MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp27

Total Repeats: 356

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008274	TAA	2	6	41	46	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074119
2	NC_008274	ACA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074119
3	NC_008274	ATA	2	6	122	127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074119
4	NC_008274	TAA	2	6	303	308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074119
5	NC_008274	TAT	2	6	319	324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074119
6	NC_008274	TAT	3	9	394	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074120
7	NC_008274	TAC	2	6	529	534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074120
8	NC_008274	CTG	2	6	649	654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111074120
9	NC_008274	ATT	2	6	862	867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074121
10	NC_008274	TCA	2	6	1027	1032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074121
11	NC_008274	TTA	2	6	1049	1054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074121
12	NC_008274	TAA	2	6	1137	1142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074121
13	NC_008274	ATT	2	6	1143	1148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074121
14	NC_008274	ATC	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074121
15	NC_008274	TGT	2	6	1200	1205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074121
16	NC_008274	TTC	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074121
17	NC_008274	ATT	2	6	1341	1346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074121
18	NC_008274	TAT	2	6	1367	1372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074121
19	NC_008274	GAA	2	6	1390	1395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074121
20	NC_008274	AAC	2	6	1488	1493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074121
21	NC_008274	TAA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074121
22	NC_008274	TAT	3	9	1505	1513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074121
23	NC_008274	CGA	2	6	1597	1602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111074121
24	NC_008274	TAA	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074121
25	NC_008274	ATT	2	6	1669	1674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074121
26	NC_008274	ATT	2	6	1821	1826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074121
27	NC_008274	TAT	2	6	1928	1933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074121
28	NC_008274	ATT	2	6	1978	1983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074121
29	NC_008274	ATT	2	6	2008	2013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074121
30	NC_008274	ATT	2	6	2109	2114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074121
31	NC_008274	AAT	2	6	2616	2621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074122
32	NC_008274	ATA	2	6	2722	2727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074122
33	NC_008274	CAT	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074122
34	NC_008274	CAA	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074122
35	NC_008274	ATT	2	6	3079	3084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074122
36	NC_008274	ACA	2	6	3151	3156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074122
37	NC_008274	CAG	2	6	3188	3193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111074122
38	NC_008274	ATA	2	6	3274	3279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074122
39	NC_008274	ACA	2	6	3487	3492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074122
40	NC_008274	AGA	2	6	3984	3989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074123
41	NC_008274	TAG	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074123
42	NC_008274	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074123
43	NC_008274	AGC	2	6	4092	4097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111074123
44	NC_008274	ATA	2	6	4156	4161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074123
45	NC_008274	CAA	2	6	4162	4167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074123
46	NC_008274	GAA	2	6	4261	4266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074123
47	NC_008274	ATA	2	6	4285	4290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074123
48	NC_008274	TAC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074124
49	NC_008274	GTT	2	6	4446	4451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074124
50	NC_008274	TGT	2	6	4463	4468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074124
51	NC_008274	CAC	2	6	4477	4482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074124
52	NC_008274	GAA	2	6	4509	4514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074124
53	NC_008274	AAT	2	6	4544	4549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074124
54	NC_008274	ATA	2	6	4615	4620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074124
55	NC_008274	AAG	2	6	4633	4638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074124
56	NC_008274	ATT	2	6	4696	4701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074125
57	NC_008274	TAT	2	6	4830	4835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074125
58	NC_008274	ATT	2	6	4907	4912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074125
59	NC_008274	GAA	2	6	4966	4971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074125
60	NC_008274	AAT	2	6	5046	5051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074125
61	NC_008274	ACA	2	6	5143	5148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074125
62	NC_008274	ATT	2	6	5162	5167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074125
63	NC_008274	TAA	2	6	5196	5201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074125
64	NC_008274	AGA	2	6	5205	5210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074125
65	NC_008274	AAG	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074125
66	NC_008274	ATA	2	6	5437	5442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074125
67	NC_008274	TAC	2	6	5512	5517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074125
