MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo

Total Repeats: 12237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008277	CTA	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114824
2	NC_008277	ATA	2	6	640	645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114824
3	NC_008277	ATA	2	6	742	747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114824
4	NC_008277	AGC	2	6	753	758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114824
5	NC_008277	TCC	2	6	852	857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111114824
6	NC_008277	TCC	2	6	954	959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111114824
7	NC_008277	CTA	2	6	1159	1164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114824
8	NC_008277	TCA	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114824
9	NC_008277	CAA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114824
10	NC_008277	TCG	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111114824
11	NC_008277	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114824
12	NC_008277	TCA	2	6	1427	1432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114824
13	NC_008277	GCA	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114825
14	NC_008277	TAG	2	6	1618	1623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114825
15	NC_008277	ATT	2	6	1631	1636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114825
16	NC_008277	TAT	2	6	1853	1858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114825
17	NC_008277	TCA	2	6	1860	1865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114825
18	NC_008277	GAA	2	6	1959	1964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114825
19	NC_008277	TCC	2	6	1967	1972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111114825
20	NC_008277	CTC	2	6	2020	2025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111114825
21	NC_008277	AGA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114825
22	NC_008277	ATT	3	9	2240	2248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114825
23	NC_008277	TAT	2	6	2251	2256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114825
24	NC_008277	ATC	2	6	2336	2341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114825
25	NC_008277	AAG	2	6	2758	2763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114825
26	NC_008277	TAA	2	6	2772	2777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114825
27	NC_008277	CTT	2	6	2782	2787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114825
28	NC_008277	TAA	2	6	3313	3318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
29	NC_008277	ATT	2	6	3334	3339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114826
30	NC_008277	ATT	2	6	3402	3407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114826
31	NC_008277	TAA	2	6	3430	3435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
32	NC_008277	TGG	2	6	3587	3592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111114826
33	NC_008277	ATA	2	6	3621	3626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
34	NC_008277	ATA	2	6	3640	3645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
35	NC_008277	TAA	2	6	3661	3666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
36	NC_008277	TGA	2	6	3695	3700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
37	NC_008277	ATA	2	6	3732	3737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
38	NC_008277	AAT	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
39	NC_008277	ATA	2	6	3985	3990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
40	NC_008277	CTA	2	6	4029	4034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
41	NC_008277	ATC	2	6	4143	4148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
42	NC_008277	GTA	2	6	4173	4178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
43	NC_008277	ATG	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
44	NC_008277	GAT	2	6	4338	4343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114826
45	NC_008277	TAC	2	6	4433	4438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
46	NC_008277	ATT	2	6	4457	4462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114826
47	NC_008277	ACT	2	6	4507	4512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
48	NC_008277	ACA	2	6	4548	4553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114826
49	NC_008277	ATC	2	6	4577	4582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
50	NC_008277	AGG	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	111114826
51	NC_008277	TAA	2	6	4793	4798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
52	NC_008277	TTG	2	6	4804	4809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111114826
53	NC_008277	TAA	2	6	4846	4851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
54	NC_008277	CTA	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114826
55	NC_008277	TAA	2	6	4910	4915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
56	NC_008277	TAA	2	6	4921	4926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
57	NC_008277	ATA	2	6	4943	4948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114826
58	NC_008277	TTC	2	6	5019	5024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
59	NC_008277	TAC	2	6	5101	5106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114827
60	NC_008277	TCA	2	6	5153	5158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114827
61	NC_008277	TCT	2	6	5188	5193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
62	NC_008277	CTT	2	6	5272	5277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
63	NC_008277	CTT	2	6	5301	5306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
64	NC_008277	TCA	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114827
65	NC_008277	CCA	2	6	5496	5501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111114827
66	NC_008277	CTT	2	6	5570	5575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
67	NC_008277	TTA	2	6	5834	5839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114827
68	NC_008277	TAA	2	6	5949	5954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114827
69	NC_008277	CTT	2	6	5970	5975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114827
70	NC_008277	TAC	2	6	5992	5997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114827
71	NC_008277	ACC	2	6	6126	6131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111114828
72	NC_008277	CAG	2	6	6335	6340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114828
73	NC_008277	TTA	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114828
74	NC_008277	AGC	2	6	6536	6541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114828
