MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp30

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008273	AT	3	6	666	671	50 %	50 %	0 %	0 %	111074076
2	NC_008273	AT	3	6	1304	1309	50 %	50 %	0 %	0 %	111074077
3	NC_008273	AT	3	6	2921	2926	50 %	50 %	0 %	0 %	111074080
4	NC_008273	AT	3	6	3330	3335	50 %	50 %	0 %	0 %	111074081
5	NC_008273	AT	4	8	3606	3613	50 %	50 %	0 %	0 %	111074081
6	NC_008273	AT	3	6	4000	4005	50 %	50 %	0 %	0 %	111074082
7	NC_008273	AT	3	6	5072	5077	50 %	50 %	0 %	0 %	111074086
8	NC_008273	AT	3	6	5882	5887	50 %	50 %	0 %	0 %	111074086
9	NC_008273	TA	3	6	8130	8135	50 %	50 %	0 %	0 %	111074090
10	NC_008273	GT	3	6	8534	8539	0 %	50 %	50 %	0 %	111074092
11	NC_008273	AT	4	8	10364	10371	50 %	50 %	0 %	0 %	111074094
12	NC_008273	TA	3	6	10839	10844	50 %	50 %	0 %	0 %	111074095
13	NC_008273	AT	3	6	10855	10860	50 %	50 %	0 %	0 %	111074095
14	NC_008273	AT	3	6	11158	11163	50 %	50 %	0 %	0 %	111074096
15	NC_008273	TC	3	6	11409	11414	0 %	50 %	0 %	50 %	111074097
16	NC_008273	CT	3	6	11486	11491	0 %	50 %	0 %	50 %	111074097
17	NC_008273	AT	3	6	12497	12502	50 %	50 %	0 %	0 %	111074098
18	NC_008273	AG	3	6	13585	13590	50 %	0 %	50 %	0 %	111074100
19	NC_008273	AT	3	6	13807	13812	50 %	50 %	0 %	0 %	111074100
20	NC_008273	TA	3	6	13848	13853	50 %	50 %	0 %	0 %	111074100
21	NC_008273	CG	3	6	13930	13935	0 %	0 %	50 %	50 %	111074100
22	NC_008273	TC	4	8	15254	15261	0 %	50 %	0 %	50 %	111074102
23	NC_008273	AG	3	6	16091	16096	50 %	0 %	50 %	0 %	111074103
24	NC_008273	AT	3	6	16262	16267	50 %	50 %	0 %	0 %	111074103
25	NC_008273	TA	3	6	16340	16345	50 %	50 %	0 %	0 %	111074103
26	NC_008273	TA	3	6	16648	16653	50 %	50 %	0 %	0 %	111074103
27	NC_008273	CA	3	6	16699	16704	50 %	0 %	0 %	50 %	111074103
28	NC_008273	TC	3	6	16804	16809	0 %	50 %	0 %	50 %	111074104
29	NC_008273	AT	3	6	17051	17056	50 %	50 %	0 %	0 %	111074104
30	NC_008273	GT	4	8	17109	17116	0 %	50 %	50 %	0 %	111074104
31	NC_008273	TC	3	6	17218	17223	0 %	50 %	0 %	50 %	111074104
32	NC_008273	AT	4	8	17709	17716	50 %	50 %	0 %	0 %	111074104
33	NC_008273	AT	3	6	18051	18056	50 %	50 %	0 %	0 %	111074104
34	NC_008273	CA	3	6	18524	18529	50 %	0 %	0 %	50 %	111074105
35	NC_008273	AC	3	6	23017	23022	50 %	0 %	0 %	50 %	111074111
36	NC_008273	AT	3	6	24138	24143	50 %	50 %	0 %	0 %	111074112
37	NC_008273	AT	3	6	25391	25396	50 %	50 %	0 %	0 %	111074113
38	NC_008273	AT	3	6	25532	25537	50 %	50 %	0 %	0 %	111074113
39	NC_008273	AT	3	6	25586	25591	50 %	50 %	0 %	0 %	111074113
40	NC_008273	TA	3	6	26052	26057	50 %	50 %	0 %	0 %	111074114
41	NC_008273	TA	3	6	26891	26896	50 %	50 %	0 %	0 %	111074115
42	NC_008273	AT	3	6	27037	27042	50 %	50 %	0 %	0 %	111074115
43	NC_008273	AT	3	6	27766	27771	50 %	50 %	0 %	0 %	111074117
44	NC_008273	TA	3	6	28693	28698	50 %	50 %	0 %	0 %	111074117

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.