MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp30

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008273	AAGTG	2	10	56	65	40 %	20 %	40 %	0 %	111074075
2	NC_008273	ATTTT	2	10	817	826	20 %	80 %	0 %	0 %	111074076
3	NC_008273	AAGAT	2	10	1883	1892	60 %	20 %	20 %	0 %	111074079
4	NC_008273	TACTT	2	10	3391	3400	20 %	60 %	0 %	20 %	111074081
5	NC_008273	GTTGA	2	10	3457	3466	20 %	40 %	40 %	0 %	111074081
6	NC_008273	TTGTA	2	10	4019	4028	20 %	60 %	20 %	0 %	111074082
7	NC_008273	AAATT	2	10	4521	4530	60 %	40 %	0 %	0 %	111074083
8	NC_008273	AGTTG	2	10	6398	6407	20 %	40 %	40 %	0 %	111074087
9	NC_008273	TCTTT	2	10	6791	6800	0 %	80 %	0 %	20 %	111074088
10	NC_008273	GTATA	2	10	6920	6929	40 %	40 %	20 %	0 %	111074088
11	NC_008273	GTTTT	2	10	8460	8469	0 %	80 %	20 %	0 %	111074091
12	NC_008273	TGCAG	2	10	9196	9205	20 %	20 %	40 %	20 %	111074093
13	NC_008273	TTGAA	2	10	9809	9818	40 %	40 %	20 %	0 %	111074093
14	NC_008273	AGTAT	2	10	11027	11036	40 %	40 %	20 %	0 %	111074096
15	NC_008273	ATTTA	2	10	11831	11840	40 %	60 %	0 %	0 %	111074097
16	NC_008273	TTTGC	2	10	12897	12906	0 %	60 %	20 %	20 %	111074099
17	NC_008273	ATTAA	2	10	13493	13502	60 %	40 %	0 %	0 %	111074100
18	NC_008273	TTGAA	2	10	14044	14053	40 %	40 %	20 %	0 %	111074100
19	NC_008273	TTTTC	2	10	17934	17943	0 %	80 %	0 %	20 %	111074104
20	NC_008273	AAATT	2	10	19212	19221	60 %	40 %	0 %	0 %	111074106
21	NC_008273	TAAAA	2	10	19523	19532	80 %	20 %	0 %	0 %	111074106
22	NC_008273	AAATC	2	10	19818	19827	60 %	20 %	0 %	20 %	111074107
23	NC_008273	CATCC	2	10	20430	20439	20 %	20 %	0 %	60 %	111074108
24	NC_008273	TTTTA	2	10	20927	20936	20 %	80 %	0 %	0 %	111074109
25	NC_008273	AATGC	2	10	21504	21513	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_008273	CAAAT	2	10	21667	21676	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_008273	AAAAT	2	10	21998	22007	80 %	20 %	0 %	0 %	111074110
28	NC_008273	TTGTT	2	10	23088	23097	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008273	AACTC	2	10	23544	23553	40 %	20 %	0 %	40 %	111074112
30	NC_008273	TTTAT	2	10	24795	24804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_008273	TATAA	2	10	25194	25203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008273	TAGAT	2	10	25383	25392	40 %	40 %	20 %	0 %	111074113
33	NC_008273	TATAT	2	10	25728	25737	40 %	60 %	0 %	0 %	111074113
34	NC_008273	ATTTT	2	10	26311	26320	20 %	80 %	0 %	0 %	111074114
35	NC_008273	TTATT	2	10	26372	26381	20 %	80 %	0 %	0 %	111074115
36	NC_008273	TTCTT	2	10	27504	27513	0 %	80 %	0 %	20 %	111074116
37	NC_008273	CTTTT	2	10	27844	27853	0 %	80 %	0 %	20 %	111074117
38	NC_008273	CAATT	2	10	27925	27934	40 %	40 %	0 %	20 %	111074117
39	NC_008273	TTAAT	2	10	28897	28906	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_008273	AAGTG	2	10	29605	29614	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.