MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Frankia alni ACN14a chromosome

Total Repeats: 8818

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008278	GGGGC	2	10	943	952	0 %	0 %	80 %	20 %	111219506
2	NC_008278	CCCGA	2	10	5252	5261	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_008278	CGGCG	2	10	5375	5384	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_008278	CCGGC	2	10	6028	6037	0 %	0 %	40 %	60 %	111219511
5	NC_008278	CCGCG	2	10	7237	7246	0 %	0 %	40 %	60 %	111219512
6	NC_008278	ACCGG	2	10	9215	9224	20 %	0 %	40 %	40 %	111219513
7	NC_008278	TCGCC	2	10	9804	9813	0 %	20 %	20 %	60 %	111219513
8	NC_008278	GGGCC	2	10	10560	10569	0 %	0 %	60 %	40 %	111219513
9	NC_008278	CGGGG	2	10	11469	11478	0 %	0 %	80 %	20 %	111219514
10	NC_008278	GTGGC	2	10	13126	13135	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_008278	TCCCT	2	10	13148	13157	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_008278	GGAAG	2	10	14335	14344	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008278	TCGCC	2	10	15285	15294	0 %	20 %	20 %	60 %	111219518
14	NC_008278	CCCGG	2	10	18194	18203	0 %	0 %	40 %	60 %	111219524
15	NC_008278	GGCCG	2	10	18301	18310	0 %	0 %	60 %	40 %	111219524
16	NC_008278	GGCCG	2	10	18373	18382	0 %	0 %	60 %	40 %	111219524
17	NC_008278	CACGA	2	10	19323	19332	40 %	0 %	20 %	40 %	111219526
18	NC_008278	CGGCG	2	10	19895	19904	0 %	0 %	60 %	40 %	111219527
19	NC_008278	CCGCA	2	10	20431	20440	20 %	0 %	20 %	60 %	111219527
20	NC_008278	GCGCC	2	10	21551	21560	0 %	0 %	40 %	60 %	111219528
21	NC_008278	GCCCG	2	10	23722	23731	0 %	0 %	40 %	60 %	111219530
22	NC_008278	TCCGT	2	10	24837	24846	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_008278	TGCCG	2	10	25379	25388	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_008278	GCCGC	2	10	26054	26063	0 %	0 %	40 %	60 %	111219532
25	NC_008278	CCGAC	2	10	26409	26418	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_008278	TCGCG	2	10	27710	27719	0 %	20 %	40 %	40 %	111219534
27	NC_008278	GCGGT	2	10	28040	28049	0 %	20 %	60 %	20 %	111219534
28	NC_008278	GACCG	2	10	28781	28790	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008278	GGCCG	2	10	28812	28821	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_008278	CCGCC	2	10	29031	29040	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
31	NC_008278	GGTGG	2	10	29254	29263	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008278	GCGCC	2	10	30544	30553	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_008278	GATCG	2	10	31015	31024	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_008278	GATCG	2	10	31032	31041	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_008278	ATCGG	2	10	31050	31059	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_008278	CCGGC	2	10	32190	32199	0 %	0 %	40 %	60 %	111219538
37	NC_008278	CCGGG	2	10	32633	32642	0 %	0 %	60 %	40 %	111219538
38	NC_008278	AGCCG	2	10	34003	34012	20 %	0 %	40 %	40 %	111219539
39	NC_008278	CGTGC	2	10	36526	36535	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_008278	GTCCG	2	10	36871	36880	0 %	20 %	40 %	40 %	111219541
41	NC_008278	ATCGA	2	10	37812	37821	40 %	20 %	20 %	20 %	111219541
42	NC_008278	TCCGG	2	10	39234	39243	0 %	20 %	40 %	40 %	111219544
43	NC_008278	CGCGG	2	10	39634	39643	0 %	0 %	60 %	40 %	111219544
44	NC_008278	CCGAC	2	10	40140	40149	20 %	0 %	20 %	60 %	111219544
45	NC_008278	CCGCG	2	10	40423	40432	0 %	0 %	40 %	60 %	111219544
46	NC_008278	GCCCG	2	10	40487	40496	0 %	0 %	40 %	60 %	111219544
