MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo

Total Repeats: 614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008277	TGACCA	2	12	2208	2219	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	111114825
2	NC_008277	TTTTTA	2	12	2655	2666	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	111114825
3	NC_008277	TTAAAC	2	12	2853	2864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111114825
4	NC_008277	GGATTA	2	12	3369	3380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
5	NC_008277	AAGAAA	2	12	6914	6925	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	111114828
6	NC_008277	CAATAG	2	12	8410	8421	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	111114830
7	NC_008277	CAATAA	2	12	8833	8844	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	111114830
8	NC_008277	TCTATT	2	12	8865	8876	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	111114830
9	NC_008277	AAAAAT	2	12	9240	9251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114831
10	NC_008277	AATAAA	2	12	9273	9284	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114831
11	NC_008277	TAAAGA	2	12	9699	9710	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	111114831
12	NC_008277	TAAAAA	2	12	9743	9754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114831
13	NC_008277	AGACAA	2	12	10892	10903	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	111114833
14	NC_008277	CAGATA	2	12	10939	10950	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	111114833
15	NC_008277	AAAATT	2	12	13255	13266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114836
16	NC_008277	ATTCAT	2	12	14973	14984	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	111114837
17	NC_008277	GAAAAA	2	12	15618	15629	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	111114839
18	NC_008277	TAAAGG	2	12	16083	16094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	111114839
19	NC_008277	AACTAT	2	12	18832	18843	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111114842
20	NC_008277	GTAAAT	2	12	26172	26183	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	111114849
21	NC_008277	TAACCT	2	12	27405	27416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114851
22	NC_008277	TCAAAC	2	12	28525	28536	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	111114853
23	NC_008277	ATTTAA	2	12	31950	31961	50 %	50 %	0 %	0 %	111114858
24	NC_008277	TATCAA	2	12	32610	32621	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111114858
25	NC_008277	TAAAAA	2	12	36325	36336	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114860
26	NC_008277	AATATT	2	12	38239	38250	50 %	50 %	0 %	0 %	111114862
27	NC_008277	ATTTTT	2	12	38482	38493	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	111114862
28	NC_008277	TAAATT	2	12	38746	38757	50 %	50 %	0 %	0 %	111114862
29	NC_008277	AATATA	2	12	39658	39669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114863
30	NC_008277	AAAATC	2	12	40862	40873	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	111114864
31	NC_008277	CAAAAA	2	12	42212	42223	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	111114865
32	NC_008277	TCAATA	2	12	42306	42317	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111114866
33	NC_008277	ATTAAA	2	12	42612	42623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114866
34	NC_008277	CTCTTT	2	12	43470	43481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114867
35	NC_008277	TAAATT	2	12	43554	43565	50 %	50 %	0 %	0 %	111114867
36	NC_008277	TATATC	2	12	47363	47374	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	111114871
37	NC_008277	ATTTTT	2	12	47400	47411	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	111114871
38	NC_008277	AAATAA	2	12	48144	48155	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114872
39	NC_008277	TAAAAA	2	12	49415	49426	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114874
40	NC_008277	AATAAA	2	12	49753	49764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114874
41	NC_008277	TCAAAT	2	12	51199	51210	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111114877
42	NC_008277	TTTATT	2	12	53801	53812	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	111114879
43	NC_008277	TTTAAA	2	12	54213	54224	50 %	50 %	0 %	0 %	111114879
44	NC_008277	TAAATT	2	12	55414	55425	50 %	50 %	0 %	0 %	111114880
45	NC_008277	TTAAAA	2	12	57081	57092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114883
46	NC_008277	AAATTT	2	12	57102	57113	50 %	50 %	0 %	0 %	111114883
47	NC_008277	AAAAAT	2	12	57422	57433	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114883
48	NC_008277	AATCAA	2	12	58976	58987	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	111114885
49	NC_008277	TAAATT	2	12	62445	62456	50 %	50 %	0 %	0 %	111114889
50	NC_008277	TTTAAG	2	12	63155	63166	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	111114890
51	NC_008277	GATATT	2	12	63935	63946	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	111114891
52	NC_008277	AAAAAT	2	12	67601	67612	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114894
53	NC_008277	TATTTT	2	12	69146	69157	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	111114894
54	NC_008277	ATAAAA	2	12	69362	69373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114895
55	NC_008277	TAATTT	2	12	69504	69515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114895
56	NC_008277	GAAATT	2	12	71174	71185	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	111114897
57	NC_008277	AATTGA	2	12	71911	71922	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	111114897
58	NC_008277	AATAGA	2	12	73045	73056	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	111114898
59	NC_008277	TGAATA	2	12	74049	74060	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	111114899
60	NC_008277	TTGCTA	2	12	75957	75968	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	111114901
61	NC_008277	TGGAAT	2	12	77154	77165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114902
62	NC_008277	TAAGCT	2	12	77312	77323	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	111114902
63	NC_008277	AAAAGA	2	12	77403	77414	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	111114902
