MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Frankia alni ACN14a chromosome

Total Repeats: 7211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008278	GGGGC	2	10	943	952	0 %	0 %	80 %	20 %	111219506
2	NC_008278	CCGGC	2	10	6028	6037	0 %	0 %	40 %	60 %	111219511
3	NC_008278	CCGCG	2	10	7237	7246	0 %	0 %	40 %	60 %	111219512
4	NC_008278	ACCGG	2	10	9215	9224	20 %	0 %	40 %	40 %	111219513
5	NC_008278	TCGCC	2	10	9804	9813	0 %	20 %	20 %	60 %	111219513
6	NC_008278	GGGCC	2	10	10560	10569	0 %	0 %	60 %	40 %	111219513
7	NC_008278	CGGGG	2	10	11469	11478	0 %	0 %	80 %	20 %	111219514
8	NC_008278	TCGCC	2	10	15285	15294	0 %	20 %	20 %	60 %	111219518
9	NC_008278	CCCGG	2	10	18194	18203	0 %	0 %	40 %	60 %	111219524
10	NC_008278	GGCCG	2	10	18301	18310	0 %	0 %	60 %	40 %	111219524
11	NC_008278	GGCCG	2	10	18373	18382	0 %	0 %	60 %	40 %	111219524
12	NC_008278	CACGA	2	10	19323	19332	40 %	0 %	20 %	40 %	111219526
13	NC_008278	CGGCG	2	10	19895	19904	0 %	0 %	60 %	40 %	111219527
14	NC_008278	CCGCA	2	10	20431	20440	20 %	0 %	20 %	60 %	111219527
15	NC_008278	GCGCC	2	10	21551	21560	0 %	0 %	40 %	60 %	111219528
16	NC_008278	GCCCG	2	10	23722	23731	0 %	0 %	40 %	60 %	111219530
17	NC_008278	GCCGC	2	10	26054	26063	0 %	0 %	40 %	60 %	111219532
18	NC_008278	TCGCG	2	10	27710	27719	0 %	20 %	40 %	40 %	111219534
19	NC_008278	GCGGT	2	10	28040	28049	0 %	20 %	60 %	20 %	111219534
20	NC_008278	CCGGC	2	10	32190	32199	0 %	0 %	40 %	60 %	111219538
21	NC_008278	CCGGG	2	10	32633	32642	0 %	0 %	60 %	40 %	111219538
22	NC_008278	AGCCG	2	10	34003	34012	20 %	0 %	40 %	40 %	111219539
23	NC_008278	GTCCG	2	10	36871	36880	0 %	20 %	40 %	40 %	111219541
24	NC_008278	ATCGA	2	10	37812	37821	40 %	20 %	20 %	20 %	111219541
25	NC_008278	TCCGG	2	10	39234	39243	0 %	20 %	40 %	40 %	111219544
26	NC_008278	CGCGG	2	10	39634	39643	0 %	0 %	60 %	40 %	111219544
27	NC_008278	CCGAC	2	10	40140	40149	20 %	0 %	20 %	60 %	111219544
28	NC_008278	CCGCG	2	10	40423	40432	0 %	0 %	40 %	60 %	111219544
29	NC_008278	GCCCG	2	10	40487	40496	0 %	0 %	40 %	60 %	111219544
30	NC_008278	TGGCG	2	10	40649	40658	0 %	20 %	60 %	20 %	111219544
31	NC_008278	GCGCG	2	10	41504	41513	0 %	0 %	60 %	40 %	111219544
32	NC_008278	CCTGC	2	10	42369	42378	0 %	20 %	20 %	60 %	111219546
33	NC_008278	CCCGG	2	10	44991	45000	0 %	0 %	40 %	60 %	111219551
34	NC_008278	ATGGG	2	10	45123	45132	20 %	20 %	60 %	0 %	111219551
35	NC_008278	CGCGC	2	10	46118	46127	0 %	0 %	40 %	60 %	111219552
36	NC_008278	GGGGC	2	10	46680	46689	0 %	0 %	80 %	20 %	111219552
37	NC_008278	CCGAG	2	10	46987	46996	20 %	0 %	40 %	40 %	111219553
38	NC_008278	CGGAC	2	10	47015	47024	20 %	0 %	40 %	40 %	111219553
39	NC_008278	GGTCG	2	10	47168	47177	0 %	20 %	60 %	20 %	111219554
40	NC_008278	GCCGG	2	10	47420	47429	0 %	0 %	60 %	40 %	111219554
41	NC_008278	GCTGG	2	10	47531	47540	0 %	20 %	60 %	20 %	111219554
42	NC_008278	GGCCG	2	10	47558	47567	0 %	0 %	60 %	40 %	111219554
43	NC_008278	CGCCC	2	10	48943	48952	0 %	0 %	20 %	80 %	111219554
44	NC_008278	CCGGG	2	10	49828	49837	0 %	0 %	60 %	40 %	111219555
45	NC_008278	GCCGC	2	10	50000	50009	0 %	0 %	40 %	60 %	111219555