47	NC_008278	TGGCG	2	10	40649	40658	0 %	20 %	60 %	20 %	111219544
48	NC_008278	GCGCG	2	10	41504	41513	0 %	0 %	60 %	40 %	111219544
49	NC_008278	CCTGC	2	10	42369	42378	0 %	20 %	20 %	60 %	111219546
50	NC_008278	CCCGG	2	10	44991	45000	0 %	0 %	40 %	60 %	111219551
51	NC_008278	ATGGG	2	10	45123	45132	20 %	20 %	60 %	0 %	111219551
52	NC_008278	CGCGC	2	10	46118	46127	0 %	0 %	40 %	60 %	111219552
53	NC_008278	GGGGC	2	10	46680	46689	0 %	0 %	80 %	20 %	111219552
54	NC_008278	CCGAG	2	10	46987	46996	20 %	0 %	40 %	40 %	111219553
55	NC_008278	CGGAC	2	10	47015	47024	20 %	0 %	40 %	40 %	111219553
56	NC_008278	GGTCG	2	10	47168	47177	0 %	20 %	60 %	20 %	111219554
57	NC_008278	GCCGG	2	10	47420	47429	0 %	0 %	60 %	40 %	111219554
58	NC_008278	GCTGG	2	10	47531	47540	0 %	20 %	60 %	20 %	111219554
59	NC_008278	GGCCG	2	10	47558	47567	0 %	0 %	60 %	40 %	111219554
60	NC_008278	CGCCC	2	10	48943	48952	0 %	0 %	20 %	80 %	111219554
61	NC_008278	CCGGG	2	10	49828	49837	0 %	0 %	60 %	40 %	111219555
62	NC_008278	GCCGC	2	10	50000	50009	0 %	0 %	40 %	60 %	111219555
63	NC_008278	GGCCG	2	10	50167	50176	0 %	0 %	60 %	40 %	111219555
64	NC_008278	GGCCG	2	10	50335	50344	0 %	0 %	60 %	40 %	111219555
65	NC_008278	CGGGT	2	10	50693	50702	0 %	20 %	60 %	20 %	111219555
66	NC_008278	GCCCG	2	10	51188	51197	0 %	0 %	40 %	60 %	111219555
67	NC_008278	CGGGC	2	10	51254	51263	0 %	0 %	60 %	40 %	111219555
68	NC_008278	CGTGG	2	10	52995	53004	0 %	20 %	60 %	20 %	111219557
69	NC_008278	CGACC	2	10	53137	53146	20 %	0 %	20 %	60 %	111219557
70	NC_008278	CGGGG	2	10	54460	54469	0 %	0 %	80 %	20 %	111219558
71	NC_008278	CGGCC	2	10	54671	54680	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_008278	CCGTA	2	10	55213	55222	20 %	20 %	20 %	40 %	111219560
73	NC_008278	ACCCG	2	10	55268	55277	20 %	0 %	20 %	60 %	111219560
74	NC_008278	GGGGT	2	10	55288	55297	0 %	20 %	80 %	0 %	111219560
75	NC_008278	GCGCC	2	10	55492	55501	0 %	0 %	40 %	60 %	111219561
76	NC_008278	GCCCG	2	10	55859	55868	0 %	0 %	40 %	60 %	111219562
77	NC_008278	AGCGC	2	10	55958	55967	20 %	0 %	40 %	40 %	111219562
78	NC_008278	CGCGG	2	10	56127	56136	0 %	0 %	60 %	40 %	111219562
79	NC_008278	CGCGT	2	10	57009	57018	0 %	20 %	40 %	40 %	111219562
80	NC_008278	CGGCG	2	10	57140	57149	0 %	0 %	60 %	40 %	111219562
81	NC_008278	TCGGC	2	10	57785	57794	0 %	20 %	40 %	40 %	111219562
82	NC_008278	GCCGA	2	10	58156	58165	20 %	0 %	40 %	40 %	111219562
83	NC_008278	GGCGC	2	10	58441	58450	0 %	0 %	60 %	40 %	111219562
84	NC_008278	GGCAC	2	10	58922	58931	20 %	0 %	40 %	40 %	111219562
85	NC_008278	CCGTC	2	10	59029	59038	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
86	NC_008278	GTCCC	2	10	59126	59135	0 %	20 %	20 %	60 %	111219563
87	NC_008278	GGCCA	2	10	59217	59226	20 %	0 %	40 %	40 %	111219563
88	NC_008278	GTCGA	2	10	61678	61687	20 %	20 %	40 %	20 %	111219566
89	NC_008278	GCCTC	2	10	61763	61772	0 %	20 %	20 %	60 %	111219566
90	NC_008278	ACCGG	2	10	63833	63842	20 %	0 %	40 %	40 %	111219568
91	NC_008278	GCGCC	2	10	63904	63913	0 %	0 %	40 %	60 %	111219568
92	NC_008278	GCCCC	2	10	64072	64081	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
93	NC_008278	GACCA	2	10	64909	64918	40 %	0 %	20 %	40 %	111219570
94	NC_008278	GCCGC	2	10	65010	65019	0 %	0 %	40 %	60 %	111219570
95	NC_008278	CTCCG	2	10	65494	65503	0 %	20 %	20 %	60 %	111219570
96	NC_008278	GCCCG	2	10	67004	67013	0 %	0 %	40 %	60 %	111219570
97	NC_008278	GCGCA	2	10	67024	67033	20 %	0 %	40 %	40 %	111219570
98	NC_008278	GAGCT	2	10	69471	69480	20 %	20 %	40 %	20 %	111219571
