MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp27

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008274	ATTTTT	2	12	2071	2082	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	111074121
2	NC_008274	GCACCA	2	12	2830	2841	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	111074122
3	NC_008274	AATTTA	2	12	6068	6079	50 %	50 %	0 %	0 %	111074126
4	NC_008274	AGAAAA	2	12	6720	6731	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	111074127
5	NC_008274	ATTGAA	2	12	7081	7092	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	111074127
6	NC_008274	TAAAAA	2	12	8477	8488	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111074128
7	NC_008274	ATATTA	2	12	9284	9295	50 %	50 %	0 %	0 %	111074130
8	NC_008274	AAGAAA	2	12	9297	9308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	111074130
9	NC_008274	TTTTAA	2	12	9813	9824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074130
10	NC_008274	TTAAAA	2	12	10038	10049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074131
11	NC_008274	AATTTT	2	12	10863	10874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074132
12	NC_008274	TATCAA	2	12	14656	14667	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111074135
13	NC_008274	TTTATT	2	12	16960	16971	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	111074137
14	NC_008274	AAATTT	2	12	21664	21675	50 %	50 %	0 %	0 %	111074141
15	NC_008274	CCAGTA	2	12	23577	23588	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	111074144
16	NC_008274	AAAATA	2	12	23968	23979	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	111074144
17	NC_008274	ATCTAT	2	12	24879	24890	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	111074145

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.