MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp30

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008273	AGAACA	2	12	143	154	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	111074075
2	NC_008273	TCATTA	2	12	1029	1040	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	111074077
3	NC_008273	ATTTCC	2	12	1395	1406	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	111074078
4	NC_008273	TATCAA	2	12	3083	3094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111074081
5	NC_008273	ATTAAG	2	12	3657	3668	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	111074081
6	NC_008273	TTTTTG	2	12	4199	4210	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	111074082
7	NC_008273	TATCTA	2	12	5805	5816	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	111074086
8	NC_008273	ACTTCA	2	12	5942	5953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074087
9	NC_008273	TCCATT	2	12	9873	9884	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	111074093
10	NC_008273	CCACTA	2	12	11498	11509	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	111074097
11	NC_008273	TCAAAT	2	12	11558	11569	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111074097
12	NC_008273	CTTATC	2	12	12283	12294	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	111074098
13	NC_008273	GAAAAT	2	12	19151	19162	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	111074106
14	NC_008273	TAACAA	2	12	19407	19418	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	111074106
15	NC_008273	TTTAAA	2	12	19646	19657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008273	ACTTAA	2	12	20116	20127	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	111074107
17	NC_008273	TTACTT	2	12	21864	21875	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_008273	AATTTT	2	12	23357	23368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074112
19	NC_008273	AGAACA	2	12	29692	29703	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.