MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus somnus 129PT chromosome

Total Repeats: 23545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008309	AAT	2	6	519	524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460150
2	NC_008309	TAA	2	6	610	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460150
3	NC_008309	TAG	2	6	632	637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460150
4	NC_008309	GAA	2	6	639	644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460150
5	NC_008309	ATT	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460150
6	NC_008309	TAA	2	6	794	799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460150
7	NC_008309	TCT	2	6	888	893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460150
8	NC_008309	ACA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460150
9	NC_008309	TGA	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460150
10	NC_008309	AAT	2	6	1065	1070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460150
11	NC_008309	TAT	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460150
12	NC_008309	TAT	2	6	2023	2028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460151
13	NC_008309	TCG	2	6	2037	2042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460151
14	NC_008309	CAA	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460151
15	NC_008309	TGA	2	6	2124	2129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460151
16	NC_008309	TAA	2	6	2408	2413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460151
17	NC_008309	TGC	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460151
18	NC_008309	CTG	2	6	2606	2611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460151
19	NC_008309	CTT	2	6	2630	2635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460151
20	NC_008309	TGG	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	113460151
21	NC_008309	GTA	2	6	2710	2715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460151
22	NC_008309	ATT	2	6	2836	2841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460151
23	NC_008309	CTG	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460151
24	NC_008309	CAA	2	6	3040	3045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460151
25	NC_008309	GAA	2	6	3274	3279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460151
26	NC_008309	GTT	2	6	3448	3453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460152
27	NC_008309	ATC	2	6	3488	3493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460152
28	NC_008309	CAG	2	6	3508	3513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460152
29	NC_008309	ATC	2	6	3593	3598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460152
30	NC_008309	CCA	2	6	3618	3623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460152
31	NC_008309	TGC	2	6	3635	3640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460152
32	NC_008309	CCA	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	113460152
33	NC_008309	AAT	2	6	3767	3772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460152
34	NC_008309	ACA	2	6	3846	3851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460152
35	NC_008309	ACT	2	6	4019	4024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460153
36	NC_008309	CTT	2	6	4063	4068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460153
37	NC_008309	AGA	2	6	4073	4078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460153
38	NC_008309	ATT	2	6	4095	4100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460153
39	NC_008309	TGA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460153
40	NC_008309	GTA	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460153
41	NC_008309	GAA	2	6	4422	4427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460153
42	NC_008309	GAA	2	6	4500	4505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460153
43	NC_008309	CGG	2	6	4532	4537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460153
44	NC_008309	AAT	2	6	4578	4583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460153
45	NC_008309	CAA	2	6	4701	4706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460153
46	NC_008309	CAA	2	6	4917	4922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460153
47	NC_008309	GTA	2	6	4983	4988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460153
48	NC_008309	CAT	2	6	5023	5028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460153
49	NC_008309	CTT	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460153
50	NC_008309	TCC	2	6	5704	5709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460154
51	NC_008309	AGC	2	6	5847	5852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
52	NC_008309	CTT	2	6	5885	5890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460154
53	NC_008309	CAT	2	6	6068	6073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
54	NC_008309	TCA	2	6	6097	6102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
55	NC_008309	TAA	2	6	6341	6346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
56	NC_008309	CAA	2	6	6348	6353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460154
57	NC_008309	ATT	2	6	6436	6441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460154
58	NC_008309	TAA	2	6	6570	6575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
59	NC_008309	TCA	2	6	6589	6594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
60	NC_008309	GTT	2	6	6599	6604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460154
61	NC_008309	TTC	2	6	6645	6650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460154
62	NC_008309	AAT	2	6	6669	6674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
63	NC_008309	ATA	2	6	6756	6761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
64	NC_008309	TCA	2	6	6874	6879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
65	NC_008309	CTC	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460154
66	NC_008309	AAT	2	6	6942	6947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
67	NC_008309	TGT	2	6	6991	6996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460154
