MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp30

Total Repeats: 419

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008273	AAT	2	6	90	95	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074075
2	NC_008273	CAA	2	6	119	124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074075
3	NC_008273	TAA	2	6	199	204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074075
4	NC_008273	AAC	2	6	210	215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074075
5	NC_008273	ATA	2	6	325	330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074075
6	NC_008273	ATT	2	6	339	344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074075
7	NC_008273	AAT	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074075
8	NC_008273	TGA	2	6	386	391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074075
9	NC_008273	TTA	2	6	424	429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074075
10	NC_008273	GGC	2	6	464	469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	111074075
11	NC_008273	TGA	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074075
12	NC_008273	AGA	2	6	596	601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074075
13	NC_008273	GCA	2	6	624	629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111074075
14	NC_008273	CGC	3	9	715	723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	111074076
15	NC_008273	AAG	2	6	726	731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074076
16	NC_008273	CCA	2	6	762	767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074076
17	NC_008273	TCA	2	6	831	836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074076
18	NC_008273	GTT	2	6	892	897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074076
19	NC_008273	ATC	2	6	905	910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074076
20	NC_008273	AAG	2	6	926	931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008273	TTC	2	6	932	937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_008273	TCT	2	6	954	959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_008273	TTG	2	6	1172	1177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074077
24	NC_008273	TCA	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074077
25	NC_008273	TAA	2	6	1449	1454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074078
26	NC_008273	TAA	2	6	1535	1540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074078
27	NC_008273	TAG	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074079
28	NC_008273	ATA	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074079
29	NC_008273	TCA	3	9	1862	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074079
30	NC_008273	ATC	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074079
31	NC_008273	ATT	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074079
32	NC_008273	TCA	2	6	2210	2215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074079
33	NC_008273	TAC	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074079
34	NC_008273	CAT	2	6	2346	2351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074079
35	NC_008273	AGT	2	6	2354	2359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074079
36	NC_008273	ATT	3	9	2368	2376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074079
37	NC_008273	TCT	2	6	2417	2422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074079
38	NC_008273	TCA	2	6	2423	2428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074079
39	NC_008273	TCT	3	9	2441	2449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074079
40	NC_008273	CCT	2	6	2462	2467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_008273	ATT	2	6	2503	2508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008273	AAT	2	6	2533	2538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008273	GTA	2	6	2690	2695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074080
44	NC_008273	AAT	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074080
45	NC_008273	GTA	2	6	2750	2755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074080
46	NC_008273	TCA	2	6	2804	2809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074080
47	NC_008273	AGT	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074081
48	NC_008273	ATC	2	6	3132	3137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074081
49	NC_008273	AAT	2	6	3318	3323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074081
50	NC_008273	GTT	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074081
51	NC_008273	GTT	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074081
52	NC_008273	TTA	2	6	3571	3576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074081
53	NC_008273	TCT	2	6	3589	3594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074081
54	NC_008273	GAA	2	6	3706	3711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074081
55	NC_008273	TTC	2	6	3717	3722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074081
56	NC_008273	AGC	2	6	3726	3731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111074081
57	NC_008273	ACC	2	6	3741	3746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074081
58	NC_008273	TCT	2	6	3790	3795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074081
59	NC_008273	AGA	2	6	3810	3815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074081
60	NC_008273	AAT	2	6	3819	3824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074081
61	NC_008273	ATC	2	6	3846	3851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074081
62	NC_008273	AGT	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074082
63	NC_008273	CAA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074082
64	NC_008273	TTA	2	6	4242	4247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074082
65	NC_008273	ATT	2	6	4262	4267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074082
66	NC_008273	TTA	2	6	4394	4399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008273	TAC	2	6	4408	4413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074083
68	NC_008273	ATA	2	6	4436	4441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074083
69	NC_008273	GTT	2	6	4466	4471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074083
70	NC_008273	CTA	2	6	4490	4495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074083
71	NC_008273	AGT	2	6	4625	4630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008273	TAT	2	6	4756	4761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_008273	TCT	2	6	4805	4810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074084
74	NC_008273	TCT	2	6	4862	4867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074084
75	NC_008273	TGG	2	6	4981	4986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	111074085
76	NC_008273	CTT	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074086
77	NC_008273	TCT	2	6	5141	5146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074086
78	NC_008273	TTA	2	6	5238	5243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074086
79	NC_008273	TAT	2	6	5266	5271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074086
80	NC_008273	GAA	2	6	5452	5457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	111074086
81	NC_008273	TAA	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074086
82	NC_008273	ATA	2	6	5587	5592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074086
83	NC_008273	TGA	2	6	5692	5697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074086
