MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL3

Total Repeats: 979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008271	TCGA	2	8	107	114	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_008271	CAAT	2	8	432	439	50 %	25 %	0 %	25 %	111026828
3	NC_008271	CCAG	2	8	666	673	25 %	0 %	25 %	50 %	111026829
4	NC_008271	CACT	2	8	1054	1061	25 %	25 %	0 %	50 %	111026830
5	NC_008271	CACC	2	8	1125	1132	25 %	0 %	0 %	75 %	111026830
6	NC_008271	TCAG	2	8	1291	1298	25 %	25 %	25 %	25 %	111026831
7	NC_008271	CAGA	2	8	1354	1361	50 %	0 %	25 %	25 %	111026831
8	NC_008271	CAGC	2	8	2046	2053	25 %	0 %	25 %	50 %	111026832
9	NC_008271	CCAG	3	12	2244	2255	25 %	0 %	25 %	50 %	111026832
10	NC_008271	ACAA	2	8	2491	2498	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008271	CCAC	2	8	2586	2593	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_008271	TGGG	2	8	2617	2624	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008271	ACGA	2	8	2633	2640	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_008271	TGTT	2	8	2732	2739	0 %	75 %	25 %	0 %	111026833
15	NC_008271	ACCG	2	8	3052	3059	25 %	0 %	25 %	50 %	111026833
16	NC_008271	AGCT	2	8	3281	3288	25 %	25 %	25 %	25 %	111026833
17	NC_008271	GCCC	2	8	3312	3319	0 %	0 %	25 %	75 %	111026833
18	NC_008271	GACC	2	8	3537	3544	25 %	0 %	25 %	50 %	111026833
19	NC_008271	AGGT	2	8	3721	3728	25 %	25 %	50 %	0 %	111026834
20	NC_008271	ATCA	2	8	3939	3946	50 %	25 %	0 %	25 %	111026834
21	NC_008271	CGTT	2	8	4221	4228	0 %	50 %	25 %	25 %	111026834
22	NC_008271	GGCC	2	8	4499	4506	0 %	0 %	50 %	50 %	111026834
23	NC_008271	GCAG	2	8	4681	4688	25 %	0 %	50 %	25 %	111026835
24	NC_008271	GCGG	2	8	4997	5004	0 %	0 %	75 %	25 %	111026835
25	NC_008271	GCCG	2	8	5159	5166	0 %	0 %	50 %	50 %	111026835
26	NC_008271	CAGC	2	8	5455	5462	25 %	0 %	25 %	50 %	111026836
27	NC_008271	GCAG	2	8	5778	5785	25 %	0 %	50 %	25 %	111026836
28	NC_008271	GCCG	2	8	6069	6076	0 %	0 %	50 %	50 %	111026836
29	NC_008271	GCGG	2	8	6183	6190	0 %	0 %	75 %	25 %	111026837
30	NC_008271	GGTC	2	8	6518	6525	0 %	25 %	50 %	25 %	111026837
31	NC_008271	GCCA	2	8	6550	6557	25 %	0 %	25 %	50 %	111026837
32	NC_008271	CGGT	2	8	6559	6566	0 %	25 %	50 %	25 %	111026837
33	NC_008271	GTTC	2	8	6575	6582	0 %	50 %	25 %	25 %	111026837
34	NC_008271	AGTC	2	8	7150	7157	25 %	25 %	25 %	25 %	111026838
35	NC_008271	GGCG	2	8	7287	7294	0 %	0 %	75 %	25 %	111026838
36	NC_008271	CCCG	2	8	8182	8189	0 %	0 %	25 %	75 %	111026839
37	NC_008271	GGCC	2	8	8814	8821	0 %	0 %	50 %	50 %	111026840
38	NC_008271	CGAG	2	8	9227	9234	25 %	0 %	50 %	25 %	111026840
39	NC_008271	CGTA	2	8	9846	9853	25 %	25 %	25 %	25 %	111026840
40	NC_008271	CTCG	2	8	9919	9926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_008271	CGGC	2	8	10002	10009	0 %	0 %	50 %	50 %	111026841
42	NC_008271	GAAC	2	8	10489	10496	50 %	0 %	25 %	25 %	111026841
43	NC_008271	CCGG	2	8	11228	11235	0 %	0 %	50 %	50 %	111026841
44	NC_008271	TCCA	2	8	11544	11551	25 %	25 %	0 %	50 %	111026841
45	NC_008271	CCCG	2	8	11877	11884	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_008271	CGGA	2	8	12089	12096	25 %	0 %	50 %	25 %	111026842
47	NC_008271	GCCG	2	8	12222	12229	0 %	0 %	50 %	50 %	111026843
48	NC_008271	ATAC	2	8	12340	12347	50 %	25 %	0 %	25 %	111026843