68	NC_008274	AAT	2	6	5518	5523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074125
69	NC_008274	AAT	2	6	5638	5643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074125
70	NC_008274	GAA	2	6	5677	5682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074125
71	NC_008274	ATA	2	6	5725	5730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074125
72	NC_008274	ATA	3	9	5797	5805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074126
73	NC_008274	TAG	3	9	5871	5879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074126
74	NC_008274	ATC	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074126
75	NC_008274	ATC	2	6	5935	5940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074126
76	NC_008274	ATA	2	6	5951	5956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074126
77	NC_008274	ATT	2	6	5986	5991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074126
78	NC_008274	TAA	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074126
79	NC_008274	TAA	2	6	6109	6114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074126
80	NC_008274	ATT	2	6	6154	6159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074126
81	NC_008274	AAT	2	6	6189	6194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074126
82	NC_008274	TAA	2	6	6312	6317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074126
83	NC_008274	GAA	2	6	6323	6328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074126
84	NC_008274	ATT	2	6	6558	6563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074127
85	NC_008274	TTA	2	6	6565	6570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074127
86	NC_008274	AAG	2	6	6650	6655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074127
87	NC_008274	AAT	2	6	6660	6665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074127
88	NC_008274	TAA	2	6	6791	6796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074127
89	NC_008274	GAA	2	6	6799	6804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074127
90	NC_008274	TAA	2	6	6855	6860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074127
91	NC_008274	ATT	2	6	6865	6870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074127
92	NC_008274	TAA	2	6	6987	6992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074127
93	NC_008274	ATA	2	6	7070	7075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074127
94	NC_008274	AGA	2	6	7125	7130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074127
95	NC_008274	TTA	2	6	7131	7136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074127
96	NC_008274	ATT	2	6	7161	7166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074127
97	NC_008274	ATT	2	6	7217	7222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074127
98	NC_008274	ATG	2	6	7301	7306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074127
99	NC_008274	CTT	2	6	7501	7506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074127
100	NC_008274	AAG	2	6	7520	7525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074127
101	NC_008274	TAA	2	6	7712	7717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074128
102	NC_008274	TAA	2	6	7727	7732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074128
103	NC_008274	AGT	2	6	7733	7738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074128
104	NC_008274	ACT	2	6	7786	7791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074128
105	NC_008274	TGT	2	6	7823	7828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074128
106	NC_008274	TAA	2	6	8039	8044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074128
107	NC_008274	ATA	2	6	8094	8099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074128
108	NC_008274	GAA	2	6	8100	8105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074128
109	NC_008274	CTT	2	6	8225	8230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074128
110	NC_008274	TAA	2	6	8260	8265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074128
111	NC_008274	AGA	2	6	8270	8275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074128
112	NC_008274	GAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074128
113	NC_008274	TAA	2	6	8464	8469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074128
114	NC_008274	AGA	2	6	8490	8495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074128
115	NC_008274	GAA	2	6	8500	8505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074128
116	NC_008274	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074128
117	NC_008274	TGT	2	6	8558	8563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074128
118	NC_008274	TAA	2	6	8578	8583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074128
119	NC_008274	ATT	2	6	8693	8698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074129
120	NC_008274	TAT	2	6	8884	8889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074129
121	NC_008274	ATA	2	6	9148	9153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074129
122	NC_008274	GGT	2	6	9172	9177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111074130
123	NC_008274	ACA	2	6	9190	9195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074130
124	NC_008274	ATT	2	6	9240	9245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074130
125	NC_008274	AAT	2	6	9372	9377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074130
126	NC_008274	TAA	2	6	9546	9551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074130
127	NC_008274	TAA	2	6	9557	9562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074130
128	NC_008274	TAA	2	6	9623	9628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074130
129	NC_008274	CAG	2	6	9630	9635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111074130
130	NC_008274	TAA	2	6	9677	9682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074130
131	NC_008274	AGA	2	6	9807	9812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074130
132	NC_008274	ATT	2	6	9830	9835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074130
133	NC_008274	TAA	2	6	10066	10071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074131
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.