75	NC_008277	ATT	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114828
76	NC_008277	TAG	2	6	6611	6616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114828
77	NC_008277	ACA	3	9	6683	6691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114828
78	NC_008277	ACT	2	6	6697	6702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114828
79	NC_008277	AAT	2	6	6723	6728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114828
80	NC_008277	TAA	2	6	6785	6790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114828
81	NC_008277	ATA	2	6	6829	6834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114828
82	NC_008277	TAG	2	6	6853	6858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114828
83	NC_008277	TAA	2	6	6889	6894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114828
84	NC_008277	ATA	2	6	6926	6931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114828
85	NC_008277	TAA	2	6	6941	6946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114828
86	NC_008277	ATT	2	6	7383	7388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114829
87	NC_008277	TCT	2	6	7487	7492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114829
88	NC_008277	TTA	2	6	7504	7509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114829
89	NC_008277	ATT	2	6	7731	7736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114829
90	NC_008277	CTT	2	6	7746	7751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114829
91	NC_008277	TCA	2	6	7768	7773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114829
92	NC_008277	TAA	2	6	7781	7786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114829
93	NC_008277	TAT	2	6	7832	7837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114829
94	NC_008277	TCA	2	6	7987	7992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114829
95	NC_008277	TGC	2	6	8002	8007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111114829
96	NC_008277	CTA	2	6	8307	8312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114830
97	NC_008277	ATT	2	6	8353	8358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114830
98	NC_008277	TAA	2	6	8452	8457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114830
99	NC_008277	GAA	2	6	8505	8510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114830
100	NC_008277	GTT	2	6	8520	8525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111114830
101	NC_008277	ATA	2	6	8613	8618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114830
102	NC_008277	ACG	2	6	8695	8700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114830
103	NC_008277	TAA	2	6	8707	8712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114830
104	NC_008277	GAA	2	6	8853	8858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114830
105	NC_008277	AAT	2	6	8955	8960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
106	NC_008277	ATA	2	6	8986	8991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
107	NC_008277	TGA	2	6	9003	9008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114831
108	NC_008277	AAC	2	6	9087	9092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114831
109	NC_008277	TAA	2	6	9210	9215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
110	NC_008277	AAT	2	6	9216	9221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
111	NC_008277	ATT	2	6	9222	9227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114831
112	NC_008277	TTA	2	6	9457	9462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111114831
113	NC_008277	AGT	2	6	9561	9566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114831
114	NC_008277	GTA	2	6	9604	9609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114831
115	NC_008277	AAT	2	6	9645	9650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
116	NC_008277	TAA	2	6	9672	9677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
117	NC_008277	TAA	2	6	9716	9721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
118	NC_008277	ACA	2	6	9848	9853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114831
119	NC_008277	AAT	2	6	9933	9938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114831
120	NC_008277	ATA	2	6	9981	9986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114832
121	NC_008277	GCA	2	6	10081	10086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114832
122	NC_008277	TAA	2	6	10192	10197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114832
123	NC_008277	AGA	2	6	10406	10411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114833
124	NC_008277	AGT	2	6	10425	10430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114833
125	NC_008277	GCA	2	6	10548	10553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114833
126	NC_008277	ATA	2	6	10645	10650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114833
127	NC_008277	AAG	2	6	10681	10686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114833
128	NC_008277	TGT	2	6	10711	10716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111114833
129	NC_008277	AGC	2	6	10766	10771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111114833
130	NC_008277	AGA	2	6	10808	10813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111114833
131	NC_008277	ACT	2	6	11058	11063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114833
132	NC_008277	TGA	2	6	11281	11286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111114834
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135	NC_008277	ATA	2	6	11358	11363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114834
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154	NC_008277	ATA	2	6	12719	12724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114836
155	NC_008277	ATA	2	6	12737	12742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114836
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247	NC_008277	AAT	2	6	18435	18440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114842
248	NC_008277	CAA	2	6	18705	18710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111114842
249	NC_008277	CTT	2	6	18714	18719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114842
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252	NC_008277	ATC	2	6	19231	19236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111114842
253	NC_008277	ACC	2	6	19237	19242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111114842
254	NC_008277	AAT	4	12	19243	19254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111114842
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256	NC_008277	TTC	2	6	19323	19328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111114842
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