MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Frankia alni ACN14a chromosome

Total Repeats: 28753

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008278	GCGG	2	8	42	49	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008278	CCCA	2	8	367	374	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_008278	CCGC	2	8	386	393	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_008278	CCGG	2	8	771	778	0 %	0 %	50 %	50 %	111219506
5	NC_008278	CCGG	2	8	854	861	0 %	0 %	50 %	50 %	111219506
6	NC_008278	CGGG	2	8	862	869	0 %	0 %	75 %	25 %	111219506
7	NC_008278	GACC	2	8	1860	1867	25 %	0 %	25 %	50 %	111219506
8	NC_008278	CGGG	2	8	2095	2102	0 %	0 %	75 %	25 %	111219507
9	NC_008278	ACCG	2	8	2104	2111	25 %	0 %	25 %	50 %	111219507
10	NC_008278	GTGG	2	8	2295	2302	0 %	25 %	75 %	0 %	111219507
11	NC_008278	CGGC	2	8	2312	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	111219507
12	NC_008278	CGGC	2	8	2413	2420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_008278	CCAC	2	8	2607	2614	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
14	NC_008278	GAGC	2	8	2767	2774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008278	CCGC	2	8	2826	2833	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_008278	CCGC	2	8	2968	2975	0 %	0 %	25 %	75 %	111219508
17	NC_008278	GCCG	2	8	2986	2993	0 %	0 %	50 %	50 %	111219508
18	NC_008278	GCCG	2	8	3167	3174	0 %	0 %	50 %	50 %	111219508
19	NC_008278	CGAC	2	8	3427	3434	25 %	0 %	25 %	50 %	111219508
20	NC_008278	CACC	2	8	4107	4114	25 %	0 %	0 %	75 %	111219509
21	NC_008278	GGTC	2	8	4182	4189	0 %	25 %	50 %	25 %	111219509
22	NC_008278	GCCA	2	8	4246	4253	25 %	0 %	25 %	50 %	111219509
23	NC_008278	CGTG	2	8	4320	4327	0 %	25 %	50 %	25 %	111219509
24	NC_008278	GGGC	2	8	4366	4373	0 %	0 %	75 %	25 %	111219509
25	NC_008278	CCGC	2	8	4694	4701	0 %	0 %	25 %	75 %	111219509
26	NC_008278	GCCC	2	8	4876	4883	0 %	0 %	25 %	75 %	111219509
27	NC_008278	TCGC	2	8	4993	5000	0 %	25 %	25 %	50 %	111219509
28	NC_008278	GCCG	2	8	5172	5179	0 %	0 %	50 %	50 %	111219509
29	NC_008278	CGGC	2	8	5960	5967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_008278	CGGC	2	8	5985	5992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_008278	CGGG	2	8	6165	6172	0 %	0 %	75 %	25 %	111219511
32	NC_008278	GCAT	2	8	6621	6628	25 %	25 %	25 %	25 %	111219512
33	NC_008278	CGGG	2	8	6678	6685	0 %	0 %	75 %	25 %	111219512
34	NC_008278	CCCG	2	8	6822	6829	0 %	0 %	25 %	75 %	111219512
35	NC_008278	GGCG	2	8	7303	7310	0 %	0 %	75 %	25 %	111219512
36	NC_008278	GGGC	2	8	7702	7709	0 %	0 %	75 %	25 %	111219512
37	NC_008278	GGCC	2	8	7969	7976	0 %	0 %	50 %	50 %	111219512
38	NC_008278	TGGC	2	8	8406	8413	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_008278	CCCG	2	8	8850	8857	0 %	0 %	25 %	75 %	111219513
40	NC_008278	CGAC	2	8	9113	9120	25 %	0 %	25 %	50 %	111219513
41	NC_008278	GACC	2	8	10071	10078	25 %	0 %	25 %	50 %	111219513
42	NC_008278	GCCC	2	8	11163	11170	0 %	0 %	25 %	75 %	111219514
43	NC_008278	GCCG	2	8	11268	11275	0 %	0 %	50 %	50 %	111219514
44	NC_008278	CGGG	2	8	11390	11397	0 %	0 %	75 %	25 %	111219514
45	NC_008278	CCGG	2	8	11459	11466	0 %	0 %	50 %	50 %	111219514
46	NC_008278	CGGC	2	8	11972	11979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008278	CGCC	2	8	12077	12084	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_008278	GCCC	2	8	12157	12164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_008278	GTCC	2	8	12211	12218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_008278	CGGC	2	8	12301	12308	0 %	0 %	50 %	50 %	111219515