84	NC_008273	TCT	2	6	5765	5770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074086
85	NC_008273	CAT	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074086
86	NC_008273	ACT	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074087
87	NC_008273	GTT	2	6	6066	6071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074087
88	NC_008273	AGT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074087
89	NC_008273	CCA	2	6	6167	6172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074087
90	NC_008273	ATA	2	6	6235	6240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074087
91	NC_008273	TAG	2	6	6246	6251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074087
92	NC_008273	TAT	2	6	6418	6423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074087
93	NC_008273	CTT	2	6	6453	6458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074087
94	NC_008273	ATT	2	6	6478	6483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074087
95	NC_008273	ACC	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074087
96	NC_008273	GCA	2	6	6589	6594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	111074088
97	NC_008273	TAT	2	6	6665	6670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074088
98	NC_008273	TTA	2	6	6677	6682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074088
99	NC_008273	TCA	2	6	6802	6807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074088
100	NC_008273	CAT	2	6	6954	6959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074088
101	NC_008273	TCC	2	6	6972	6977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111074088
102	NC_008273	GCT	2	6	7003	7008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111074088
103	NC_008273	TAA	2	6	7118	7123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074088
104	NC_008273	CTT	2	6	7145	7150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074088
105	NC_008273	TAT	2	6	7178	7183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074088
106	NC_008273	TCC	2	6	7191	7196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	111074088
107	NC_008273	CTT	2	6	7208	7213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074088
108	NC_008273	GTT	2	6	7241	7246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074088
109	NC_008273	CTT	2	6	7298	7303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074088
110	NC_008273	CAA	2	6	7412	7417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074088
111	NC_008273	ATT	2	6	7668	7673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074088
112	NC_008273	TCA	2	6	7898	7903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074089
113	NC_008273	CAT	2	6	7920	7925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074089
114	NC_008273	TCA	2	6	7979	7984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074089
115	NC_008273	ATC	2	6	8124	8129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074090
116	NC_008273	ATT	2	6	8160	8165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074090
117	NC_008273	ATA	2	6	8244	8249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074091
118	NC_008273	CAA	2	6	8251	8256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074091
119	NC_008273	TAA	2	6	8268	8273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074091
120	NC_008273	ATA	2	6	8502	8507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074091
121	NC_008273	CTG	2	6	8587	8592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111074092
122	NC_008273	CTT	2	6	8598	8603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074092
123	NC_008273	TTC	2	6	8609	8614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074092
124	NC_008273	AAT	2	6	8636	8641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074092
125	NC_008273	TTA	2	6	8812	8817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	111074092
126	NC_008273	AAC	2	6	8843	8848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074092
127	NC_008273	TTG	2	6	8854	8859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074092
128	NC_008273	ACC	2	6	8903	8908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074092
129	NC_008273	AGT	2	6	9000	9005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074093
130	NC_008273	AGT	2	6	9118	9123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074093
131	NC_008273	TAG	2	6	9144	9149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	111074093
132	NC_008273	CAC	2	6	9185	9190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074093
133	NC_008273	CAA	2	6	9254	9259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074093
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244	NC_008273	ATA	2	6	17153	17158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074104
245	NC_008273	ATA	2	6	17200	17205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074104
246	NC_008273	ATC	2	6	17209	17214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074104
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250	NC_008273	CTT	2	6	17577	17582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	111074104
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254	NC_008273	TAA	2	6	17874	17879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074104
255	NC_008273	ACC	2	6	17917	17922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	111074104
256	NC_008273	TTG	2	6	18030	18035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	111074104
257	NC_008273	CTT	2	6	18136	18141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_008273	AAC	2	6	18226	18231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	111074105
259	NC_008273	GCT	2	6	18554	18559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	111074105
260	NC_008273	ATC	2	6	18604	18609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074105
261	NC_008273	ATT	2	6	18665	18670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_008273	ATA	2	6	18678	18683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_008273	TAA	2	6	18692	18697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_008273	TTA	2	6	18699	18704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_008273	ATT	2	6	18719	18724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_008273	CTG	2	6	18737	18742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_008273	TTA	3	9	18760	18768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_008273	ATA	2	6	18992	18997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074106
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276	NC_008273	CAA	2	6	19533	19538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_008273	TCT	2	6	19603	19608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_008273	ATT	2	6	19628	19633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_008273	AAT	2	6	19728	19733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	111074107
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287	NC_008273	CCT	2	6	20174	20179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_008273	TAT	2	6	20185	20190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_008273	TTA	2	6	20234	20239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_008273	CAT	2	6	20376	20381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	111074108
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.