46	NC_008278	GGCCG	2	10	50167	50176	0 %	0 %	60 %	40 %	111219555
47	NC_008278	GGCCG	2	10	50335	50344	0 %	0 %	60 %	40 %	111219555
48	NC_008278	CGGGT	2	10	50693	50702	0 %	20 %	60 %	20 %	111219555
49	NC_008278	GCCCG	2	10	51188	51197	0 %	0 %	40 %	60 %	111219555
50	NC_008278	CGGGC	2	10	51254	51263	0 %	0 %	60 %	40 %	111219555
51	NC_008278	CGTGG	2	10	52995	53004	0 %	20 %	60 %	20 %	111219557
52	NC_008278	CGACC	2	10	53137	53146	20 %	0 %	20 %	60 %	111219557
53	NC_008278	CGGGG	2	10	54460	54469	0 %	0 %	80 %	20 %	111219558
54	NC_008278	CCGTA	2	10	55213	55222	20 %	20 %	20 %	40 %	111219560
55	NC_008278	ACCCG	2	10	55268	55277	20 %	0 %	20 %	60 %	111219560
56	NC_008278	GGGGT	2	10	55288	55297	0 %	20 %	80 %	0 %	111219560
57	NC_008278	GCGCC	2	10	55492	55501	0 %	0 %	40 %	60 %	111219561
58	NC_008278	GCCCG	2	10	55859	55868	0 %	0 %	40 %	60 %	111219562
59	NC_008278	AGCGC	2	10	55958	55967	20 %	0 %	40 %	40 %	111219562
60	NC_008278	CGCGG	2	10	56127	56136	0 %	0 %	60 %	40 %	111219562
61	NC_008278	CGCGT	2	10	57009	57018	0 %	20 %	40 %	40 %	111219562
62	NC_008278	CGGCG	2	10	57140	57149	0 %	0 %	60 %	40 %	111219562
63	NC_008278	TCGGC	2	10	57785	57794	0 %	20 %	40 %	40 %	111219562
64	NC_008278	GCCGA	2	10	58156	58165	20 %	0 %	40 %	40 %	111219562
65	NC_008278	GGCGC	2	10	58441	58450	0 %	0 %	60 %	40 %	111219562
66	NC_008278	GGCAC	2	10	58922	58931	20 %	0 %	40 %	40 %	111219562
67	NC_008278	GTCCC	2	10	59126	59135	0 %	20 %	20 %	60 %	111219563
68	NC_008278	GGCCA	2	10	59217	59226	20 %	0 %	40 %	40 %	111219563
69	NC_008278	GTCGA	2	10	61678	61687	20 %	20 %	40 %	20 %	111219566
70	NC_008278	GCCTC	2	10	61763	61772	0 %	20 %	20 %	60 %	111219566
71	NC_008278	ACCGG	2	10	63833	63842	20 %	0 %	40 %	40 %	111219568
72	NC_008278	GCGCC	2	10	63904	63913	0 %	0 %	40 %	60 %	111219568
73	NC_008278	GACCA	2	10	64909	64918	40 %	0 %	20 %	40 %	111219570
74	NC_008278	GCCGC	2	10	65010	65019	0 %	0 %	40 %	60 %	111219570
75	NC_008278	CTCCG	2	10	65494	65503	0 %	20 %	20 %	60 %	111219570
76	NC_008278	GCCCG	2	10	67004	67013	0 %	0 %	40 %	60 %	111219570
77	NC_008278	GCGCA	2	10	67024	67033	20 %	0 %	40 %	40 %	111219570
78	NC_008278	GAGCT	2	10	69471	69480	20 %	20 %	40 %	20 %	111219571
79	NC_008278	GCGCC	2	10	70906	70915	0 %	0 %	40 %	60 %	111219572
80	NC_008278	CGGTG	2	10	72361	72370	0 %	20 %	60 %	20 %	111219574
81	NC_008278	GCCGA	2	10	74421	74430	20 %	0 %	40 %	40 %	111219576
82	NC_008278	GCCTC	2	10	77627	77636	0 %	20 %	20 %	60 %	111219578
83	NC_008278	CGGGG	2	10	77826	77835	0 %	0 %	80 %	20 %	111219578
84	NC_008278	CCGTC	2	10	79756	79765	0 %	20 %	20 %	60 %	111219581
85	NC_008278	CGGCG	2	10	81217	81226	0 %	0 %	60 %	40 %	111219582
86	NC_008278	CCAGC	2	10	81571	81580	20 %	0 %	20 %	60 %	111219582
87	NC_008278	ACCGA	2	10	83577	83586	40 %	0 %	20 %	40 %	111219584
88	NC_008278	TGGCC	2	10	83985	83994	0 %	20 %	40 %	40 %	111219585
89	NC_008278	CCGTG	2	10	85484	85493	0 %	20 %	40 %	40 %	111219586
90	NC_008278	GATCG	2	10	85699	85708	20 %	20 %	40 %	20 %	111219587
91	NC_008278	CGGCG	2	10	85855	85864	0 %	0 %	60 %	40 %	111219587
92	NC_008278	TGGCC	2	10	88624	88633	0 %	20 %	40 %	40 %	111219592
