MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008277	AATG	2	8	96	103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008277	TTAT	2	8	8113	8120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008277	AAGT	2	8	15573	15580	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008277	TAAT	2	8	19781	19788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008277	ATTT	2	8	25503	25510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008277	TATT	2	8	37920	37927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008277	ATTT	2	8	40509	40516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008277	ATAA	2	8	45776	45783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008277	AATT	2	8	46207	46214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008277	AAAT	2	8	46458	46465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008277	AAGC	2	8	46625	46632	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_008277	ATAA	2	8	47622	47629	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008277	TAAT	2	8	47646	47653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008277	ACAT	2	8	56527	56534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_008277	AATC	2	8	57743	57750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_008277	ATTT	2	8	58789	58796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008277	CAAA	2	8	60281	60288	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_008277	GAAA	2	8	69868	69875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008277	AAAT	2	8	69876	69883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008277	GAAA	2	8	69962	69969	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008277	TCTT	2	8	80546	80553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_008277	TTTA	2	8	80641	80648	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008277	TACA	2	8	83674	83681	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_008277	TCCT	2	8	85576	85583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_008277	AATT	2	8	98496	98503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008277	ATAA	2	8	98531	98538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008277	ACGA	2	8	99929	99936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_008277	TTTA	2	8	101098	101105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008277	ATTT	2	8	101114	101121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008277	TAAT	3	12	102634	102645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008277	TTAA	2	8	107905	107912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008277	TTTA	2	8	112519	112526	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008277	TATT	2	8	114290	114297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008277	TTAT	2	8	114324	114331	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008277	CCAA	2	8	120329	120336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_008277	AAAC	2	8	120353	120360	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_008277	TATT	2	8	130868	130875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008277	AATA	2	8	137716	137723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008277	TTAA	2	8	143688	143695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008277	TAAT	2	8	147084	147091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008277	AAAT	2	8	150389	150396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008277	GGTA	2	8	155840	155847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008277	AATC	2	8	162282	162289	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_008277	AAAT	2	8	162509	162516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008277	ATTA	2	8	168873	168880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008277	AAAC	2	8	170627	170634	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_008277	TTTA	2	8	188012	188019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008277	ATCT	2	8	188520	188527	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_008277	GATT	2	8	189476	189483	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008277	GCAA	2	8	190941	190948	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008277	ATAA	2	8	192973	192980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008277	CATT	2	8	193048	193055	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_008277	TATT	2	8	193107	193114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008277	TTTA	2	8	205554	205561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008277	TTAA	2	8	205593	205600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008277	ATTT	2	8	205901	205908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008277	ATTA	2	8	210685	210692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008277	ACAT	2	8	227701	227708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_008277	TAAA	2	8	230408	230415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008277	AATA	2	8	230498	230505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008277	TCAA	2	8	237195	237202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008277	GAAA	2	8	244436	244443	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008277	TTAA	2	8	244488	244495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008277	ATTA	2	8	244541	244548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008277	GAAA	2	8	244554	244561	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_008277	CAAA	2	8	251185	251192	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_008277	ATTT	2	8	251203	251210	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008277	AATT	2	8	255355	255362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008277	AAAC	2	8	309995	310002	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_008277	AAAT	2	8	310027	310034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008277	TAAA	2	8	317122	317129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008277	TTAA	2	8	318587	318594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008277	ATTA	2	8	325220	325227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008277	TATT	2	8	333488	333495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008277	AATA	2	8	333523	333530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008277	TTAT	2	8	333583	333590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008277	AATA	2	8	333794	333801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008277	TAAA	2	8	337099	337106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008277	TAAA	2	8	337182	337189	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008277	TAAA	2	8	338926	338933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008277	AATA	2	8	339080	339087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008277	ACAT	2	8	343832	343839	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_008277	TAAA	2	8	345201	345208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008277	TATT	2	8	354159	354166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008277	ATTC	2	8	367205	367212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_008277	GATT	2	8	367385	367392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008277	ATTT	2	8	367428	367435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008277	TTTA	2	8	367480	367487	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008277	AATA	2	8	373038	373045	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008277	ATTT	2	8	373046	373053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008277	ATAG	2	8	383062	383069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008277	TAAA	2	8	387802	387809	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008277	TATT	2	8	390688	390695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008277	AATA	2	8	390703	390710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008277	CAAA	2	8	391820	391827	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008277	CATT	2	8	393217	393224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_008277	AATC	2	8	393464	393471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_008277	CAAA	2	8	393504	393511	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_008277	AATC	2	8	395145	395152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_008277	CAAA	2	8	395185	395192	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_008277	AATC	2	8	397369	397376	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_008277	ATTT	2	8	397390	397397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_008277	TCCT	2	8	411612	411619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008277	CAAA	2	8	416520	416527	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_008277	TAAT	2	8	418774	418781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008277	CTTA	2	8	418787	418794	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008277	AAAT	2	8	426718	426725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008277	TTAA	2	8	438222	438229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008277	TACG	2	8	438695	438702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008277	ACCT	2	8	438759	438766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008277	CTAC	2	8	438829	438836	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_008277	GTTT	2	8	439590	439597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008277	CTAA	2	8	439725	439732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_008277	TCGC	2	8	440215	440222	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008277	TAGC	2	8	440314	440321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008277	TTAA	2	8	441459	441466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008277	TACG	2	8	441932	441939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_008277	ACCT	2	8	441996	442003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_008277	CTAC	2	8	442066	442073	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_008277	GTTT	2	8	442827	442834	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008277	CTAA	2	8	442962	442969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_008277	TCGC	2	8	443452	443459	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_008277	TAGC	2	8	443551	443558	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_008277	AAAT	2	8	443816	443823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008277	TCAA	2	8	445637	445644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008277	TAAA	2	8	446490	446497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008277	CATA	2	8	446814	446821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_008277	AATA	2	8	447024	447031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008277	CTAC	2	8	447460	447467	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_008277	AGTA	2	8	447534	447541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008277	ATTC	2	8	447639	447646	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_008277	CAAC	2	8	447800	447807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_008277	ATTA	2	8	447918	447925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008277	CTAC	2	8	449194	449201	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_008277	AACT	2	8	449720	449727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_008277	AATT	2	8	449787	449794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008277	CTTA	2	8	450028	450035	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_008277	TTTA	2	8	451575	451582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_008277	TATC	2	8	451623	451630	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_008277	AAAG	2	8	451692	451699	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008277	TTAA	2	8	452039	452046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008277	AAAC	2	8	452491	452498	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_008277	AATA	2	8	452521	452528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_008277	TTTA	2	8	454777	454784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008277	TTTA	2	8	454821	454828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008277	ATAA	2	8	454844	454851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008277	AAAC	2	8	454930	454937	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_008277	CATT	2	8	460291	460298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_008277	TACA	2	8	460353	460360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_008277	ACAA	2	8	460386	460393	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_008277	ATTT	2	8	469145	469152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.