MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008277	TA	3	6	27	32	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008277	AT	3	6	480	485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008277	AC	3	6	486	491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_008277	AT	3	6	8119	8124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008277	TC	3	6	39584	39589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_008277	CT	3	6	46683	46688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_008277	AT	3	6	49067	49072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008277	TA	3	6	49094	49099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008277	AT	3	6	56512	56517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008277	TG	3	6	70096	70101	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008277	AT	3	6	86589	86594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008277	AT	3	6	93918	93923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008277	TA	3	6	105532	105537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008277	TA	3	6	112482	112487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008277	AG	3	6	112488	112493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008277	TA	3	6	130780	130785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008277	TA	3	6	130804	130809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008277	AT	3	6	132076	132081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008277	TA	3	6	133502	133507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_008277	TA	3	6	137458	137463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008277	AG	3	6	159543	159548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008277	AT	3	6	159553	159558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008277	AT	3	6	164330	164335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008277	TA	3	6	170603	170608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_008277	AT	3	6	182307	182312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008277	TA	3	6	189332	189337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008277	CA	3	6	189455	189460	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_008277	TA	4	8	192997	193004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008277	AT	3	6	202067	202072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008277	AT	3	6	205568	205573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008277	AT	3	6	205697	205702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008277	AT	3	6	208058	208063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008277	AG	3	6	208095	208100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008277	TA	3	6	230472	230477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008277	AT	3	6	237171	237176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008277	AT	3	6	241294	241299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008277	AT	3	6	244331	244336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008277	AT	3	6	244628	244633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_008277	AC	5	10	251272	251281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_008277	TA	3	6	272579	272584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008277	TC	3	6	301717	301722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_008277	AT	3	6	316925	316930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008277	AT	3	6	325598	325603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008277	AT	3	6	326686	326691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008277	AT	3	6	339108	339113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_008277	CT	3	6	367602	367607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_008277	AC	3	6	373057	373062	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_008277	AT	5	10	383034	383043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008277	AT	3	6	387796	387801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008277	CA	3	6	397669	397674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_008277	AT	3	6	399728	399733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_008277	AT	3	6	407431	407436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_008277	TA	3	6	407832	407837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008277	TA	3	6	418034	418039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_008277	CA	3	6	420562	420567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_008277	AT	3	6	426655	426660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_008277	AT	3	6	437572	437577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_008277	TC	3	6	438730	438735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_008277	GC	3	6	438736	438741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_008277	CT	3	6	438877	438882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008277	TA	3	6	440100	440105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008277	AT	4	8	440516	440523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_008277	AT	5	10	440543	440552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_008277	AT	3	6	440809	440814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008277	TC	3	6	441967	441972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008277	GC	3	6	441973	441978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_008277	CT	3	6	442114	442119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_008277	TA	3	6	443337	443342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_008277	AT	4	8	443753	443760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008277	TC	3	6	444752	444757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_008277	AT	3	6	444837	444842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008277	TA	3	6	445937	445942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008277	TA	3	6	447004	447009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008277	TA	3	6	447047	447052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008277	AC	3	6	447171	447176	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_008277	TA	3	6	447399	447404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008277	TA	3	6	447453	447458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008277	AC	3	6	447477	447482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_008277	GT	3	6	448577	448582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008277	GT	3	6	448746	448751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008277	TA	3	6	448933	448938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008277	TA	3	6	448976	448981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_008277	TA	3	6	449378	449383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008277	TC	3	6	450046	450051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_008277	AT	3	6	451531	451536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008277	TA	3	6	460424	460429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_008277	TA	5	10	462085	462094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008277	AT	3	6	462142	462147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_008277	TA	3	6	463731	463736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008277	AT	3	6	476372	476377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008277	AT	3	6	478482	478487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008277	TA	3	6	480194	480199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_008277	GA	3	6	485039	485044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008277	TC	3	6	485120	485125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_008277	GA	3	6	486171	486176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008277	TA	3	6	486537	486542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008277	AT	3	6	489517	489522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_008277	AG	3	6	493738	493743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008277	TG	3	6	494614	494619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008277	TA	3	6	496335	496340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_008277	AT	3	6	499982	499987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008277	CT	3	6	499994	499999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_008277	AT	4	8	535490	535497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_008277	GT	3	6	535559	535564	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_008277	GT	3	6	535648	535653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008277	AT	3	6	551549	551554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_008277	AT	3	6	555832	555837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_008277	AT	3	6	573000	573005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_008277	AG	4	8	575657	575664	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_008277	CT	4	8	575672	575679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008277	AT	3	6	581133	581138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_008277	TA	3	6	587222	587227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_008277	TA	3	6	587818	587823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_008277	TA	3	6	588761	588766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008277	TA	3	6	594024	594029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_008277	AT	3	6	603161	603166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_008277	TA	4	8	603201	603208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008277	AT	3	6	604640	604645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008277	TA	3	6	611689	611694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_008277	TA	3	6	622398	622403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_008277	TA	5	10	632781	632790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008277	TA	3	6	634503	634508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008277	TA	3	6	634513	634518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008277	GT	3	6	639818	639823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008277	AT	3	6	657627	657632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_008277	TA	3	6	662625	662630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008277	TA	3	6	665307	665312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_008277	TA	3	6	665314	665319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_008277	TA	4	8	665323	665330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_008277	TA	3	6	676982	676987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_008277	AT	3	6	677057	677062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_008277	AT	3	6	677070	677075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008277	TA	3	6	699390	699395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_008277	TA	3	6	703831	703836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008277	TA	3	6	704764	704769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008277	TA	4	8	709354	709361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008277	AT	3	6	710445	710450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_008277	AG	3	6	734324	734329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_008277	TA	3	6	737681	737686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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144	NC_008277	AG	3	6	754987	754992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008277	TA	3	6	766015	766020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_008277	TA	3	6	773323	773328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_008277	AT	3	6	786539	786544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_008277	AT	3	6	787079	787084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008277	TA	3	6	787086	787091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_008277	AC	3	6	805353	805358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.