MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp30

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008273	ATCA	2	8	135	142	50 %	25 %	0 %	25 %	111074075
2	NC_008273	ATTA	2	8	177	184	50 %	50 %	0 %	0 %	111074075
3	NC_008273	TTCC	2	8	1058	1065	0 %	50 %	0 %	50 %	111074077
4	NC_008273	ATTT	2	8	1134	1141	25 %	75 %	0 %	0 %	111074077
5	NC_008273	TAGA	2	8	2079	2086	50 %	25 %	25 %	0 %	111074079
6	NC_008273	AAAT	2	8	2682	2689	75 %	25 %	0 %	0 %	111074080
7	NC_008273	GTTT	2	8	2698	2705	0 %	75 %	25 %	0 %	111074080
8	NC_008273	TTTG	2	8	3157	3164	0 %	75 %	25 %	0 %	111074081
9	NC_008273	ATTA	2	8	3780	3787	50 %	50 %	0 %	0 %	111074081
10	NC_008273	ATAA	2	8	4191	4198	75 %	25 %	0 %	0 %	111074082
11	NC_008273	TTTC	2	8	4452	4459	0 %	75 %	0 %	25 %	111074083
12	NC_008273	TAAT	2	8	5183	5190	50 %	50 %	0 %	0 %	111074086
13	NC_008273	CAAT	2	8	6694	6701	50 %	25 %	0 %	25 %	111074088
14	NC_008273	ATAA	2	8	7228	7235	75 %	25 %	0 %	0 %	111074088
15	NC_008273	AATT	2	8	7837	7844	50 %	50 %	0 %	0 %	111074089
16	NC_008273	GTAA	2	8	8089	8096	50 %	25 %	25 %	0 %	111074090
17	NC_008273	AAAT	2	8	8275	8282	75 %	25 %	0 %	0 %	111074091
18	NC_008273	AGCA	2	8	8672	8679	50 %	0 %	25 %	25 %	111074092
19	NC_008273	GTAA	2	8	9039	9046	50 %	25 %	25 %	0 %	111074093
20	NC_008273	CTTG	2	8	9478	9485	0 %	50 %	25 %	25 %	111074093
21	NC_008273	TTTC	3	12	9550	9561	0 %	75 %	0 %	25 %	111074093
22	NC_008273	TTTA	2	8	10222	10229	25 %	75 %	0 %	0 %	111074094
23	NC_008273	GATT	2	8	10244	10251	25 %	50 %	25 %	0 %	111074094
24	NC_008273	ACCA	2	8	10964	10971	50 %	0 %	0 %	50 %	111074095
25	NC_008273	GTCC	2	8	10997	11004	0 %	25 %	25 %	50 %	111074095
26	NC_008273	TACT	2	8	11229	11236	25 %	50 %	0 %	25 %	111074096
27	NC_008273	CACT	2	8	11371	11378	25 %	25 %	0 %	50 %	111074096
28	NC_008273	ATGA	2	8	11925	11932	50 %	25 %	25 %	0 %	111074098
29	NC_008273	CATA	2	8	12342	12349	50 %	25 %	0 %	25 %	111074098
30	NC_008273	TTAC	2	8	12839	12846	25 %	50 %	0 %	25 %	111074099
31	NC_008273	CATT	2	8	13402	13409	25 %	50 %	0 %	25 %	111074099
32	NC_008273	ATCT	2	8	13524	13531	25 %	50 %	0 %	25 %	111074100
33	NC_008273	ATTG	2	8	13567	13574	25 %	50 %	25 %	0 %	111074100
34	NC_008273	CATA	2	8	13776	13783	50 %	25 %	0 %	25 %	111074100
35	NC_008273	CTTG	2	8	14093	14100	0 %	50 %	25 %	25 %	111074100
36	NC_008273	CTGC	2	8	14130	14137	0 %	25 %	25 %	50 %	111074100
37	NC_008273	TTAC	2	8	14191	14198	25 %	50 %	0 %	25 %	111074101
38	NC_008273	AATT	2	8	14868	14875	50 %	50 %	0 %	0 %	111074102
39	NC_008273	TACT	2	8	15558	15565	25 %	50 %	0 %	25 %	111074103
40	NC_008273	TACT	2	8	15654	15661	25 %	50 %	0 %	25 %	111074103