49	NC_008271	ACCG	2	8	12743	12750	25 %	0 %	25 %	50 %	111026843
50	NC_008271	GCCG	2	8	12970	12977	0 %	0 %	50 %	50 %	111026843
51	NC_008271	GGCA	2	8	13108	13115	25 %	0 %	50 %	25 %	111026843
52	NC_008271	GGCC	2	8	13485	13492	0 %	0 %	50 %	50 %	111026844
53	NC_008271	GCCG	2	8	14213	14220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_008271	GCCG	2	8	14424	14431	0 %	0 %	50 %	50 %	111026845
55	NC_008271	GCGG	2	8	14528	14535	0 %	0 %	75 %	25 %	111026845
56	NC_008271	CGGC	2	8	14651	14658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_008271	GGAC	2	8	14662	14669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_008271	CGGT	2	8	14703	14710	0 %	25 %	50 %	25 %	111026846
59	NC_008271	TGAG	2	8	15253	15260	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008271	ACCA	2	8	15964	15971	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_008271	CCGT	2	8	16025	16032	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_008271	TCGA	2	8	16339	16346	25 %	25 %	25 %	25 %	111026848
63	NC_008271	GCCG	2	8	16396	16403	0 %	0 %	50 %	50 %	111026848
64	NC_008271	TCTT	2	8	16419	16426	0 %	75 %	0 %	25 %	111026848
65	NC_008271	CTTC	2	8	16642	16649	0 %	50 %	0 %	50 %	111026848
66	NC_008271	TGAA	2	8	16765	16772	50 %	25 %	25 %	0 %	111026849
67	NC_008271	ACCA	2	8	16908	16915	50 %	0 %	0 %	50 %	111026849
68	NC_008271	CGGG	2	8	17241	17248	0 %	0 %	75 %	25 %	111026849
69	NC_008271	CTAT	2	8	17416	17423	25 %	50 %	0 %	25 %	111026849
70	NC_008271	GCAC	2	8	17534	17541	25 %	0 %	25 %	50 %	111026849
71	NC_008271	TGCC	2	8	18569	18576	0 %	25 %	25 %	50 %	111026850
72	NC_008271	ACCA	2	8	18764	18771	50 %	0 %	0 %	50 %	111026850
73	NC_008271	CGAT	2	8	18894	18901	25 %	25 %	25 %	25 %	111026850
74	NC_008271	TCAT	2	8	19044	19051	25 %	50 %	0 %	25 %	111026850
75	NC_008271	TGCT	2	8	19348	19355	0 %	50 %	25 %	25 %	111026851
76	NC_008271	CGGC	2	8	19634	19641	0 %	0 %	50 %	50 %	111026851
77	NC_008271	CCAG	2	8	19650	19657	25 %	0 %	25 %	50 %	111026851
78	NC_008271	CGGC	2	8	19800	19807	0 %	0 %	50 %	50 %	111026851
79	NC_008271	ACTG	2	8	20211	20218	25 %	25 %	25 %	25 %	111026851
80	NC_008271	CGCC	2	8	20819	20826	0 %	0 %	25 %	75 %	111026852
81	NC_008271	GTCG	2	8	20857	20864	0 %	25 %	50 %	25 %	111026852
82	NC_008271	GCCA	2	8	20893	20900	25 %	0 %	25 %	50 %	111026852
83	NC_008271	AGGT	2	8	21701	21708	25 %	25 %	50 %	0 %	111026853
84	NC_008271	GCCG	2	8	22258	22265	0 %	0 %	50 %	50 %	111026854
85	NC_008271	CTCA	2	8	22508	22515	25 %	25 %	0 %	50 %	111026855
86	NC_008271	GGTG	2	8	22789	22796	0 %	25 %	75 %	0 %	111026855
87	NC_008271	TGCC	2	8	23173	23180	0 %	25 %	25 %	50 %	111026855
88	NC_008271	GCCC	2	8	23713	23720	0 %	0 %	25 %	75 %	111026856
89	NC_008271	TTCC	2	8	24619	24626	0 %	50 %	0 %	50 %	111026856
90	NC_008271	GGCG	2	8	24648	24655	0 %	0 %	75 %	25 %	111026856
91	NC_008271	CTTC	2	8	25167	25174	0 %	50 %	0 %	50 %	111026857
92	NC_008271	CCGC	2	8	25742	25749	0 %	0 %	25 %	75 %	111026857
93	NC_008271	CGGG	2	8	26515	26522	0 %	0 %	75 %	25 %	111026858
94	NC_008271	CGCT	2	8	27312	27319	0 %	25 %	25 %	50 %	111026859
95	NC_008271	AGCC	2	8	27591	27598	25 %	0 %	25 %	50 %	111026859
96	NC_008271	CGAT	2	8	28866	28873	25 %	25 %	25 %	25 %	111026860