99	NC_008278	GCGCC	2	10	70906	70915	0 %	0 %	40 %	60 %	111219572
100	NC_008278	CGGTG	2	10	72361	72370	0 %	20 %	60 %	20 %	111219574
101	NC_008278	GCCGA	2	10	74421	74430	20 %	0 %	40 %	40 %	111219576
102	NC_008278	CGGCG	2	10	76815	76824	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_008278	GCCTC	2	10	77627	77636	0 %	20 %	20 %	60 %	111219578
104	NC_008278	CGGGG	2	10	77826	77835	0 %	0 %	80 %	20 %	111219578
105	NC_008278	CCCGA	2	10	78154	78163	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_008278	CCGTC	2	10	79756	79765	0 %	20 %	20 %	60 %	111219581
107	NC_008278	CGGCG	2	10	81217	81226	0 %	0 %	60 %	40 %	111219582
108	NC_008278	CCAGC	2	10	81571	81580	20 %	0 %	20 %	60 %	111219582
109	NC_008278	ACCGA	2	10	83577	83586	40 %	0 %	20 %	40 %	111219584
110	NC_008278	TGGCC	2	10	83985	83994	0 %	20 %	40 %	40 %	111219585
111	NC_008278	CCGTG	2	10	85484	85493	0 %	20 %	40 %	40 %	111219586
112	NC_008278	GATCG	2	10	85699	85708	20 %	20 %	40 %	20 %	111219587
113	NC_008278	CGGCG	2	10	85855	85864	0 %	0 %	60 %	40 %	111219587
114	NC_008278	CGAGG	2	10	86157	86166	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_008278	CGAGG	2	10	86175	86184	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_008278	CGGGG	2	10	87725	87734	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
117	NC_008278	TGGCC	2	10	88624	88633	0 %	20 %	40 %	40 %	111219592
118	NC_008278	GCCAG	2	10	89744	89753	20 %	0 %	40 %	40 %	111219592
119	NC_008278	CCAGC	2	10	89854	89863	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
120	NC_008278	CGCTG	2	10	91735	91744	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_008278	CGGCG	2	10	92620	92629	0 %	0 %	60 %	40 %	111219596
122	NC_008278	CGCGG	2	10	94812	94821	0 %	0 %	60 %	40 %	111219597
123	NC_008278	CCAGG	2	10	95424	95433	20 %	0 %	40 %	40 %	111219597
124	NC_008278	GCCGG	2	10	95471	95480	0 %	0 %	60 %	40 %	111219597
125	NC_008278	CGGAC	2	10	96727	96736	20 %	0 %	40 %	40 %	111219598
126	NC_008278	GCCCT	2	10	97560	97569	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
127	NC_008278	GCCCT	2	10	97575	97584	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_008278	GGGCT	2	10	97591	97600	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_008278	CCGGC	2	10	98477	98486	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_008278	CCGGG	2	10	100121	100130	0 %	0 %	60 %	40 %	111219600
131	NC_008278	CCGAC	2	10	100349	100358	20 %	0 %	20 %	60 %	111219600
132	NC_008278	CCCGG	2	10	102753	102762	0 %	0 %	40 %	60 %	111219603
133	NC_008278	CGGGC	2	10	103768	103777	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
134	NC_008278	GGCCG	2	10	103927	103936	0 %	0 %	60 %	40 %	111219604
135	NC_008278	GCCGG	2	10	104182	104191	0 %	0 %	60 %	40 %	111219604
136	NC_008278	CTGGC	2	10	104570	104579	0 %	20 %	40 %	40 %	111219604
137	NC_008278	CAGGG	2	10	105367	105376	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
138	NC_008278	GGGTC	2	10	107453	107462	0 %	20 %	60 %	20 %	111219607
139	NC_008278	CCGGC	2	10	108318	108327	0 %	0 %	40 %	60 %	111219608
140	NC_008278	GGCGA	2	10	108617	108626	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_008278	GTGAG	2	10	108648	108657	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008278	GCGCG	2	10	109912	109921	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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144	NC_008278	AACGC	2	10	113888	113897	40 %	0 %	20 %	40 %	111219613
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