93	NC_008278	GCCAG	2	10	89744	89753	20 %	0 %	40 %	40 %	111219592
94	NC_008278	CGGCG	2	10	92620	92629	0 %	0 %	60 %	40 %	111219596
95	NC_008278	CGCGG	2	10	94812	94821	0 %	0 %	60 %	40 %	111219597
96	NC_008278	CCAGG	2	10	95424	95433	20 %	0 %	40 %	40 %	111219597
97	NC_008278	GCCGG	2	10	95471	95480	0 %	0 %	60 %	40 %	111219597
98	NC_008278	CGGAC	2	10	96727	96736	20 %	0 %	40 %	40 %	111219598
99	NC_008278	CCGGG	2	10	100121	100130	0 %	0 %	60 %	40 %	111219600
100	NC_008278	CCGAC	2	10	100349	100358	20 %	0 %	20 %	60 %	111219600
101	NC_008278	CCCGG	2	10	102753	102762	0 %	0 %	40 %	60 %	111219603
102	NC_008278	GGCCG	2	10	103927	103936	0 %	0 %	60 %	40 %	111219604
103	NC_008278	GCCGG	2	10	104182	104191	0 %	0 %	60 %	40 %	111219604
104	NC_008278	CTGGC	2	10	104570	104579	0 %	20 %	40 %	40 %	111219604
105	NC_008278	GGGTC	2	10	107453	107462	0 %	20 %	60 %	20 %	111219607
106	NC_008278	CCGGC	2	10	108318	108327	0 %	0 %	40 %	60 %	111219608
107	NC_008278	AACGG	2	10	110711	110720	40 %	0 %	40 %	20 %	111219611
108	NC_008278	AACGC	2	10	113888	113897	40 %	0 %	20 %	40 %	111219613
109	NC_008278	CGGTT	2	10	113945	113954	0 %	40 %	40 %	20 %	111219613
110	NC_008278	CCCGG	2	10	114374	114383	0 %	0 %	40 %	60 %	111219615
111	NC_008278	CCGCG	2	10	115445	115454	0 %	0 %	40 %	60 %	111219616
112	NC_008278	CCGTG	2	10	117132	117141	0 %	20 %	40 %	40 %	111219617
113	NC_008278	CGGGC	2	10	117883	117892	0 %	0 %	60 %	40 %	111219618
114	NC_008278	CGGCG	2	10	119860	119869	0 %	0 %	60 %	40 %	111219621
115	NC_008278	CGGTC	2	10	120642	120651	0 %	20 %	40 %	40 %	111219622
116	NC_008278	GTCGG	2	10	120960	120969	0 %	20 %	60 %	20 %	111219623
117	NC_008278	GTCGG	2	10	120996	121005	0 %	20 %	60 %	20 %	111219623
118	NC_008278	GTCGG	2	10	121014	121023	0 %	20 %	60 %	20 %	111219623
119	NC_008278	CCGGG	2	10	121296	121305	0 %	0 %	60 %	40 %	111219623
120	NC_008278	GACGC	2	10	121746	121755	20 %	0 %	40 %	40 %	111219624
121	NC_008278	CGCCC	2	10	121991	122000	0 %	0 %	20 %	80 %	111219624
122	NC_008278	GACGG	2	10	122687	122696	20 %	0 %	60 %	20 %	111219624
123	NC_008278	CGGGT	2	10	123152	123161	0 %	20 %	60 %	20 %	111219625
124	NC_008278	GGCTC	2	10	123241	123250	0 %	20 %	40 %	40 %	111219625
125	NC_008278	GTCCG	2	10	124409	124418	0 %	20 %	40 %	40 %	111219627
126	NC_008278	CCGGT	2	10	124721	124730	0 %	20 %	40 %	40 %	111219627
127	NC_008278	CCGGT	2	10	125957	125966	0 %	20 %	40 %	40 %	111219627
128	NC_008278	CGCCC	2	10	126454	126463	0 %	0 %	20 %	80 %	111219627
129	NC_008278	GGCGA	2	10	127725	127734	20 %	0 %	60 %	20 %	111219627
130	NC_008278	CGGAC	2	10	128269	128278	20 %	0 %	40 %	40 %	111219628
131	NC_008278	GGCCG	2	10	128616	128625	0 %	0 %	60 %	40 %	111219628
132	NC_008278	CACGC	2	10	129828	129837	20 %	0 %	20 %	60 %	111219629
133	NC_008278	GCGCG	2	10	131659	131668	0 %	0 %	60 %	40 %	111219630
134	NC_008278	GCCCG	2	10	132075	132084	0 %	0 %	40 %	60 %	111219631
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136	NC_008278	GCCGC	2	10	136588	136597	0 %	0 %	40 %	60 %	111219636
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