97	NC_008271	CTCA	2	8	28964	28971	25 %	25 %	0 %	50 %	111026860
98	NC_008271	GAGG	2	8	29972	29979	25 %	0 %	75 %	0 %	111026861
99	NC_008271	GGCG	2	8	30375	30382	0 %	0 %	75 %	25 %	111026861
100	NC_008271	ACGC	2	8	30399	30406	25 %	0 %	25 %	50 %	111026861
101	NC_008271	TCGG	2	8	30786	30793	0 %	25 %	50 %	25 %	111026861
102	NC_008271	CCAC	2	8	31756	31763	25 %	0 %	0 %	75 %	111026862
103	NC_008271	GCTC	2	8	33021	33028	0 %	25 %	25 %	50 %	111026863
104	NC_008271	CAGC	2	8	33180	33187	25 %	0 %	25 %	50 %	111026863
105	NC_008271	GGCC	2	8	33277	33284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_008271	CTTC	2	8	34080	34087	0 %	50 %	0 %	50 %	111026865
107	NC_008271	CCCG	2	8	34647	34654	0 %	0 %	25 %	75 %	111026866
108	NC_008271	GGCC	2	8	34731	34738	0 %	0 %	50 %	50 %	111026866
109	NC_008271	CGGT	2	8	35195	35202	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_008271	GAAG	2	8	35405	35412	50 %	0 %	50 %	0 %	111026867
111	NC_008271	TCAC	2	8	35909	35916	25 %	25 %	0 %	50 %	111026867
112	NC_008271	GAAC	2	8	36268	36275	50 %	0 %	25 %	25 %	111026868
113	NC_008271	CCCA	2	8	36327	36334	25 %	0 %	0 %	75 %	111026868
114	NC_008271	TGCA	2	8	36684	36691	25 %	25 %	25 %	25 %	111026868
115	NC_008271	GATC	2	8	37267	37274	25 %	25 %	25 %	25 %	111026868
116	NC_008271	GGGC	2	8	38794	38801	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_008271	CGAG	2	8	39089	39096	25 %	0 %	50 %	25 %	111026870
118	NC_008271	CCGA	2	8	39122	39129	25 %	0 %	25 %	50 %	111026870
119	NC_008271	CGCA	2	8	39146	39153	25 %	0 %	25 %	50 %	111026870
120	NC_008271	CCCG	2	8	40034	40041	0 %	0 %	25 %	75 %	111026871
121	NC_008271	GGAT	2	8	40534	40541	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_008271	GGTT	2	8	40652	40659	0 %	50 %	50 %	0 %	111026872
123	NC_008271	TGTC	2	8	41601	41608	0 %	50 %	25 %	25 %	111026873
124	NC_008271	AGGA	2	8	42447	42454	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_008271	GCTG	2	8	42574	42581	0 %	25 %	50 %	25 %	111026874
126	NC_008271	CCTG	2	8	43173	43180	0 %	25 %	25 %	50 %	111026875
127	NC_008271	CGTC	2	8	43356	43363	0 %	25 %	25 %	50 %	111026875
128	NC_008271	CCGG	2	8	43410	43417	0 %	0 %	50 %	50 %	111026875
129	NC_008271	GTTG	2	8	43710	43717	0 %	50 %	50 %	0 %	111026875
130	NC_008271	GCCC	2	8	44212	44219	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_008271	CGTG	2	8	44255	44262	0 %	25 %	50 %	25 %	111026876
132	NC_008271	CGGC	2	8	44273	44280	0 %	0 %	50 %	50 %	111026876
133	NC_008271	CCAG	2	8	45287	45294	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_008271	CAGG	2	8	45672	45679	25 %	0 %	50 %	25 %	111026878
135	NC_008271	CTGT	2	8	45688	45695	0 %	50 %	25 %	25 %	111026878
136	NC_008271	CCGT	2	8	46137	46144	0 %	25 %	25 %	50 %	111026879
137	NC_008271	CGCA	2	8	46180	46187	25 %	0 %	25 %	50 %	111026879
138	NC_008271	GCGG	2	8	47462	47469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_008271	GCTA	2	8	47510	47517	25 %	25 %	25 %	25 %	111026881
140	NC_008271	GCCC	2	8	47558	47565	0 %	0 %	25 %	75 %	111026881
141	NC_008271	CGAT	2	8	48040	48047	25 %	25 %	25 %	25 %	111026881
142	NC_008271	GCAG	2	8	48140	48147	25 %	0 %	50 %	25 %	111026881
143	NC_008271	CTGC	2	8	48573	48580	0 %	25 %	25 %	50 %	111026881
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