51	NC_008278	CGCC	2	8	12311	12318	0 %	0 %	25 %	75 %	111219515
52	NC_008278	CCGC	3	12	12521	12532	0 %	0 %	25 %	75 %	111219515
53	NC_008278	GCCG	2	8	12538	12545	0 %	0 %	50 %	50 %	111219515
54	NC_008278	GCTG	2	8	12743	12750	0 %	25 %	50 %	25 %	111219515
55	NC_008278	ACGG	2	8	12903	12910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_008278	GGCC	2	8	13823	13830	0 %	0 %	50 %	50 %	111219517
57	NC_008278	GGCC	2	8	13865	13872	0 %	0 %	50 %	50 %	111219517
58	NC_008278	GTGC	2	8	14199	14206	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008278	CGGG	2	8	14360	14367	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_008278	CGGG	2	8	14493	14500	0 %	0 %	75 %	25 %	111219518
61	NC_008278	CGGG	2	8	14628	14635	0 %	0 %	75 %	25 %	111219518
62	NC_008278	CCGC	2	8	14828	14835	0 %	0 %	25 %	75 %	111219518
63	NC_008278	GCCG	2	8	15138	15145	0 %	0 %	50 %	50 %	111219518
64	NC_008278	CGGC	2	8	15744	15751	0 %	0 %	50 %	50 %	111219519
65	NC_008278	GGGC	2	8	16332	16339	0 %	0 %	75 %	25 %	111219520
66	NC_008278	CCCG	2	8	17025	17032	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_008278	GCCG	2	8	17160	17167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008278	CGGA	2	8	17204	17211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_008278	CCCG	2	8	17321	17328	0 %	0 %	25 %	75 %	111219523
70	NC_008278	CTGC	2	8	17747	17754	0 %	25 %	25 %	50 %	111219523
71	NC_008278	CGCC	2	8	17861	17868	0 %	0 %	25 %	75 %	111219523
72	NC_008278	CCCG	2	8	18030	18037	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_008278	CGGG	2	8	18384	18391	0 %	0 %	75 %	25 %	111219524
74	NC_008278	CGGG	3	12	18851	18862	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_008278	CGGC	2	8	18945	18952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008278	CCGG	2	8	19005	19012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_008278	CGGC	2	8	19177	19184	0 %	0 %	50 %	50 %	111219526
78	NC_008278	GACT	2	8	19695	19702	25 %	25 %	25 %	25 %	111219526
79	NC_008278	CGGT	2	8	19911	19918	0 %	25 %	50 %	25 %	111219527
80	NC_008278	CGGC	2	8	19925	19932	0 %	0 %	50 %	50 %	111219527
81	NC_008278	AGCG	2	8	20240	20247	25 %	0 %	50 %	25 %	111219527
82	NC_008278	CGGC	2	8	20260	20267	0 %	0 %	50 %	50 %	111219527
83	NC_008278	ACCG	2	8	20929	20936	25 %	0 %	25 %	50 %	111219527
84	NC_008278	AGGG	2	8	22144	22151	25 %	0 %	75 %	0 %	111219529
85	NC_008278	GCCC	2	8	22265	22272	0 %	0 %	25 %	75 %	111219529
86	NC_008278	CCGC	2	8	22779	22786	0 %	0 %	25 %	75 %	111219529
87	NC_008278	TCCG	2	8	23131	23138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_008278	CGGC	2	8	23241	23248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_008278	CCGG	2	8	23260	23267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_008278	GCGT	2	8	23274	23281	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_008278	GACC	2	8	23382	23389	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_008278	GGCC	2	8	24193	24200	0 %	0 %	50 %	50 %	111219531
93	NC_008278	GTCG	2	8	24401	24408	0 %	25 %	50 %	25 %	111219531
94	NC_008278	CGCC	2	8	24542	24549	0 %	0 %	25 %	75 %	111219531
95	NC_008278	CTGA	2	8	24644	24651	25 %	25 %	25 %	25 %	111219531