41	NC_008273	TTAA	2	8	15819	15826	50 %	50 %	0 %	0 %	111074103
42	NC_008273	AATA	2	8	16893	16900	75 %	25 %	0 %	0 %	111074104
43	NC_008273	GTAA	2	8	16948	16955	50 %	25 %	25 %	0 %	111074104
44	NC_008273	TGCT	2	8	17340	17347	0 %	50 %	25 %	25 %	111074104
45	NC_008273	TTGT	2	8	17720	17727	0 %	75 %	25 %	0 %	111074104
46	NC_008273	GCTA	2	8	17908	17915	25 %	25 %	25 %	25 %	111074104
47	NC_008273	TTTG	2	8	18104	18111	0 %	75 %	25 %	0 %	111074104
48	NC_008273	AAAG	2	8	18998	19005	75 %	0 %	25 %	0 %	111074106
49	NC_008273	AATA	2	8	19190	19197	75 %	25 %	0 %	0 %	111074106
50	NC_008273	AACA	2	8	19445	19452	75 %	0 %	0 %	25 %	111074106
51	NC_008273	TATT	2	8	20046	20053	25 %	75 %	0 %	0 %	111074107
52	NC_008273	TAAA	2	8	20130	20137	75 %	25 %	0 %	0 %	111074107
53	NC_008273	CTCA	2	8	21391	21398	25 %	25 %	0 %	50 %	111074109
54	NC_008273	CTGG	2	8	22145	22152	0 %	25 %	50 %	25 %	111074110
55	NC_008273	AAAT	2	8	22500	22507	75 %	25 %	0 %	0 %	111074110
56	NC_008273	ATTT	3	12	22526	22537	25 %	75 %	0 %	0 %	111074110
57	NC_008273	CAAA	2	8	22637	22644	75 %	0 %	0 %	25 %	111074110
58	NC_008273	CTAT	2	8	22691	22698	25 %	50 %	0 %	25 %	111074111
59	NC_008273	TTTC	2	8	22771	22778	0 %	75 %	0 %	25 %	111074111
60	NC_008273	ATCT	2	8	23254	23261	25 %	50 %	0 %	25 %	111074112
61	NC_008273	TTTA	2	8	23417	23424	25 %	75 %	0 %	0 %	111074112
62	NC_008273	TACT	2	8	23850	23857	25 %	50 %	0 %	25 %	111074112
63	NC_008273	CCAT	2	8	23966	23973	25 %	25 %	0 %	50 %	111074112
64	NC_008273	ATTT	2	8	24049	24056	25 %	75 %	0 %	0 %	111074112
65	NC_008273	TTTA	2	8	25235	25242	25 %	75 %	0 %	0 %	111074113
66	NC_008273	ATAA	2	8	25261	25268	75 %	25 %	0 %	0 %	111074113
67	NC_008273	TATC	2	8	25367	25374	25 %	50 %	0 %	25 %	111074113
68	NC_008273	TATC	2	8	25454	25461	25 %	50 %	0 %	25 %	111074113
69	NC_008273	ATAA	2	8	25474	25481	75 %	25 %	0 %	0 %	111074113
70	NC_008273	ATCT	2	8	25509	25516	25 %	50 %	0 %	25 %	111074113
71	NC_008273	TATC	2	8	25562	25569	25 %	50 %	0 %	25 %	111074113
72	NC_008273	ATCC	2	8	26117	26124	25 %	25 %	0 %	50 %	111074114
73	NC_008273	TTTA	2	8	26609	26616	25 %	75 %	0 %	0 %	111074115
74	NC_008273	ATTC	2	8	27229	27236	25 %	50 %	0 %	25 %	111074116
75	NC_008273	TTCT	2	8	27459	27466	0 %	75 %	0 %	25 %	111074116
76	NC_008273	TCAA	2	8	27602	27609	50 %	25 %	0 %	25 %	111074116
77	NC_008273	ATTT	2	8	28036	28043	25 %	75 %	0 %	0 %	111074117
78	NC_008273	TGTT	2	8	28154	28161	0 %	75 %	25 %	0 %	111074117
79	NC_008273	ATTT	2	8	28321	28328	25 %	75 %	0 %	0 %	111074117
80	NC_008273	CATT	2	8	28475	28482	25 %	50 %	0 %	25 %	111074117
81	NC_008273	GTTG	2	8	28546	28553	0 %	50 %	50 %	0 %	111074117

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.