64	NC_008277	TTTAGA	2	12	77537	77548	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	111114903
65	NC_008277	CATTTG	2	12	78217	78228	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	111114903
66	NC_008277	AGGAAT	2	12	79950	79961	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	111114905
67	NC_008277	TTAAAT	2	12	80054	80065	50 %	50 %	0 %	0 %	111114905
68	NC_008277	TTTTAT	2	12	80422	80433	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	111114905
69	NC_008277	ATAAAA	2	12	80496	80507	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114905
70	NC_008277	TACAAA	2	12	81041	81052	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	111114906
71	NC_008277	AAAGAA	2	12	81509	81520	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	111114907
72	NC_008277	AATACT	2	12	85561	85572	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111114910
73	NC_008277	AGATAA	2	12	87711	87722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	111114913
74	NC_008277	ATAAAA	2	12	87998	88009	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114913
75	NC_008277	TTAAAC	2	12	88400	88411	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111114913
76	NC_008277	CAATTT	2	12	88419	88430	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	111114913
77	NC_008277	ATTTTT	2	12	89396	89407	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	111114914
78	NC_008277	CAGAAA	2	12	90405	90416	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	111114915
79	NC_008277	TAACTT	2	12	92711	92722	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	111114917
80	NC_008277	TCTTTC	2	12	95101	95112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114920
81	NC_008277	GAAATA	2	12	96031	96042	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	111114920
82	NC_008277	AACATA	2	12	98268	98279	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	111114922
83	NC_008277	TGGACT	2	12	99829	99840	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	111114923
84	NC_008277	TCAAAC	2	12	100098	100109	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	111114924
85	NC_008277	GAAATA	2	12	105022	105033	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	111114928
86	NC_008277	TTGCTG	2	12	105635	105646	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	111114930
87	NC_008277	GGAATT	2	12	108313	108324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114932
88	NC_008277	TAAACT	2	12	111527	111538	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111114935
89	NC_008277	CAATAT	2	12	111577	111588	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111114936
90	NC_008277	AAATAG	2	12	114177	114188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	111114938
91	NC_008277	AGATCA	2	12	117491	117502	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	111114942
92	NC_008277	AATTTC	2	12	119499	119510	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	111114945
93	NC_008277	TAATTT	2	12	119808	119819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114945
94	NC_008277	CTTTCT	2	12	123286	123297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114950
95	NC_008277	CATTTC	2	12	123982	123993	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	111114951
96	NC_008277	AATTCT	2	12	124560	124571	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	111114952
97	NC_008277	ATCTGA	2	12	127861	127872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	111114955
98	NC_008277	ATTTTT	2	12	132313	132324	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	111114958
99	NC_008277	ATTTCC	2	12	134706	134717	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	111114959
100	NC_008277	TTAAAA	2	12	135017	135028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114959
101	NC_008277	AATAAA	3	18	135402	135419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114959
102	NC_008277	AAACTA	2	12	136769	136780	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	111114960
103	NC_008277	CCTATA	2	12	138160	138171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114962
104	NC_008277	TCCACT	2	12	138416	138427	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	111114963
105	NC_008277	ATTTTA	2	12	139350	139361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114963
106	NC_008277	ATCCCA	2	12	140184	140195	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	111114963
107	NC_008277	TCCTCA	2	12	142248	142259	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	111114964
108	NC_008277	CTTATT	2	12	142280	142291	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	111114964
109	NC_008277	ACTAAG	2	12	142308	142319	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	111114964
110	NC_008277	TGGAAT	2	12	142419	142430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114965
111	NC_008277	AAAAGA	2	12	143596	143607	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	111114965
112	NC_008277	AATCAA	2	12	145658	145669	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	111114968
113	NC_008277	TCTAAA	2	12	145956	145967	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111114969
114	NC_008277	TTTCAT	2	12	146764	146775	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	111114969
115	NC_008277	CATTGC	2	12	147151	147162	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	111114970
116	NC_008277	GTCTGA	2	12	147793	147804	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	111114970
117	NC_008277	TCAACT	2	12	149197	149208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114971
118	NC_008277	CAAGAA	2	12	152108	152119	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	111114973
119	NC_008277	TTGGAA	2	12	152207	152218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114973
120	NC_008277	AACTAC	2	12	154592	154603	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	111114975
121	NC_008277	TAAAAA	2	12	156201	156212	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111114976
122	NC_008277	AATACT	2	12	156334	156345	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111114976
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