68	NC_008309	CAA	2	6	7004	7009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460154
69	NC_008309	TTC	2	6	7161	7166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460154
70	NC_008309	TGC	2	6	7177	7182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	113460154
71	NC_008309	TGT	2	6	7198	7203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460154
72	NC_008309	GAC	2	6	7205	7210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
73	NC_008309	GCA	2	6	7300	7305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
74	NC_008309	CAA	2	6	7455	7460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460154
75	NC_008309	GCA	2	6	7468	7473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
76	NC_008309	GAC	3	9	7580	7588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
77	NC_008309	GGC	2	6	7686	7691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460154
78	NC_008309	TCA	2	6	7813	7818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
79	NC_008309	TAA	2	6	8025	8030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460154
80	NC_008309	CAG	2	6	8033	8038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460154
81	NC_008309	CAT	3	9	8048	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
82	NC_008309	ACA	2	6	8090	8095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460154
83	NC_008309	TCA	2	6	8135	8140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460154
84	NC_008309	AGC	2	6	8385	8390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460155
85	NC_008309	TGA	2	6	8570	8575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460155
86	NC_008309	CTA	2	6	8665	8670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460155
87	NC_008309	TTG	2	6	8697	8702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460155
88	NC_008309	TAA	2	6	8709	8714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460155
89	NC_008309	TAT	2	6	8825	8830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460155
90	NC_008309	AAT	2	6	8836	8841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460155
91	NC_008309	AAC	2	6	8888	8893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460155
92	NC_008309	TGT	3	9	8902	8910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460155
93	NC_008309	TGT	2	6	8989	8994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460155
94	NC_008309	TCA	2	6	9007	9012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460155
95	NC_008309	GAG	2	6	9074	9079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	113460155
96	NC_008309	TGT	2	6	9442	9447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460156
97	NC_008309	TAA	2	6	9561	9566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460156
98	NC_008309	CGA	2	6	9632	9637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	113460156
99	NC_008309	AAT	2	6	9660	9665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460156
100	NC_008309	TTG	2	6	9682	9687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460156
101	NC_008309	TCT	2	6	9744	9749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460157
102	NC_008309	CAA	2	6	9880	9885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460157
103	NC_008309	TGT	2	6	9918	9923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460157
104	NC_008309	TTC	2	6	9938	9943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460157
105	NC_008309	ATT	2	6	10073	10078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460157
106	NC_008309	AAC	2	6	10120	10125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460157
107	NC_008309	AAT	2	6	10443	10448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460158
108	NC_008309	ATG	2	6	10527	10532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460158
109	NC_008309	TTA	2	6	10566	10571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460158
110	NC_008309	CGG	2	6	10675	10680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	113460158
111	NC_008309	AAT	2	6	10782	10787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460158
112	NC_008309	TGA	2	6	10808	10813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460158
113	NC_008309	ATT	2	6	10865	10870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460158
114	NC_008309	CAA	3	9	10899	10907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460158
115	NC_008309	TTG	3	9	11088	11096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460159
116	NC_008309	AAC	2	6	11215	11220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460159
117	NC_008309	TGA	2	6	11233	11238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460159
118	NC_008309	AAT	2	6	11343	11348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460159
119	NC_008309	AAT	2	6	11420	11425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460160
120	NC_008309	AGA	2	6	11480	11485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	113460160
121	NC_008309	TGT	2	6	11503	11508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460160
122	NC_008309	GAT	2	6	11583	11588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	113460160
123	NC_008309	TTA	2	6	11667	11672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	113460160
124	NC_008309	TCC	2	6	11678	11683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	113460160
125	NC_008309	TCA	2	6	11713	11718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	113460160
126	NC_008309	TCT	2	6	11760	11765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	113460160
127	NC_008309	TGT	3	9	11795	11803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	113460160
128	NC_008309	TAA	2	6	11930	11935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460160
129	NC_008309	CCG	2	6	11943	11948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	113460160
130	NC_008309	ACA	2	6	11958	11963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	113460160
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250	NC_008309	AAT	2	6	20033	20038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	113460167
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