MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo

Total Repeats: 13118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008277	CAA	2	6	145	150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008277	TTC	2	6	243	248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008277	ACT	2	6	279	284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_008277	AAC	2	6	299	304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_008277	TAA	2	6	368	373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008277	CAA	2	6	507	512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008277	CTA	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114824
8	NC_008277	ATA	2	6	640	645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114824
9	NC_008277	ATA	2	6	742	747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114824
10	NC_008277	AGC	2	6	753	758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114824
11	NC_008277	TCC	2	6	852	857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111114824
12	NC_008277	TCC	2	6	954	959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111114824
13	NC_008277	CTA	2	6	1159	1164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114824
14	NC_008277	TCA	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114824
15	NC_008277	CAA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114824
16	NC_008277	TCG	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111114824
17	NC_008277	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114824
18	NC_008277	TCA	2	6	1427	1432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114824
19	NC_008277	GCA	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114825
20	NC_008277	TAG	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114825
21	NC_008277	ATT	2	6	1631	1636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114825
22	NC_008277	TAT	2	6	1853	1858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114825
23	NC_008277	TCA	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114825
24	NC_008277	GAA	2	6	1959	1964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114825
25	NC_008277	TCC	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111114825
26	NC_008277	CTC	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111114825
27	NC_008277	AGA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114825
28	NC_008277	ATT	3	9	2240	2248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114825
29	NC_008277	TAT	2	6	2251	2256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114825
30	NC_008277	ATC	2	6	2336	2341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114825
31	NC_008277	AAG	2	6	2758	2763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114825
32	NC_008277	TAA	2	6	2772	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114825
33	NC_008277	CTT	2	6	2782	2787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114825
34	NC_008277	TAA	2	6	3079	3084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008277	ATT	2	6	3099	3104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008277	TAT	2	6	3110	3115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008277	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008277	TAA	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
39	NC_008277	ATT	2	6	3334	3339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114826
40	NC_008277	ATT	2	6	3402	3407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114826
41	NC_008277	TAA	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
42	NC_008277	TGG	2	6	3587	3592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111114826
43	NC_008277	ATA	2	6	3621	3626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
44	NC_008277	ATA	2	6	3640	3645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
45	NC_008277	TAA	2	6	3661	3666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
46	NC_008277	TGA	2	6	3695	3700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
47	NC_008277	ATA	2	6	3732	3737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
48	NC_008277	AAT	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
49	NC_008277	ATA	2	6	3985	3990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
50	NC_008277	CTA	2	6	4029	4034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
51	NC_008277	ATC	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
52	NC_008277	GTA	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
53	NC_008277	ATG	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
54	NC_008277	GAT	2	6	4338	4343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
55	NC_008277	TAC	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
56	NC_008277	ATT	2	6	4457	4462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114826
57	NC_008277	ACT	2	6	4507	4512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
58	NC_008277	ACA	2	6	4548	4553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114826
59	NC_008277	ATC	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
60	NC_008277	AGG	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111114826
61	NC_008277	TAA	2	6	4793	4798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
62	NC_008277	TTG	2	6	4804	4809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111114826
63	NC_008277	TAA	2	6	4846	4851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
64	NC_008277	CTA	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
65	NC_008277	TAA	2	6	4910	4915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
66	NC_008277	TAA	2	6	4921	4926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
67	NC_008277	ATA	2	6	4943	4948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
68	NC_008277	ATA	2	6	4969	4974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008277	CAC	2	6	4982	4987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_008277	TTC	2	6	5019	5024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
71	NC_008277	TAC	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114827
72	NC_008277	TCA	2	6	5153	5158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114827
73	NC_008277	TCT	2	6	5188	5193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
74	NC_008277	CTT	2	6	5272	5277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
75	NC_008277	CTT	2	6	5301	5306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
76	NC_008277	TCA	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114827
77	NC_008277	CCA	2	6	5496	5501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111114827
78	NC_008277	CTT	2	6	5570	5575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
79	NC_008277	TTA	2	6	5834	5839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114827
80	NC_008277	TAA	2	6	5949	5954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114827
81	NC_008277	CTT	2	6	5970	5975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
82	NC_008277	TAC	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114827
83	NC_008277	ACC	2	6	6126	6131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111114828
84	NC_008277	CAG	2	6	6335	6340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114828
85	NC_008277	TTA	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114828
86	NC_008277	AGC	2	6	6536	6541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114828
87	NC_008277	ATT	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114828
88	NC_008277	TAG	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114828
89	NC_008277	ACA	3	9	6683	6691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114828
90	NC_008277	ACT	2	6	6697	6702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114828
91	NC_008277	AAT	2	6	6723	6728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114828
92	NC_008277	TAA	2	6	6785	6790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114828
93	NC_008277	ATA	2	6	6829	6834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114828
94	NC_008277	TAG	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114828
95	NC_008277	TAA	2	6	6889	6894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114828
96	NC_008277	ATA	2	6	6926	6931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114828
97	NC_008277	TAA	2	6	6941	6946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114828
98	NC_008277	CTC	2	6	7163	7168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_008277	GCT	2	6	7182	7187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_008277	TAA	2	6	7211	7216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008277	ATT	2	6	7383	7388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114829
102	NC_008277	TCT	2	6	7487	7492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114829
103	NC_008277	TTA	2	6	7504	7509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114829
104	NC_008277	ATT	2	6	7731	7736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114829
105	NC_008277	CTT	2	6	7746	7751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114829
106	NC_008277	TCA	2	6	7768	7773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114829
107	NC_008277	TAA	2	6	7781	7786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114829
108	NC_008277	TAT	2	6	7832	7837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114829
109	NC_008277	TCA	2	6	7987	7992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114829
110	NC_008277	TGC	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111114829
111	NC_008277	TAT	2	6	8129	8134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008277	CTA	2	6	8307	8312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114830
113	NC_008277	ATT	2	6	8353	8358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114830
114	NC_008277	TAA	2	6	8452	8457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114830
115	NC_008277	GAA	2	6	8505	8510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114830
116	NC_008277	GTT	2	6	8520	8525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111114830
117	NC_008277	ATA	2	6	8613	8618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114830
118	NC_008277	ACG	2	6	8695	8700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114830
119	NC_008277	TAA	2	6	8707	8712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114830
120	NC_008277	GAA	2	6	8853	8858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114830
121	NC_008277	AAT	2	6	8955	8960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
122	NC_008277	ATA	2	6	8986	8991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
123	NC_008277	TGA	2	6	9003	9008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114831
124	NC_008277	AAC	2	6	9087	9092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114831
125	NC_008277	TAA	2	6	9210	9215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
126	NC_008277	AAT	2	6	9216	9221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
127	NC_008277	ATT	2	6	9222	9227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114831
128	NC_008277	TTA	2	6	9457	9462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114831
129	NC_008277	AGT	2	6	9561	9566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114831
130	NC_008277	GTA	2	6	9604	9609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114831
131	NC_008277	AAT	2	6	9645	9650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
132	NC_008277	TAA	2	6	9672	9677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
133	NC_008277	TAA	2	6	9716	9721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
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259	NC_008277	CAA	2	6	18216	18221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114842
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263	NC_008277	AAT	2	6	18435	18440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114842
264	NC_008277	CAA	2	6	18705	18710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114842
265	NC_008277	CTT	2	6	18714	18719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114842
266	NC_008277	TCA	2	6	18893	18898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114842
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280	NC_008277	GTA	2	6	20121	20126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114843
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