %	113460171
70	NC_008309	AGAA	2	8	24262	24269	75 %	0 %	25 %	0 %	113460171
71	NC_008309	TGTT	2	8	24473	24480	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008309	AAAG	2	8	24712	24719	75 %	0 %	25 %	0 %	113460172
73	NC_008309	TTGC	2	8	24805	24812	0 %	50 %	25 %	25 %	113460172
74	NC_008309	AATT	2	8	25120	25127	50 %	50 %	0 %	0 %	113460173
75	NC_008309	TAAA	2	8	25771	25778	75 %	25 %	0 %	0 %	113460173
76	NC_008309	TGTT	2	8	25831	25838	0 %	75 %	25 %	0 %	113460173
77	NC_008309	GTTG	2	8	25971	25978	0 %	50 %	50 %	0 %	113460173
78	NC_008309	TGGT	2	8	26593	26600	0 %	50 %	50 %	0 %	113460174
79	NC_008309	ATTT	2	8	26626	26633	25 %	75 %	0 %	0 %	113460174
80	NC_008309	ATTT	2	8	26755	26762	25 %	75 %	0 %	0 %	113460174
81	NC_008309	TGGC	2	8	26990	26997	0 %	25 %	50 %	25 %	113460174
82	NC_008309	GATT	2	8	28028	28035	25 %	50 %	25 %	0 %	113460175
83	NC_008309	CTTT	2	8	28811	28818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_008309	AAAG	2	8	29086	29093	75 %	0 %	25 %	0 %	113460177
85	NC_008309	TGCT	2	8	29844	29851	0 %	50 %	25 %	25 %	113460177
86	NC_008309	ATCT	2	8	30198	30205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_008309	TAGA	2	8	30291	30298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008309	TCAG	2	8	30576	30583	25 %	25 %	25 %	25 %	113460178
89	NC_008309	TACT	2	8	30659	30666	25 %	50 %	0 %	25 %	113460178
90	NC_008309	CAAA	2	8	31119	31126	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008309	ACAT	2	8	31256	31263	50 %	25 %	0 %	25 %	113460179
92	NC_008309	AATT	2	8	31453	31460	50 %	50 %	0 %	0 %	113460179
93	NC_008309	AAAG	2	8	31475	31482	75 %	0 %	25 %	0 %	113460179
94	NC_008309	GAAT	2	8	31571	31578	50 %	25 %	25 %	0 %	113460179
95	NC_008309	TTAT	2	8	31690	31697	25 %	75 %	0 %	0 %	113460179
96	NC_008309	AGAA	2	8	31756	31763	75 %	0 %	25 %	0 %	113460179
97	NC_008309	TTCT	2	8	32228	32235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008309	ATTT	2	8	32268	32275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008309	GTCA	2	8	32845	32852	25 %	25 %	25 %	25 %	113460180
100	NC_008309	CGGA	2	8	33133	33140	25 %	0 %	50 %	25 %	113460180
101	NC_008309	AATT	2	8	33392	33399	50 %	50 %	0 %	0 %	113460180
102	NC_008309	AAGG	2	8	33553	33560	50 %	0 %	50 %	0 %	113460180
103	NC_008309	CTAT	2	8	33698	33705	25 %	50 %	0 %	25 %	113460180
104	NC_008309	CAAA	2	8	34192	34199	75 %	0 %	0 %	25 %	113460181
105	NC_008309	TCAA	2	8	34809	34816	50 %	25 %	0 %	25 %	113460182
106	NC_008309	TGCT	2	8	34914	34921	0 %	50 %	25 %	25 %	113460182
107	NC_008309	ATTA	2	8	34923	34930	50 %	50 %	0 %	0 %	113460182
108	NC_008309	TCTA	2	8	34974	34981	25 %	50 %	0 %	25 %	113460182
109	NC_008309	ATTA	2	8	35004	35011	50 %	50 %	0 %	0 %	113460182
110	NC_008309	ATTA	2	8	35085	35092	50 %	50 %	0 %	0 %	113460182
111	NC_008309	ATTA	2	8	35742	35749	50 %	50 %	0 %	0 %	113460183
112	NC_008309	GATA	2	8	36219	36226	50 %	25 %	25 %	0 %	113460183
113	NC_008309	CCAA	2	8	36820	36827	50 %	0 %	0 %	50 %	113460183
114	NC_008309	GATT	2	8	37355	37362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008309	CAAA	2	8	38008	38015	75 %	0 %	0 %	25 %	113460184
116	NC_008309	GAAT	2	8	38219	38226	50 %	25 %	25 %	0 %	113460185
117	NC_008309	TTTA	2	8	38385	38392	25 %	75 %	0 %	0 %	113460185
118	NC_008309	GAAA	2	8	38454	38461	75 %	0 %	25 %	0 %	113460185
119	NC_008309	AATG	2	8	38484	38491	50 %	25 %	25 %	0 %	113460185
120	NC_008309	TATT	2	8	38530	38537	25 %	75 %	0 %	0 %	113460185
121	NC_008309	ATTT	2	8	39354	39361	25 %	75 %	0 %	0 %	113460186
122	NC_008309	TAAA	2	8	39743	39750	75 %	25 %	0 %	0 %	113460187
123	NC_008309	TAAA	2	8	39805	39812	75 %	25 %	0 %	0 %	113460187
124	NC_008309	CAAT	2	8	40571	40578	50 %	25 %	0 %	25 %	113460187
125	NC_008309	CCAA	2	8	40616	40623	50 %	0 %	0 %	50 %	113460187
126	NC_008309	TCAC	2	8	41054	41061	25 %	25 %	0 %	50 %	113460187
127	NC_008309	AATC	2	8	41604	41611	50 %	25 %	0 %	25 %	113460188
128	NC_008309	TTTC	2	8	41685	41692	0 %	75 %	0 %	25 %	113460188
129	NC_008309	CTTG	2	8	41906	41913	0 %	50 %	25 %	25 %	113460188
130	NC_008309	TCAT	2	8	43114	43121	25 %	50 %	0 %	25 %	113460189
131	NC_008309	TTTC	2	8	43657	43664	0 %	75 %	0 %	25 %	113460190
132	NC_008309	ATCT	2	8	43721	43728	25 %	50 %	0 %	25 %	113460190
133	NC_008309	ATCG	2	8	43943	43950	25 %	25 %	25 %	25 %	113460190
134	NC_008309	AAAT	2	8	44420	44427	75 %	25 %	0 %	0 %	113460191
135	NC_008309	CATT	2	8	44480	44487	25 %	50 %	0 %	25 %	113460191
136	NC_008309	AATA	2	8	44504	44511	75 %	25 %	0 %	0 %	113460191
137	NC_008309	TCGC	2	8	45246	45253	0 %	25 %	25 %	50 %	113460192
138	NC_008309	TTTG	2	8	45587	45594	0 %	75 %	25 %	0 %	113460192
139	NC_008309	ACTT	2	8	45748	45755	25 %	50 %	0 %	25 %	113460192
140	NC_008309	GTTA	2	8	45779	45786	25 %	50 %	25 %	0 %	113460192
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142	NC_008309	ATTT	2	8	45988	45995	25 %	75 %	0 %	0 %	113460192
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