96	NC_008278	CCGG	2	8	24673	24680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_008278	CGTG	2	8	24722	24729	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008278	CCGT	2	8	24811	24818	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_008278	TCCA	2	8	24825	24832	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_008278	CGGG	2	8	24973	24980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008278	GGCC	2	8	25327	25334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_008278	ACCA	2	8	25603	25610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008278	GCCC	2	8	25645	25652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_008278	CACG	2	8	26679	26686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008278	CGGC	2	8	26731	26738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008278	GCCG	2	8	26739	26746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_008278	TCCC	2	8	26809	26816	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
108	NC_008278	CCCT	2	8	26937	26944	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_008278	GCGG	2	8	27507	27514	0 %	0 %	75 %	25 %	111219534
110	NC_008278	CCGG	2	8	27695	27702	0 %	0 %	50 %	50 %	111219534
111	NC_008278	GCCC	2	8	28121	28128	0 %	0 %	25 %	75 %	111219534
112	NC_008278	CGGC	2	8	28156	28163	0 %	0 %	50 %	50 %	111219534
113	NC_008278	GGGA	2	8	28174	28181	25 %	0 %	75 %	0 %	111219534
114	NC_008278	GCGG	2	8	28191	28198	0 %	0 %	75 %	25 %	111219534
115	NC_008278	CCGC	2	8	28208	28215	0 %	0 %	25 %	75 %	111219534
116	NC_008278	CCGG	2	8	28522	28529	0 %	0 %	50 %	50 %	111219534
117	NC_008278	CGGC	2	8	28587	28594	0 %	0 %	50 %	50 %	111219534
118	NC_008278	GCCG	2	8	28706	28713	0 %	0 %	50 %	50 %	111219534
119	NC_008278	CCGG	2	8	28834	28841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008278	GTTC	2	8	29012	29019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_008278	TTCT	2	8	29469	29476	0 %	75 %	0 %	25 %	111219535
122	NC_008278	GGCC	2	8	29615	29622	0 %	0 %	50 %	50 %	111219535
123	NC_008278	GTTC	2	8	29729	29736	0 %	50 %	25 %	25 %	111219535
124	NC_008278	AGAT	2	8	29869	29876	50 %	25 %	25 %	0 %	111219535
125	NC_008278	GCCG	2	8	30050	30057	0 %	0 %	50 %	50 %	111219535
126	NC_008278	GCCG	2	8	30095	30102	0 %	0 %	50 %	50 %	111219535
127	NC_008278	CGCC	2	8	30352	30359	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_008278	CGGT	2	8	30489	30496	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_008278	GCCT	2	8	30517	30524	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008278	CGTC	2	8	30779	30786	0 %	25 %	25 %	50 %	111219536
131	NC_008278	TGAG	2	8	30952	30959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008278	GCGG	2	8	31390	31397	0 %	0 %	75 %	25 %	111219537
133	NC_008278	CGGG	2	8	31418	31425	0 %	0 %	75 %	25 %	111219537
134	NC_008278	GGCG	2	8	31675	31682	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
135	NC_008278	CGGC	2	8	31813	31820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008278	GGTC	2	8	31821	31828	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008278	AGAC	2	8	31914	31921	50 %	0 %	25 %	25 %	111219538
138	NC_008278	CGGC	2	8	31942	31949	0 %	0 %	50 %	50 %	111219538
139	NC_008278	CGCC	2	8	31958	31965	0 %	0 %	25 %	75 %	111219538
140	NC_008278	CGCC	2	8	32207	32214	0 %	0 %	25 %	75 %	111219538
141	NC_008278	GCCG	2	8	32295	32302	0 %	0 %	50 %	50 %	111219538
142	NC_008278	GGCA	2	8	32392	32399	25 %	0 %	50 %	25 %	111219538
143	NC_008278	GAAC	2	8	32540	32547	50 %	0 %	25 %	25 %	111219538
144	NC_008278	GCGG	2	8	32741	32748	0 %	0 %	75 %	25 %	111219538
145	NC_008278	GAGC	2	8	32808	32815	25 %	0 %	50 %	25 %	111219538
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147	NC_008278	TCCA	2	8	33477	33484	25 %	25 %	0 %	50 %	111219539
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