MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008309	GTTA	2	8	1480	1487	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008309	ATTA	2	8	1897	1904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008309	AGCA	2	8	5503	5510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008309	AAAT	2	8	22285	22292	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008309	CTGT	2	8	22354	22361	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_008309	TAAC	2	8	23451	23458	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_008309	TGTT	2	8	24473	24480	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008309	CTTT	2	8	28811	28818	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_008309	ATCT	2	8	30198	30205	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_008309	TAGA	2	8	30291	30298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008309	CAAA	2	8	31119	31126	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008309	TTCT	2	8	32228	32235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_008309	ATTT	2	8	32268	32275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008309	GATT	2	8	37355	37362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008309	TCTA	2	8	47478	47485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008309	AATG	2	8	53231	53238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008309	TTTA	2	8	63063	63070	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008309	TTAA	2	8	65851	65858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008309	GAAA	2	8	77543	77550	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008309	ATTT	2	8	79678	79685	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008309	CTTA	2	8	82136	82143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008309	ATTT	2	8	82302	82309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008309	AAAT	2	8	85746	85753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008309	GAAA	2	8	85769	85776	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008309	ATCC	2	8	91044	91051	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008309	TCTG	2	8	91996	92003	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_008309	ATTG	2	8	92203	92210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008309	ATGA	2	8	94961	94968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008309	AAAT	2	8	95199	95206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008309	GAAA	2	8	95380	95387	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008309	GATA	2	8	109897	109904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008309	AGCT	2	8	115633	115640	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_008309	CTTT	2	8	119494	119501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_008309	AAAG	2	8	141637	141644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008309	AAAT	2	8	141651	141658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008309	TACA	2	8	150057	150064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008309	TGGT	2	8	151687	151694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008309	ATTT	2	8	152408	152415	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008309	ATTG	2	8	152425	152432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008309	GTTT	2	8	152992	152999	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008309	AGCA	2	8	158435	158442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008309	TATG	2	8	162694	162701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008309	ATTA	2	8	169713	169720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008309	ATTT	2	8	170314	170321	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008309	TTAA	2	8	177028	177035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008309	CTAC	2	8	177423	177430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008309	TCAA	2	8	183599	183606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_008309	AATT	2	8	186275	186282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008309	TAAG	2	8	186342	186349	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008309	AAAT	2	8	186381	186388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_008309	ATTA	2	8	186401	186408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008309	AATA	2	8	186431	186438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008309	TTTA	2	8	191514	191521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008309	TTTA	2	8	191617	191624	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008309	TTTA	2	8	191644	191651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008309	CAAA	2	8	191672	191679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_008309	AATC	2	8	195240	195247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008309	GATG	2	8	196981	196988	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008309	TAGA	2	8	212534	212541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008309	ATAA	2	8	212545	212552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008309	ACAA	2	8	216930	216937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008309	AAAG	2	8	216945	216952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008309	ATGA	2	8	218887	218894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008309	AAAT	2	8	223391	223398	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008309	TAAA	2	8	230554	230561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008309	TTGA	2	8	231367	231374	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008309	AATC	2	8	231492	231499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_008309	AACA	2	8	241824	241831	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008309	TTCA	2	8	244078	244085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008309	AAAG	2	8	245225	245232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008309	ATTA	2	8	249569	249576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008309	TTAT	2	8	253021	253028	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008309	TAAA	2	8	253294	253301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008309	TATT	2	8	256407	256414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008309	ACAA	2	8	261147	261154	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_008309	ATTC	2	8	261449	261456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008309	TTAT	2	8	261476	261483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008309	TGTT	2	8	261495	261502	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008309	AGTC	2	8	269105	269112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008309	TAAT	2	8	276959	276966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008309	TCAA	2	8	277001	277008	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_008309	TAAG	2	8	279626	279633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008309	ATTT	2	8	283623	283630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008309	TTAG	2	8	293355	293362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008309	TGAA	2	8	293639	293646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008309	GTAA	2	8	294220	294227	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008309	TTTA	2	8	295395	295402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008309	TAAA	2	8	312436	312443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008309	CTAC	2	8	313571	313578	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008309	GTAG	2	8	313585	313592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008309	TTAT	2	8	313666	313673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008309	ATTT	2	8	317011	317018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008309	ATTG	2	8	317618	317625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008309	TACT	2	8	322304	322311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_008309	TATT	2	8	322385	322392	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008309	TAAA	2	8	327126	327133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008309	CTTA	2	8	327510	327517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008309	TACT	2	8	329113	329120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008309	AAAC	2	8	333423	333430	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008309	CCTT	2	8	334146	334153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_008309	ATGA	2	8	336871	336878	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008309	GCAA	2	8	346223	346230	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_008309	TGAA	2	8	346346	346353	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008309	ATGA	2	8	348206	348213	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008309	AGTA	2	8	348222	348229	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008309	ATCA	2	8	348240	348247	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008309	AGGA	2	8	352849	352856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008309	CCAA	2	8	353072	353079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008309	ACGC	2	8	353123	353130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_008309	TTTA	2	8	354835	354842	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008309	CAGT	2	8	355469	355476	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_008309	AAAG	2	8	372204	372211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008309	TTAC	2	8	373208	373215	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008309	CAAT	2	8	375281	375288	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_008309	GTTG	2	8	380351	380358	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008309	TAAA	2	8	380425	380432	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008309	CCTC	2	8	380464	380471	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_008309	AATT	2	8	380487	380494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008309	CAAG	2	8	383067	383074	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_008309	ATTT	2	8	389182	389189	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008309	AATA	2	8	389301	389308	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008309	TATT	2	8	389370	389377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008309	ATCT	2	8	390267	390274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008309	ATTT	2	8	406874	406881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008309	TAGA	2	8	406937	406944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008309	ATAA	2	8	406948	406955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008309	TATT	2	8	407302	407309	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008309	ATTA	2	8	407326	407333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008309	GAAT	2	8	414291	414298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008309	AGAA	2	8	419281	419288	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008309	TTAT	2	8	432374	432381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008309	GCTT	2	8	437920	437927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_008309	ATTA	2	8	439692	439699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008309	ATTT	2	8	445487	445494	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008309	TTTG	2	8	446972	446979	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008309	AGCA	2	8	456581	456588	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008309	GATA	2	8	462812	462819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008309	TCTA	2	8	478394	478401	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008309	TGTT	2	8	478440	478447	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008309	TTTA	2	8	487846	487853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008309	ATCA	2	8	487854	487861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_008309	GATA	2	8	491319	491326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008309	AATA	2	8	491327	491334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008309	ATAA	2	8	491395	491402	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008309	CAAA	2	8	493151	493158	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_008309	TATT	2	8	493682	493689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008309	AAGA	2	8	494463	494470	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_008309	TTTA	2	8	497645	497652	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008309	TTTC	2	8	499160	499167	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008309	GATA	2	8	499208	499215	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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